Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6H4B4

Protein Details
Accession C6H4B4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-53LERPIRTRKQHELRRIFLKTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 7, cyto 6.5, mito 6, cyto_nucl 5.5, nucl 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
CDD cd11371  RNase_PH_MTR3  
Amino Acid Sequences MADKRRLNGPPGGTRPPVFASSLLSSDGQHCVALERPIRTRKQHELRRIFLKTGLIPSASGSAYLEFQPSSFIARSKLKTLIPPSSSLKLICSIHGPKPLPRSAPFSPNLLLSTHVKFAPFASRRRRGNIRDVNERDLGVHLETALRGAIIAERWPKSGLDITVTVLEGEDDCWWGDVLSPGPLGSVDGWGLMNVLAGCITVASAAIADARIDCMDLITGGVAAFVESPNVEASGRTKDSSQRGHGYSLVLDPDPSEHLGIVSACVVGYMPSRDEITELWLKGDTSNISAGSQNAAARHEALIDGAVDAARGAQAVLAEAVRESAERFAIHAGKKLALSGSGTEDIEMKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.48
4 0.42
5 0.34
6 0.28
7 0.27
8 0.25
9 0.26
10 0.24
11 0.21
12 0.2
13 0.2
14 0.22
15 0.17
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.16
20 0.22
21 0.25
22 0.27
23 0.34
24 0.42
25 0.49
26 0.54
27 0.59
28 0.63
29 0.7
30 0.75
31 0.78
32 0.79
33 0.79
34 0.81
35 0.77
36 0.68
37 0.6
38 0.55
39 0.47
40 0.42
41 0.37
42 0.28
43 0.24
44 0.23
45 0.23
46 0.18
47 0.15
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.09
54 0.09
55 0.11
56 0.11
57 0.14
58 0.13
59 0.14
60 0.18
61 0.25
62 0.27
63 0.29
64 0.34
65 0.32
66 0.37
67 0.42
68 0.45
69 0.4
70 0.42
71 0.43
72 0.41
73 0.41
74 0.34
75 0.3
76 0.27
77 0.26
78 0.22
79 0.24
80 0.25
81 0.28
82 0.35
83 0.36
84 0.35
85 0.41
86 0.44
87 0.42
88 0.4
89 0.43
90 0.39
91 0.44
92 0.41
93 0.38
94 0.35
95 0.31
96 0.3
97 0.23
98 0.22
99 0.18
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.16
106 0.23
107 0.25
108 0.3
109 0.38
110 0.46
111 0.49
112 0.55
113 0.63
114 0.58
115 0.64
116 0.66
117 0.62
118 0.65
119 0.65
120 0.62
121 0.55
122 0.5
123 0.39
124 0.31
125 0.26
126 0.16
127 0.12
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.07
139 0.11
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.17
146 0.14
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.1
153 0.08
154 0.07
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.03
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.08
221 0.13
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.22
226 0.28
227 0.34
228 0.37
229 0.37
230 0.38
231 0.39
232 0.38
233 0.33
234 0.28
235 0.24
236 0.2
237 0.14
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.11
263 0.15
264 0.19
265 0.18
266 0.18
267 0.18
268 0.19
269 0.18
270 0.21
271 0.16
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.15
280 0.14
281 0.14
282 0.15
283 0.14
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.17
316 0.23
317 0.24
318 0.29
319 0.29
320 0.3
321 0.3
322 0.3
323 0.26
324 0.21
325 0.22
326 0.18
327 0.21
328 0.21
329 0.21
330 0.2