Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SBY4

Protein Details
Accession R7SBY4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-217QPDDTPPPPSRRKRRISDDDEVEAcidic
300-322ESSKSGRKRARSKKDQGDSRKTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-342KSGRKRARSKKDQGDSRKTKMPVKRGPISRVLGQEKHAIR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028386  CENP-C/Mif2/cnp3  
IPR025974  Mif2/CENP-C_cupin  
IPR014710  RmlC-like_jellyroll  
IPR011051  RmlC_Cupin_sf  
Gene Ontology GO:0000776  C:kinetochore  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0019237  F:centromeric DNA binding  
GO:0051382  P:kinetochore assembly  
KEGG tms:TREMEDRAFT_70107  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11699  CENP-C_C  
CDD cd06993  cupin_CENP-C_C  
Amino Acid Sequences MATQTTPGGTRRPRLEKAYVPFNAQPKAVGTRSGAPMPTNVPRRSDGFEDPDAFFKSPASEHPFRGRKSIIDTPGTVTSVGTVRRGRMSELVPDDDDDPFAEDLLGDEDDLARATPPPFFSKHNPPSVRLPKTSRLPPASPSVRYGDIPSPQKNSPYKSPRKSITAANRARRSSSTPPPEAELGIDELESTYVSQPDDTPPPPSRRKRRISDDDEVEPEVARHQTNRSSMMNKRTVQTEESDDEDAAGRSIMYDTGHEPEFDDPPTGFNGDAPDDMDLEDEQEMEDGEEEQEQEQEPQAESSKSGRKRARSKKDQGDSRKTKMPVKRGPISRVLGQEKHAIRKRISELEDDPDNDGVSGDFIVRRSGRKHFAPLAWWRGEKFSYKRGDKLAIIKEIVKVPEEVPEPLSSRYKPSRTGRSQSVKMESADVAEPEGLGWDNQTDPIGIVKDYPSGAEAKRRIAFPQSRLSPKPSETPGGHFLYQKVFGEEQFIAAGVIYIPVGGIKPGKHSKDNAYIFYVIAGAVNVKVHRTSFVMGVGSMFRVPRGNHYSIENISPNTQVQLFFAQARKLRSTEEEDTMADGVEEVEGETVAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.67
3 0.67
4 0.68
5 0.7
6 0.63
7 0.61
8 0.6
9 0.58
10 0.54
11 0.45
12 0.4
13 0.34
14 0.38
15 0.33
16 0.31
17 0.28
18 0.32
19 0.36
20 0.38
21 0.36
22 0.3
23 0.31
24 0.33
25 0.38
26 0.41
27 0.39
28 0.39
29 0.41
30 0.44
31 0.46
32 0.46
33 0.44
34 0.41
35 0.44
36 0.44
37 0.42
38 0.42
39 0.41
40 0.36
41 0.3
42 0.24
43 0.21
44 0.19
45 0.25
46 0.3
47 0.3
48 0.34
49 0.45
50 0.52
51 0.51
52 0.56
53 0.51
54 0.45
55 0.49
56 0.53
57 0.49
58 0.45
59 0.45
60 0.42
61 0.43
62 0.4
63 0.32
64 0.24
65 0.19
66 0.19
67 0.19
68 0.2
69 0.2
70 0.22
71 0.26
72 0.27
73 0.28
74 0.3
75 0.31
76 0.33
77 0.35
78 0.36
79 0.32
80 0.32
81 0.31
82 0.26
83 0.24
84 0.17
85 0.15
86 0.11
87 0.11
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.1
92 0.09
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.05
100 0.07
101 0.08
102 0.11
103 0.13
104 0.17
105 0.2
106 0.25
107 0.31
108 0.4
109 0.47
110 0.55
111 0.55
112 0.55
113 0.63
114 0.68
115 0.67
116 0.63
117 0.61
118 0.59
119 0.64
120 0.67
121 0.65
122 0.61
123 0.57
124 0.54
125 0.57
126 0.55
127 0.49
128 0.45
129 0.4
130 0.36
131 0.34
132 0.35
133 0.3
134 0.31
135 0.36
136 0.37
137 0.38
138 0.37
139 0.44
140 0.45
141 0.46
142 0.49
143 0.54
144 0.61
145 0.63
146 0.7
147 0.67
148 0.68
149 0.65
150 0.64
151 0.64
152 0.64
153 0.65
154 0.67
155 0.69
156 0.64
157 0.63
158 0.57
159 0.53
160 0.5
161 0.52
162 0.51
163 0.47
164 0.47
165 0.47
166 0.46
167 0.39
168 0.31
169 0.22
170 0.15
171 0.12
172 0.11
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.11
184 0.16
185 0.16
186 0.2
187 0.25
188 0.33
189 0.42
190 0.51
191 0.59
192 0.64
193 0.73
194 0.76
195 0.81
196 0.84
197 0.82
198 0.81
199 0.75
200 0.68
201 0.61
202 0.53
203 0.43
204 0.32
205 0.24
206 0.17
207 0.14
208 0.11
209 0.1
210 0.12
211 0.16
212 0.18
213 0.23
214 0.24
215 0.28
216 0.32
217 0.39
218 0.44
219 0.41
220 0.4
221 0.39
222 0.38
223 0.34
224 0.31
225 0.28
226 0.22
227 0.23
228 0.22
229 0.18
230 0.17
231 0.16
232 0.14
233 0.09
234 0.08
235 0.05
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.07
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.13
289 0.19
290 0.22
291 0.3
292 0.33
293 0.41
294 0.51
295 0.61
296 0.68
297 0.71
298 0.77
299 0.79
300 0.84
301 0.84
302 0.83
303 0.83
304 0.78
305 0.72
306 0.7
307 0.62
308 0.61
309 0.57
310 0.58
311 0.54
312 0.55
313 0.58
314 0.56
315 0.58
316 0.57
317 0.54
318 0.48
319 0.48
320 0.44
321 0.38
322 0.35
323 0.39
324 0.34
325 0.4
326 0.41
327 0.39
328 0.35
329 0.4
330 0.42
331 0.42
332 0.41
333 0.37
334 0.34
335 0.35
336 0.36
337 0.31
338 0.28
339 0.21
340 0.19
341 0.15
342 0.12
343 0.08
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.09
350 0.1
351 0.12
352 0.16
353 0.21
354 0.26
355 0.28
356 0.33
357 0.35
358 0.36
359 0.39
360 0.42
361 0.44
362 0.42
363 0.4
364 0.35
365 0.33
366 0.33
367 0.33
368 0.3
369 0.31
370 0.37
371 0.39
372 0.42
373 0.43
374 0.45
375 0.41
376 0.45
377 0.43
378 0.37
379 0.36
380 0.33
381 0.32
382 0.31
383 0.29
384 0.22
385 0.18
386 0.15
387 0.19
388 0.19
389 0.18
390 0.16
391 0.18
392 0.19
393 0.2
394 0.24
395 0.2
396 0.25
397 0.31
398 0.33
399 0.4
400 0.46
401 0.53
402 0.57
403 0.63
404 0.66
405 0.67
406 0.7
407 0.66
408 0.64
409 0.56
410 0.49
411 0.45
412 0.35
413 0.29
414 0.24
415 0.18
416 0.14
417 0.11
418 0.1
419 0.07
420 0.08
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.1
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.1
439 0.12
440 0.14
441 0.21
442 0.23
443 0.27
444 0.3
445 0.31
446 0.32
447 0.38
448 0.43
449 0.4
450 0.48
451 0.49
452 0.53
453 0.55
454 0.59
455 0.54
456 0.51
457 0.52
458 0.46
459 0.46
460 0.4
461 0.43
462 0.44
463 0.43
464 0.42
465 0.37
466 0.35
467 0.32
468 0.33
469 0.29
470 0.26
471 0.22
472 0.21
473 0.24
474 0.22
475 0.19
476 0.15
477 0.15
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.03
486 0.04
487 0.04
488 0.05
489 0.08
490 0.09
491 0.17
492 0.26
493 0.31
494 0.35
495 0.4
496 0.46
497 0.54
498 0.57
499 0.52
500 0.48
501 0.44
502 0.4
503 0.35
504 0.28
505 0.17
506 0.13
507 0.1
508 0.07
509 0.07
510 0.09
511 0.09
512 0.1
513 0.12
514 0.12
515 0.14
516 0.16
517 0.17
518 0.17
519 0.19
520 0.18
521 0.17
522 0.17
523 0.16
524 0.15
525 0.15
526 0.13
527 0.12
528 0.16
529 0.17
530 0.25
531 0.31
532 0.33
533 0.33
534 0.37
535 0.41
536 0.39
537 0.44
538 0.38
539 0.32
540 0.31
541 0.31
542 0.28
543 0.25
544 0.25
545 0.19
546 0.18
547 0.19
548 0.2
549 0.22
550 0.25
551 0.29
552 0.32
553 0.37
554 0.38
555 0.37
556 0.38
557 0.4
558 0.44
559 0.43
560 0.44
561 0.41
562 0.38
563 0.38
564 0.35
565 0.29
566 0.2
567 0.14
568 0.1
569 0.07
570 0.07
571 0.05
572 0.05