Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SCM9

Protein Details
Accession R7SCM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-272FLNEHGRTKKWKGKKEKDRSNKVAAPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
252-265RTKKWKGKKEKDRS
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.333, cyto 6.5, cyto_mito 5.666, pero 4, mito 3.5
Family & Domain DBs
KEGG tms:TREMEDRAFT_65059  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSSNDLSKSFDTVPKLTGKENYLVWHQRLTVVLFMTQTRSFVLSTTIAPTATTTTSSTGSSLLLEAWNKRDGQVAAAILHSTSEDILSAHLHLLSPLDPPLTNQPVSTTIFPAYRAQTIYDSLKKTYGTNGVQYSFALAKKFVDNRCSEDEDVEEWVNKVLAQYRDLKVLSYDLNQLCGNVLLNGLPDRFSSFIDGIWKEDDTPSVENIKIKILRVSAEGREGTKQGSSLCSMWIGRLVDCPVPAFLNEHGRTKKWKGKKEKDRSNKVAAPVETKTEAAAIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.35
4 0.37
5 0.35
6 0.34
7 0.34
8 0.34
9 0.37
10 0.41
11 0.4
12 0.37
13 0.35
14 0.33
15 0.33
16 0.32
17 0.26
18 0.21
19 0.2
20 0.18
21 0.18
22 0.21
23 0.19
24 0.18
25 0.16
26 0.16
27 0.15
28 0.14
29 0.16
30 0.13
31 0.14
32 0.16
33 0.16
34 0.14
35 0.14
36 0.15
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.12
41 0.13
42 0.14
43 0.15
44 0.14
45 0.13
46 0.12
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.11
52 0.13
53 0.15
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.21
58 0.19
59 0.19
60 0.2
61 0.18
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.11
66 0.11
67 0.09
68 0.06
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.09
87 0.15
88 0.18
89 0.18
90 0.17
91 0.18
92 0.2
93 0.22
94 0.22
95 0.17
96 0.15
97 0.15
98 0.17
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.17
106 0.2
107 0.22
108 0.22
109 0.21
110 0.22
111 0.21
112 0.2
113 0.21
114 0.23
115 0.19
116 0.22
117 0.23
118 0.22
119 0.21
120 0.21
121 0.19
122 0.15
123 0.14
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.13
128 0.18
129 0.18
130 0.21
131 0.22
132 0.26
133 0.29
134 0.32
135 0.29
136 0.24
137 0.23
138 0.19
139 0.2
140 0.16
141 0.12
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.1
148 0.11
149 0.13
150 0.18
151 0.19
152 0.22
153 0.22
154 0.22
155 0.17
156 0.18
157 0.17
158 0.14
159 0.19
160 0.15
161 0.18
162 0.17
163 0.17
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.07
168 0.07
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.19
196 0.23
197 0.22
198 0.22
199 0.23
200 0.21
201 0.21
202 0.23
203 0.26
204 0.21
205 0.24
206 0.24
207 0.23
208 0.24
209 0.23
210 0.21
211 0.18
212 0.18
213 0.14
214 0.15
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.17
219 0.16
220 0.15
221 0.19
222 0.18
223 0.16
224 0.18
225 0.2
226 0.19
227 0.19
228 0.2
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.16
234 0.25
235 0.26
236 0.33
237 0.36
238 0.38
239 0.45
240 0.52
241 0.58
242 0.57
243 0.65
244 0.69
245 0.77
246 0.85
247 0.89
248 0.91
249 0.93
250 0.94
251 0.91
252 0.9
253 0.84
254 0.79
255 0.76
256 0.67
257 0.62
258 0.53
259 0.51
260 0.42
261 0.37
262 0.31