Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SCR3

Protein Details
Accession R7SCR3    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-26VAKYQRRKALRDKVEKAWLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 8.5, cyto_nucl 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG tms:TREMEDRAFT_35522  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MSRADYVAKYQRRKALRDKVEKAWLDEPQRPGGQLDSSMKKHTTLLNRLKTSLLIGPAETLIHEIDGLTLSKYLEEIVAAVVEGAGRGKGDVDVAVDIVVHLHTRLTPEFLPQLLHPAALLGILTPTTSVAGKDADKDKEDKDRLARQRLVLRIVAELAMVGGWVDGVSKGASEVTKILKAFMTGDPQFSNMPLLSYFLKHLAGAYLGPDPSTEKTGLIDDDLPGNVEDLVPAESQKNIRDLFQTYFNNASKTLVKGQLKLLEQDKRNHEAYIRSGEIFEDRQHAYERMAKAVERLTTGVQAMADLLGLAPPTLPTTASLNKGGLQIVEGQSSFVVRDDGEGGGIWDDDEEQRFYEDLLDLKQTVPSALLGIKERMKGTKADALKGQDTVMVEKEDDAVRAEAQKKREEEEIQRLLEQVEQSESTMDNEEPQGKDSSEINGLPSAQSQLAIDPLDDPLEETYESAEPLTASSLKESKDMDDGLQPGPHARLNAIFAALPQASNREMVDKLAVDFAFLNSKAARKRLVAFIGAVPKTRTDLLPHYSRLIATLNPYMPDIGTGVLEILEEETRYLQRKRLIRELDSVRLKNVRFWGELAKFKVAKPYAILHVLKVFLDDFRANIENISNLLETCGRFLLRYEGTAATAKSMVGPFYHRISTCCKVTDVSQVELMRRKQANSHLDQRHLIMLENAFYMCNPPERVVRQIIELTPMQSFIQYLLHDVLMKRTVDKVVKLFRKLHWEEQETYDYILMTFTHIWEIKYENIEYAASVVCDLQKYHPEFSIAVVDQVLEDIRVGMEENIFKYNQRRIASVKYLGELYMYRVIGAQIILDTLWTLISFGHQEAFPVPGRDSPIDSVTDFFRVRLVCTLLDSCGICFSKGSLKRKMDNFLVFFQLYVVCKVETPMDVEFMLSDTFETLRPSETRLKTFADAAAAVDTILAVQTEVDDSISEVDSEIMRPPIEEPPLTSSLPTARSQIEKLEEDDTVVLLRDPHQKDEMDLELQEEFEREFSKMLVDPGNRNGERKAPPLFDAAVPHIRKGEPGLIGQMDDSVLMENEGTIQFTFLAKKGGRQQMRPLQVPTDSNIAINLRSHQERSKAEQEHLKRLVLQNERRQELSEIQCKFRPTFVHVSSFFPFPPRLHNLISTPSPFLLHH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.74
3 0.76
4 0.79
5 0.79
6 0.79
7 0.81
8 0.76
9 0.71
10 0.66
11 0.62
12 0.57
13 0.57
14 0.53
15 0.5
16 0.49
17 0.44
18 0.4
19 0.35
20 0.31
21 0.31
22 0.35
23 0.35
24 0.37
25 0.41
26 0.41
27 0.39
28 0.41
29 0.42
30 0.44
31 0.47
32 0.54
33 0.59
34 0.61
35 0.61
36 0.59
37 0.52
38 0.46
39 0.39
40 0.33
41 0.24
42 0.21
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.16
47 0.14
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.06
90 0.07
91 0.11
92 0.13
93 0.17
94 0.17
95 0.21
96 0.23
97 0.23
98 0.25
99 0.21
100 0.27
101 0.23
102 0.22
103 0.18
104 0.15
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.11
119 0.12
120 0.18
121 0.24
122 0.27
123 0.29
124 0.32
125 0.34
126 0.42
127 0.44
128 0.45
129 0.47
130 0.53
131 0.59
132 0.65
133 0.66
134 0.62
135 0.66
136 0.64
137 0.6
138 0.53
139 0.45
140 0.37
141 0.33
142 0.27
143 0.19
144 0.14
145 0.1
146 0.07
147 0.06
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.11
162 0.14
163 0.18
164 0.18
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.2
169 0.2
170 0.24
171 0.21
172 0.24
173 0.23
174 0.25
175 0.24
176 0.21
177 0.22
178 0.14
179 0.14
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.14
