FuNGI

R7S9J4

Protein Details

Accession

R7S9J4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1115-1136	ITTGKERDQKKKEEAEKEKEER	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	tms:TREMEDRAFT_65875 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MLGNIKERSSSISPPQPPSIKSGGSFPRAIHRSNRQNPISSPLDRSVHQTYVTPNPPLDKTPVRPTYDGRNHPDEVGRIRTEVNEENRRRVESMTEEEREQEVEDLQQRFGSRLLDLLRTRAQLRGFSRDPQLTPGPTSQIPPPQLTSTEITSPHQVEEQYPYLKNQIEPPVEVEDHLSHLKSIYFPTVPSEPDKLAWLQPLPSPSPNEDPTPRFDLTGSPVSSESTLSIPVSRGLHHHGSSPHLAGYTIDEVLWLCRSAMPSQRVTMFGVLSGIIRRYISFSLPKEAGRVAKEIGVVERGLELSLEGLKGKSNNILRASVDLLYTCIGSSETGHEQVYQRPILAHWDINNYELRRAIKISDLPWEELIPTLCKLLSTDILSPLSTSQLISILRLAARHSKSLADQLIPLFTPIAQHQILSRPWPLSASTNNEIDEPFNPPSIPTLSLLIEAITSSRLVARNITENSIPAGLLKFLVPSLWDASDSTHDLVHGVLTLLIQLGRYGLSSSFARSSRDIIEDLQRALIDRGDDTLLEKYWDLISIWTCCAVDPHRTTPEHDITWSQVISMGWEEDAFSQFDKMVKDENWGTVSSILWFLVSWTEGLRVNTPDRLTEWGQQVWKMLERTSIVHQLFERDDEIEGVEMKRALAGLSRLRRILNFDPYSRRVMTNERVDLREMWSRVLETDSLLSDHEKTREWQRRAFHLMRSFRQGEEPLALDLIDALLSIPSPTTSSSSPTRLQPDGNLLTTGEQPQVEEHSQMVELSSVDTNIPSERHKEENDPINFTILRPLYQHMILPDLQNVIGPIIPNHFYLPSTSTLRSLPLSPIRPDPSTPSPNTIHVSDNETIGETHSIPIRKEGLPLSPDWTFQPLRDLLRSAESEALQHAQNIIDWSPGEIEIVRAVLGLVQSQLLSCGFYEDDGKGGMNRSRLILGLMDVFMLEQNQSSSSSSTSHDEVFRDGLISSTIDHLLDLTIKPFPDHPDHTVNLEKLKVKLNEDGHGDRGQEKEKVGPLERGFSGVGTFYQYYSTLLSLHSSISVGHRAFTRVLLVPLSIKYPSDYKKLVWSHPDILKASNLANVKSGEVPVDEATSKWSLSSSSSFLSASPSHSSIEKVITTGKERDQKKKEEAEKEKEEREEIEKEEVEKEKESMMEEDLEVLWGYCRALGKCWVNERSFLWDMAIIHLDKFFFHSTGNVIKQVESSYKEEDVKSLGTDQFNDEKMSKKQLEERDRVKEKEKEKERMMRAIFSSGSSNVIRRLLGKVSNDEEKRRLEIIQSSCGSEIVQRVKNLMRSSTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.61
3	0.6
4	0.57
5	0.57
6	0.54
7	0.48
8	0.42
9	0.45
10	0.44
11	0.44
12	0.45
13	0.4
14	0.44
15	0.45
16	0.47
17	0.47
18	0.5
19	0.56
20	0.64
21	0.72
22	0.67
23	0.69
24	0.68
25	0.67
26	0.63
27	0.55
28	0.51
29	0.47
30	0.46
31	0.41
32	0.45
33	0.43
34	0.39
35	0.37
36	0.34
37	0.32
38	0.39
39	0.43
40	0.39
41	0.35
42	0.37
43	0.38
44	0.39
45	0.41
46	0.39
47	0.41
48	0.49
49	0.55
50	0.56
51	0.57
52	0.57
53	0.61
54	0.64
55	0.66
56	0.63
57	0.61
58	0.57
59	0.57
60	0.58
61	0.51
62	0.47
63	0.45
64	0.39
65	0.34
66	0.33
67	0.32
68	0.34
69	0.36
70	0.4
71	0.44
72	0.46
73	0.53
74	0.56
75	0.57
76	0.53
77	0.47
78	0.43
79	0.39
80	0.44
81	0.43
82	0.42
83	0.39
84	0.4
85	0.4
86	0.35
87	0.29
88	0.22
89	0.16
90	0.18
91	0.24
92	0.23
93	0.23
94	0.24
95	0.24
96	0.24
97	0.25
98	0.21
99	0.15
100	0.17
101	0.2
102	0.25
103	0.25
104	0.29
105	0.32
106	0.33
107	0.34
108	0.34
109	0.34
110	0.34
111	0.37
112	0.41
113	0.4
114	0.41
115	0.48
116	0.48
117	0.47
118	0.45
119	0.47
120	0.4
121	0.41
122	0.38
123	0.36
124	0.32
125	0.33
126	0.32
127	0.34
128	0.35
129	0.34
130	0.35
131	0.33
132	0.34
133	0.35
134	0.33
