Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R7SA58

Protein Details
Accession R7SA58    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSMLRTVKPKNARVKRALEKREPQLIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-263RPKIDKK
269-273LGKKR
301-311RKMKGLKKSRG
Subcellular Location(s) nucl 24, mito_nucl 13.833, cyto_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG tms:TREMEDRAFT_70448  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MSMLRTVKPKNARVKRALEKREPQLIENEKTAIFVRGQNTSQRVRDCMKDLYALKRPLAINFSHKNDVHPFDDTSSLEFFARKNDASLLITGLHSKKRPHDLVLTRMFDGRVLDMLELGVEGFRAMSDVPSVKSSLGARPLIVFHSDLFDTHPSYQLLKSFFLDIYNGHSLSELPLTSIEHVISITASPLPSSTTTTSEAASQNPALIHFRVYTIKLSSSGTKIPEMQLTEMGPSIDFTIRRTKEAEDEMMKMALKRPKIDKKDVESGLGKKRKNIETDEMGDKVGRIHLDKQDLSKLQSRKMKGLKKSRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.84
4 0.85
5 0.84
6 0.83
7 0.81
8 0.82
9 0.74
10 0.65
11 0.64
12 0.63
13 0.56
14 0.49
15 0.44
16 0.34
17 0.34
18 0.33
19 0.25
20 0.19
21 0.2
22 0.21
23 0.23
24 0.25
25 0.3
26 0.34
27 0.38
28 0.42
29 0.4
30 0.43
31 0.41
32 0.44
33 0.42
34 0.41
35 0.37
36 0.38
37 0.39
38 0.42
39 0.47
40 0.45
41 0.41
42 0.42
43 0.41
44 0.37
45 0.37
46 0.32
47 0.32
48 0.35
49 0.4
50 0.41
51 0.41
52 0.42
53 0.45
54 0.46
55 0.4
56 0.36
57 0.32
58 0.27
59 0.29
60 0.26
61 0.22
62 0.19
63 0.17
64 0.15
65 0.15
66 0.13
67 0.15
68 0.18
69 0.15
70 0.16
71 0.16
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.15
76 0.13
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.18
81 0.2
82 0.23
83 0.28
84 0.35
85 0.38
86 0.38
87 0.45
88 0.46
89 0.51
90 0.55
91 0.52
92 0.44
93 0.42
94 0.39
95 0.3
96 0.26
97 0.17
98 0.11
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.03
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.09
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.19
186 0.19
187 0.17
188 0.17
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.16
201 0.15
202 0.16
203 0.16
204 0.18
205 0.18
206 0.19
207 0.21
208 0.2
209 0.2
210 0.21
211 0.21
212 0.22
213 0.22
214 0.2
215 0.19
216 0.17
217 0.16
218 0.16
219 0.14
220 0.11
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.22
227 0.23
228 0.25
229 0.27
230 0.27
231 0.3
232 0.33
233 0.37
234 0.3
235 0.31
236 0.31
237 0.3
238 0.29
239 0.24
240 0.26
241 0.25
242 0.25
243 0.28
244 0.36
245 0.45
246 0.53
247 0.62
248 0.64
249 0.67
250 0.74
251 0.7
252 0.66
253 0.61
254 0.6
255 0.6
256 0.59
257 0.53
258 0.49
259 0.56
260 0.57
261 0.56
262 0.57
263 0.54
264 0.54
265 0.59
266 0.57
267 0.49
268 0.44
269 0.39
270 0.32
271 0.25
272 0.21
273 0.18
274 0.16
275 0.22
276 0.27
277 0.34
278 0.36
279 0.39
280 0.44
281 0.45
282 0.47
283 0.49
284 0.47
285 0.48
286 0.54
287 0.54
288 0.56
289 0.63
290 0.67
291 0.69