Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SC22

Protein Details
Accession R7SC22    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-125EKEGLHKRIKRKKSWLLPIGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-118KEGLHKRIKRKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.666, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG tms:TREMEDRAFT_70078  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
Amino Acid Sequences MRRELSEVKRSEIYGRWDAGQKQNEIAAQKSINQSTVHRTTKRKLEDNSHSSHPRSGRPSKVTEPAKRKILGQIDDNPNLPWQYYGRNVDEHQNNVSGQTVKRVAEKEGLHKRIKRKKSWLLPIGWTIRRAHKEYTSKHMHIHFHSNHISVPIWGAIAYNKKFPLFRIPLERIKRPKGWKTYVAEVQEEQGGGVCMMVDGSPAHRAQITRDAEAALSLQQFPHPPYSPDLNPIKSMWADVKHELDHGRPQPTNADKLFQEIQRIWDGIPITRVNQLIESMSARRDELEKADGLQTSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.39
3 0.38
4 0.41
5 0.45
6 0.49
7 0.49
8 0.44
9 0.4
10 0.41
11 0.41
12 0.37
13 0.34
14 0.29
15 0.24
16 0.28
17 0.32
18 0.3
19 0.3
20 0.29
21 0.3
22 0.34
23 0.42
24 0.45
25 0.46
26 0.51
27 0.55
28 0.63
29 0.69
30 0.69
31 0.66
32 0.68
33 0.72
34 0.71
35 0.69
36 0.68
37 0.64
38 0.58
39 0.57
40 0.51
41 0.47
42 0.5
43 0.52
44 0.53
45 0.54
46 0.58
47 0.58
48 0.64
49 0.66
50 0.67
51 0.67
52 0.65
53 0.66
54 0.61
55 0.57
56 0.55
57 0.53
58 0.47
59 0.44
60 0.47
61 0.47
62 0.48
63 0.47
64 0.4
65 0.34
66 0.31
67 0.26
68 0.18
69 0.12
70 0.14
71 0.2
72 0.24
73 0.24
74 0.27
75 0.28
76 0.34
77 0.36
78 0.35
79 0.3
80 0.28
81 0.26
82 0.23
83 0.24
84 0.19
85 0.15
86 0.18
87 0.19
88 0.18
89 0.22
90 0.23
91 0.22
92 0.26
93 0.28
94 0.33
95 0.39
96 0.45
97 0.47
98 0.5
99 0.58
100 0.62
101 0.69
102 0.67
103 0.68
104 0.71
105 0.75
106 0.81
107 0.77
108 0.71
109 0.65
110 0.62
111 0.59
112 0.5
113 0.43
114 0.35
115 0.35
116 0.35
117 0.35
118 0.32
119 0.34
120 0.4
121 0.41
122 0.47
123 0.48
124 0.45
125 0.46
126 0.48
127 0.44
128 0.38
129 0.44
130 0.36
131 0.34
132 0.34
133 0.31
134 0.27
135 0.24
136 0.22
137 0.13
138 0.13
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.12
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.17
150 0.18
151 0.25
152 0.23
153 0.26
154 0.32
155 0.36
156 0.43
157 0.48
158 0.54
159 0.51
160 0.53
161 0.57
162 0.56
163 0.59
164 0.6
165 0.61
166 0.61
167 0.59
168 0.6
169 0.58
170 0.52
171 0.46
172 0.37
173 0.33
174 0.26
175 0.21
176 0.14
177 0.09
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.05
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.13
194 0.22
195 0.24
196 0.22
197 0.23
198 0.23
199 0.21
200 0.21
201 0.19
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.11
208 0.13
209 0.18
210 0.18
211 0.19
212 0.23
213 0.29
214 0.29
215 0.35
216 0.39
217 0.34
218 0.35
219 0.34
220 0.32
221 0.26
222 0.27
223 0.24
224 0.22
225 0.24
226 0.25
227 0.28
228 0.25
229 0.28
230 0.28
231 0.27
232 0.31
233 0.32
234 0.35
235 0.33
236 0.34
237 0.39
238 0.42
239 0.46
240 0.39
241 0.38
242 0.32
243 0.37
244 0.41
245 0.34
246 0.35
247 0.3
248 0.32
249 0.32
250 0.32
251 0.27
252 0.25
253 0.25
254 0.21
255 0.24
256 0.22
257 0.2
258 0.24
259 0.24
260 0.22
261 0.22
262 0.21
263 0.18
264 0.19
265 0.2
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.18
270 0.19
271 0.2
272 0.2
273 0.21
274 0.23
275 0.22
276 0.23
277 0.27