Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HPV8

Protein Details
Accession C6HPV8    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-322EGSEEKRKRRDYRLARKAAFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-50KTPAKAASPPPPKR
308-320KRKRRDYRLARKA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSGSDSSSLSSPPSTDDETIAASVHRSIGLEKYFKPKTPAKAASPPPPKRAPSRHMNMCSQTSRHCGKFNACLSAIPMSKKLRDFIVMFRSRFSDVFPKSLPHYGPQDIEKGVTDSIPGDHIERLLCALIGLCLNRKRDVERGHYQRALEDVVQTHSSQWPRSWGGKNPLQGGGSFATMTPDERLTFLKALILWALSSSDAVQAKLKESYKQTRHDDDLNQPLSVQPWGNDAYKRRYWLIEGRDDTHFRLYRENNPALKNRTWWSVAGTISELKAVADSLSEEKSQHSKRLSEKIYTSIPRFEGSEEKRKRRDYRLARKAAFARPEPGYSLYEGRTRGKKLKYTYSDEDDDFSSDTAPTRKSARQSRFSTPNELPAGPTFTASGRQVKARVGGPYGESMLSGQRKDRPQLPSWSVGAGDEEVDGDVEQPVPNGGRPRRGTMVRLSNGAGSHIEGYNAGDEIDEESEASPSSGNEWDGDEIMIMETGMRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.23
4 0.22
5 0.23
6 0.23
7 0.2
8 0.16
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.1
14 0.11
15 0.17
16 0.22
17 0.26
18 0.28
19 0.37
20 0.41
21 0.43
22 0.49
23 0.5
24 0.53
25 0.59
26 0.63
27 0.62
28 0.67
29 0.71
30 0.75
31 0.78
32 0.77
33 0.74
34 0.74
35 0.71
36 0.71
37 0.74
38 0.7
39 0.7
40 0.73
41 0.76
42 0.74
43 0.76
44 0.72
45 0.69
46 0.66
47 0.59
48 0.53
49 0.51
50 0.51
51 0.48
52 0.47
53 0.44
54 0.44
55 0.51
56 0.5
57 0.49
58 0.43
59 0.4
60 0.38
61 0.4
62 0.38
63 0.3
64 0.33
65 0.31
66 0.35
67 0.36
68 0.36
69 0.31
70 0.33
71 0.33
72 0.34
73 0.4
74 0.43
75 0.41
76 0.41
77 0.41
78 0.38
79 0.36
80 0.33
81 0.32
82 0.27
83 0.32
84 0.32
85 0.32
86 0.33
87 0.38
88 0.35
89 0.3
90 0.33
91 0.31
92 0.33
93 0.32
94 0.32
95 0.27
96 0.27
97 0.23
98 0.19
99 0.17
100 0.14
101 0.12
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.12
120 0.17
121 0.19
122 0.23
123 0.24
124 0.27
125 0.33
126 0.39
127 0.41
128 0.47
129 0.53
130 0.56
131 0.58
132 0.55
133 0.48
134 0.43
135 0.37
136 0.27
137 0.21
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.18
144 0.2
145 0.19
146 0.19
147 0.21
148 0.24
149 0.31
150 0.34
151 0.36
152 0.42
153 0.45
154 0.48
155 0.45
156 0.44
157 0.38
158 0.33
159 0.29
160 0.22
161 0.17
162 0.14
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.25
196 0.34
197 0.37
198 0.45
199 0.49
200 0.48
201 0.5
202 0.51
203 0.49
204 0.45
205 0.47
206 0.4
207 0.35
208 0.3
209 0.27
210 0.24
211 0.21
212 0.16
213 0.08
214 0.09
215 0.12
216 0.13
217 0.16
218 0.19
219 0.24
220 0.26
221 0.27
222 0.26
223 0.24
224 0.26
225 0.29
226 0.3
227 0.31
228 0.31
229 0.31
230 0.33
231 0.33
232 0.31
233 0.31
234 0.29
235 0.22
236 0.27
237 0.27
238 0.32
239 0.38
240 0.43
241 0.4
242 0.42
243 0.46
244 0.45
245 0.43
246 0.39
247 0.34
248 0.31
249 0.29
250 0.26
251 0.23
252 0.22
253 0.21
254 0.18
255 0.17
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.1
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.18
272 0.2
273 0.24
274 0.25
275 0.28
276 0.33
277 0.42
278 0.43
279 0.4
280 0.4
281 0.39
282 0.42
283 0.41
284 0.38
285 0.32
286 0.3
287 0.26
288 0.25
289 0.23
290 0.25
291 0.27
292 0.36
293 0.41
294 0.48
295 0.54
296 0.62
297 0.67
298 0.67
299 0.72
300 0.73
301 0.76
302 0.79
303 0.81
304 0.75
305 0.74
306 0.71
307 0.66
308 0.6
309 0.5
310 0.44
311 0.36
312 0.36
313 0.32
314 0.29
315 0.25
316 0.21
317 0.22
318 0.19
319 0.21
320 0.22
321 0.25
322 0.28
323 0.31
324 0.37
325 0.41
326 0.45
327 0.48
328 0.56
329 0.57
330 0.6
331 0.61
332 0.6
333 0.57
334 0.51
335 0.47
336 0.37
337 0.32
338 0.24
339 0.18
340 0.13
341 0.1
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.18
347 0.22
348 0.3
349 0.39
350 0.46
351 0.53
352 0.58
353 0.65
354 0.69
355 0.68
356 0.68
357 0.59
358 0.58
359 0.52
360 0.46
361 0.39
362 0.31
363 0.33
364 0.25
365 0.24
366 0.18
367 0.15
368 0.19
369 0.19
370 0.24
371 0.21
372 0.24
373 0.26
374 0.27
375 0.31
376 0.3
377 0.3
378 0.26
379 0.26
380 0.24
381 0.24
382 0.23
383 0.19
384 0.15
385 0.13
386 0.18
387 0.2
388 0.2
389 0.21
390 0.27
391 0.32
392 0.37
393 0.43
394 0.43
395 0.46
396 0.55
397 0.56
398 0.54
399 0.5
400 0.46
401 0.39
402 0.33
403 0.28
404 0.19
405 0.15
406 0.09
407 0.09
408 0.07
409 0.08
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.12
419 0.21
420 0.24
421 0.33
422 0.36
423 0.42
424 0.48
425 0.51
426 0.52
427 0.52
428 0.59
429 0.52
430 0.51
431 0.46
432 0.41
433 0.38
434 0.36
435 0.27
436 0.18
437 0.18
438 0.16
439 0.15
440 0.12
441 0.13
442 0.13
443 0.12
444 0.1
445 0.08
446 0.08
447 0.09
448 0.1
449 0.09
450 0.08
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.08
456 0.07
457 0.1
458 0.12
459 0.13
460 0.13
461 0.15
462 0.16
463 0.16
464 0.16
465 0.13
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.08