Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SBM2

Protein Details
Accession R7SBM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-114STTLIPSLRRKKSRLGKRNERRKKELRRMKKMLTQRMAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-106RRKKSRLGKRNERRKKELRRMKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011709  DEAD-box_helicase_OB_fold  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR007502  Helicase-assoc_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG tms:TREMEDRAFT_45797  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF04408  HA2  
PF00271  Helicase_C  
PF07717  OB_NTP_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17917  DEXHc_RHA-like  
cd18791  SF2_C_RHA  
Amino Acid Sequences MRREFDFQRANRASSPETFTGSVVLRKKKSKNVYDLEEVRLTPHPPLQIGTAQEAKHYAATYALFRPPPLLIKHGSTTLIPSLRRKKSRLGKRNERRKKELRRMKKMLTQRMAQVAQGMMQRFPTAVLEATRDISSNPSDLLSGSATPSLDLPNIESQLTTLGFRPAHITSALTALSAANARLYSSSSSSTDPLVLSLSILSPLEAAIEWLLLHLPEDDLPPRYRTTSSAGDLVTGVSVGGKEQLVKGWLIDKLTKGAGFPRKAVEEVIRNVEATSSALDILGRRLCGWDGDWAPEAYEPWDGHETEGESRRSAREEEMLTLEAVLGERFTILSSTECTVDIEYERDNLTLHLLFDDASPFPSPTHPTYPPAFYLSSDTVPSYMRLHLHSQLLRQFRDPERHDFTSVLEAGAGGAVLLMVEHIETLLPDVLANPPDLGEVTRFLVPRLEEISPAIPKSDGPGRSKPEIRRHRHQATSADEASVQKRHQAMSQDPAYKKILDDRQKLPAWKERHNITSALDSNRVILVVGETGCGKTTQLPQFILDHEISQNRGSKTNIIVTQPRRVAAMGVAQRVAYERLEDLDKATGTVGYAIRGERRASSDTRLLFCTTGVVLRRLGTDKDLGGVSHVIVDEAHERGVDTDLLICLLKEILERNKTLKVVIMSATINERIFIDYFNGCPSLSIPGFTYPVKDHYLENVIPLLPNLQPTQQRFGSKQTEEQKISIRADFEKLSLDPISQRTLEILSQSDRIDYNLISAVVTHIISISEEGAILIFLPGVMEIRQCISNLSSASIGQVEILPLHANLTSTEQRRVFLSTGRKRKIVVSTNVAETSVTIPDVVFVIDTGRVKETDYDVMTGMQKLEEGWTSRASGRQRRGRAGRTREGECFKLYTKRTEEKKMMKFSKPEMLRVPLEMVLLQVKAMDENIDVEAFLLKAIDPPKLHAISTAWTTLIDLGIVLSSSPSSPLTALGKHISSIPVDLRLAKMLVLAVIFKVLDPILTITALLSSKPLFISPLDNRDTARTAREKFSTGRSDLLTDVKAYSAAMELSGMEQRKFCEENFISSSTVRDVRSLREDFIGALQGIGFLGRKGEIEKFSQNGKLEGLVKGVVVGGLYPRIARINMPKATYERVQQGAVLKDHEAKEVKLFDPSGRVFLHPSSILFTESGFKPGFIAYFSKAETSKVFLRDATEVPLYSLLLFGGPLTINHFAGGVLIGKEGHIKLRAQPRVGALCSQLRRLLDAQLAETVESPDGVEGLSSKDGEGVVNAMMALLTRDGLSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.49
3 0.4
4 0.4
5 0.37
6 0.34
7 0.32
8 0.31
9 0.32
10 0.33
11 0.4
12 0.43
13 0.51
14 0.58
15 0.64
16 0.73
17 0.76
18 0.78
19 0.78
20 0.78
21 0.79
22 0.76
23 0.71
24 0.64
25 0.54
26 0.47
27 0.42
28 0.36
29 0.3
30 0.29
31 0.26
32 0.24
33 0.26
34 0.26
35 0.27
36 0.28
37 0.3
38 0.32
39 0.29
40 0.29
41 0.3
42 0.27
43 0.25
44 0.23
45 0.18
46 0.15
47 0.17
48 0.19
49 0.22
50 0.26
51 0.24
52 0.24
53 0.26
54 0.25
55 0.3
56 0.29
57 0.3
58 0.28
59 0.31
60 0.34
61 0.35
62 0.34
63 0.28
64 0.29
65 0.3
66 0.32
67 0.31
68 0.38
69 0.46
70 0.54
71 0.61
72 0.62
73 0.66
74 0.71
75 0.79
76 0.8
77 0.81
78 0.82
79 0.86
80 0.93
81 0.94
82 0.93
83 0.92
84 0.92
85 0.92
86 0.92
87 0.92
88 0.92
89 0.92
90 0.92
91 0.9
92 0.88
93 0.87
94 0.86
95 0.81
96 0.75
97 0.69
98 0.68
99 0.61
100 0.52
101 0.45
102 0.34
103 0.31
104 0.31
105 0.26
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.16
110 0.16
111 0.14
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.16
116 0.17
117 0.19
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.18
122 0.18
123 0.16
124 0.15
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.14
140 0.17
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.15
145 0.17
146 0.18
147 0.15
148 0.12
149 0.16
150 0.16
151 0.17
152 0.2
153 0.18
154 0.19
155 0.19
156 0.18
157 0.14
158 0.17
159 0.16
160 0.12
161 0.11
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.17
175 0.19
176 0.2
177 0.2
178 0.2
179 0.17
180 0.16
181 0.14
182 0.12
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.09
205 0.12
206 0.15
207 0.18
208 0.2
209 0.21
210 0.23
211 0.23
212 0.24
213 0.28
214 0.3
215 0.3
216 0.31
217 0.29
218 0.27
219 0.26
220 0.24
221 0.17
222 0.11
223 0.08
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.15
237 0.16
238 0.18
239 0.17
240 0.19
241 0.2
242 0.2
243 0.17
244 0.24
245 0.3
246 0.3
247 0.3
248 0.32
249 0.32
250 0.33
251 0.34
252 0.32
253 0.3
254 0.31
255 0.34
256 0.3
257 0.28
258 0.28
259 0.25
260 0.21
261 0.15
262 0.12
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.13
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.17
277 0.17
278 0.19
279 0.21
280 0.19
281 0.2
282 0.19
283 0.18
284 0.13
285 0.15
286 0.12
287 0.14
288 0.17
289 0.17
290 0.17
291 0.18
292 0.19
293 0.2
294 0.26
295 0.24
296 0.22
297 0.23
298 0.25
299 0.25
300 0.25
301 0.22
302 0.22
303 0.22
304 0.24
305 0.25
306 0.24
307 0.21
308 0.19
309 0.17
310 0.11
311 0.1
312 0.07
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.06
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.11
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.13
350 0.17
351 0.19
352 0.25
353 0.26
354 0.29
355 0.31
356 0.33
357 0.32
358 0.31
359 0.27
360 0.22
361 0.24
362 0.23
363 0.21
364 0.19
365 0.18
366 0.16
367 0.16
368 0.17
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.16
373 0.19
374 0.22
375 0.27
376 0.27
377 0.29
378 0.33
379 0.37
380 0.35
381 0.34
382 0.37
383 0.36
384 0.44
385 0.44
386 0.45
387 0.48
388 0.49
389 0.48
390 0.42
391 0.39
392 0.35
393 0.31
394 0.23
395 0.15
396 0.12
397 0.11
398 0.1
399 0.08
400 0.03
401 0.02
402 0.02
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.02
408 0.02
409 0.02
410 0.02
411 0.02
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.09
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.14
432 0.14
433 0.15
434 0.17
435 0.16
436 0.13
437 0.14
438 0.18
439 0.16
440 0.16
441 0.15
442 0.11
443 0.11
444 0.14
445 0.19
446 0.2
447 0.24
448 0.31
449 0.35
450 0.4
451 0.47
452 0.52
453 0.56
454 0.62
455 0.64
456 0.68
457 0.72
458 0.74
459 0.73
460 0.7
461 0.66
462 0.6
463 0.59
464 0.5
465 0.41
466 0.34
467 0.31
468 0.28
469 0.25
470 0.2
471 0.17
472 0.18
473 0.18
474 0.2
475 0.24
476 0.24
477 0.28
478 0.34
479 0.38
480 0.37
481 0.39
482 0.38
483 0.33
484 0.31
485 0.31
486 0.33
487 0.35
488 0.4
489 0.4
490 0.46
491 0.49
492 0.51
493 0.47
494 0.47
495 0.44
496 0.45
497 0.47
498 0.44
499 0.44
500 0.44
501 0.41
502 0.34
503 0.35
504 0.31
505 0.28
506 0.26
507 0.22
508 0.21
509 0.2
510 0.18
511 0.12
512 0.08
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.08
523 0.15
524 0.19
525 0.21
526 0.22
527 0.23
528 0.24
529 0.25
530 0.24
531 0.18
532 0.14
533 0.13
534 0.14
535 0.14
536 0.15
537 0.19
538 0.17
539 0.19
540 0.19
541 0.2
542 0.21
543 0.24
544 0.25
545 0.22
546 0.28
547 0.29
548 0.34
549 0.33
550 0.31
551 0.27
552 0.25
553 0.22
554 0.16
555 0.2
556 0.16
557 0.16
558 0.16
559 0.15
560 0.15
561 0.15
562 0.15
563 0.09
564 0.07
565 0.06
566 0.08
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.09
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.07
575 0.06
576 0.09
577 0.08
578 0.07
579 0.08
580 0.08
581 0.09
582 0.11
583 0.12
584 0.1
585 0.13
586 0.16
587 0.16
588 0.19
589 0.23
590 0.23
591 0.24
592 0.25
593 0.22
594 0.2
595 0.18
596 0.15
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.12
604 0.13
605 0.13
606 0.12
607 0.12
608 0.1
609 0.11
610 0.11
611 0.09
612 0.08
613 0.08
614 0.07
615 0.06
616 0.06
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.05
624 0.05
625 0.06
626 0.07
627 0.06
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.07
639 0.11
640 0.14
641 0.15
642 0.17
643 0.19
644 0.19
645 0.19
646 0.19
647 0.15
648 0.14
649 0.14
650 0.13
651 0.11
652 0.11
653 0.12
654 0.11
655 0.1
656 0.09
657 0.09
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.09
662 0.08
663 0.08
664 0.09
665 0.09
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.11
674 0.13
675 0.13
676 0.14
677 0.11
678 0.14
679 0.16
680 0.16
681 0.15
682 0.15
683 0.2
684 0.18
685 0.17
686 0.15
687 0.13
688 0.12
689 0.12
690 0.11
691 0.07
692 0.09
693 0.09
694 0.11
695 0.16
696 0.18
697 0.23
698 0.24
699 0.26
700 0.26
701 0.32
702 0.35
703 0.32
704 0.37
705 0.39
706 0.43
707 0.43
708 0.42
709 0.41
710 0.39
711 0.39
712 0.33
713 0.27
714 0.22
715 0.23
716 0.21
717 0.17
718 0.14
719 0.13
720 0.14
721 0.12
722 0.12
723 0.11
724 0.13
725 0.14
726 0.13
727 0.13
728 0.11
729 0.12
730 0.12
731 0.11
732 0.11
733 0.1
734 0.12
735 0.12
736 0.12
737 0.11
738 0.12
739 0.12
740 0.1
741 0.1
742 0.09
743 0.09
744 0.08
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.07
749 0.06
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.05
755 0.04
756 0.04
757 0.04
758 0.04
759 0.03
760 0.03
761 0.03
762 0.02
763 0.02
764 0.02
765 0.02
766 0.03
767 0.03
768 0.03
769 0.04
770 0.06
771 0.06
772 0.07
773 0.08
774 0.08
775 0.1
776 0.1
777 0.11
778 0.1
779 0.09
780 0.1
781 0.09
782 0.09
783 0.06
784 0.06
785 0.05
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.05
790 0.05
791 0.05
792 0.06
793 0.06
794 0.11
795 0.16
796 0.18
797 0.23
798 0.23
799 0.24
800 0.24
801 0.27
802 0.22
803 0.23
804 0.32
805 0.36
806 0.45
807 0.48
808 0.48
809 0.46
810 0.5
811 0.53
812 0.5
813 0.46
814 0.43
815 0.42
816 0.43
817 0.42
818 0.38
819 0.29
820 0.21
821 0.17
822 0.11
823 0.09
824 0.06
825 0.06
826 0.06
827 0.06
828 0.06
829 0.04
830 0.04
831 0.04
832 0.07
833 0.07
834 0.08
835 0.09
836 0.09
837 0.1
838 0.12
839 0.13
840 0.15
841 0.15
842 0.15
843 0.15
844 0.16
845 0.16
846 0.15
847 0.13
848 0.09
849 0.08
850 0.07
851 0.08
852 0.09
853 0.1
854 0.12
855 0.13
856 0.15
857 0.16
858 0.2
859 0.26
860 0.32
861 0.39
862 0.46
863 0.5
864 0.57
865 0.63
866 0.68
867 0.71
868 0.71
869 0.7
870 0.67
871 0.65
872 0.63
873 0.59
874 0.52
875 0.44
876 0.38
877 0.32
878 0.35
879 0.33
880 0.34
881 0.37
882 0.44
883 0.48
884 0.54
885 0.6
886 0.62
887 0.68
888 0.71
889 0.71
890 0.68
891 0.66
892 0.62
893 0.62
894 0.54
895 0.51
896 0.45
897 0.44
898 0.39
899 0.36
900 0.34
901 0.25
902 0.23
903 0.19
904 0.15
905 0.11
906 0.1
907 0.09
908 0.07
909 0.07
910 0.06
911 0.06
912 0.06
913 0.05
914 0.06
915 0.07
916 0.07
917 0.07
918 0.07
919 0.07
920 0.06
921 0.06
922 0.05
923 0.04
924 0.08
925 0.09
926 0.13
927 0.13
928 0.16
929 0.22
930 0.23
931 0.23
932 0.21
933 0.21
934 0.2
935 0.22
936 0.2
937 0.13
938 0.12
939 0.13
940 0.11
941 0.1
942 0.07
943 0.05
944 0.04
945 0.04
946 0.04
947 0.04
948 0.03
949 0.04
950 0.04
951 0.05
952 0.06
953 0.06
954 0.07
955 0.1
956 0.12
957 0.13
958 0.15
959 0.17
960 0.17
961 0.16
962 0.18
963 0.16
964 0.14
965 0.16
966 0.14
967 0.14
968 0.15
969 0.15
970 0.15
971 0.15
972 0.15
973 0.12
974 0.11
975 0.09
976 0.08
977 0.08
978 0.07
979 0.06
980 0.06
981 0.06
982 0.05
983 0.06
984 0.06
985 0.05
986 0.06
987 0.07
988 0.07
989 0.07
990 0.07
991 0.06
992 0.09
993 0.09
994 0.08
995 0.08
996 0.08
997 0.09
998 0.09
999 0.1
1000 0.09
1001 0.1
1002 0.18
1003 0.21
1004 0.27
1005 0.29
1006 0.3
1007 0.3
1008 0.32
1009 0.35
1010 0.29
1011 0.31
1012 0.31
1013 0.32
1014 0.36
1015 0.38
1016 0.38
1017 0.38
1018 0.44
1019 0.44
1020 0.38
1021 0.38
1022 0.34
1023 0.33
1024 0.32
1025 0.32
1026 0.25
1027 0.19
1028 0.18
1029 0.14
1030 0.13
1031 0.12
1032 0.1
1033 0.08
1034 0.07
1035 0.06
1036 0.06
1037 0.06
1038 0.07
1039 0.11
1040 0.13
1041 0.13
1042 0.14
1043 0.15
1044 0.2
1045 0.21
1046 0.2
1047 0.26
1048 0.26
1049 0.31
1050 0.34
1051 0.35
1052 0.31
1053 0.3
1054 0.31
1055 0.25
1056 0.28
1057 0.22
1058 0.22
1059 0.22
1060 0.26
1061 0.33
1062 0.34
1063 0.32
1064 0.3
1065 0.29
1066 0.26
1067 0.26
1068 0.23
1069 0.15
1070 0.13
1071 0.11
1072 0.09
1073 0.09
1074 0.09
1075 0.07
1076 0.05
1077 0.06
1078 0.06
1079 0.07
1080 0.09
1081 0.14
1082 0.16
1083 0.21
1084 0.25
1085 0.27
1086 0.3
1087 0.35
1088 0.34
1089 0.31
1090 0.29
1091 0.28
1092 0.26
1093 0.25
1094 0.23
1095 0.18
1096 0.16
1097 0.15
1098 0.14
1099 0.1
1100 0.07
1101 0.06
1102 0.06
1103 0.07
1104 0.07
1105 0.07
1106 0.08
1107 0.1
1108 0.11
1109 0.15
1110 0.23
1111 0.31
1112 0.35
1113 0.37
1114 0.39
1115 0.4
1116 0.45
1117 0.44
1118 0.4
1119 0.37
1120 0.35
1121 0.34
1122 0.33
1123 0.35
1124 0.35
1125 0.34
1126 0.31
1127 0.27
1128 0.3
1129 0.31
1130 0.34
1131 0.31
1132 0.26
1133 0.3
1134 0.33
1135 0.31
1136 0.3
1137 0.3
1138 0.26
1139 0.31
1140 0.31
1141 0.3
1142 0.27
1143 0.28
1144 0.26
1145 0.26
1146 0.29
1147 0.22
1148 0.22
1149 0.21
1150 0.21
1151 0.21
1152 0.18
1153 0.18
1154 0.19
1155 0.19
1156 0.22
1157 0.19
1158 0.18
1159 0.17
1160 0.18
1161 0.18
1162 0.14
1163 0.17
1164 0.16
1165 0.18
1166 0.19
1167 0.22
1168 0.22
1169 0.24
1170 0.23
1171 0.25
1172 0.28
1173 0.28
1174 0.29
1175 0.26
1176 0.29
1177 0.31
1178 0.31
1179 0.3
1180 0.26
1181 0.23
1182 0.23
1183 0.23
1184 0.2
1185 0.16
1186 0.15
1187 0.1
1188 0.08
1189 0.07
1190 0.06
1191 0.07
1192 0.07
1193 0.07
1194 0.11
1195 0.14
1196 0.14
1197 0.14
1198 0.14
1199 0.12
1200 0.12
1201 0.13
1202 0.11
1203 0.08
1204 0.09
1205 0.09
1206 0.09
1207 0.13
1208 0.14
1209 0.17
1210 0.18
1211 0.19
1212 0.27
1213 0.37
1214 0.43
1215 0.42
1216 0.45
1217 0.47
1218 0.51
1219 0.51
1220 0.46
1221 0.41
1222 0.43
1223 0.43
1224 0.43
1225 0.4
1226 0.34
1227 0.36
1228 0.35
1229 0.35
1230 0.31
1231 0.29
1232 0.27
1233 0.27
1234 0.27
1235 0.23
1236 0.22
1237 0.19
1238 0.15
1239 0.13
1240 0.12
1241 0.09
1242 0.08
1243 0.08
1244 0.07
1245 0.06
1246 0.09
1247 0.11
1248 0.11
1249 0.11
1250 0.12
1251 0.13
1252 0.13
1253 0.13
1254 0.11
1255 0.09
1256 0.09
1257 0.08
1258 0.07
1259 0.06
1260 0.06
1261 0.07
1262 0.05
1263 0.06