186 0.15
187 0.13
188 0.14
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.17
200 0.15
201 0.13
202 0.14
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.14
223 0.16
224 0.19
225 0.18
226 0.2
227 0.22
228 0.25
229 0.25
230 0.31
231 0.31
232 0.29
233 0.35
234 0.35
235 0.33
236 0.3
237 0.3
238 0.24
239 0.26
240 0.28
241 0.3
242 0.31
243 0.32
244 0.35
245 0.39
246 0.38
247 0.39
248 0.4
249 0.4
250 0.42
251 0.47
252 0.49
253 0.47
254 0.47
255 0.44
256 0.4
257 0.37
258 0.37
259 0.36
260 0.32
261 0.27
262 0.26
263 0.25
264 0.26
265 0.23
266 0.2
267 0.17
268 0.16
269 0.17
270 0.2
271 0.2
272 0.2
273 0.25
274 0.25
275 0.23
276 0.24
277 0.22
278 0.22
279 0.25
280 0.23
281 0.18
282 0.19
283 0.16
284 0.17
285 0.17
286 0.15
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.07
291 0.06
292 0.04
293 0.04
294 0.03
295 0.04
296 0.04
297 0.03
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.12
304 0.15
305 0.18
306 0.2
307 0.19
308 0.21
309 0.22
310 0.21
311 0.16
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.07
322 0.07
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.1
357 0.11
358 0.14
359 0.16
360 0.18
361 0.19
362 0.2
363 0.2
364 0.2
365 0.22
366 0.25
367 0.24
368 0.24
369 0.27
370 0.29
371 0.28
372 0.27
373 0.24
374 0.19
375 0.18
376 0.17
377 0.15
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.14
388 0.2
389 0.21
390 0.24
391 0.29
392 0.29
393 0.31
394 0.35
395 0.35
396 0.36
397 0.42
398 0.44
399 0.39
400 0.38
401 0.36
402 0.32
403 0.29
404 0.23
405 0.14
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.1
416 0.13
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.13
421 0.15
422 0.14
423 0.15
424 0.14
425 0.14
426 0.13
427 0.12
428 0.12
429 0.11
430 0.11
431 0.1
432 0.08
433 0.08
434 0.07
435 0.07
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.07
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.05
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.08
459 0.11
460 0.11
461 0.14
462 0.14
463 0.14
464 0.15
465 0.15
466 0.14
467 0.15
468 0.16
469 0.14
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.13
474 0.13
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.11
480 0.1
481 0.09
482 0.08
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.1
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.11
495 0.09
496 0.09
497 0.11
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.08
506 0.12
507 0.14
508 0.15
509 0.17
510 0.17
511 0.19
512 0.22
513 0.23
514 0.21
515 0.2
516 0.21
517 0.25
518 0.23
519 0.22
520 0.18
521 0.16
522 0.17
523 0.17
524 0.15
525 0.11
526 0.15
527 0.19
528 0.22
529 0.23
530 0.23
531 0.23
532 0.22
533 0.2
534 0.17
535 0.13
536 0.12
537 0.13
538 0.12
539 0.12
540 0.13
541 0.12
542 0.1
543 0.1
544 0.08
545 0.05
