Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SBY9

Protein Details
Accession R7SBY9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
424-447SGTNIPRGPKEKEKRVKVRFGEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
434-437EKEK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.5, nucl 10, mito 10, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008728  Elongator_complex_protein_4  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
KEGG tms:TREMEDRAFT_34882  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05625  PAXNEB  
CDD cd19494  Elp4  
Amino Acid Sequences MPSFTRRIPPSTPAPAGTHPSPSTSLPLISTGLPALDDLLGGGLPLSSILLVLSPDPHSSWGKLVSRYFLAQGLSTGQNVSVISGEEEGKELVKGCMWKVNEGSESEGEGIEDVDMGERGKIAWRYHSMNKFETTISTSNHLSLMHTIPSTTIQKMEAGNQLRYLPLTSQTDHISSSNKSGRGILEHVLLSLHDDIKKNGRKDQVGRYVLHDFGSADWGNLTADQIHRFLHSLRSLLKGTNSSAIITLPPWLVTSPPSDLERTEWVNSLSWSVDACIELRGFGDDPTLPILFPQSHGTFHLHSFPTSHTLLPPTLRHSSLLGISTTTSSASGGGGAGENNLSFRLKRKAFVIERMHLGVEGGIGERRTAPPPDSRADLPTEGVESSISGTNPHSHDIPTSSQVTNPSKEPNVSSTSISISTGQSGTNIPRGPKEKEKRVKVRFGEEEEIPIIEVSIGHDSQDEHRHEHKESLKQKQSIRHDRMDLYEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.51
4 0.46
5 0.45
6 0.37
7 0.37
8 0.36
9 0.33
10 0.34
11 0.28
12 0.28
13 0.21
14 0.23
15 0.21
16 0.19
17 0.18
18 0.14
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.03
31 0.03
32 0.03
33 0.04
34 0.03
35 0.03
36 0.03
37 0.04
38 0.05
39 0.05
40 0.08
41 0.09
42 0.11
43 0.12
44 0.16
45 0.18
46 0.19
47 0.21
48 0.26
49 0.29
50 0.34
51 0.35
52 0.35
53 0.35
54 0.35
55 0.34
56 0.29
57 0.25
58 0.2
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.12
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.11
81 0.13
82 0.13
83 0.19
84 0.19
85 0.22
86 0.23
87 0.26
88 0.26
89 0.25
90 0.28
91 0.22
92 0.22
93 0.19
94 0.18
95 0.13
96 0.11
97 0.1
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.1
108 0.15
109 0.16
110 0.21
111 0.25
112 0.31
113 0.4
114 0.47
115 0.47
116 0.45
117 0.46
118 0.43
119 0.38
120 0.34
121 0.31
122 0.27
123 0.24
124 0.24
125 0.22
126 0.21
127 0.21
128 0.2
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.16
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.16
142 0.17
143 0.19
144 0.23
145 0.23
146 0.24
147 0.24
148 0.24
149 0.22
150 0.21
151 0.19
152 0.13
153 0.14
154 0.16
155 0.15
156 0.17
157 0.19
158 0.19
159 0.19
160 0.19
161 0.17
162 0.15
163 0.21
164 0.24
165 0.23
166 0.23
167 0.23
168 0.23
169 0.23
170 0.24
171 0.19
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.22
184 0.28
185 0.29
186 0.33
187 0.37
188 0.39
189 0.44
190 0.52
191 0.53
192 0.51
193 0.5
194 0.48
195 0.45
196 0.4
197 0.35
198 0.26
199 0.16
200 0.13
201 0.16
202 0.12
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.05
210 0.06
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.19
225 0.16
226 0.15
227 0.17
228 0.16
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.14
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.11
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.09
278 0.08
279 0.1
280 0.13
281 0.12
282 0.13
283 0.15
284 0.18
285 0.17
286 0.18
287 0.23
288 0.19
289 0.18
290 0.19
291 0.18
292 0.2
293 0.2
294 0.19
295 0.14
296 0.16
297 0.17
298 0.19
299 0.19
300 0.19
301 0.21
302 0.22
303 0.21
304 0.2
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.1
313 0.09
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.11
331 0.2
332 0.21
333 0.23
334 0.26
335 0.35
336 0.38
337 0.48
338 0.51
339 0.45
340 0.46
341 0.46
342 0.43
343 0.32
344 0.29
345 0.19
346 0.12
347 0.09
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.09
353 0.11
354 0.14
355 0.16
356 0.18
357 0.23
358 0.27
359 0.3
360 0.32
361 0.32
362 0.31
363 0.33
364 0.31
365 0.26
366 0.22
367 0.2
368 0.16
369 0.15
370 0.12
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.16
378 0.18
379 0.2
380 0.19
381 0.17
382 0.19
383 0.22
384 0.24
385 0.23
386 0.25
387 0.24
388 0.24
389 0.32
390 0.35
391 0.34
392 0.33
393 0.35
394 0.34
395 0.35
396 0.36
397 0.32
398 0.33
399 0.32
400 0.31
401 0.27
402 0.26
403 0.25
404 0.24
405 0.21
406 0.17
407 0.17
408 0.16
409 0.15
410 0.13
411 0.15
412 0.17
413 0.21
414 0.24
415 0.23
416 0.3
417 0.35
418 0.41
419 0.49
420 0.56
421 0.61
422 0.69
423 0.78
424 0.82
425 0.85
426 0.88
427 0.83
428 0.83
429 0.79
430 0.76
431 0.7
432 0.6
433 0.55
434 0.46
435 0.4
436 0.3
437 0.23
438 0.16
439 0.11
440 0.1
441 0.08
442 0.12
443 0.11
444 0.11
445 0.12
446 0.14
447 0.2
448 0.28
449 0.29
450 0.31
451 0.37
452 0.41
453 0.43
454 0.5
455 0.52
456 0.53
457 0.59
458 0.64
459 0.67
460 0.7
461 0.73
462 0.75
463 0.78
464 0.79
465 0.78
466 0.76
467 0.72
468 0.69