Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D0DZ44

Protein Details
Accession A0A0D0DZ44    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-216PETLQRERHDRKKKKLVKIEHEGFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-86RGRGRGRGRGGEGRGAAPR
201-207HDRKKKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14.5, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSSQGEAGPSGGQKAIGSLAKKQSDVTRQGTQKLKFVPTLPARRKKEEVKQEAPPSSVATTTERGTVRGRGRGRGRGGEGRGAAPRPPPVEMTASGPFAMGPALAGTSARRSAPRSNFAPIVPLGPTNASNLGANLSNTAAPALEKNKQRENVLVDGGQRPKTENDEEVYSEPDEGVQIIDMENVRQMDWMAPETLQRERHDRKKKKLVKIEHEGFVLPSTPKGKDPAGKVINDGQEVDSSNALNLSESEEEEELEDLIEDFAIRAGTAEEGIRQERLYFFQFPEPFPTFISNVTPPSESPLAMDIDTPDQGTSTAKRRVSFADDVKSPAPATSSTTPAGAVVEPPKKPKVDGIIGQLEVYRSGTVKMRLDNGIVLNVFEATQPSFLQQAVHLDMDNKKLHVLGEVNKRFVVSPDLDTLLTAMEAADKRDGGMALDDANLIKMDTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.17
3 0.18
4 0.2
5 0.25
6 0.33
7 0.35
8 0.36
9 0.38
10 0.41
11 0.45
12 0.51
13 0.5
14 0.51
15 0.52
16 0.59
17 0.65
18 0.6
19 0.57
20 0.56
21 0.55
22 0.49
23 0.47
24 0.49
25 0.51
26 0.59
27 0.63
28 0.67
29 0.69
30 0.73
31 0.78
32 0.77
33 0.78
34 0.78
35 0.78
36 0.74
37 0.76
38 0.77
39 0.73
40 0.65
41 0.56
42 0.48
43 0.39
44 0.33
45 0.26
46 0.22
47 0.21
48 0.2
49 0.25
50 0.23
51 0.24
52 0.26
53 0.32
54 0.33
55 0.39
56 0.41
57 0.44
58 0.5
59 0.56
60 0.58
61 0.57
62 0.58
63 0.57
64 0.57
65 0.53
66 0.48
67 0.43
68 0.41
69 0.36
70 0.32
71 0.27
72 0.29
73 0.26
74 0.26
75 0.25
76 0.23
77 0.26
78 0.25
79 0.27
80 0.25
81 0.24
82 0.22
83 0.21
84 0.18
85 0.14
86 0.13
87 0.07
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.08
95 0.1
96 0.11
97 0.13
98 0.17
99 0.26
100 0.33
101 0.39
102 0.4
103 0.42
104 0.43
105 0.41
106 0.41
107 0.32
108 0.27
109 0.2
110 0.18
111 0.14
112 0.13
113 0.14
114 0.12
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.09
130 0.11
131 0.17
132 0.23
133 0.28
134 0.34
135 0.37
136 0.38
137 0.4
138 0.41
139 0.38
140 0.34
141 0.31
142 0.26
143 0.29
144 0.31
145 0.29
146 0.25
147 0.23
148 0.23
149 0.26
150 0.26
151 0.23
152 0.22
153 0.21
154 0.23
155 0.22
156 0.22
157 0.18
158 0.15
159 0.13
160 0.11
161 0.09
162 0.07
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.11
182 0.15
183 0.18
184 0.19
185 0.26
186 0.32
187 0.42
188 0.52
189 0.59
190 0.65
191 0.72
192 0.8
193 0.81
194 0.84
195 0.83
196 0.8
197 0.81
198 0.76
199 0.67
200 0.58
201 0.49
202 0.39
203 0.3
204 0.23
205 0.13
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.15
212 0.18
213 0.21
214 0.28
215 0.29
216 0.29
217 0.29
218 0.32
219 0.31
220 0.27
221 0.25
222 0.16
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.12
265 0.15
266 0.15
267 0.16
268 0.23
269 0.25
270 0.25
271 0.3
272 0.3
273 0.28
274 0.26
275 0.28
276 0.21
277 0.2
278 0.23
279 0.18
280 0.17
281 0.18
282 0.18
283 0.15
284 0.2
285 0.2
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.14
291 0.14
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.1
300 0.12
301 0.17
302 0.24
303 0.26
304 0.27
305 0.29
306 0.32
307 0.37
308 0.41
309 0.39
310 0.38
311 0.37
312 0.39
313 0.37
314 0.35
315 0.29
316 0.22
317 0.18
318 0.13
319 0.18
320 0.17
321 0.2
322 0.19
323 0.19
324 0.19
325 0.18
326 0.18
327 0.12
328 0.13
329 0.16
330 0.22
331 0.23
332 0.28
333 0.32
334 0.32
335 0.33
336 0.34
337 0.35
338 0.36
339 0.39
340 0.41
341 0.42
342 0.41
343 0.4
344 0.36
345 0.29
346 0.23
347 0.19
348 0.13
349 0.09
350 0.1
351 0.15
352 0.19
353 0.22
354 0.24
355 0.27
356 0.28
357 0.29
358 0.3
359 0.26
360 0.25
361 0.21
362 0.18
363 0.15
364 0.14
365 0.13
366 0.1
367 0.1
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.16
377 0.17
378 0.18
379 0.17
380 0.2
381 0.23
382 0.28
383 0.29
384 0.24
385 0.22
386 0.22
387 0.22
388 0.23
389 0.25
390 0.27
391 0.36
392 0.4
393 0.42
394 0.41
395 0.41
396 0.37
397 0.34
398 0.33
399 0.25
400 0.23
401 0.25
402 0.27
403 0.26
404 0.25
405 0.23
406 0.17
407 0.14
408 0.1
409 0.07
410 0.1
411 0.11
412 0.13
413 0.15
414 0.15
415 0.15
416 0.18
417 0.18
418 0.14
419 0.15
420 0.14
421 0.13
422 0.13
423 0.14
424 0.11
425 0.12
426 0.11