Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SCD1

Protein Details
Accession R7SCD1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
506-527EISPRTRGKRDRQARSRLRALRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
512-521RGKRDRQARS
Subcellular Location(s) plas 21, mito 3, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027005  GlyclTrfase_39-like  
IPR003342  Glyco_trans_39/83  
IPR036300  MIR_dom_sf  
IPR016093  MIR_motif  
IPR032421  PMT_4TMC  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0004169  F:dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase activity  
KEGG tms:TREMEDRAFT_45551  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02815  MIR  
PF02366  PMT  
PF16192  PMT_4TMC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50919  MIR  
Amino Acid Sequences MPSISPPPSTHRRHPLSTPAPASTILSTPSISTYLGATRSGSPSYASDHTLGSGQARGGHDTPTVVGHTRESEADMRLQQKGFGKARNRAGTTIGLRKREWGLVIGVTALGLFVRGYKLWQPSSVVFDEVHFGGFAAKYIRRKFFMDVHPPLAKLLITLSAFIGGFDGQFDFKDIGKDYLEPHVPYIIMRSFPMLLGLALIPITFLTLIALRLSLATALLGSLLVTFDNALATQSRLILLDSYLVFFTALTTLFWVRFASLDASGSAFTPSWWRYLSLTGLGLGATMSCKWVGLFTIATVGLGTLRQLWLLLGNLKVTPRMWAKHFAARAWCLIVLPAVFYMAMFKIHFWILNMSGDGDGFMSSEFQHTLQGHGMDDTQADVGYGSIITLKHVHTQGGYLHSHAHAYPAGSQQQQITLYPHRDENNNWRITNGSSTDGPPSYSWDELPFGHVLNGGKIRLEHVITEKRLHSHDIRPPVSDVDFQNEVSGYGFPGFAGDANDDFIVEISPRTRGKRDRQARSRLRALRTEFRLRHALSGCYLFSHKVKLPEWGYEQQEVTCNKNPTWENSLWYIETNHHAQLPPDAEMVNYVRPSFFEKFFELQAVMWQTNAGLTERHAYDSRPSSWPVLRRGINFWVKDHRQVYLIGNPLVWWSSTAAIVLYLGMRSLLVLRQKRGFRDLYQPKIAFYDEVCSFLIIAWALHYLPFYLMQRQLFLHHYLPALYFSILLFCAAFDYATSKMRPRTRIQVAAVFLVLVIWSYAHFSPLTYGEPWTRGKCEKGKWLKTWDFSCSDFHEHSGMYNQHAVVSSQKIETGDHLGPDAQTTIIDEAPEPIKNIFIEAVEPEEKTIAPVGPANEVQMQESTEAISPEETQVVAHPEDLRIPVGLDAGSPEVTAAAEDDGGWHGGAEEGKREVDDGYDPTESDMTRGRKIVDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.73
3 0.71
4 0.72
5 0.67
6 0.58
7 0.53
8 0.48
9 0.44
10 0.35
11 0.29
12 0.22
13 0.19
14 0.17
15 0.16
16 0.17
17 0.16
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.15
22 0.16
23 0.17
24 0.17
25 0.19
26 0.22
27 0.23
28 0.21
29 0.2
30 0.2
31 0.24
32 0.24
33 0.24
34 0.22
35 0.21
36 0.21
37 0.21
38 0.2
39 0.16
40 0.16
41 0.14
42 0.18
43 0.19
44 0.23
45 0.22
46 0.24
47 0.23
48 0.22
49 0.22
50 0.19
51 0.19
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.19
56 0.2
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.22
61 0.25
62 0.28
63 0.29
64 0.32
65 0.32
66 0.33
67 0.35
68 0.43
69 0.43
70 0.46
71 0.51
72 0.55
73 0.64
74 0.68
75 0.65
76 0.57
77 0.55
78 0.54
79 0.52
80 0.54
81 0.5
82 0.47
83 0.44
84 0.47
85 0.47
86 0.43
87 0.38
88 0.3
89 0.27
90 0.23
91 0.23
92 0.19
93 0.15
94 0.12
95 0.1
96 0.08
97 0.05
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.06
102 0.07
103 0.1
104 0.16
105 0.22
106 0.24
107 0.26
108 0.29
109 0.29
110 0.35
111 0.34
112 0.3
113 0.23
114 0.22
115 0.23
116 0.19
117 0.17
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.17
125 0.24
126 0.3
127 0.36
128 0.37
129 0.4
130 0.43
131 0.48
132 0.53
133 0.56
134 0.55
135 0.56
136 0.55
137 0.53
138 0.48
139 0.4
140 0.3
141 0.2
142 0.16
143 0.14
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.06
156 0.07
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.13
161 0.14
162 0.16
163 0.16
164 0.18
165 0.18
166 0.23
167 0.26
168 0.24
169 0.23
170 0.22
171 0.21
172 0.2
173 0.22
174 0.18
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.16
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.04
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.1
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.08
255 0.07
256 0.12
257 0.12
258 0.14
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.18
263 0.19
264 0.16
265 0.16
266 0.14
267 0.13
268 0.12
269 0.1
270 0.08
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.12
304 0.11
305 0.14
306 0.16
307 0.19
308 0.21
309 0.27
310 0.3
311 0.35
312 0.37
313 0.34
314 0.35
315 0.33
316 0.32
317 0.25
318 0.22
319 0.16
320 0.15
321 0.13
322 0.09
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.03
372 0.03
373 0.04
374 0.05
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.12
379 0.13
380 0.14
381 0.12
382 0.14
383 0.15
384 0.17
385 0.17
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.09
393 0.09
394 0.11
395 0.13
396 0.15
397 0.15
398 0.16
399 0.15
400 0.16
401 0.16
402 0.15
403 0.15
404 0.16
405 0.18
406 0.19
407 0.21
408 0.21
409 0.22
410 0.24
411 0.3
412 0.35
413 0.37
414 0.36
415 0.33
416 0.32
417 0.31
418 0.31
419 0.23
420 0.16
421 0.13
422 0.14
423 0.16
424 0.15
425 0.15
426 0.12
427 0.15
428 0.14
429 0.14
430 0.13
431 0.13
432 0.14
433 0.13
434 0.15
435 0.11
436 0.09
437 0.09
438 0.11
439 0.1
440 0.1
441 0.12
442 0.1
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.09
449 0.13
450 0.18
451 0.19
452 0.22
453 0.21
454 0.21
455 0.22
456 0.25
457 0.23
458 0.24
459 0.28
460 0.34
461 0.35
462 0.34
463 0.34
464 0.32
465 0.29
466 0.26
467 0.21
468 0.17
469 0.17
470 0.16
471 0.15
472 0.14
473 0.13
474 0.1
475 0.1
476 0.06
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.05
494 0.04
495 0.08
496 0.11
497 0.13
498 0.18
499 0.26
500 0.34
501 0.45
502 0.54
503 0.61
504 0.68
505 0.77
506 0.8
507 0.79
508 0.8
509 0.76
510 0.7
511 0.66
512 0.62
513 0.59
514 0.57
515 0.59
516 0.51
517 0.48
518 0.5
519 0.44
520 0.44
521 0.38
522 0.32
523 0.24
524 0.25
525 0.21
526 0.16
527 0.17
528 0.13
529 0.12
530 0.15
531 0.16
532 0.2
533 0.2
534 0.26
535 0.27
536 0.29
537 0.33
538 0.34
539 0.35
540 0.31
541 0.31
542 0.25
543 0.29
544 0.27
545 0.27
546 0.28
547 0.27
548 0.25
549 0.32
550 0.32
551 0.31
552 0.36
553 0.32
554 0.28
555 0.29
556 0.31
557 0.25
558 0.24
559 0.21
560 0.16
561 0.17
562 0.17
563 0.15
564 0.15
565 0.15
566 0.14
567 0.17
568 0.17
569 0.15
570 0.14
571 0.13
572 0.11
573 0.13
574 0.14
575 0.13
576 0.12
577 0.11
578 0.1
579 0.11
580 0.17
581 0.18
582 0.18
583 0.19
584 0.22
585 0.23
586 0.24
587 0.24
588 0.19
589 0.15
590 0.17
591 0.17
