Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SD04

Protein Details
Accession R7SD04    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-337EEEVGAKRARRKKREREKGKKKQLPLLABasic
1041-1061FEEVEKKGKGGKKRKRVEVRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
315-331AKRARRKKREREKGKKK
1046-1058KKGKGGKKRKRVE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.833, cyto_mito 9.166, nucl 9, mito 8.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG tms:TREMEDRAFT_72445  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04003  Utp12  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MVKSYFRHGPTQAFGVITSPTANCAYDGKLAYVPAWEDVLVWDMKLGEMVSMWHSPSLISPITRLLPSPSSNQTFAVAYQDGSIRLWSSSPPTEIVTFNGHRKSPTFLAWDDQGTRLASGGTEGEIVIWDVVGEVGLYRLKGHRGAITGLKLIPSTKMRGSGWLVSCSRDNYLKLWDLSTQHCVQTVVVGRGEVVSLDIIEEVIGLGDEDTEVHAEEEGVDEENQKRGRWLVVTGSGDGEAKVWTIEKSDLARGLKTTDGELGTFVKPLCSLPLPSNTQPISQISFHPTLPLLLLQNGERTITVLRIRTEEEVGAKRARRKKREREKGKKKQLPLLASATNKSGLTEKGDDVGEEGVEKGTEGGEEEEGDDGDQVKWEEKLTSLCVVRTNAKIRSFAFDEEVGKGGVSVLVQLSNNSLETYTLPLPSSSSRKLKNQSTEPIKTHSLELPGHRQDPRTLCISSDDQVIASASSGTLKLWNSRTTACLRTMECGYALCSTFLPGDRHVVIGTKTGELALYDIAGSTLLESYKVHKGPIWGIQVRPDGRGLVSCSGDHDVKFFDFSFIEEEEQEPSQVLDKSSSNPPSTNGLKYNAANGKPAKDITRVTGVMEDNRDSRSTRIKPKRLTLIHTRTLKLTDDILSIRFSPNGKLLAVALLDTTVKLFFTDTLKFFLSLYGHRLPVLSMDISDDNKLLVTCGADKSVKIWGLDFGDCHRSLYAHDESVMSVRWEKGGHMFWSVGKDGLLKYWDGDKFELVQTLRGHQAEIWSLAVSNNSSYVVTSSHDKSIRIWEKTDEPLFLEEEREKELEQMYDTNLVDSLNPRVEKEGGEEVEGVGKQTNESLIDGEKIVEALEVAERERKGLEEWRVENGLATNSNDPSSITVQSTSVVGDQSKVITDENGEVKNLTEKPTRPTELESANMSGGQYVYKVVKGVKTAGMEDALVGLSFGSAMSLLRYLNEWAKDNIDPILTARIARFILSTHSTQLVVSRDPIIRSIISSLRTNLRKNLTMERDRVGYNLAGLRYLKGKYELESGSTFVDTFEEVEKKGKGGKKRKRVEVRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.23
4 0.18
5 0.16
6 0.12
7 0.13
8 0.15
9 0.15
10 0.14
11 0.16
12 0.18
13 0.22
14 0.23
15 0.22
16 0.23
17 0.23
18 0.22
19 0.22
20 0.21
21 0.16
22 0.16
23 0.13
24 0.12
25 0.12
26 0.15
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.11
38 0.13
39 0.14
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.2
49 0.23
50 0.23
51 0.23
52 0.23
53 0.25
54 0.27
55 0.32
56 0.36
57 0.38
58 0.38
59 0.38
60 0.36
61 0.31
62 0.29
63 0.29
64 0.21
65 0.17
66 0.17
67 0.18
68 0.17
69 0.16
70 0.17
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.2
77 0.21
78 0.22
79 0.24
80 0.25
81 0.26
82 0.26
83 0.28
84 0.29
85 0.33
86 0.37
87 0.36
88 0.36
89 0.36
90 0.4
91 0.36
92 0.37
93 0.35
94 0.31
95 0.34
96 0.34
97 0.37
98 0.32
99 0.3
100 0.27
101 0.23
102 0.22
103 0.18
104 0.15
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.08
126 0.11
127 0.14
128 0.16
129 0.19
130 0.21
131 0.22
132 0.26
133 0.29
134 0.3
135 0.29
136 0.27
137 0.26
138 0.23
139 0.21
140 0.23
141 0.21
142 0.23
143 0.22
144 0.27
145 0.27
146 0.31
147 0.35
148 0.38
149 0.38
150 0.4
151 0.39
152 0.36
153 0.38
154 0.34
155 0.33
156 0.3
157 0.28
158 0.24
159 0.29
160 0.31
161 0.3
162 0.3
163 0.3
164 0.29
165 0.3
166 0.34
167 0.31
168 0.26
169 0.27
170 0.26
171 0.22
172 0.25
173 0.26
174 0.22
175 0.2
176 0.2
177 0.18
178 0.18
179 0.18
180 0.12
181 0.08
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.1
209 0.12
210 0.18
211 0.2
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.22
216 0.21
217 0.22
218 0.2
219 0.25
220 0.27
221 0.26
222 0.25
223 0.23
224 0.21
225 0.19
226 0.15
227 0.09
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.09
233 0.1
234 0.12
235 0.14
236 0.17
237 0.21
238 0.22
239 0.23
240 0.21
241 0.22
242 0.21
243 0.19
244 0.18
245 0.16
246 0.15
247 0.14
248 0.15
249 0.16
250 0.14
251 0.15
252 0.14
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.14
257 0.13
258 0.14
259 0.16
260 0.23
261 0.29
262 0.3
263 0.36
264 0.34
265 0.33
266 0.33
267 0.31
268 0.28
269 0.23
270 0.24
271 0.23
272 0.24
273 0.23
274 0.22
275 0.2
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.11
280 0.1
281 0.12
282 0.11
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.13
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.2
295 0.21
296 0.21
297 0.19
298 0.21
299 0.21
300 0.23
301 0.26
302 0.28
303 0.34
304 0.42
305 0.51
306 0.57
307 0.65
308 0.73
309 0.8
310 0.87
311 0.91
312 0.93
313 0.95
314 0.96
315 0.96
316 0.93
317 0.86
318 0.83
319 0.78
320 0.7
321 0.63
322 0.57
323 0.51
324 0.45
325 0.41
326 0.34
327 0.28
328 0.24
329 0.2
330 0.17
331 0.13
332 0.16
333 0.17
334 0.16
335 0.17
336 0.17
337 0.16
338 0.15
339 0.14
340 0.1
341 0.08
342 0.08
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.11
368 0.11
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.18
373 0.19
374 0.22
375 0.25
376 0.28
377 0.3
378 0.31
379 0.33
380 0.31
381 0.34
382 0.33
383 0.29
384 0.26
385 0.22
386 0.22
387 0.2
388 0.19
389 0.15
390 0.12
391 0.11
392 0.08
393 0.07
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.06
406 0.07
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.12
413 0.14
414 0.19
415 0.21
416 0.26
417 0.29
418 0.36
419 0.42
420 0.48
421 0.52
422 0.53
423 0.57
424 0.59
425 0.61
426 0.56
427 0.53
428 0.49
429 0.42
430 0.38
431 0.31
432 0.26
433 0.23
434 0.24
435 0.27
436 0.28
437 0.3
438 0.29
439 0.29
440 0.3
441 0.31
442 0.3
443 0.26
444 0.24
445 0.21
446 0.23
447 0.23
448 0.19
449 0.18
450 0.16
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.08
455 0.06
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.07
