Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SB39

Protein Details
Accession R7SB39    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-186KGNEERMKKWRESKKRRKLREERKQAVRRGFIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-183HGGKGGKGGKGNEERMKKWRESKKRRKLREERKQAVRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012341  6hp_glycosidase-like_sf  
IPR001382  Glyco_hydro_47  
IPR036026  Seven-hairpin_glycosidases  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0004571  F:mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG tms:TREMEDRAFT_66619  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01532  Glyco_hydro_47  
Amino Acid Sequences MEDDWEDFPFDDNSSNSDGGNDDDTKQQEEYIIVNGDHYFPHHIPSNIPPFTPHPTSLPEPNTILPEIDLENIRPPKENPFPENELDEVLSSTQEEVTGTGYYVSEDSWARNWEKPKVWDEERGEIRKVQWEGFDGIGTEVEDVKHGGKGGKGGKGNEERMKKWRESKKRRKLREERKQAVRRGFIHAWQGYKDHAWGHDEVKPVSQQPSNPFNNWGATIIDSLDTLLLLGFPEEYTLCRPHINQLNFHWISGRDWRHPYISPTLVVPTTDPDSSSQPLTIHRDHNIGLPVFETGIRYLGGLLGAYDLTGDQLLLDRAIDLAHILGRAFDTDSGLPAGRIDPGSPGGFRLGSVSAAEVGSMTLELIRLSQITKDRQWFDLSQRAIDFIENRIIPRVLHPPLVPLWFTPNSPFSQQLNGAISFGGLADSYYEYLIKTYKLLGGTTVSKQYSKLYSDSIDTARKVLLYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.19
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.21
8 0.2
9 0.17
10 0.22
11 0.24
12 0.26
13 0.26
14 0.24
15 0.21
16 0.2
17 0.2
18 0.18
19 0.19
20 0.16
21 0.17
22 0.18
23 0.17
24 0.16
25 0.16
26 0.19
27 0.16
28 0.21
29 0.25
30 0.25
31 0.27
32 0.35
33 0.43
34 0.37
35 0.37
36 0.37
37 0.36
38 0.42
39 0.43
40 0.37
41 0.3
42 0.34
43 0.39
44 0.43
45 0.42
46 0.39
47 0.37
48 0.37
49 0.37
50 0.32
51 0.28
52 0.2
53 0.19
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.14
58 0.21
59 0.24
60 0.25
61 0.26
62 0.26
63 0.32
64 0.4
65 0.46
66 0.42
67 0.46
68 0.5
69 0.5
70 0.51
71 0.43
72 0.35
73 0.29
74 0.25
75 0.19
76 0.14
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.1
95 0.13
96 0.17
97 0.19
98 0.24
99 0.28
100 0.33
101 0.39
102 0.42
103 0.44
104 0.48
105 0.49
106 0.53
107 0.53
108 0.55
109 0.56
110 0.54
111 0.51
112 0.45
113 0.43
114 0.41
115 0.39
116 0.31
117 0.25
118 0.24
119 0.24
120 0.22
121 0.21
122 0.15
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.15
137 0.19
138 0.23
139 0.26
140 0.26
141 0.33
142 0.37
143 0.43
144 0.44
145 0.45
146 0.42
147 0.47
148 0.52
149 0.49
150 0.53
151 0.57
152 0.62
153 0.68
154 0.77
155 0.8
156 0.85
157 0.91
158 0.92
159 0.93
160 0.93
161 0.93
162 0.93
163 0.91
164 0.91
165 0.89
166 0.84
167 0.8
168 0.75
169 0.66
170 0.62
171 0.55
172 0.46
173 0.46
174 0.41
175 0.35
176 0.3
177 0.29
178 0.22
179 0.21
180 0.19
181 0.13
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.16
186 0.18
187 0.19
188 0.18
189 0.19
190 0.18
191 0.17
192 0.19
193 0.18
194 0.18
195 0.22
196 0.3
197 0.31
198 0.31
199 0.32
200 0.3
201 0.29
202 0.27
203 0.22
204 0.14
205 0.12
206 0.11
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.02
217 0.02
218 0.03
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.17
229 0.25
230 0.26
231 0.27
232 0.28
233 0.37
234 0.36
235 0.36
236 0.31
237 0.23
238 0.24
239 0.28
240 0.29
241 0.24
242 0.27
243 0.28
244 0.29
245 0.3
246 0.31
247 0.29
248 0.27
249 0.23
250 0.21
251 0.21
252 0.18
253 0.17
254 0.14
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.16
266 0.21
267 0.23
268 0.23
269 0.23
270 0.24
271 0.24
272 0.26
273 0.26
274 0.21
275 0.17
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.09
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.07
316 0.06
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.11
330 0.13
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.1
357 0.16
358 0.22
359 0.27
360 0.34
361 0.36
362 0.38
363 0.42
364 0.41
365 0.42
366 0.45
367 0.4
368 0.36
369 0.34
370 0.33
371 0.29
372 0.28
373 0.23
374 0.17
375 0.22
376 0.2
377 0.21
378 0.23
379 0.23
380 0.21
381 0.24
382 0.29
383 0.25
384 0.28
385 0.27
386 0.28
387 0.3
388 0.33
389 0.29
390 0.22
391 0.26
392 0.24
393 0.25
394 0.26
395 0.26
396 0.26
397 0.29
398 0.32
399 0.27
400 0.32
401 0.32
402 0.33
403 0.34
404 0.31
405 0.28
406 0.23
407 0.21
408 0.15
409 0.13
410 0.09
411 0.05
412 0.04
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.08
419 0.1
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.13
424 0.16
425 0.17
426 0.17
427 0.18
428 0.21
429 0.24
430 0.27
431 0.32
432 0.3
433 0.29
434 0.3
435 0.34
436 0.35
437 0.34
438 0.33
439 0.3
440 0.3
441 0.33
442 0.36
443 0.37
444 0.37
445 0.34
446 0.33
447 0.3