592 0.13
593 0.12
594 0.11
595 0.1
596 0.1
597 0.11
598 0.08
599 0.05
600 0.06
601 0.11
602 0.11
603 0.14
604 0.14
605 0.14
606 0.19
607 0.24
608 0.26
609 0.25
610 0.26
611 0.28
612 0.31
613 0.36
614 0.35
615 0.38
616 0.38
617 0.37
618 0.4
619 0.44
620 0.46
621 0.42
622 0.39
623 0.41
624 0.4
625 0.45
626 0.42
627 0.35
628 0.3
629 0.31
630 0.32
631 0.28
632 0.29
633 0.22
634 0.21
635 0.2
636 0.19
637 0.17
638 0.14
639 0.1
640 0.07
641 0.07
642 0.08
643 0.08
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.06
648 0.05
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.05
655 0.08
656 0.15
657 0.19
658 0.22
659 0.29
660 0.33
661 0.35
662 0.4
663 0.4
664 0.36
665 0.44
666 0.5
667 0.5
668 0.55
669 0.53
670 0.48
671 0.46
672 0.44
673 0.33
674 0.25
675 0.23
676 0.15
677 0.17
678 0.17
679 0.15
680 0.14
681 0.13
682 0.14
683 0.08
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.07
689 0.07
690 0.06
691 0.07
692 0.1
693 0.1
694 0.14
695 0.18
696 0.18
697 0.2
698 0.2
699 0.22
700 0.22
701 0.25
702 0.22
703 0.2
704 0.2
705 0.19
706 0.19
707 0.18
708 0.16
709 0.13
710 0.11
711 0.09
712 0.1
713 0.09
714 0.09
715 0.07
716 0.05
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.05
721 0.07
722 0.09
723 0.13
724 0.14
725 0.18
726 0.25
727 0.32
728 0.38
729 0.41
730 0.48
731 0.53
732 0.59
733 0.58
734 0.57
735 0.52
736 0.47
737 0.42
738 0.32
739 0.23
740 0.16
741 0.12
742 0.06
743 0.04
744 0.03
745 0.03
746 0.06
747 0.07
748 0.08
749 0.08
750 0.09
751 0.11
752 0.13
753 0.16
754 0.14
755 0.16
756 0.17
757 0.21
758 0.26
759 0.27
760 0.3
761 0.31
762 0.37
763 0.42
764 0.46
765 0.53
766 0.6
767 0.65
768 0.67
769 0.73
770 0.73
771 0.73
772 0.69
773 0.64
774 0.57
775 0.5
776 0.47
777 0.41
778 0.4
779 0.34
780 0.32
781 0.28
782 0.25
783 0.24
784 0.28
785 0.24
786 0.21
787 0.23
788 0.22
789 0.21
790 0.22
791 0.22
792 0.19
793 0.21
794 0.2
795 0.17
796 0.2
797 0.19
798 0.19
799 0.2
800 0.22
801 0.2
802 0.18
803 0.19
804 0.18
805 0.17
806 0.17
807 0.16
808 0.1
809 0.08
810 0.1
811 0.1
812 0.1
813 0.11
814 0.1
815 0.12
816 0.15
817 0.16
818 0.16
819 0.14
820 0.16
821 0.15
822 0.16
823 0.14
824 0.12
825 0.13
826 0.12
827 0.17
828 0.16
829 0.16
830 0.15
831 0.15
832 0.15
833 0.15
834 0.16
835 0.11
836 0.11
837 0.14
838 0.15
839 0.18
840 0.18
841 0.2
842 0.21
843 0.21
844 0.21
845 0.19
846 0.19
847 0.15
848 0.15
849 0.14
850 0.13
851 0.13
852 0.12
853 0.12
854 0.12
855 0.13
856 0.13
857 0.12
858 0.1
859 0.12
860 0.16
861 0.15
862 0.16
863 0.16
864 0.16
865 0.19
866 0.2
867 0.19
868 0.15
869 0.15
870 0.13
871 0.13
872 0.12
873 0.1
874 0.1
875 0.11
876 0.11
877 0.1
878 0.09
879 0.08
880 0.08
881 0.08
882 0.07
883 0.06
884 0.06
885 0.06
886 0.07
887 0.08
888 0.09
889 0.09
890 0.08
891 0.07
892 0.09
893 0.12
894 0.12
895 0.14
896 0.15
897 0.16
898 0.16
899 0.17
900 0.15
901 0.15
902 0.17
903 0.16
904 0.18
905 0.19
906 0.19
907 0.2
908 0.22
909 0.2
910 0.19
911 0.25
912 0.25
913 0.29
914 0.31