Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SDZ3

Protein Details
Accession R7SDZ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
289-319HVVSPRKKTMKHDEKKRTKREKDRDEDNIERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-310RKKTMKHDEKKRTKREK
472-478PRKKKKV
Subcellular Location(s) mito 11, mito_nucl 10.833, nucl 9.5, cyto_mito 8.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013178  Histone_AcTrfase_Rtt109/CBP  
IPR016849  Rtt109  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0010484  F:histone H3 acetyltransferase activity  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0043618  P:regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress  
KEGG tms:TREMEDRAFT_35021  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08214  HAT_KAT11  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51728  RTT109_HAT  
Amino Acid Sequences PRTLVAALSAYRYTLGSTSILYISKVDSSGYAPSPLAYTRTLVISFLSYFLAGDLISTFESKSKQPKLIITLFARSQTRYLFPNSGEGEGNKVVLGGLKLCQWWKSVFEEVSMKYLLSQTSSTSSESFQRFTESLGAHIQPHSINDVRLSYLLPSYSEAEAKGMLGLPRRPIPEWLKWEYSPPFIQPLFPASSGDPHTKPPKSFHNMYDQTKSLGNIIPSLPDDPKTRFLEELVLSFSKPTLQPPPPPQSQSQNLASTSTHITENNLTSAPAPKSEISPEWKITSQNDHVVSPRKKTMKHDEKKRTKREKDRDEDNIERQRSYNALSEISMKEFWERMGFRQECSSGDVTGFFSLTIYEETVRATSEKEMTGTISTEHENMLDIRKERKGEDPHLPPLVLSRLLETLLNLDFSTTSAGLESSATWLNSVENIVKSEIGVDGWESCKGFIPAKIGMGVIEKKRVEREVTILQPRKKKKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.11
4 0.12
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.15
13 0.13
14 0.12
15 0.13
16 0.17
17 0.18
18 0.19
19 0.17
20 0.17
21 0.19
22 0.19
23 0.19
24 0.16
25 0.16
26 0.15
27 0.18
28 0.18
29 0.16
30 0.16
31 0.16
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.09
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.1
47 0.13
48 0.17
49 0.27
50 0.32
51 0.37
52 0.41
53 0.46
54 0.51
55 0.54
56 0.56
57 0.5
58 0.49
59 0.45
60 0.46
61 0.42
62 0.36
63 0.33
64 0.29
65 0.28
66 0.26
67 0.3
68 0.28
69 0.27
70 0.33
71 0.33
72 0.32
73 0.3
74 0.28
75 0.27
76 0.24
77 0.23
78 0.15
79 0.13
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.08
84 0.08
85 0.1
86 0.12
87 0.13
88 0.15
89 0.15
90 0.17
91 0.18
92 0.22
93 0.26
94 0.24
95 0.26
96 0.29
97 0.28
98 0.29
99 0.27
100 0.22
101 0.17
102 0.19
103 0.16
104 0.13
105 0.13
106 0.11
107 0.15
108 0.16
109 0.17
110 0.16
111 0.17
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.2
116 0.23
117 0.21
118 0.22
119 0.26
120 0.19
121 0.2
122 0.21
123 0.22
124 0.19
125 0.19
126 0.19
127 0.14
128 0.15
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.12
153 0.13
154 0.16
155 0.19
156 0.22
157 0.22
158 0.27
159 0.31
160 0.35
161 0.4
162 0.42
163 0.42
164 0.4
165 0.45
166 0.4
167 0.39
168 0.32
169 0.27
170 0.27
171 0.23
172 0.23
173 0.18
174 0.2
175 0.18
176 0.18
177 0.18
178 0.13
179 0.16
180 0.19
181 0.22
182 0.19
183 0.22
184 0.29
185 0.31
186 0.32
187 0.33
188 0.39
189 0.42
190 0.45
191 0.43
192 0.47
193 0.5
194 0.52
195 0.52
196 0.43
197 0.38
198 0.35
199 0.32
200 0.23
201 0.18
202 0.15
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.13
208 0.11
209 0.12
210 0.14
211 0.15
212 0.22
213 0.23
214 0.24
215 0.22
216 0.22
217 0.24
218 0.22
219 0.2
220 0.16
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.15
229 0.18
230 0.23
231 0.3
232 0.37
233 0.38
234 0.41
235 0.41
236 0.4
237 0.41
238 0.41
239 0.38
240 0.33
241 0.3
242 0.29
243 0.26
244 0.22
245 0.2
246 0.16
247 0.13
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.12
254 0.1
255 0.1
256 0.15
257 0.14
258 0.12
259 0.14
260 0.13
261 0.14
262 0.16
263 0.19
264 0.19
265 0.22
266 0.23
267 0.24
268 0.25
269 0.25
270 0.25
271 0.28
272 0.26
273 0.27
274 0.27
275 0.25
276 0.27
277 0.35
278 0.36
279 0.34
280 0.38
281 0.37
282 0.39
283 0.45
284 0.53
285 0.55
286 0.62
287 0.7
288 0.74
289 0.81
290 0.88
291 0.92
292 0.92
293 0.91
294 0.92
295 0.92
296 0.92
297 0.88
298 0.86
299 0.83
300 0.8
301 0.76
302 0.73
303 0.7
304 0.61
305 0.54
306 0.46
307 0.39
308 0.32
309 0.29
310 0.26
311 0.19
312 0.18
313 0.18
314 0.21
315 0.21
316 0.22
317 0.2
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.17
323 0.17
324 0.18
325 0.28
326 0.28
327 0.27
328 0.31
329 0.31
330 0.26
331 0.29
332 0.28
333 0.18
334 0.18
335 0.18
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.09
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.11
353 0.13
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.14
360 0.13
361 0.12
362 0.13
363 0.13
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.12
368 0.15
369 0.18
370 0.19
371 0.23
372 0.28
373 0.3
374 0.31
375 0.38
376 0.42
377 0.43
378 0.51
379 0.52
380 0.54
381 0.55
382 0.53
383 0.43
384 0.39
385 0.36
386 0.28
387 0.22
388 0.18
389 0.16
390 0.17
391 0.17
392 0.14
393 0.13
394 0.12
395 0.12
396 0.1
397 0.1
398 0.09
399 0.09
400 0.12
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.12
415 0.14
416 0.15
417 0.14
418 0.16
419 0.17
420 0.16
421 0.16
422 0.16
423 0.14
424 0.1
425 0.09
426 0.08
427 0.1
428 0.11
429 0.14
430 0.13
431 0.14
432 0.17
433 0.19
434 0.21
435 0.21
436 0.24
437 0.24
438 0.25
439 0.26
440 0.22
441 0.21
442 0.24
443 0.28
444 0.26
445 0.32
446 0.32
447 0.34
448 0.39
449 0.43
450 0.41
451 0.38
452 0.42
453 0.43
454 0.5
455 0.58
456 0.62
457 0.65
458 0.7