FuNGI

R7SCX0

Protein Details

Accession

R7SCX0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MTHRPEKRTRKGKATGHAGPS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-13	KRTRKGK

Subcellular Location(s)

mito 20, nucl 3, cyto 3, cyto_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011047 Quinoprotein_ADH-like_supfam IPR007319 SSU_processome_Utp21 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat
Gene Ontology	GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	tms:TREMEDRAFT_45592 -
Pfam	View protein in Pfam PF04192 Utp21 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MTHRPEKRTRKGKATGHAGPSQPPPSSRLFAPFRALGHVSNHVPFSMFVHSSRGALAKPSVNIVTSIGRSWMMWEAGRMGLLFVGPDSGEQITSLAQTGTDVYAACGNGVTRYLRGKAVGRYESGGDKVGKILIFGEQLVGLTEDGGGLLIWDIQSKELVNKIQFPPTFKATVLLHPATYLNKILIGDSQGQLALYNTRTCSLIHNFTPTSSPITALVQSPAIDVVGVGHLDGTVDIYDIREGESIMQMKMDDGGISALSFRMDGVPVLAAGSTSGSVALWDLSKEGRILHVLRGAHEQSVGALEWVPGQPLFITSSGDNTVKQWLCDSPDSPPRLLKHRGGHHSPPTLIRYYGTDGKQILTSGRDRSLRYTSVVRDSRSHELSQGQSFHKRSKALGMSVSELKLAPITALSSCSIRSKDWDDVLTAHQDEPGARTWKVLDKKMGGHLLEVDDGVVQAVCVSACGNFGIIGSSTGEIKMWNMQSGKHRRTYHLNGLLGTGTSKVTKKSKGETLRQQGAAITGLATDALNTVVVASTIEGKIYFFDFHTTKLLHRLALPSPITALDLQRDSGLLSATCDDLIVRLVDVETRRVVRELRGFKGRILDTTFSPDSRWLIAASLDSAIRTFDIPTGRLIDAFQVPSIPTSLTFSPTGDFLATSHVDSLGVHLWANRAQFTDVPLKAIDEEAELIQSNLPSVRDDTSSGLEDLVGFSGEVGLPEFVDSYETPEQLEDGLVTLSLMPRSRWQTLLNLDTIRERNKPKVPPKAPEKAPFFLPTVSGLETRFDLSTQIEGEKVERIGGLGGFSGHGGLGGLLESEFTKRLEADGGDYTSFFTYLKSLSPSNADLEIRSLSSLSHLSILLTALTARLASKKDYEAVHAFTAVFLQIHGDVLVGNSELLEGLVKLREAQREAGKRIGEMLGYAQGTLTFLRGGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.8
3	0.76
4	0.74
5	0.66
6	0.6
7	0.59
8	0.54
9	0.47
10	0.4
11	0.38
12	0.38
13	0.39
14	0.36
15	0.38
16	0.39
17	0.4
18	0.44
19	0.43
20	0.38
21	0.4
22	0.4
23	0.34
24	0.33
25	0.35
26	0.33
27	0.32
28	0.32
29	0.26
30	0.25
31	0.23
32	0.22
33	0.22
34	0.2
35	0.18
36	0.23
37	0.24
38	0.23
39	0.25
40	0.24
41	0.19
42	0.2
43	0.24
44	0.23
45	0.23
46	0.26
47	0.25
48	0.24
49	0.24
50	0.23
51	0.23
52	0.2
53	0.2
54	0.18
55	0.17
56	0.16
57	0.18
58	0.19
59	0.17
60	0.16
61	0.17
62	0.18
63	0.18
64	0.18
65	0.16
66	0.12
67	0.1
68	0.09
69	0.08
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.08
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.09
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.08
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.11
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.1
95	0.1
96	0.12
97	0.13
98	0.13
99	0.17
100	0.19
101	0.2
102	0.24
103	0.28
104	0.31
105	0.38
106	0.38
107	0.36
108	0.36
109	0.37
110	0.36
111	0.32
112	0.3
113	0.23
114	0.2
115	0.2
116	0.21
117	0.18
118	0.16
119	0.15
120	0.13
121	0.13
122	0.12
123	0.12
124	0.09
125	0.09
126	0.09
127	0.1
128	0.07
129	0.06
130	0.06
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.04
135	0.03
136	0.03
137	0.04
138	0.04
139	0.06
140	0.06
141	0.07
142	0.08
143	0.09
144	0.11
145	0.15
146	0.2
147	0.2
148	0.27
149	0.29
150	0.36
151	0.38
152	0.41
153	0.41
154	0.41
155	0.4
156	0.33
157	0.36
158	0.29
159	0.33
160	0.34
161	0.3
162	0.26
163	0.25
164	0.27
165	0.24
166	0.24
167	0.19
168	0.13
169	0.13
170	0.14
171	0.13
172	0.13
173	0.14
174	0.15
175	0.15
176	0.15
177	0.13
178	0.13
179	0.13
180	0.12
181	0.12
182	0.11
183	0.13
184	0.13
185	0.14
186	0.15
187	0.15
188	0.2
189	0.23
190	0.27
191	0.27
192	0.32
193	0.31
194	0.31
195	0.33
196	0.28
197	0.27
198	0.21
199	0.21
200	0.16
201	0.18
202	0.19
203	0.17
204	0.17
205	0.13
206	0.13
207	0.12
208	0.11
209	0.09
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.11
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.11
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.07
240	0.05
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.05
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.06
270	0.06
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.11
276	0.12
277	0.14
278	0.18
279	0.17
280	0.19
281	0.23
282	0.23
283	0.2
284	0.19
285	0.16
286	0.12
287	0.13
288	0.12
289	0.07
290	0.06
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.08
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.09
300	0.07
301	0.09
302	0.08
303	0.11
304	0.13
305	0.14
306	0.13
307	0.12
308	0.2
309	0.18
310	0.18
311	0.18
312	0.17
313	0.2
314	0.22
315	0.22
316	0.2
317	0.27
318	0.29
319	0.29
320	0.31
321	0.3
322	0.35
323	0.39
324	0.4
325	0.4
326	0.46
327	0.53
328	0.55
329	0.59
330	0.59
331	0.57
332	0.52
333	0.48
334	0.42
335	0.37
336	0.31
337	0.24
338	0.2
339	0.21
340	0.26
341	0.23
342	0.23
343	0.22
344	0.22
345	0.22
346	0.2
347	0.17
348	0.14
349	0.16
350	0.15
351	0.19
352	0.21
353	0.22
354	0.25
355	0.28
356	0.27
357	0.27
358	0.28
359	0.26
360	0.32
361	0.35
362	0.33
363	0.32
364	0.35
365	0.38
366	0.37
367	0.35
368	0.27
369	0.27
370	0.28
371	0.28
372	0.27
373	0.24
374	0.28
375	0.3
376	0.32
377	0.32
378	0.31
379	0.28
380	0.32
381	0.32
382	0.28
383	0.29
384	0.26
385	0.25
386	0.26
387	0.25
388	0.18
389	0.15
390	0.13
391	0.1
392	0.09
393	0.06
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.08
401	0.1
402	0.11
403	0.11
404	0.14
405	0.17
406	0.19
407	0.21
408	0.2
409	0.19
410	0.19
411	0.2
412	0.19
413	0.16
414	0.13
415	0.12
416	0.11
417	0.1
418	0.11
419	0.14
420	0.15
421	0.14
422	0.14
423	0.15
424	0.21
425	0.25
426	0.27
427	0.26
428	0.25
429	0.27
430	0.3
431	0.32
432	0.26
433	0.22
434	0.2
435	0.17
436	0.15
437	0.13
438	0.09
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.04
443	0.03
444	0.02
445	0.02
446	0.02
447	0.02
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.08
466	0.08
467	0.11
468	0.11
469	0.14
470	0.23
471	0.32
472	0.35
473	0.39
474	0.41
475	0.41
476	0.49
477	0.53
478	0.53
479	0.51
480	0.49
481	0.41
482	0.4
483	0.37
484	0.28
485	0.22
486	0.13
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.11
491	0.15
492	0.2
493	0.23
494	0.27
495	0.35
496	0.41
497	0.48
498	0.53
499	0.58
500	0.58
501	0.55
502	0.51
503	0.43
504	0.36
505	0.29
506	0.19
507	0.11
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.04
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.06
528	0.07
529	0.07
530	0.06
531	0.1
532	0.1
533	0.12
534	0.15
535	0.15
536	0.15
537	0.21
538	0.21
539	0.18
540	0.19
541	0.21
542	0.19
543	0.24
544	0.24
545	0.17
546	0.17
547	0.16
548	0.16
549	0.14
550	0.13
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.09
555	0.09
556	0.08
557	0.08
558	0.08
559	0.06
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.05
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.07
