FuNGI

R7SDE4

Protein Details

Accession

R7SDE4

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
96-122	TPSQDPQPSKKARKPVKPKVYVPQPGS	Hydrophilic
761-781	DVINGKGKKRKREVEGFFAER	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
105-112	KKARKPVK
766-776	KGKKRKREVEG
779-788	AERIKGEGRR

Subcellular Location(s)

mito 13.5, cyto_mito 9.833, nucl 6.5, cyto_nucl 6.333, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027421 DNA_pol_lamdba_lyase_dom_sf IPR042530 EME1/EME2_C IPR006166 ERCC4_domain IPR033309 Mus81 IPR011335 Restrct_endonuc-II-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR047417 WH_MUS81 IPR047416 XPF_nuclease_Mus81
Gene Ontology	GO:0048476 C:Holliday junction resolvase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0008821 F:crossover junction DNA endonuclease activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006308 P:DNA catabolic process GO:0000727 P:double-strand break repair via break-induced replication GO:0051321 P:meiotic cell cycle
KEGG	tms:TREMEDRAFT_45770 -
Pfam	View protein in Pfam PF02732 ERCC4
CDD	cd21036 WH_MUS81 cd20074 XPF_nuclease_Mus81

Amino Acid Sequences

MPPKIQCGNPLFLSWMQGQLRGCKSLASCPITYPRPRDLVCLRGIGPKIVSVLEKRWKVHCEENGLALPGTPQRKTGKNRAPTPPSDISIDESVPTPSQDPQPSKKARKPVKPKVYVPQPGSGGYGILLALILAIDDPRRSTQVFLTKGEVMNAAQEYCDSSYERSDKGTHFTAWSSMKTLVNKGYVYVTGNPHKYCLTEEGYEVALAVRNLRPEFSHMEKHPFLHSPARVGSSSKAPTSHKPLDSATASGPSIVHKEKIVPRKSSEKFEFWYIDAFESRVHDMSEALLRLDPDEFVNIRKIEFRFHQRDHPFTAQLRIVDTTARVRHGTEATLYGYIIEDTAPPRCSTFSLSGDAPMTKDISPPRLSNTAVTLNDDSAGISDDEDFLPIMDKSTVIDRPTSSVTTVPKSSSLLAAEATVHRNTITGQSQTTASLKSTRSTQVYRPAPRLSSHMPAPTAIPDSSEKLTNPVPAFTPADAITFPAGSYDIVLILDTREVESKTRRDEFAEALIKKGINVEQRALRLGDMLWIARRRDGWGGEADECVLDYVVERKRLDDLCSSIKDGRYTEQCFRLGNSAISQVFYIVEDYNVAERMAYDGPAILTAKSQLQVHAGFFLKETHRLSETIDFLVTMTNLLTSMHFQHDLKILPTKYISRSSYTTFQDYLRKTYPRQKYLTSFEAYQSLNDKSASRTLREQWGRMLLCIKGISAERVSAVLDEYDTPVALWRAMKQAREVGGEIRGTGVDDGVGKGAQEVVVDDVINGKGKKRKREVEGFFAERIKGEGRRKIGEALSVVMWNGLMGNEG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.31
3	0.26
4	0.29
5	0.29
6	0.34
7	0.36
8	0.35
9	0.34
10	0.3
11	0.31
12	0.35
13	0.42
14	0.39
15	0.37
16	0.38
17	0.46
18	0.5
19	0.55
20	0.53
21	0.51
22	0.53
23	0.53
24	0.57
25	0.55
26	0.53
27	0.5
28	0.48
29	0.43
30	0.43
31	0.43
32	0.38
33	0.33
34	0.27
35	0.26
36	0.23
37	0.24
38	0.21
39	0.28
40	0.34
41	0.39
42	0.41
43	0.46
44	0.48
45	0.51
46	0.56
47	0.54
48	0.54
49	0.5
50	0.52
51	0.48
52	0.46
53	0.4
54	0.31
55	0.27
56	0.25
57	0.27
58	0.22
59	0.26
60	0.3
61	0.39
62	0.46
63	0.55
64	0.59
65	0.64
66	0.73
67	0.77
68	0.79
69	0.74
70	0.75
71	0.69
72	0.61
73	0.54
74	0.46
75	0.41
76	0.35
77	0.32
78	0.24
79	0.2
80	0.2
81	0.17
82	0.17
83	0.14
84	0.15
85	0.22
86	0.29
87	0.35
88	0.4
89	0.5
90	0.59
91	0.67
92	0.7
93	0.74
94	0.76
95	0.8
96	0.84
97	0.85
98	0.86
99	0.86
100	0.86
101	0.85
102	0.86
103	0.84
104	0.76
105	0.71
106	0.62
107	0.54
108	0.49
109	0.39
110	0.28
111	0.2
112	0.17
113	0.1
114	0.08
115	0.06
116	0.04
117	0.04
118	0.03
119	0.03
120	0.02
121	0.03
122	0.04
123	0.05
124	0.08
125	0.1
126	0.12
127	0.13
128	0.15
129	0.21
