Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SEB1

Protein Details
Accession R7SEB1    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MGKEKKAHKGEKRKRSDESQIESBasic
146-168ETLRSGPSKKKVKGKKYVPSDETHydrophilic
526-552STDADRQARRLAKKKLRHGMARNEEKGHydrophilic
561-585AERASKRAKVISKKGRVRSEKAVARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-15KEKKAHKGEKRKR
153-161SKKKVKGKK
520-590ERKMAKSTDADRQARRLAKKKLRHGMARNEEKGSVKLNPTSAERASKRAKVISKKGRVRSEKAVARMKGQR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tms:TREMEDRAFT_70147  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKEKKAHKGEKRKRSDESQIESPTVGLKLVGKSKDAELDDIFNKSVCSYLKGGFQLTHQATLNQTSTVSAIAGPSTFLEVSSNSELVKDTQGSGKKPKKSVRVQEVEEDDEPVIGPVEGGPSGTPISEKDDSQVDISDQEDLIHETLRSGPSKKKVKGKKYVPSDETPGDRDRRTIFVGNVPLECAKVKSALTKLRAHILSYAPSAKIESVRFRSVPFATPTSILPSDNPEKDETRRLKREKERAATWREQIDHDPKSKSKTKSRDDEEVVDTSKVYIDAKGKRKVAFIKKDFHDQAATCNAYIVFEHPPPDRSKNLPPLMNPYEAANLALKADGSEVMGRSIRVDVVRASGRKGDDADGTSKKRDGWLPSGTDPKRSLFVGGLDYAAKEEDVRVFFEELVKKERGDSPDGRWVTGVRIVRDKETQLGKGFGYVHFTDRESVDEIIALNSTKLKLAKRDIRVQQCKTLPSATVKPSPITNLKSSDKTKPKTTSARSIITTIPKGNPALGEKLKDLSKEERKMAKSTDADRQARRLAKKKLRHGMARNEEKGSVKLNPTSAERASKRAKVISKKGRVRSEKAVARMKGQRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.83
3 0.84
4 0.82
5 0.79
6 0.77
7 0.7
8 0.64
9 0.57
10 0.48
11 0.4
12 0.31
13 0.23
14 0.15
15 0.15
16 0.18
17 0.25
18 0.26
19 0.26
20 0.27
21 0.29
22 0.35
23 0.33
24 0.32
25 0.26
26 0.3
27 0.3
28 0.31
29 0.29
30 0.22
31 0.21
32 0.17
33 0.19
34 0.15
35 0.17
36 0.18
37 0.2
38 0.26
39 0.28
40 0.29
41 0.27
42 0.27
43 0.33
44 0.31
45 0.33
46 0.27
47 0.27
48 0.27
49 0.3
50 0.3
51 0.21
52 0.19
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.13
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.15
69 0.17
70 0.17
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.2
76 0.16
77 0.14
78 0.2
79 0.25
80 0.29
81 0.39
82 0.45
83 0.5
84 0.57
85 0.64
86 0.67
87 0.73
88 0.79
89 0.79
90 0.79
91 0.75
92 0.74
93 0.7
94 0.65
95 0.55
96 0.46
97 0.35
98 0.26
99 0.23
100 0.16
101 0.12
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.14
115 0.16
116 0.16
117 0.16
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.2
122 0.14
123 0.13
124 0.14
125 0.13
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.14
136 0.16
137 0.18
138 0.24
139 0.32
140 0.42
141 0.48
142 0.55
143 0.63
144 0.7
145 0.77
146 0.81
147 0.81
148 0.81
149 0.84
150 0.8
151 0.74
152 0.69
153 0.62
154 0.55
155 0.49
156 0.44
157 0.39
158 0.34
159 0.33
160 0.3
161 0.29
162 0.3
163 0.3
164 0.27
165 0.28
166 0.32
167 0.31
168 0.28
169 0.27
170 0.23
171 0.2
172 0.19
173 0.14
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.15
178 0.21
179 0.26
180 0.31
181 0.35
182 0.35
183 0.4
184 0.4
185 0.37
186 0.34
187 0.29
188 0.27
189 0.24
190 0.24
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.14
195 0.16
196 0.16
197 0.2
198 0.23
199 0.26
200 0.27
201 0.27
202 0.3
203 0.28
204 0.3
205 0.26
206 0.24
207 0.22
208 0.22
209 0.22
210 0.22
211 0.21
212 0.18
213 0.15
214 0.18
215 0.23
216 0.23
217 0.24
218 0.22
219 0.24
220 0.26
221 0.35
222 0.37
223 0.4