573	0.08
574	0.09
575	0.11
576	0.12
577	0.13
578	0.14
579	0.15
580	0.17
581	0.25
582	0.28
583	0.31
584	0.36
585	0.37
586	0.36
587	0.42
588	0.38
589	0.32
590	0.31
591	0.29
592	0.23
593	0.29
594	0.28
595	0.22
596	0.22
597	0.21
598	0.18
599	0.17
600	0.17
601	0.11
602	0.1
603	0.1
604	0.1
605	0.09
606	0.09
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.06
612	0.07
613	0.06
614	0.08
615	0.1
616	0.11
617	0.12
618	0.16
619	0.15
620	0.15
621	0.15
622	0.14
623	0.15
624	0.14
625	0.13
626	0.1
627	0.1
628	0.1
629	0.11
630	0.09
631	0.07
632	0.1
633	0.11
634	0.13
635	0.13
636	0.13
637	0.13
638	0.13
639	0.13
640	0.1
641	0.09
642	0.07
643	0.11
644	0.11
645	0.11
646	0.11
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.11
651	0.09
652	0.08
653	0.08
654	0.09
655	0.1
656	0.12
657	0.13
658	0.12
659	0.12
660	0.13
661	0.13
662	0.16
663	0.23
664	0.21
665	0.22
666	0.21
667	0.2
668	0.19
669	0.19
670	0.16
671	0.08
672	0.09
673	0.08
674	0.08
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.07
680	0.08
681	0.08
682	0.08
683	0.1
684	0.12
685	0.12
686	0.14
687	0.16
688	0.17
689	0.18
690	0.17
691	0.15
692	0.14
693	0.12
694	0.11
695	0.09
696	0.07
697	0.05
698	0.04
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.06
707	0.05
708	0.08
709	0.07
710	0.13
711	0.16
712	0.16
713	0.16
714	0.16
715	0.16
716	0.14
717	0.14
718	0.07
719	0.06
720	0.06
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.06
725	0.08
726	0.09
727	0.1
728	0.16
729	0.21
730	0.24
731	0.26
732	0.26
733	0.31
734	0.36
735	0.38
736	0.36
737	0.32
738	0.31
739	0.34
740	0.35
741	0.33
742	0.34
743	0.35
744	0.39
745	0.47
746	0.56
747	0.6
748	0.67
749	0.7
750	0.73
751	0.77
752	0.79
753	0.78
754	0.77
755	0.74
756	0.66
757	0.62
758	0.56
759	0.49
760	0.4
761	0.33
762	0.27
763	0.23
764	0.22
765	0.19
766	0.17
767	0.16
768	0.16
769	0.17
770	0.15
771	0.13
772	0.12
773	0.12
774	0.14
775	0.14
776	0.13
777	0.12
778	0.13
779	0.14
780	0.15
781	0.14
782	0.12
783	0.11
784	0.11
785	0.11
786	0.11
787	0.1
788	0.07
789	0.08
790	0.07
791	0.07
792	0.07
793	0.05
794	0.05
795	0.04
796	0.04
797	0.04
798	0.04
799	0.04
800	0.04
801	0.04
802	0.05
803	0.07
804	0.08
805	0.08
806	0.1
807	0.1
808	0.11
809	0.13
810	0.14
811	0.16
812	0.19
813	0.2
814	0.19
815	0.19
816	0.2
817	0.17
818	0.17
819	0.13
820	0.1
821	0.09
822	0.1
823	0.13
824	0.15
825	0.16
826	0.17
827	0.21
828	0.22
829	0.23
830	0.26
831	0.24
832	0.21
833	0.23
834	0.22
835	0.19
836	0.17
837	0.15
838	0.11
839	0.13
840	0.14
841	0.12
842	0.12
843	0.12
844	0.12
845	0.12
846	0.13
847	0.1
848	0.09
849	0.08
850	0.06
851	0.07
852	0.07
853	0.07
854	0.11
855	0.13
856	0.16
857	0.19
858	0.22
859	0.27
860	0.28
861	0.33
862	0.33
863	0.35
864	0.33
865	0.31
866	0.28
867	0.23
868	0.23
869	0.17
870	0.12
871	0.08
872	0.09
873	0.08
874	0.09
875	0.09
876	0.08
877	0.07
878	0.07
879	0.08
880	0.07
881	0.06
882	0.06
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.05
888	0.07
889	0.08
890	0.09
891	0.12
892	0.17
893	0.22
894	0.25
895	0.31
896	0.39
897	0.46
898	0.5
899	0.52
900	0.49
901	0.44
902	0.44
903	0.39
904	0.3
905	0.23
906	0.21
907	0.2
908	0.19
909	0.18
910	0.15
911	0.13
912	0.14
913	0.14
914	0.12

R7SCX0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer