Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HHP1

Protein Details
Accession C6HHP1    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-85QDINLSRLFRRKKKDSDGPPETTFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007603  Choline_transptr-like  
Gene Ontology GO:0005886  C:plasma membrane  
GO:0022857  F:transmembrane transporter activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04515  Choline_transpo  
Amino Acid Sequences MSQPSAQEDNTSANNPDEQPRDAAVAGDGAGEGAGGGKKKKNINISWPALKFSMGNLTVTFQDINLSRLFRRKKKDSDGPPETTFKEAFKLYKKEYFDIWASLLFLLNVLAFVALSSFVTDRYAKGVDFDGHIVNDPSNSIALDLNVVLLLSAVLPLAVSASVVYFLIFLFFTDKLVWVTGLLNVSASFGTGAVYLYRRQWAIGGVFTGLGLFAVIYFVNWIPRIPFTTVLLRSSAAVIRRHGSVNMICIMGSMLTVGFAALLFVTLVTTYIAFDPDETKPNPLCYNYRCKSIATKTLMTFSVLSAYWITEWIKNTMHATVAGAYGSWYFYGGNSKEMPTRPLRSASRRAITYSFGSICLGSLVVGVVDLLRQLCSISGQEVVADQTIVGRATTHVREIMSSLRRVTSVFNRYAFSHVVLYGKPYGLAAKYTWQMMEHHGIDALVNDSIAATTITLGSLFVAYLCAFVAYVELGYTTPDFNRTGRFTPAIMAYAFLCGFQICKVYMTPVVSGVDTTFMAMGLDPEVLVTQHPDLWEALLRVYPRIQDRINP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.32
4 0.32
5 0.31
6 0.31
7 0.31
8 0.31
9 0.28
10 0.26
11 0.19
12 0.16
13 0.14
14 0.11
15 0.09
16 0.06
17 0.06
18 0.05
19 0.04
20 0.05
21 0.07
22 0.09
23 0.13
24 0.18
25 0.24
26 0.31
27 0.38
28 0.46
29 0.51
30 0.59
31 0.65
32 0.68
33 0.71
34 0.66
35 0.63
36 0.53
37 0.48
38 0.38
39 0.29
40 0.31
41 0.22
42 0.22
43 0.2
44 0.21
45 0.21
46 0.22
47 0.2
48 0.11
49 0.15
50 0.14
51 0.16
52 0.17
53 0.19
54 0.2
55 0.29
56 0.38
57 0.42
58 0.52
59 0.59
60 0.66
61 0.74
62 0.81
63 0.83
64 0.85
65 0.85
66 0.81
67 0.76
68 0.71
69 0.62
70 0.55
71 0.46
72 0.36
73 0.31
74 0.28
75 0.29
76 0.33
77 0.39
78 0.4
79 0.46
80 0.49
81 0.47
82 0.46
83 0.46
84 0.4
85 0.34
86 0.3
87 0.24
88 0.21
89 0.19
90 0.17
91 0.12
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.14
113 0.17
114 0.15
115 0.16
116 0.18
117 0.16
118 0.15
119 0.16
120 0.15
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.06
197 0.04
198 0.03
199 0.02
200 0.02
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.2
216 0.21
217 0.21
218 0.21
219 0.18
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.14
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.18
228 0.18
229 0.17
230 0.18
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.13
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.07
239 0.06
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.08
263 0.09
264 0.13
265 0.13
266 0.16
267 0.16
268 0.18
269 0.19
270 0.19
271 0.22
272 0.22
273 0.32
274 0.31
275 0.35
276 0.34
277 0.33
278 0.38
279 0.38
280 0.42
281 0.37
282 0.38
283 0.34
284 0.35
285 0.35
286 0.29
287 0.25
288 0.17
289 0.14
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.15
303 0.14
304 0.13
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.11
319 0.11
320 0.14
321 0.14
322 0.16
323 0.2
324 0.21
325 0.24
326 0.24
327 0.27
328 0.27
329 0.33
330 0.37
331 0.4
332 0.48
333 0.51
334 0.5
335 0.48
336 0.48
337 0.43
338 0.4
339 0.35
340 0.29
341 0.23
342 0.18
343 0.18
344 0.15
345 0.13
346 0.11
347 0.09
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.11
380 0.12
381 0.13
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.15
386 0.22
387 0.22
388 0.23
389 0.22
390 0.22
391 0.22
392 0.22
393 0.25
394 0.27
395 0.29
396 0.31
397 0.32
398 0.33
399 0.34
400 0.36
401 0.33
402 0.26
403 0.21
404 0.18
405 0.18
406 0.16
407 0.18
408 0.17
409 0.16
410 0.14
411 0.13
412 0.14
413 0.12
414 0.14
415 0.12
416 0.15
417 0.16
418 0.17
419 0.17
420 0.16
421 0.17
422 0.2
423 0.25
424 0.21
425 0.2
426 0.2
427 0.19
428 0.18
429 0.17
430 0.14
431 0.08
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.06
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.05
457 0.05
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.09
465 0.12
466 0.14
467 0.15
468 0.21
469 0.24
470 0.27
471 0.31
472 0.32
473 0.3
474 0.31
475 0.32
476 0.28
477 0.23
478 0.21
479 0.16
480 0.16
481 0.16
482 0.12
483 0.11
484 0.08
485 0.09
486 0.09
487 0.12
488 0.1
489 0.11
490 0.12
491 0.15
492 0.19
493 0.2
494 0.2
495 0.2
496 0.21
497 0.19
498 0.19
499 0.16
500 0.14
501 0.12
502 0.12
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.08
508 0.06
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.09
516 0.09
517 0.11
518 0.12
519 0.13
520 0.13
521 0.15
522 0.18
523 0.16
524 0.16
525 0.18
526 0.18
527 0.19
528 0.21
529 0.25
530 0.27
531 0.33