Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SCN2

Protein Details
Accession R7SCN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-353VSSKYRDRDRDDRHERYREKBasic
389-422SSKYDKYDENRDREKRHRSREKERSRSPPKRRLVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
398-422NRDREKRHRSREKERSRSPPKRRLV
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
KEGG tms:TREMEDRAFT_45982  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGKMAEVQRRLLEQMMGPEAMGVAVINYDWWDDKVCRNYLFGTCPHNVFSNTKMDLGSCPKIHSDRILEQFKEAQAADPDDPRIASYKREHENNLYSFVEECDRRIRASQRKLEKTPEENRKTVDLMREIGEIELSIQGATEEVEALGEAGKVEESMEKLKAVDALKSLKTDKERELQVLNENAGASGHQKLRVCETCGAMLSVLDSDKRLADHFGGKLHLGYHELRKLLAQMAEDRMIGRQSHQNPSGPPPSAPSAPSGPRQTHLGPPGGPGLMGPPGIGNGAAPHTPMHPRVPPVDEMPLVGHGDKIRREAGELEEDLKEVKGEREREERHVSSKYRDRDRDDRHERYREKDGYDKYDRREDRDRGESHRSRDRDRDGERDRDRDRSSKYDKYDENRDREKRHRSREKERSRSPPKRRLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.24
4 0.21
5 0.19
6 0.17
7 0.14
8 0.12
9 0.07
10 0.04
11 0.04
12 0.04
13 0.04
14 0.04
15 0.06
16 0.07
17 0.08
18 0.12
19 0.14
20 0.22
21 0.29
22 0.33
23 0.33
24 0.34
25 0.37
26 0.37
27 0.39
28 0.36
29 0.35
30 0.34
31 0.34
32 0.34
33 0.34
34 0.33
35 0.31
36 0.3
37 0.32
38 0.3
39 0.3
40 0.28
41 0.26
42 0.28
43 0.32
44 0.35
45 0.28
46 0.29
47 0.32
48 0.34
49 0.35
50 0.36
51 0.36
52 0.37
53 0.45
54 0.5
55 0.46
56 0.46
57 0.47
58 0.42
59 0.39
60 0.31
61 0.25
62 0.21
63 0.25
64 0.24
65 0.22
66 0.23
67 0.2
68 0.2
69 0.18
70 0.2
71 0.17
72 0.21
73 0.26
74 0.33
75 0.39
76 0.44
77 0.47
78 0.49
79 0.56
80 0.52
81 0.51
82 0.42
83 0.37
84 0.32
85 0.3
86 0.27
87 0.2
88 0.2
89 0.21
90 0.22
91 0.22
92 0.27
93 0.36
94 0.41
95 0.5
96 0.57
97 0.61
98 0.68
99 0.71
100 0.74
101 0.72
102 0.7
103 0.7
104 0.72
105 0.68
106 0.62
107 0.6
108 0.55
109 0.5
110 0.44
111 0.4
112 0.31
113 0.27
114 0.26
115 0.24
116 0.22
117 0.19
118 0.16
119 0.11
120 0.09
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.21
156 0.2
157 0.24
158 0.26
159 0.27
160 0.3
161 0.3
162 0.31
163 0.31
164 0.29
165 0.29
166 0.27
167 0.23
168 0.18
169 0.16
170 0.13
171 0.12
172 0.1
173 0.07
174 0.1
175 0.11
176 0.13
177 0.15
178 0.15
179 0.22
180 0.24
181 0.26
182 0.25
183 0.24
184 0.22
185 0.21
186 0.21
187 0.14
188 0.11
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.14
211 0.15
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.12
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.16
229 0.19
230 0.26
231 0.28
232 0.3
233 0.3
234 0.35
235 0.38
236 0.32
237 0.28
238 0.25
239 0.26
240 0.25
241 0.24
242 0.21
243 0.2
244 0.22
245 0.27
246 0.28
247 0.26
248 0.26
249 0.29
250 0.29
251 0.3
252 0.3
253 0.28
254 0.24
255 0.24
256 0.24
257 0.2
258 0.18
259 0.13
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.07
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.12
276 0.15
277 0.18
278 0.19
279 0.22
280 0.25
281 0.27
282 0.27
283 0.27
284 0.28
285 0.24
286 0.22
287 0.2
288 0.19
289 0.17
290 0.15
291 0.14
292 0.12
293 0.16
294 0.17
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.2
299 0.21
300 0.22
301 0.23
302 0.22
303 0.22
304 0.2
305 0.2
306 0.19
307 0.17
308 0.14
309 0.1
310 0.14
311 0.18
312 0.21
313 0.26
314 0.35
315 0.39
316 0.45
317 0.53
318 0.51
319 0.49
320 0.53
321 0.52
322 0.51
323 0.56
324 0.58
325 0.59
326 0.64
327 0.67
328 0.7
329 0.75
330 0.78
331 0.79
332 0.8
333 0.79
334 0.82
335 0.78
336 0.74
337 0.75
338 0.69
339 0.64
340 0.63
341 0.6
342 0.59
343 0.65
344 0.65
345 0.6
346 0.65
347 0.63
348 0.61
349 0.65
350 0.62
351 0.59
352 0.63
353 0.61
354 0.58
355 0.66
356 0.66
357 0.63
358 0.67
359 0.64
360 0.61
361 0.67
362 0.68
363 0.66
364 0.66
365 0.69
366 0.67
367 0.72
368 0.72
369 0.72
370 0.67
371 0.66
372 0.66
373 0.63
374 0.63
375 0.62
376 0.64
377 0.63
378 0.66
379 0.67
380 0.69
381 0.69
382 0.74
383 0.73
384 0.74
385 0.76
386 0.78
387 0.77
388 0.79
389 0.83
390 0.83
391 0.85
392 0.87
393 0.86
394 0.89
395 0.92
396 0.93
397 0.93
398 0.92
399 0.92
400 0.92
401 0.94
402 0.93