135	0.28
136	0.29
137	0.28
138	0.27
139	0.3
140	0.29
141	0.27
142	0.26
143	0.24
144	0.22
145	0.26
146	0.29
147	0.29
148	0.29
149	0.29
150	0.31
151	0.33
152	0.32
153	0.33
154	0.37
155	0.35
156	0.35
157	0.36
158	0.37
159	0.34
160	0.33
161	0.29
162	0.22
163	0.23
164	0.23
165	0.2
166	0.15
167	0.16
168	0.16
169	0.14
170	0.16
171	0.17
172	0.16
173	0.16
174	0.2
175	0.22
176	0.23
177	0.26
178	0.27
179	0.24
180	0.24
181	0.26
182	0.24
183	0.23
184	0.25
185	0.23
186	0.21
187	0.23
188	0.26
189	0.27
190	0.28
191	0.29
192	0.3
193	0.35
194	0.35
195	0.39
196	0.41
197	0.39
198	0.41
199	0.44
200	0.4
201	0.34
202	0.32
203	0.29
204	0.29
205	0.34
206	0.29
207	0.24
208	0.24
209	0.25
210	0.25
211	0.22
212	0.18
213	0.11
214	0.12
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.15
219	0.15
220	0.15
221	0.17
222	0.21
223	0.26
224	0.26
225	0.3
226	0.28
227	0.31
228	0.33
229	0.32
230	0.26
231	0.21
232	0.21
233	0.16
234	0.18
235	0.15
236	0.13
237	0.11
238	0.11
239	0.11
240	0.12
241	0.12
242	0.09
243	0.08
244	0.09
245	0.12
246	0.15
247	0.23
248	0.26
249	0.27
250	0.3
251	0.31
252	0.31
253	0.31
254	0.29
255	0.21
256	0.17
257	0.15
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.1
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.12
266	0.13
267	0.16
268	0.22
269	0.23
270	0.28
271	0.3
272	0.3
273	0.29
274	0.3
275	0.3
276	0.26
277	0.26
278	0.21
279	0.21
280	0.22
281	0.2
282	0.19
283	0.16
284	0.14
285	0.12
286	0.12
287	0.1
288	0.09
289	0.08
290	0.06
291	0.05
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.08
297	0.09
298	0.1
299	0.16
300	0.19
301	0.25
302	0.27
303	0.29
304	0.27
305	0.29
306	0.3
307	0.24
308	0.2
309	0.14
310	0.13
311	0.11
312	0.11
313	0.08
314	0.07
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.1
319	0.12
320	0.14
321	0.14
322	0.16
323	0.17
324	0.22
325	0.25
326	0.22
327	0.2
328	0.19
329	0.19
330	0.22
331	0.23
332	0.21
333	0.18
334	0.23
335	0.23
336	0.24
337	0.29
338	0.24
339	0.23
340	0.25
341	0.24
342	0.21
343	0.22
344	0.21
345	0.2
346	0.22
347	0.22
348	0.27
349	0.27
350	0.27
351	0.27
352	0.26
353	0.22
354	0.2
355	0.2
356	0.14
357	0.12
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.11
363	0.12
364	0.13
365	0.14
366	0.17
367	0.17
368	0.17
369	0.17
370	0.15
371	0.14
372	0.11
373	0.1
374	0.07
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.13
383	0.18
384	0.19
385	0.21
386	0.21
387	0.21
388	0.22
389	0.27
390	0.27
391	0.2
392	0.19
393	0.18
394	0.19
395	0.17
396	0.16
397	0.1
398	0.08
399	0.09
400	0.08
401	0.12
402	0.11
403	0.11
404	0.12
405	0.17
406	0.19
407	0.2
408	0.22
409	0.18
410	0.18
411	0.19
412	0.19
413	0.18
414	0.21
415	0.25
416	0.25
417	0.26
418	0.27
419	0.26
420	0.25
421	0.22
422	0.19
423	0.17
424	0.15
425	0.14
426	0.13
427	0.13
428	0.15
429	0.16
430	0.16
431	0.12
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.11
437	0.09
438	0.07
439	0.07
440	0.05
441	0.05
442	0.04
443	0.07
444	0.08
445	0.09
446	0.11
447	0.12
448	0.18
449	0.19
450	0.21
451	0.19
452	0.18
453	0.18
454	0.17
455	0.15
456	0.09
457	0.09
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.06
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.06
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.09
471	0.12
472	0.13
473	0.12
474	0.1
475	0.1
476	0.1
477	0.09
478	0.08
479	0.06
480	0.05
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.05
492	0.05
493	0.07
494	0.08
495	0.09
496	0.13
497	0.14
498	0.16
499	0.16
500	0.18
501	0.18
502	0.19
503	0.19
504	0.17
505	0.21
506	0.21
507	0.2
508	0.18
509	0.16
510	0.15
511	0.15
512	0.14
513	0.08
514	0.07
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.09
520	0.08
521	0.09
522	0.08
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.07
527	0.08
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.11
535	0.11
536	0.16
537	0.18
538	0.23
539	0.27
540	0.28
541	0.31
542	0.35
543	0.37
544	0.31
545	0.28
546	0.25
547	0.21
548	0.22
549	0.2
550	0.13
551	0.12
552	0.11
553	0.11
554	0.1
555	0.08
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.05
560	0.07
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.09
566	0.09
567	0.09
568	0.11
569	0.11
570	0.14
571	0.15
572	0.16
573	0.15
574	0.15
575	0.15
576	0.12
577	0.12
578	0.09
579	0.09
580	0.07
581	0.06
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.04
587	0.04
588	0.06
589	0.08
590	0.09
591	0.1
592	0.12
593	0.13
594	0.15
595	0.15
596	0.14
597	0.14
598	0.17
599	0.18
600	0.2
601	0.22
602	0.22
603	0.22
604	0.22
605	0.22
606	0.19
607	0.2
608	0.16
609	0.13
610	0.13
611	0.13
612	0.15
613	0.16
614	0.22
615	0.2
616	0.2
617	0.2
618	0.2
619	0.2
620	0.19
621	0.16
622	0.1
623	0.1
624	0.09
625	0.09
626	0.06
627	0.07
628	0.06
629	0.06
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.07
637	0.13
638	0.16
639	0.18
640	0.19
641	0.19
642	0.19
643	0.24
644	0.25
645	0.28
646	0.28
647	0.29
648	0.33
649	0.35
650	0.39
651	0.34
652	0.31
653	0.24
654	0.27
655	0.31
656	0.31
657	0.33
658	0.32
659	0.31
660	0.32
661	0.31
662	0.28
663	0.26
664	0.21
665	0.17
666	0.16
667	0.15
668	0.14
669	0.14
670	0.11
671	0.07
672	0.08
673	0.07
674	0.07
675	0.07
676	0.07
677	0.08
678	0.1
679	0.11
680	0.11
681	0.12
682	0.22
683	0.32
684	0.34
685	0.37
686	0.39
687	0.44
688	0.51
689	0.52
690	0.47
691	0.46
692	0.49
693	0.46
694	0.49
695	0.44
696	0.36
697	0.36
698	0.31
699	0.24
700	0.2
701	0.18
702	0.12
703	0.11
704	0.1
705	0.07
706	0.06
707	0.05
708	0.03
709	0.03
710	0.02
711	0.02
712	0.02
713	0.02
714	0.03
715	0.03
716	0.04
717	0.04
718	0.07
719	0.07
720	0.11
721	0.14
722	0.18
723	0.2
724	0.23
725	0.27
726	0.26
727	0.26
728	0.23
729	0.27
730	0.25
731	0.24
732	0.21
733	0.16
734	0.16
735	0.17
736	0.17
737	0.11
738	0.09
739	0.09
740	0.09
741	0.12
742	0.12
743	0.11
744	0.1
745	0.1
746	0.1
747	0.09
748	0.09
749	0.06
750	0.05
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.07
758	0.08
759	0.08
760	0.12
761	0.15
762	0.18
763	0.2
764	0.24
765	0.29
766	0.37
767	0.38
768	0.38
769	0.35
770	0.34
771	0.32
772	0.28
773	0.28
774	0.19
775	0.18
776	0.15
777	0.16
778	0.15
779	0.16
780	0.17
781	0.11
782	0.14
783	0.14
784	0.13
785	0.13
786	0.11
787	0.11
788	0.1
789	0.1
790	0.07
791	0.07
792	0.06
793	0.06
794	0.07
795	0.09
796	0.09
797	0.1
798	0.1
799	0.1
800	0.11
801	0.13
802	0.14
803	0.16
804	0.16
805	0.17
806	0.17
807	0.18
808	0.18
809	0.17
810	0.18
811	0.21
812	0.24
813	0.25
814	0.3
815	0.32
816	0.32
817	0.31
818	0.33
819	0.35
820	0.38
821	0.37
822	0.37
823	0.35
824	0.37
825	0.38
826	0.34
827	0.28
828	0.23
829	0.27
830	0.22
831	0.21
832	0.18
833	0.16
834	0.14
835	0.13
836	0.13
837	0.08
838	0.09
839	0.12
840	0.14
841	0.13
842	0.16
843	0.19
844	0.18
845	0.2
846	0.2
847	0.21
848	0.21
849	0.21
850	0.22
851	0.19
852	0.19
853	0.18
854	0.21
855	0.18
856	0.16
857	0.2
858	0.2
859	0.21
860	0.22
861	0.23
862	0.19
863	0.22
864	0.23
865	0.2
866	0.19
867	0.17
868	0.16
869	0.16
870	0.16
871	0.13
872	0.12
873	0.11
874	0.09
875	0.09
876	0.1
877	0.1
878	0.09
879	0.09
880	0.09
881	0.09
882	0.09
883	0.08
884	0.07
885	0.07
886	0.06
887	0.06
888	0.06
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.05
893	0.05
894	0.05
895	0.05
896	0.05
897	0.05
898	0.06
899	0.05
900	0.06
901	0.05
902	0.06
903	0.06
904	0.07
905	0.09
906	0.08
907	0.09
908	0.09
909	0.09
910	0.08
911	0.12
912	0.14
913	0.14
914	0.15
915	0.16
916	0.16
917	0.16
918	0.16
919	0.13
920	0.11
921	0.1
922	0.09
923	0.08
924	0.07
925	0.07
926	0.06
927	0.06
928	0.05
929	0.04
930	0.05
931	0.06
932	0.07
933	0.08
934	0.09
935	0.1
936	0.12
937	0.13
938	0.15
939	0.16
940	0.17
941	0.18
942	0.18
943	0.19
944	0.18
945	0.16
946	0.14
947	0.13
948	0.11
949	0.09
950	0.09
951	0.08
952	0.09
953	0.09
954	0.08
955	0.08
956	0.08
957	0.07
958	0.09
959	0.08
960	0.08
961	0.09
962	0.1
963	0.11
964	0.12
965	0.16
966	0.21
967	0.25
968	0.29
969	0.33
970	0.34
971	0.37
972	0.4
973	0.37
974	0.33
975	0.33
976	0.3
977	0.27
978	0.33
979	0.33
980	0.31
981	0.36
982	0.36
983	0.37
984	0.4
985	0.4
986	0.36
987	0.35
988	0.33
989	0.28
990	0.28
991	0.27
992	0.24
993	0.22
994	0.23
995	0.26
996	0.3
997	0.3
998	0.34
999	0.32
1000	0.34
1001	0.33
1002	0.31
1003	0.27
1004	0.22
1005	0.2
1006	0.13
1007	0.13
1008	0.12
1009	0.12
1010	0.1
1011	0.11
1012	0.11
1013	0.12
1014	0.12
1015	0.13
1016	0.1
1017	0.1
1018	0.11
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.09
1023	0.09
1024	0.11
1025	0.17
1026	0.15
1027	0.16
1028	0.17
1029	0.19
1030	0.2
1031	0.19
1032	0.2
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.17
1036	0.16
1037	0.16
1038	0.16
1039	0.17
1040	0.14
1041	0.13
1042	0.13
1043	0.19
1044	0.22
1045	0.27
1046	0.28
1047	0.27
1048	0.36
1049	0.41
1050	0.44
1051	0.44
1052	0.46
1053	0.47
1054	0.49
1055	0.53
1056	0.45
1057	0.42
1058	0.38
1059	0.33
1060	0.28
1061	0.25
1062	0.23
1063	0.18
1064	0.2
1065	0.19
1066	0.19
1067	0.19
1068	0.19
1069	0.15
1070	0.14
1071	0.15
1072	0.13
1073	0.14
1074	0.13
1075	0.12
1076	0.15
1077	0.15
1078	0.15
1079	0.13
1080	0.12
1081	0.11
1082	0.14
1083	0.17
1084	0.16
1085	0.16
1086	0.17
1087	0.17
1088	0.17
1089	0.21
1090	0.19
1091	0.19
1092	0.2
1093	0.21
1094	0.21
1095	0.21
1096	0.23
1097	0.2
1098	0.23
1099	0.2
1100	0.17
1101	0.2
1102	0.22
1103	0.26
1104	0.28
1105	0.34
1106	0.38
1107	0.44
1108	0.53
1109	0.57
1110	0.62
1111	0.66
1112	0.72
1113	0.74
1114	0.77
1115	0.8
1116	0.79
1117	0.81
1118	0.79
1119	0.76
1120	0.68
1121	0.61
1122	0.53
1123	0.49
1124	0.43
1125	0.36
1126	0.36
1127	0.32
1128	0.31
1129	0.35
1130	0.36
1131	0.33
1132	0.31
1133	0.29
1134	0.25
1135	0.24
1136	0.25
1137	0.21
1138	0.19
1139	0.18
1140	0.16
1141	0.17
1142	0.15
1143	0.14
1144	0.12
1145	0.1
1146	0.09
1147	0.08
1148	0.08
1149	0.08
1150	0.12
1151	0.12
1152	0.16
1153	0.24
1154	0.3
1155	0.35
1156	0.44
1157	0.49
1158	0.46
1159	0.49
1160	0.48
1161	0.48
1162	0.43
1163	0.37
1164	0.3
1165	0.26
1166	0.25
1167	0.24
1168	0.26
1169	0.18
1170	0.17
1171	0.18
1172	0.17
1173	0.14
1174	0.18
1175	0.17
1176	0.14
1177	0.14
1178	0.15
1179	0.18
1180	0.25
1181	0.28
1182	0.28
1183	0.26
1184	0.26
1185	0.27
1186	0.29
1187	0.3
1188	0.27
1189	0.28
1190	0.28
1191	0.31
1192	0.34
1193	0.33
1194	0.32
1195	0.3
1196	0.27
1197	0.25
1198	0.25
1199	0.25
1200	0.24
1201	0.25
1202	0.28
1203	0.3
1204	0.31
1205	0.32
1206	0.29
1207	0.31
1208	0.33
1209	0.41
1210	0.39
1211	0.39
1212	0.46
1213	0.53
1214	0.61
1215	0.65
1216	0.69
1217	0.7
1218	0.74
1219	0.74
1220	0.75
1221	0.72
1222	0.7
1223	0.71
1224	0.73
1225	0.72
1226	0.73
1227	0.78
1228	0.76
1229	0.77
1230	0.72
1231	0.67
1232	0.6
1233	0.55
1234	0.47
1235	0.38
1236	0.36
1237	0.27
1238	0.28
1239	0.24
1240	0.24
1241	0.23
1242	0.24
1243	0.23
1244	0.22
1245	0.25
1246	0.26
1247	0.3
1248	0.33
1249	0.35
1250	0.39
1251	0.48
1252	0.5
1253	0.52
1254	0.52
1255	0.51
1256	0.51
1257	0.46
1258	0.42
1259	0.37
1260	0.41
1261	0.4
1262	0.43
1263	0.41
1264	0.39
1265	0.37
1266	0.36
1267	0.32
1268	0.26
1269	0.29
1270	0.28
1271	0.32
1272	0.31
1273	0.35
1274	0.4
1275	0.46
1276	0.46

R7S9J4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer