FuNGI

C6HCG6

Protein Details

Accession

C6HCG6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-123	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic
407-427	AIFRRRRQTEERKNANAKRRK	Basic
435-458	EERSREEERSRKKRRSSPNYGSME	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
410-450	RRRRQTEERKNANAKRRKEEERYREEERSREEERSRKKRRS

Subcellular Location(s)

mito 9, nucl 8, cyto 8, cyto_nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSSKYPKIISPVVEEIPQEIDGEEVPVDTTKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPDGKPPPETEEDMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEADEKKEEFAKLLRKQNGSKGGEGLVEEVITKTWDSNVITPGTPFMDILAAALRYWVAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFIRSQRSCAEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQESKGRTCHLCGQTGHIAEACKGTAKEKNGEFDEKGKGSPLKPFIWLHVSVLREYLAVEMHVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPAMNGYLTKDGHVDLDRAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQTEERKNANAKRRKEEERYREEERSREEERSRKKRRSSPNYGSMENELVPPPLIVPGKGHISRADRELTHSMLVNRGAVYKANMANKSAAAVLKSQLIKGGSSGDAVTAGVEDSVDGTVNNTSPFSLGKRKADALETETESETPKKPDDTDELPPDTVRLWEDGYADRYYEQKFHVDPKDIEFRHKVARAYVEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDLGNMKIEFNKGAPFKPFEQLMGVLPAASNHAIPEVFHDLMSDPESEIIDFYPEDFPIDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKRLLLAMEKRYPLLSNEEHARNTTGREILFLSDRHPLYENLTANFYSKKQLAPTLKLNMRVSEGLGGKVGRNDAYVPHSSLVPPFDNGGLPTLDEDHSISVIYDMPKSMYTHKSMLLRGVKHNPPVLDKTDIEITRNKAQRSGRSFGGVPFGNGRGRGGRMSYASDRPSNDRPNPFAAHINPAYVPPAIPPSQMSGQPAGWIPPPPGITGSSSGAARFDKPYQDPPYQQQGGRGYSHQSGQRGHYSQSYNQPREYGQGRQYSQSQQYEQRGRGGYEQYSGGRSNSGGGGGGRGRGGGSYRGGGRGGPYHHGQNGYNGNRNDGYGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.49
4	0.51
5	0.47
6	0.46
7	0.44
8	0.41
9	0.39
10	0.36
11	0.31
12	0.29
13	0.26
14	0.19
15	0.14
16	0.13
17	0.11
18	0.12
19	0.1
20	0.08
21	0.08
22	0.08
23	0.09
24	0.1
25	0.14
26	0.21
27	0.26
28	0.29
29	0.3
30	0.33
31	0.37
32	0.38
33	0.39
34	0.34
35	0.33
36	0.3
37	0.28
38	0.25
39	0.2
40	0.18
41	0.12
42	0.09
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.37
54	0.43
55	0.49
56	0.49
57	0.5
58	0.52
59	0.54
60	0.48
61	0.43
62	0.37
63	0.31
64	0.28
65	0.23
66	0.18
67	0.14
68	0.13
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.13
73	0.14
74	0.17
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.46
80	0.45
81	0.46
82	0.45
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.46
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.82
105	0.79
106	0.76
107	0.77
108	0.77
109	0.72
110	0.73
111	0.65
112	0.59
113	0.64
114	0.58
115	0.49
116	0.47
117	0.41
118	0.35
119	0.4
120	0.37
121	0.31
122	0.35
123	0.42
124	0.43
125	0.51
126	0.55
127	0.55
128	0.58
129	0.65
130	0.69
131	0.62
132	0.56
133	0.49
134	0.43
135	0.38
136	0.34
137	0.27
138	0.17
139	0.13
140	0.12
141	0.1
142	0.09
143	0.08
144	0.08
145	0.07
146	0.08
147	0.12
148	0.13
149	0.16
150	0.19
151	0.21
152	0.21
153	0.21
154	0.21
155	0.19
156	0.17
157	0.14
158	0.11
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.13
173	0.18
174	0.25
175	0.25
176	0.27
177	0.28
178	0.31
179	0.36
180	0.33
181	0.29
182	0.26
183	0.32
184	0.28
185	0.29
186	0.26
187	0.21
188	0.24
189	0.24
190	0.21
191	0.16
192	0.15
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.09
197	0.09
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.13
203	0.17
204	0.26
205	0.27
206	0.28
207	0.3
208	0.33
209	0.35
210	0.38
211	0.42
212	0.39
213	0.47
214	0.51
215	0.51
216	0.53
217	0.49
218	0.43
219	0.35
220	0.29
221	0.22
222	0.19
223	0.16
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.06
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.07