462 0.07
463 0.11
464 0.14
465 0.16
466 0.17
467 0.18
468 0.21
469 0.22
470 0.24
471 0.22
472 0.23
473 0.22
474 0.22
475 0.22
476 0.2
477 0.16
478 0.14
479 0.13
480 0.11
481 0.11
482 0.09
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.11
487 0.12
488 0.11
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.11
495 0.13
496 0.13
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.08
502 0.08
503 0.05
504 0.04
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.04
514 0.04
515 0.07
516 0.13
517 0.13
518 0.13
519 0.14
520 0.16
521 0.17
522 0.23
523 0.26
524 0.23
525 0.22
526 0.26
527 0.3
528 0.29
529 0.28
530 0.22
531 0.16
532 0.15
533 0.16
534 0.14
535 0.12
536 0.12
537 0.11
538 0.12
539 0.13
540 0.14
541 0.13
542 0.11
543 0.1
544 0.09
545 0.11
546 0.1
547 0.08
548 0.08
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.1
556 0.1
557 0.09
558 0.07
559 0.07
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.13
566 0.18
567 0.22
568 0.21
569 0.2
570 0.22
571 0.25
572 0.27
573 0.27
574 0.24
575 0.23
576 0.25
577 0.24
578 0.29
579 0.28
580 0.26
581 0.28
582 0.26
583 0.26
584 0.25
585 0.26
586 0.22
587 0.2
588 0.2
589 0.18
590 0.22
591 0.2
592 0.19
593 0.22
594 0.2
595 0.19
596 0.2
597 0.19
598 0.15
599 0.15
600 0.16
601 0.13
602 0.15
603 0.22
604 0.27
605 0.37
606 0.46
607 0.53
608 0.57
609 0.62
610 0.7
611 0.64
612 0.63
613 0.63
614 0.6
615 0.6
616 0.58
617 0.53
618 0.45
619 0.43
620 0.39
621 0.29
622 0.23
623 0.17
624 0.14
625 0.14
626 0.14
627 0.13
628 0.13
629 0.12
630 0.13
631 0.12
632 0.12
633 0.14
634 0.14
635 0.13
636 0.13
637 0.12
638 0.12
639 0.11
640 0.09
641 0.07
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.05
650 0.06
651 0.09
652 0.12
653 0.13
654 0.16
655 0.17
656 0.17
657 0.17
658 0.17
659 0.16
660 0.14
661 0.19
662 0.18
663 0.18
664 0.18
665 0.18
666 0.15
667 0.15
668 0.16
669 0.1
670 0.07
671 0.09
672 0.11
673 0.12
674 0.12
675 0.11
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.07
680 0.06
681 0.06
682 0.07
683 0.08
684 0.11
685 0.11
686 0.11
687 0.12
688 0.16
689 0.17
690 0.15
691 0.15
692 0.15
693 0.17
694 0.18
695 0.17
696 0.15
697 0.18
698 0.18
699 0.19
700 0.16
701 0.14
702 0.14
703 0.2
704 0.2
705 0.15
706 0.16
707 0.15
708 0.15
709 0.16
710 0.16
711 0.11
712 0.1
713 0.1
714 0.11
715 0.11
716 0.11
717 0.15
718 0.18
719 0.18
720 0.18
721 0.18
722 0.18
723 0.21
724 0.21
725 0.17
726 0.13
727 0.13
728 0.12
729 0.13
730 0.13
731 0.1
732 0.1
733 0.16
734 0.18
735 0.19
736 0.19
737 0.18
738 0.19
739 0.2
740 0.23
741 0.17
742 0.21
743 0.19
744 0.21
745 0.24
746 0.22
747 0.21
748 0.18
749 0.19
750 0.16
751 0.16
752 0.14
753 0.1
754 0.11
755 0.1
756 0.11
757 0.09
758 0.08
759 0.08
760 0.08
761 0.08
762 0.07
763 0.08
764 0.08
765 0.09
766 0.13
767 0.15
768 0.2
769 0.22
770 0.22
771 0.23
772 0.33
773 0.4
774 0.38
775 0.37
776 0.35
777 0.37
778 0.43
779 0.43
780 0.33
781 0.27
782 0.26
783 0.26
784 0.23
785 0.22
786 0.17
787 0.16
788 0.18
789 0.18
790 0.16
791 0.16
792 0.18
793 0.15
794 0.15
795 0.15
796 0.14
797 0.18
798 0.17
799 0.16
800 0.15
801 0.14
802 0.13
803 0.13
804 0.15
805 0.16
806 0.17
807 0.17
808 0.19
809 0.2
810 0.2
811 0.23
812 0.25
813 0.21
814 0.22
815 0.21
816 0.19
817 0.21
818 0.2
819 0.16
820 0.11
821 0.11
822 0.1
823 0.1
824 0.11
825 0.09
826 0.1
827 0.1
828 0.1
829 0.11
830 0.11
831 0.11
832 0.1
833 0.09
834 0.08
835 0.07
836 0.06
837 0.05
838 0.07
839 0.07
840 0.08
841 0.13
842 0.13
843 0.14
844 0.14
845 0.14
846 0.16
847 0.23
848 0.29
849 0.32
850 0.34
851 0.37
852 0.39
853 0.37
854 0.35
855 0.29
856 0.25
857 0.19
858 0.19
859 0.18
860 0.17
861 0.18
862 0.17
863 0.16
864 0.16
865 0.17
866 0.17
867 0.15
868 0.15
869 0.15
870 0.15
871 0.15
872 0.13
873 0.11
874 0.11
875 0.1
876 0.1
877 0.1
878 0.1
879 0.11
880 0.11
881 0.11
882 0.1
883 0.11
884 0.15
885 0.19
886 0.19
887 0.18
888 0.17
889 0.18
890 0.24
891 0.24
892 0.24
893 0.26
894 0.28
895 0.33
896 0.41
897 0.44
898 0.4
899 0.43
900 0.44
901 0.41
902 0.41
903 0.38
904 0.32
905 0.29
906 0.27
907 0.22
908 0.17
909 0.14
910 0.11
911 0.08
912 0.09
913 0.1
914 0.1
915 0.13
916 0.14
917 0.17
918 0.19
919 0.22
920 0.24
921 0.25
922 0.25
923 0.25
924 0.23
925 0.2
926 0.18
927 0.15
928 0.11
929 0.08
930 0.07
931 0.05
932 0.04
933 0.04
934 0.04
935 0.03
936 0.03
937 0.04
938 0.05
939 0.06
940 0.06
941 0.07
942 0.09
943 0.12
944 0.17
945 0.2
946 0.22
947 0.23
948 0.27
949 0.27
950 0.27
951 0.25
952 0.21
953 0.18
954 0.16
955 0.2
956 0.17
957 0.17
958 0.16
959 0.18
960 0.18
961 0.18
962 0.17
963 0.13
964 0.18
965 0.21
966 0.22
967 0.21
968 0.22
969 0.22
970 0.22
971 0.25
972 0.23
973 0.21
974 0.21
975 0.24
976 0.25
977 0.26
978 0.27
979 0.26
980 0.23
981 0.22
982 0.25
983 0.24
984 0.24
985 0.26
986 0.29
987 0.35
988 0.4
989 0.43
990 0.46
991 0.49
992 0.52
993 0.53
994 0.6
995 0.6
996 0.62
997 0.62
998 0.58
999 0.54
1000 0.48
1001 0.45
1002 0.38
1003 0.28
1004 0.24
1005 0.25
1006 0.22
1007 0.22
1008 0.22
1009 0.23
1010 0.24
1011 0.25
1012 0.24
1013 0.25
1014 0.26
1015 0.26
1016 0.32
1017 0.31
1018 0.31
1019 0.31
1020 0.3
1021 0.26
1022 0.25
1023 0.22
1024 0.15
1025 0.15
1026 0.12
1027 0.12
1028 0.16
1029 0.16
1030 0.17
1031 0.21
1032 0.22
1033 0.23
1034 0.3
1035 0.34
1036 0.4
1037 0.49
1038 0.59
1039 0.65
1040 0.74
1041 0.84