546 0.05
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.03
552 0.04
553 0.03
554 0.03
555 0.04
556 0.04
557 0.06
558 0.1
559 0.11
560 0.14
561 0.19
562 0.24
563 0.29
564 0.36
565 0.38
566 0.37
567 0.44
568 0.44
569 0.46
570 0.46
571 0.42
572 0.36
573 0.36
574 0.34
575 0.3
576 0.3
577 0.25
578 0.21
579 0.21
580 0.27
581 0.26
582 0.3
583 0.29
584 0.29
585 0.27
586 0.27
587 0.32
588 0.26
589 0.23
590 0.21
591 0.21
592 0.19
593 0.24
594 0.24
595 0.17
596 0.18
597 0.18
598 0.16
599 0.14
600 0.12
601 0.07
602 0.09
603 0.08
604 0.07
605 0.09
606 0.1
607 0.1
608 0.1
609 0.1
610 0.08
611 0.08
612 0.1
613 0.07
614 0.06
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.09
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.12
624 0.11
625 0.12
626 0.13
627 0.13
628 0.14
629 0.15
630 0.15
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.09
635 0.09
636 0.08
637 0.07
638 0.1
639 0.11
640 0.13
641 0.15
642 0.14
643 0.16
644 0.22
645 0.25
646 0.24
647 0.23
648 0.22
649 0.2
650 0.22
651 0.29
652 0.25
653 0.22
654 0.25
655 0.24
656 0.26
657 0.31
658 0.3
659 0.29
660 0.27
661 0.26
662 0.26
663 0.34
664 0.39
665 0.39
666 0.48
667 0.44
668 0.45
669 0.46
670 0.43
671 0.36
672 0.29
673 0.24
674 0.16
675 0.13
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.07
680 0.07
681 0.08
682 0.07
683 0.1
684 0.1
685 0.11
686 0.15
687 0.17
688 0.21
689 0.23
690 0.23
691 0.22
692 0.24
693 0.22
694 0.21
695 0.19
696 0.17
697 0.13
698 0.14
699 0.12
700 0.1
701 0.09
702 0.07
703 0.09
704 0.08
705 0.09
706 0.09
707 0.1
708 0.11
709 0.11
710 0.12
711 0.14
712 0.14
713 0.13
714 0.14
715 0.18
716 0.18
717 0.21
718 0.24
719 0.3
720 0.35
721 0.39
722 0.41
723 0.4
724 0.48
725 0.49
726 0.52
727 0.51
728 0.5
729 0.48
730 0.48
731 0.48
732 0.39
733 0.35
734 0.27
735 0.2
736 0.15
737 0.13
738 0.09
739 0.08
740 0.07
741 0.07
742 0.1
743 0.11
744 0.11
745 0.12
746 0.14
747 0.15
748 0.17
749 0.17
750 0.13
751 0.14
752 0.13
753 0.12
754 0.11
755 0.09
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.07
761 0.08
762 0.09
763 0.16
764 0.19
765 0.2
766 0.21
767 0.22
768 0.22
769 0.22
770 0.25
771 0.18
772 0.16
773 0.14
774 0.13
775 0.11
776 0.11
777 0.1
778 0.04
779 0.04
780 0.04
781 0.03
782 0.04
783 0.05
784 0.05
785 0.06
786 0.08
787 0.09
788 0.11
789 0.12
790 0.13
791 0.17
792 0.22
793 0.28
794 0.28
795 0.29
796 0.31
797 0.38
798 0.42
799 0.43
800 0.38
801 0.32
802 0.31
803 0.29
804 0.26
805 0.19
806 0.17
807 0.16
808 0.15
809 0.14
810 0.14
811 0.14
812 0.13
813 0.13
814 0.1
815 0.05
816 0.05
817 0.05
818 0.04
819 0.04
820 0.04
821 0.04
822 0.03
823 0.04
824 0.03
825 0.05
826 0.06
827 0.06
828 0.08
829 0.08
830 0.08
831 0.09
832 0.12
833 0.12
834 0.13
835 0.13
836 0.14
837 0.18
838 0.18
839 0.2
840 0.19
841 0.2
842 0.19
843 0.19
844 0.18
845 0.16
846 0.19
847 0.17
848 0.15
849 0.16
850 0.15
851 0.16
852 0.18
853 0.19
854 0.15
855 0.17
856 0.18
857 0.15
858 0.17
859 0.16
860 0.13
861 0.16
862 0.16
863 0.14
864 0.13
865 0.14
866 0.21
867 0.29
868 0.35
869 0.39
870 0.44
871 0.51
872 0.56
873 0.6
874 0.58
875 0.56
876 0.54
877 0.46
878 0.45
879 0.38
880 0.33
881 0.28
882 0.24
883 0.18
884 0.17
885 0.16
886 0.11
887 0.12
888 0.13
889 0.14
890 0.12
891 0.14
892 0.13
893 0.13
894 0.13
895 0.13
896 0.12
897 0.11
898 0.1
899 0.07
900 0.07
901 0.06
902 0.07
903 0.08
904 0.09
905 0.09
906 0.12
907 0.13
908 0.18
909 0.27
910 0.3
911 0.33
912 0.34
913 0.37
914 0.35
915 0.37
916 0.33
917 0.25
918 0.21
919 0.18
920 0.16
921 0.12
922 0.11
923 0.09
924 0.07
925 0.05
926 0.05
927 0.04
928 0.03
929 0.03
930 0.03
931 0.04
932 0.05
933 0.05
934 0.05
935 0.05
936 0.07
937 0.07
938 0.07
939 0.07
940 0.08
941 0.08
942 0.09
943 0.1
944 0.1
945 0.1
946 0.11
947 0.13
948 0.17
949 0.2
950 0.19
951 0.2
952 0.24
953 0.28
954 0.28
955 0.26
956 0.22
957 0.23
958 0.26
959 0.25
960 0.22
961 0.21
962 0.24
963 0.26
964 0.29
965 0.3
966 0.28
967 0.29
968 0.29
969 0.26
970 0.24
971 0.23
972 0.18
973 0.13
974 0.11
975 0.09
976 0.08
977 0.12
978 0.21
979 0.23
980 0.26
981 0.29
982 0.29
983 0.3
984 0.34
985 0.33
986 0.26
987 0.23
988 0.21
989 0.18
990 0.18
991 0.17
992 0.13
993 0.1
994 0.09
995 0.11
996 0.1
997 0.1
998 0.1
999 0.12
1000 0.13
1001 0.16
1002 0.21
1003 0.23
1004 0.26
1005 0.32
1006 0.42
1007 0.4
1008 0.41
1009 0.4
1010 0.41
1011 0.43
1012 0.44
1013 0.44
1014 0.37
1015 0.38
1016 0.4
1017 0.4
1018 0.34
1019 0.32
1020 0.33
1021 0.36
1022 0.34
1023 0.33
1024 0.32
1025 0.3
1026 0.29
1027 0.29
1028 0.29
1029 0.23
1030 0.23
1031 0.26
1032 0.24
1033 0.24
1034 0.23
1035 0.19
1036 0.14
1037 0.11
1038 0.1
1039 0.07
1040 0.06
1041 0.06
1042 0.06
1043 0.05
1044 0.07
1045 0.08
1046 0.09
1047 0.08
1048 0.08
1049 0.09
1050 0.11
1051 0.13
1052 0.12
1053 0.19
1054 0.19
1055 0.25
1056 0.34
1057 0.44
1058 0.49
1059 0.51
1060 0.61
1061 0.63
1062 0.7
1063 0.69
1064 0.62
1065 0.56
1066 0.54
1067 0.51
1068 0.44
1069 0.4
1070 0.32
1071 0.28
1072 0.27
1073 0.25
1074 0.22
1075 0.21
1076 0.22
1077 0.22
1078 0.26
1079 0.3
1080 0.32
1081 0.39
1082 0.43
1083 0.5
1084 0.56
1085 0.53
1086 0.55
1087 0.61
1088 0.62
1089 0.64
1090 0.62
1091 0.56
1092 0.52
1093 0.53
1094 0.57
1095 0.57
1096 0.6
1097 0.6
1098 0.65
1099 0.67
1100 0.63
1101 0.6
1102 0.55
1103 0.54
1104 0.54
1105 0.52
1106 0.47
1107 0.48
1108 0.51
1109 0.52
1110 0.49
1111 0.45
1112 0.4
1113 0.4
1114 0.46
1115 0.45
1116 0.5
1117 0.48
1118 0.51
1119 0.49
1120 0.47
1121 0.41
1122 0.35
1123 0.34
1124 0.27
1125 0.33
1126 0.36
1127 0.38
1128 0.39
1129 0.42
1130 0.42
1131 0.45
1132 0.49
1133 0.43
1134 0.39
1135 0.35