224 0.49
225 0.52
226 0.59
227 0.66
228 0.73
229 0.73
230 0.72
231 0.7
232 0.68
233 0.71
234 0.66
235 0.6
236 0.54
237 0.46
238 0.41
239 0.39
240 0.38
241 0.35
242 0.34
243 0.35
244 0.32
245 0.37
246 0.43
247 0.45
248 0.47
249 0.53
250 0.56
251 0.62
252 0.65
253 0.67
254 0.62
255 0.6
256 0.53
257 0.45
258 0.39
259 0.29
260 0.24
261 0.17
262 0.14
263 0.1
264 0.08
265 0.08
266 0.13
267 0.21
268 0.28
269 0.34
270 0.37
271 0.38
272 0.41
273 0.47
274 0.51
275 0.53
276 0.5
277 0.52
278 0.51
279 0.57
280 0.54
281 0.47
282 0.41
283 0.31
284 0.29
285 0.26
286 0.25
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.12
291 0.12
292 0.11
293 0.09
294 0.09
295 0.12
296 0.12
297 0.15
298 0.18
299 0.22
300 0.23
301 0.25
302 0.31
303 0.37
304 0.41
305 0.4
306 0.38
307 0.43
308 0.43
309 0.39
310 0.33
311 0.25
312 0.22
313 0.2
314 0.2
315 0.12
316 0.09
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.11
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.18
340 0.18
341 0.19
342 0.19
343 0.17
344 0.15
345 0.17
346 0.2
347 0.22
348 0.24
349 0.24
350 0.24
351 0.23
352 0.24
353 0.26
354 0.26
355 0.26
356 0.29
357 0.31
358 0.34
359 0.43
360 0.4
361 0.41
362 0.38
363 0.33
364 0.31
365 0.27
366 0.25
367 0.16
368 0.18
369 0.15
370 0.14
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.07
377 0.05
378 0.06
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.12
383 0.13
384 0.13
385 0.18
386 0.21
387 0.2
388 0.24
389 0.23
390 0.22
391 0.24
392 0.28
393 0.27
394 0.3
395 0.31
396 0.31
397 0.39
398 0.39
399 0.37
400 0.33
401 0.3
402 0.26
403 0.28
404 0.26
405 0.19
406 0.25
407 0.26
408 0.28
409 0.3
410 0.3
411 0.3
412 0.31
413 0.32
414 0.28
415 0.29
416 0.25
417 0.26
418 0.26
419 0.2
420 0.22
421 0.19
422 0.19
423 0.19
424 0.2
425 0.19
426 0.18
427 0.2
428 0.17
429 0.17
430 0.14
431 0.13
432 0.13
433 0.11
434 0.11
435 0.09
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.1
440 0.14
441 0.16
442 0.22
443 0.32
444 0.4
445 0.45
446 0.55
447 0.61
448 0.69
449 0.75
450 0.73
451 0.72
452 0.67
453 0.63
454 0.56
455 0.49
456 0.41
457 0.38
458 0.41
459 0.38
460 0.4
461 0.39
462 0.38
463 0.37
464 0.4
465 0.4
466 0.38
467 0.37
468 0.37
469 0.4
470 0.46
471 0.49
472 0.53
473 0.57
474 0.58
475 0.62
476 0.62
477 0.66
478 0.69
479 0.71
480 0.72
481 0.68
482 0.68
483 0.61
484 0.57
485 0.54
486 0.5
487 0.47
488 0.4
489 0.36
490 0.34
491 0.33
492 0.31
493 0.29
494 0.26
495 0.3
496 0.3
497 0.3
498 0.28
499 0.32
500 0.33
501 0.32
502 0.33
503 0.35
504 0.41
505 0.45
506 0.51
507 0.56
508 0.57
509 0.6
510 0.59
511 0.58
512 0.54
513 0.52
514 0.55
515 0.56
516 0.59
517 0.58
518 0.6
519 0.59
520 0.61
521 0.65
522 0.65
523 0.66
524 0.7
525 0.76
526 0.81
527 0.83
528 0.85
529 0.85
530 0.85
531 0.85
532 0.86
533 0.86
534 0.8
535 0.72
536 0.66
537 0.59
538 0.52
539 0.45
540 0.4
541 0.34
542 0.34
543 0.34
544 0.34
545 0.36
546 0.4
547 0.39
548 0.43
549 0.41
550 0.46
551 0.51
552 0.53
553 0.54
554 0.56
555 0.61
556 0.61
557 0.7
558 0.73
559 0.76
560 0.8
561 0.84
562 0.87
563 0.86
564 0.83
565 0.81
566 0.81
567 0.77
568 0.77
569 0.77
570 0.68
571 0.68