237	0.08
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.18
242	0.2
243	0.24
244	0.25
245	0.26
246	0.25
247	0.28
248	0.27
249	0.24
250	0.28
251	0.24
252	0.24
253	0.24
254	0.24
255	0.21
256	0.24
257	0.33
258	0.29
259	0.34
260	0.32
261	0.36
262	0.39
263	0.39
264	0.36
265	0.28
266	0.25
267	0.2
268	0.21
269	0.15
270	0.12
271	0.12
272	0.14
273	0.18
274	0.21
275	0.27
276	0.28
277	0.33
278	0.34
279	0.38
280	0.37
281	0.36
282	0.38
283	0.32
284	0.3
285	0.28
286	0.28
287	0.25
288	0.3
289	0.31
290	0.27
291	0.3
292	0.31
293	0.3
294	0.32
295	0.31
296	0.27
297	0.26
298	0.25
299	0.21
300	0.21
301	0.18
302	0.13
303	0.13
304	0.11
305	0.07
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.11
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.15
314	0.16
315	0.16
316	0.17
317	0.16
318	0.14
319	0.15
320	0.16
321	0.16
322	0.16
323	0.16
324	0.13
325	0.11
326	0.11
327	0.1
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.08
344	0.12
345	0.15
346	0.16
347	0.15
348	0.16
349	0.16
350	0.15
351	0.15
352	0.1
353	0.06
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.08
363	0.07
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.12
370	0.12
371	0.11
372	0.11
373	0.11
374	0.12
375	0.12
376	0.12
377	0.1
378	0.14
379	0.14
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.08
391	0.09
392	0.12
393	0.13
394	0.2
395	0.26
396	0.29
397	0.37
398	0.4
399	0.44
400	0.5
401	0.59
402	0.62
403	0.67
404	0.72
405	0.72
406	0.79
407	0.8
408	0.81
409	0.78
410	0.72
411	0.7
412	0.69
413	0.68
414	0.68
415	0.72
416	0.72
417	0.72
418	0.72
419	0.69
420	0.68
421	0.63
422	0.57
423	0.52
424	0.49
425	0.42
426	0.42
427	0.41
428	0.43
429	0.51
430	0.58
431	0.62
432	0.64
433	0.7
434	0.74
435	0.8
436	0.83
437	0.83
438	0.8
439	0.81
440	0.77
441	0.69
442	0.61
443	0.52
444	0.43
445	0.32
446	0.25
447	0.15
448	0.11
449	0.1
450	0.09
451	0.07
452	0.09
453	0.09
454	0.08
455	0.08
456	0.1
457	0.15
458	0.16
459	0.17
460	0.17
461	0.2
462	0.21
463	0.23
464	0.24
465	0.19
466	0.22
467	0.23
468	0.2
469	0.18
470	0.18
471	0.16
472	0.15
473	0.15
474	0.12
475	0.1
476	0.1
477	0.1
478	0.08
479	0.09
480	0.11
481	0.14
482	0.18
483	0.18
484	0.18
485	0.19
486	0.18
487	0.18
488	0.15
489	0.12
490	0.09
491	0.09
492	0.08
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.12
497	0.12
498	0.12
499	0.11
500	0.12
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.05
508	0.04
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.02
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.04
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.08
526	0.16
527	0.19
528	0.21
529	0.23
530	0.24
531	0.25
532	0.26
533	0.25
534	0.21
535	0.21
536	0.19
537	0.19
538	0.17
539	0.17
540	0.16
541	0.17
542	0.15
543	0.14
544	0.14
545	0.14
546	0.14
547	0.17
548	0.21
549	0.23
550	0.27
551	0.29
552	0.29
553	0.28
554	0.27
555	0.25
556	0.2
557	0.16
558	0.11
559	0.08
560	0.07
561	0.08
562	0.1
563	0.11
564	0.13
565	0.13
566	0.12
567	0.12
568	0.14
569	0.14
570	0.14
571	0.14
572	0.14
573	0.15
574	0.22
575	0.25
576	0.27
577	0.27
578	0.29
579	0.38
580	0.35
581	0.38
582	0.33
583	0.32
584	0.33
585	0.36
586	0.32
587	0.25
588	0.28
589	0.25
590	0.26
591	0.24
592	0.18
593	0.15
594	0.14
595	0.11
596	0.08
597	0.07
598	0.04
599	0.03
600	0.03
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.06
605	0.06
606	0.07
607	0.12
608	0.16
609	0.15
610	0.19
611	0.2
612	0.25
613	0.28
614	0.3
615	0.27
616	0.23
617	0.23
618	0.2
619	0.19
620	0.15
621	0.12
622	0.09
623	0.07
624	0.07
625	0.08
626	0.08
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.08
632	0.09
633	0.07
634	0.08
635	0.13
636	0.13
637	0.15
638	0.18
639	0.2
640	0.22
641	0.24
642	0.24
643	0.19
644	0.19
645	0.19
646	0.17
647	0.15
648	0.13
649	0.1
650	0.09
651	0.09
652	0.08
653	0.08
654	0.07
655	0.05
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.1
660	0.13
661	0.13
662	0.13
663	0.13
664	0.13
665	0.14
666	0.15
667	0.12
668	0.07
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.07
674	0.06
675	0.06
676	0.07
677	0.08
678	0.07
679	0.08
680	0.08
681	0.08
682	0.09
683	0.13
684	0.13
685	0.13
686	0.16
687	0.15
688	0.16
689	0.17
690	0.16
691	0.15
692	0.13
693	0.14
694	0.15
695	0.17
696	0.15
697	0.14
698	0.13
699	0.12
700	0.12
701	0.12
702	0.08
703	0.07
704	0.08
705	0.09
706	0.09
707	0.12
708	0.17
709	0.22
710	0.27
711	0.28
712	0.27
713	0.27
714	0.28
715	0.26
716	0.26
717	0.22
718	0.21
719	0.26
720	0.29
721	0.29
722	0.29
723	0.3
724	0.24
725	0.24
726	0.23
727	0.2
728	0.17
729	0.17
730	0.17
731	0.16
732	0.18
733	0.17
734	0.16
735	0.2
736	0.2
737	0.2
738	0.21
739	0.2
740	0.22
741	0.28
742	0.28
743	0.22
744	0.24
745	0.23
746	0.23
747	0.24
748	0.21
749	0.18
750	0.18
751	0.19
752	0.19
753	0.27
754	0.31
755	0.34
756	0.4
757	0.45
758	0.46
759	0.51
760	0.5
761	0.43
762	0.41
763	0.36
764	0.3
765	0.27
766	0.25
767	0.18
768	0.18
769	0.18
770	0.15
771	0.16
772	0.17
773	0.12
774	0.11
775	0.12
776	0.12
777	0.17
778	0.18
779	0.18
780	0.18
781	0.18
782	0.18
783	0.19
784	0.2
785	0.17
786	0.15
787	0.15
788	0.15
789	0.15
790	0.15
791	0.15
792	0.11
793	0.1
794	0.1
795	0.11
796	0.1
797	0.1
798	0.11
799	0.09
800	0.09
801	0.09
802	0.09
803	0.07
804	0.1
805	0.1
806	0.1
807	0.1
808	0.11
809	0.13
810	0.15
811	0.2
812	0.21
813	0.24
814	0.26
815	0.3
816	0.33
817	0.32
818	0.39
819	0.4
820	0.39
821	0.42
822	0.48
823	0.49
824	0.49
825	0.52
826	0.45
827	0.44
828	0.45
829	0.42
830	0.38
831	0.34
832	0.32
833	0.36
834	0.35
835	0.32
836	0.33
837	0.34
838	0.38
839	0.43
840	0.41
841	0.39
842	0.45
843	0.52
844	0.53
845	0.53
846	0.46
847	0.45
848	0.45
849	0.4
850	0.41
851	0.32
852	0.26
853	0.25
854	0.25
855	0.23
856	0.23
857	0.23
858	0.19
859	0.21
860	0.21
861	0.2
862	0.2
863	0.2
864	0.26
865	0.29
866	0.31
867	0.34
868	0.36
869	0.37
870	0.4
871	0.46
872	0.49
873	0.53
874	0.53
875	0.53
876	0.55
877	0.56
878	0.52
879	0.5
880	0.43
881	0.43
882	0.38
883	0.36
884	0.3
885	0.27
886	0.27
887	0.21
888	0.19
889	0.12
890	0.17
891	0.16
892	0.17
893	0.17
894	0.21
895	0.24
896	0.26
897	0.27
898	0.24
899	0.24
900	0.25
901	0.25
902	0.21
903	0.2
904	0.2
905	0.19
906	0.2
907	0.21
908	0.2
909	0.2
910	0.2
911	0.2
912	0.22
913	0.23
914	0.2
915	0.2
916	0.19
917	0.2
918	0.2
919	0.19
920	0.2
921	0.22
922	0.26
923	0.3
924	0.39
925	0.43
926	0.48
927	0.51
928	0.53
929	0.6
930	0.58
931	0.55
932	0.53
933	0.53
934	0.5
935	0.48
936	0.43
937	0.38
938	0.35
939	0.4
940	0.37
941	0.36
942	0.36
943	0.38
944	0.45
945	0.42
946	0.42
947	0.44
948	0.44
949	0.45
950	0.52
951	0.58
952	0.53
953	0.53
954	0.53
955	0.47
956	0.49
957	0.46
958	0.44
959	0.4
960	0.45
961	0.46
962	0.47
963	0.51
964	0.52
965	0.57
966	0.55
967	0.53
968	0.52
969	0.6
970	0.64
971	0.61
972	0.61
973	0.55
974	0.51
975	0.52
976	0.49
977	0.41
978	0.35
979	0.37
980	0.31
981	0.32
982	0.31
983	0.26
984	0.22
985	0.2
986	0.2
987	0.17
988	0.16
989	0.14
990	0.13
991	0.16
992	0.16
993	0.17
994	0.15
995	0.14
996	0.14
997	0.13
998	0.16
999	0.15
1000	0.17
1001	0.2
1002	0.21
1003	0.23
1004	0.24
1005	0.23
1006	0.24
1007	0.26
1008	0.27
1009	0.27
1010	0.29
1011	0.33
1012	0.36
1013	0.39
1014	0.37
1015	0.39
1016	0.46
1017	0.47
1018	0.52
1019	0.47
1020	0.48
1021	0.45
1022	0.46

C6HCG6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer