Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SAE1

Protein Details
Accession R7SAE1    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-188DAEGDAKPRKPRQKRERRRQPDEGGDEBasic
195-221GENGLKSKAKPRKPRTKKPAREARIDEBasic
279-299RVKSAKVVRGRRNPLGRKSFFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-155AQRRKENREKRAAAKKEG
167-181AKPRKPRQKRERRRQ
198-216GLKSKAKPRKPRTKKPARE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.333, nucl 12, cyto 11.5, mito_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tms:TREMEDRAFT_65587  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MVTTDALDHELWVVDELHAFSHVTRSESGRIRIHFTRIMSVQEEIPNGAEALAAAPQVEEGPKVYVGNLSYTATEDEVREFMSQAGGEITSVELPQRFNRPSGYAFVGYKTLEQAQKAVEELNEKIRMQVARSKEESAQRRKENREKRAAAKKEGAEATTTDAEGDAKPRKPRQKRERRRQPDEGGDETLVEKEGENGLKSKAKPRKPRTKKPAREARIDEVEGEVSAAEGQVTTKERPRKPRMQLTGEASPTTIFVANLPFNVDDAALAAIFTNLSIRVKSAKVVRGRRNPLGRKSFFASKGFGFVEVEDHAQQQEAVDKVEGCMIGERKISAKIANQMKPVEEEQVAEAEAEAAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.11
7 0.1
8 0.15
9 0.16
10 0.17
11 0.19
12 0.23
13 0.29
14 0.35
15 0.41
16 0.42
17 0.42
18 0.47
19 0.48
20 0.5
21 0.47
22 0.42
23 0.42
24 0.37
25 0.39
26 0.34
27 0.32
28 0.3
29 0.28
30 0.27
31 0.22
32 0.2
33 0.17
34 0.15
35 0.14
36 0.1
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.12
53 0.12
54 0.14
55 0.15
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.15
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.1
82 0.13
83 0.2
84 0.21
85 0.22
86 0.25
87 0.27
88 0.27
89 0.29
90 0.3
91 0.25
92 0.24
93 0.24
94 0.23
95 0.21
96 0.19
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.17
102 0.15
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.11
107 0.12
108 0.13
109 0.17
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.25
117 0.23
118 0.26
119 0.28
120 0.3
121 0.3
122 0.38
123 0.44
124 0.48
125 0.53
126 0.55
127 0.61
128 0.68
129 0.74
130 0.76
131 0.76
132 0.77
133 0.74
134 0.74
135 0.77
136 0.73
137 0.68
138 0.64
139 0.56
140 0.51
141 0.47
142 0.39
143 0.29
144 0.24
145 0.22
146 0.16
147 0.15
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.12
153 0.14
154 0.17
155 0.22
156 0.29
157 0.39
158 0.48
159 0.59
160 0.66
161 0.73
162 0.81
163 0.87
164 0.92
165 0.92
166 0.92
167 0.89
168 0.84
169 0.8
170 0.74
171 0.65
172 0.55
173 0.45
174 0.37
175 0.28
176 0.22
177 0.14
178 0.09
179 0.06
180 0.05
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.15
187 0.16
188 0.24
189 0.31
190 0.39
191 0.5
192 0.59
193 0.68
194 0.75
195 0.85
196 0.87
197 0.9
198 0.91
199 0.91
200 0.92
201 0.85
202 0.83
203 0.77
204 0.72
205 0.66
206 0.57
207 0.46
208 0.36
209 0.31
210 0.22
211 0.17
212 0.1
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.06
220 0.09
221 0.1
222 0.17
223 0.26
224 0.32
225 0.42
226 0.51
227 0.59
228 0.65
229 0.73
230 0.76
231 0.73
232 0.74
233 0.7
234 0.67
235 0.59
236 0.5
237 0.4
238 0.31
239 0.25
240 0.2
241 0.14
242 0.08
243 0.07
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.11
267 0.12
268 0.17
269 0.22
270 0.28
271 0.36
272 0.46
273 0.55
274 0.62
275 0.69
276 0.74
277 0.78
278 0.79
279 0.8
280 0.81
281 0.74
282 0.68
283 0.67
284 0.66
285 0.6
286 0.55
287 0.48
288 0.38
289 0.4
290 0.36
291 0.31
292 0.23
293 0.19
294 0.18
295 0.16
296 0.18
297 0.14
298 0.15
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.11
303 0.15
304 0.13
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.17
310 0.16
311 0.12
312 0.17
313 0.17
314 0.19
315 0.2
316 0.21
317 0.2
318 0.24
319 0.25
320 0.23
321 0.27
322 0.33
323 0.41
324 0.45
325 0.48
326 0.47
327 0.47
328 0.48
329 0.44
330 0.4
331 0.31
332 0.27
333 0.23
334 0.23
335 0.21
336 0.17
337 0.15