Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SB02

Protein Details
Accession R7SB02    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-199GLEEKERRKEERKRKREEKKEEEMLSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-51KGLKPK
177-196KERRKEERKRKREEKKEEEM
199-199K
204-207GKKN
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG tms:TREMEDRAFT_65395  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12874  zf-met  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSEKRDGAAPPPTRKQWDKDEWAAKAKEKDEEAIEKAKSAEAALAKGLKPKFKDKEDLPKPTKNMQQRTEDVGLNKDLNKTMLVQTTSTGKGPKGPGFYCDLCNRTLKDSLSYLDHLNGRMHLLHLGQSTKVSRSTLAQVREKIRQLREESSSRVTAKNFDFNARLEQVRNDGLEEKERRKEERKRKREEKKEEEMLSKMGVLGKKNKKDEEVEKAQKDNEDITTMMGFGGFGGVKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.65
3 0.65
4 0.67
5 0.67
6 0.69
7 0.7
8 0.67
9 0.7
10 0.67
11 0.62
12 0.59
13 0.53
14 0.49
15 0.42
16 0.41
17 0.37
18 0.38
19 0.36
20 0.36
21 0.34
22 0.3
23 0.28
24 0.26
25 0.22
26 0.17
27 0.17
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.17
32 0.16
33 0.23
34 0.25
35 0.26
36 0.29
37 0.37
38 0.43
39 0.45
40 0.52
41 0.52
42 0.61
43 0.65
44 0.72
45 0.69
46 0.67
47 0.67
48 0.66
49 0.67
50 0.65
51 0.65
52 0.6
53 0.61
54 0.57
55 0.6
56 0.56
57 0.51
58 0.43
59 0.37
60 0.33
61 0.27
62 0.26
63 0.21
64 0.18
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.16
73 0.18
74 0.19
75 0.18
76 0.17
77 0.13
78 0.17
79 0.2
80 0.23
81 0.24
82 0.23
83 0.24
84 0.28
85 0.29
86 0.28
87 0.28
88 0.26
89 0.23
90 0.25
91 0.25
92 0.22
93 0.24
94 0.21
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.18
99 0.19
100 0.16
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.13
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.09
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.12
122 0.18
123 0.21
124 0.26
125 0.29
126 0.33
127 0.36
128 0.4
129 0.43
130 0.43
131 0.4
132 0.41
133 0.41
134 0.4
135 0.42
136 0.4
137 0.4
138 0.37
139 0.38
140 0.33
141 0.31
142 0.28
143 0.28
144 0.27
145 0.3
146 0.28
147 0.27
148 0.27
149 0.26
150 0.3
151 0.28
152 0.27
153 0.21
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.2
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.25
162 0.29
163 0.31
164 0.37
165 0.39
166 0.44
167 0.5
168 0.6
169 0.63
170 0.69
171 0.74
172 0.78
173 0.86
174 0.91
175 0.93
176 0.93
177 0.91
178 0.89
179 0.88
180 0.82
181 0.75
182 0.66
183 0.56
184 0.45
185 0.36
186 0.27
187 0.22
188 0.2
189 0.2
190 0.28
191 0.37
192 0.44
193 0.51
194 0.53
195 0.54
196 0.59
197 0.63
198 0.62
199 0.64
200 0.65
201 0.62
202 0.62
203 0.6
204 0.54
205 0.49
206 0.42
207 0.33
208 0.26
209 0.22
210 0.21
211 0.19
212 0.17
213 0.14
214 0.11
215 0.09
216 0.06
217 0.08
218 0.07