Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HSS5

Protein Details
Accession C6HSS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-200LTAPSAARRRQREPRLRRRRRRHGRQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-200APSAARRRQREPRLRRRRRRHGRQ
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 11, nucl 9, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002769  eIF6  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0042256  P:cytosolic ribosome assembly  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000054  P:ribosomal subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF01912  eIF-6  
CDD cd00527  IF6  
Amino Acid Sequences MAVRARFENSNEVGVFATLTNSYALVAIGSSENFYSIFEAELQDVIPICHATIAGTRIVGRLTAGNRKGLLVPTSTTDQELQHLRNSLPDAVKIQRIEERLTALGNVICCNDHAALVHPDLERETEEIIADVLGVEVFRQTIADNVLTGSYMSLSNQGGLVHPQNLHPRSRRALLTAPSAARRRQREPRLRRRRRRHGRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.13
4 0.13
5 0.08
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.06
13 0.05
14 0.05
15 0.06
16 0.06
17 0.07
18 0.06
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.1
49 0.12
50 0.2
51 0.21
52 0.22
53 0.22
54 0.23
55 0.24
56 0.22
57 0.2
58 0.14
59 0.13
60 0.14
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.16
67 0.18
68 0.17
69 0.17
70 0.18
71 0.17
72 0.18
73 0.19
74 0.19
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.19
80 0.17
81 0.17
82 0.18
83 0.19
84 0.19
85 0.17
86 0.17
87 0.14
88 0.14
89 0.13
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.04
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.05
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.12
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.19
151 0.28
152 0.3
153 0.37
154 0.38
155 0.43
156 0.45
157 0.5
158 0.48
159 0.43
160 0.48
161 0.45
162 0.46
163 0.45
164 0.43
165 0.45
166 0.48
167 0.49
168 0.5
169 0.53
170 0.55
171 0.61
172 0.69
173 0.72
174 0.79
175 0.85
176 0.88
177 0.93
178 0.95
179 0.96
180 0.96