130	0.29
131	0.33
132	0.33
133	0.35
134	0.36
135	0.36
136	0.35
137	0.29
138	0.21
139	0.2
140	0.19
141	0.15
142	0.11
143	0.11
144	0.12
145	0.12
146	0.13
147	0.11
148	0.12
149	0.18
150	0.21
151	0.22
152	0.23
153	0.25
154	0.25
155	0.29
156	0.31
157	0.26
158	0.25
159	0.25
160	0.28
161	0.27
162	0.26
163	0.24
164	0.24
165	0.26
166	0.26
167	0.29
168	0.27
169	0.28
170	0.27
171	0.25
172	0.23
173	0.21
174	0.22
175	0.23
176	0.25
177	0.28
178	0.33
179	0.32
180	0.32
181	0.31
182	0.29
183	0.27
184	0.26
185	0.24
186	0.2
187	0.21
188	0.21
189	0.21
190	0.2
191	0.17
192	0.12
193	0.1
194	0.09
195	0.11
196	0.1
197	0.14
198	0.14
199	0.15
200	0.15
201	0.17
202	0.23
203	0.25
204	0.32
205	0.3
206	0.38
207	0.38
208	0.39
209	0.39
210	0.35
211	0.34
212	0.34
213	0.32
214	0.28
215	0.29
216	0.3
217	0.28
218	0.27
219	0.26
220	0.25
221	0.27
222	0.24
223	0.26
224	0.27
225	0.31
226	0.39
227	0.44
228	0.38
229	0.38
230	0.38
231	0.4
232	0.37
233	0.34
234	0.26
235	0.21
236	0.19
237	0.17
238	0.16
239	0.12
240	0.15
241	0.15
242	0.15
243	0.13
244	0.19
245	0.26
246	0.36
247	0.41
248	0.4
249	0.43
250	0.52
251	0.55
252	0.58
253	0.56
254	0.5
255	0.46
256	0.47
257	0.45
258	0.35
259	0.35
260	0.26
261	0.23
262	0.19
263	0.17
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.12
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.12
273	0.1
274	0.09
275	0.1
276	0.09
277	0.1
278	0.1
279	0.09
280	0.07
281	0.09
282	0.09
283	0.1
284	0.14
285	0.14
286	0.14
287	0.18
288	0.18
289	0.2
290	0.24
291	0.32
292	0.36
293	0.38
294	0.47
295	0.47
296	0.5
297	0.52
298	0.51
299	0.46
300	0.39
301	0.4
302	0.32
303	0.29
304	0.26
305	0.21
306	0.18
307	0.14
308	0.14
309	0.16
310	0.15
311	0.17
312	0.16
313	0.15
314	0.18
315	0.18
316	0.18
317	0.14
318	0.14
319	0.13
320	0.13
321	0.12
322	0.09
323	0.08
324	0.07
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.1
333	0.11
334	0.12
335	0.14
336	0.18
337	0.17
338	0.19
339	0.19
340	0.19
341	0.19
342	0.19
343	0.15
344	0.12
345	0.11
346	0.09
347	0.12
348	0.12
349	0.16
350	0.18
351	0.19
352	0.21
353	0.23
354	0.23
355	0.21
356	0.22
357	0.23
358	0.2
359	0.22
360	0.19
361	0.16
362	0.16
363	0.15
364	0.12
365	0.07
366	0.08
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.05
374	0.04
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.08
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.1
386	0.13
387	0.14
388	0.14
389	0.13
390	0.13
391	0.15
392	0.16
393	0.17
394	0.15
395	0.14
396	0.15
397	0.15
398	0.13
399	0.11
400	0.09
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.08
405	0.1
406	0.09
407	0.09
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.12
412	0.13
413	0.12
414	0.12
415	0.13
416	0.13
417	0.14
418	0.14
419	0.11
420	0.1
421	0.13
422	0.13
423	0.14
424	0.16
425	0.18
426	0.21
427	0.23
428	0.26
429	0.32
430	0.39
431	0.42
432	0.43
433	0.42
434	0.39
435	0.38
436	0.39
437	0.33
438	0.29
439	0.28
440	0.26
441	0.24
442	0.23
443	0.22
444	0.18
445	0.17
446	0.14
447	0.13
448	0.12
449	0.14
450	0.15
451	0.16
452	0.14
453	0.15
454	0.16
455	0.19
456	0.18
457	0.16
458	0.16
459	0.17
460	0.19
461	0.16
462	0.16
463	0.12
464	0.13
465	0.12
466	0.11
467	0.09
468	0.08
469	0.07
470	0.06
471	0.06
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.04
476	0.04
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.04
482	0.05
483	0.06
484	0.07
485	0.1
486	0.15
487	0.19
488	0.24
489	0.27
490	0.27
491	0.28
492	0.3
493	0.29
494	0.31
495	0.35
496	0.3
497	0.28
498	0.29
499	0.26
500	0.24
501	0.24
502	0.2
503	0.17
504	0.19
505	0.21
506	0.23
507	0.24
508	0.25
509	0.24
510	0.2
511	0.16
512	0.14
513	0.13
514	0.1
515	0.1
516	0.12
517	0.16
518	0.16
519	0.17
520	0.18
521	0.18
522	0.21
523	0.21
524	0.19
525	0.2
526	0.22
527	0.21
528	0.2
529	0.18
530	0.14
531	0.13
532	0.11
533	0.07
534	0.04
535	0.04
536	0.1
537	0.13
538	0.18
539	0.18
540	0.19
541	0.24
542	0.26
543	0.28
544	0.26
545	0.27
546	0.28
547	0.3
548	0.32
549	0.3
550	0.3
551	0.3
552	0.27
553	0.28
554	0.29
555	0.32
556	0.35
557	0.36
558	0.36
559	0.35
560	0.35
561	0.34
562	0.29
563	0.25
564	0.22
565	0.21
566	0.19
567	0.19
568	0.18
569	0.14
570	0.12
571	0.11
572	0.12
573	0.07
574	0.07
575	0.07
576	0.08
577	0.09
578	0.09
579	0.09
580	0.07
581	0.07
582	0.1
583	0.1
584	0.09
585	0.08
586	0.08
587	0.08
588	0.1
589	0.1
590	0.08
591	0.07
592	0.09
593	0.1
594	0.12
595	0.12
596	0.12
597	0.15
598	0.16
599	0.16
600	0.19
601	0.18
602	0.16
603	0.16
604	0.2
605	0.18
606	0.23
607	0.24
608	0.23
609	0.24
610	0.24
611	0.26
612	0.27
613	0.27
614	0.23
615	0.21
616	0.18
617	0.16
618	0.16
619	0.13
620	0.08
621	0.06
622	0.05
623	0.05
624	0.06
625	0.06
626	0.07
627	0.1
628	0.12
629	0.15
630	0.15
631	0.18
632	0.21
633	0.23
634	0.23
635	0.28
636	0.25
637	0.25
638	0.28
639	0.29
640	0.3
641	0.36
642	0.36
643	0.33
644	0.36
645	0.38
646	0.43
647	0.42
648	0.42
649	0.36
650	0.37
651	0.41
652	0.4
653	0.42
654	0.41
655	0.42
656	0.43
657	0.52
658	0.59
659	0.58
660	0.61
661	0.61
662	0.61
663	0.64
664	0.65
665	0.59
666	0.5
667	0.44
668	0.44
669	0.38
670	0.33
671	0.29
672	0.25
673	0.22
674	0.22
675	0.22
676	0.19
677	0.27
678	0.28
679	0.27
680	0.32
681	0.35
682	0.44
683	0.48
684	0.47
685	0.44
686	0.5
687	0.47
688	0.43
689	0.41
690	0.31
691	0.29
692	0.28
693	0.23
694	0.17
695	0.18
696	0.2
697	0.18
698	0.18
699	0.15
700	0.15
701	0.16
702	0.13
703	0.12
704	0.09
705	0.09
706	0.09
707	0.11
708	0.11
709	0.1
710	0.1
711	0.12
712	0.12
713	0.13
714	0.13
715	0.14
716	0.23
717	0.26
718	0.28
719	0.29
720	0.35
721	0.36
722	0.38
723	0.37
724	0.3
725	0.31
726	0.3
727	0.26
728	0.21
729	0.18
730	0.16
731	0.14
732	0.12
733	0.08
734	0.08
735	0.09
736	0.09
737	0.09
738	0.08
739	0.08
740	0.09
741	0.08
742	0.07
743	0.08
744	0.09
745	0.09
746	0.09
747	0.09
748	0.11
749	0.12
750	0.17
751	0.17
752	0.21
753	0.28
754	0.35
755	0.46
756	0.54
757	0.62
758	0.66
759	0.76
760	0.78
761	0.8
762	0.82
763	0.76
764	0.7
765	0.63
766	0.54
767	0.43
768	0.38
769	0.33
770	0.32
771	0.36
772	0.4
773	0.43
774	0.47
775	0.49
776	0.52
777	0.5
778	0.46
779	0.4
780	0.35
781	0.31
782	0.27
783	0.24
784	0.19
785	0.16
786	0.11
787	0.1

R7SDE4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer