Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SB10

Protein Details
Accession R7SB10    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-280EDGYVRDVKNKRKRVPRAEGDVGHBasic
322-347STESQIPSGRKRKEPRKSGTWATQSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
331-338RKRKEPRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011513  Nse1  
IPR014857  Nse1_RING_C4HC3-type  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG tms:TREMEDRAFT_74710  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07574  SMC_Nse1  
PF08746  zf-RING-like  
CDD cd16493  RING-CH-C4HC3_NSE1  
Amino Acid Sequences MSYTEPTDLHRVYIQCLLSRRAMTEDVALEMYKRAISACQALNADFHPAHPRTAAGFKSFLDEIGHMLEEVGMNVREGREEIGKGRQWIVLCNTDPSDVALSATDLTPLEITFYREMIAEIMESYPANSIGHNRAIALVNRLDGSLTRSAAEAVLRALVSRGWLAKSNRGRYSLAPRAMLELENYLRGEYDGLHNCGRCKKLMLTGVACTNPKCNTHIHGFCHEALLRTRPQCPACKIPFAEQAPRPIGEASVRREEDGYVRDVKNKRKRVPRAEGDVGHSGSESEHSSPQQPESPQHDETQTQTQTQQELSESREGTEEVSTESQIPSGRKRKEPRKSGTWATQSPAGKGRMSRVPETQYDEDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.33
4 0.35
5 0.35
6 0.35
7 0.34
8 0.32
9 0.31
10 0.28
11 0.28
12 0.25
13 0.21
14 0.21
15 0.19
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.11
20 0.1
21 0.09
22 0.1
23 0.13
24 0.18
25 0.19
26 0.22
27 0.23
28 0.24
29 0.25
30 0.24
31 0.26
32 0.2
33 0.2
34 0.24
35 0.24
36 0.24
37 0.23
38 0.24
39 0.22
40 0.28
41 0.29
42 0.23
43 0.24
44 0.23
45 0.27
46 0.25
47 0.23
48 0.19
49 0.17
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.15
69 0.22
70 0.25
71 0.26
72 0.27
73 0.28
74 0.25
75 0.28
76 0.29
77 0.28
78 0.26
79 0.27
80 0.26
81 0.24
82 0.24
83 0.21
84 0.19
85 0.13
86 0.12
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.06
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.08
97 0.08
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.12
104 0.1
105 0.09
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.09
117 0.12
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.15
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.11
130 0.09
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.13
151 0.15
152 0.22
153 0.3
154 0.35
155 0.37
156 0.39
157 0.4
158 0.37
159 0.45
160 0.44
161 0.39
162 0.34
163 0.31
164 0.3
165 0.29
166 0.27
167 0.18
168 0.13
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.11
178 0.12
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.19
183 0.23
184 0.24
185 0.19
186 0.19
187 0.18
188 0.23
189 0.27
190 0.28
191 0.26
192 0.26
193 0.28
194 0.27
195 0.26
196 0.21
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.19
203 0.27
204 0.31
205 0.32
206 0.33
207 0.35
208 0.33
209 0.34
210 0.31
211 0.24
212 0.21
213 0.22
214 0.23
215 0.22
216 0.25
217 0.27
218 0.3
219 0.35
220 0.38
221 0.44
222 0.42
223 0.46
224 0.45
225 0.45
226 0.49
227 0.46
228 0.49
229 0.42
230 0.44
231 0.4
232 0.38
233 0.35
234 0.27
235 0.24
236 0.21
237 0.24
238 0.23
239 0.28
240 0.29
241 0.28
242 0.28
243 0.28
244 0.27
245 0.25
246 0.23
247 0.22
248 0.22
249 0.3
250 0.35
251 0.45
252 0.51
253 0.59
254 0.64
255 0.69
256 0.78
257 0.81
258 0.86
259 0.84
260 0.83
261 0.8
262 0.74
263 0.68
264 0.62
265 0.52
266 0.41
267 0.33
268 0.24
269 0.17
270 0.16
271 0.13
272 0.11
273 0.13
274 0.14
275 0.19
276 0.2
277 0.23
278 0.27
279 0.27
280 0.32
281 0.37
282 0.41
283 0.39
284 0.39
285 0.39
286 0.36
287 0.37
288 0.39
289 0.34
290 0.29
291 0.3
292 0.3
293 0.29
294 0.28
295 0.26
296 0.2
297 0.2
298 0.22
299 0.26
300 0.24
301 0.23
302 0.23
303 0.22
304 0.21
305 0.19
306 0.16
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.18
314 0.21
315 0.27
316 0.36
317 0.42
318 0.5
319 0.61
320 0.7
321 0.77
322 0.84
323 0.83
324 0.83
325 0.84
326 0.83
327 0.82
328 0.81
329 0.73
330 0.67
331 0.65
332 0.57
333 0.53
334 0.51
335 0.44
336 0.38
337 0.37
338 0.39
339 0.4
340 0.44
341 0.45
342 0.45
343 0.47
344 0.49
345 0.55