Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D0DRX4

Protein Details
Accession A0A0D0DRX4    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MSSADPKQTPRKQKQKESRSKQPPNGAERLKHydrophilic
59-83VTWRAFYPGKTRKRVNKESLPSRAYHydrophilic
395-418GSGNKGKESRGKQREEKSRQTPVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-21RKQKQKESRSK
216-251KEEAKKKAAAATAAQVAKQPEPPAPPASKKGKKAAA
377-382KKRDKG
399-408KGKESRGKQR
459-476RGGARRGRGRGRGGNRGG
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSSADPKQTPRKQKQKESRSKQPPNGAERLKTVVRRLPPNLPEEIFWQSVQAWVSDETVTWRAFYPGKTRKRVNKESLPSRAYIAFKNEEQVATFSREYDGHLFRDKAGKESHAVVEFSPFQKIPTEKKKIDARNNTIDKDEDYISFIESLKSAEKNEPLPLEALIAASQPPPPPTTTPLLEALKAEKSAQKDKEAILRNHAHYKDPVASGLTSKKEEAKKKAAAATAAQVAKQPEPPAPPASKKGKKAAAAAAAAAAQKAPLPNAQHGQTAPPKGQHVSAGGPSTTKPSAPAPPTAPRVRPPREPHGRQPSAKGTIVAPAPAPAPPTSTEGVAVALPPAQAQGQLRRGRPVIGLGRQFEAALSGAGVAVGQGGDRKKRDKGGEPGSGTAEGSVGSGNKGKESRGKQREEKSRQTPVVPSILQRPESAAGLPDVVIMQRPLSPPGVEGTGGNVDASAGRGGARRGRGRGRGGNRGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.92
3 0.94
4 0.93
5 0.93
6 0.93
7 0.94
8 0.91
9 0.9
10 0.88
11 0.84
12 0.84
13 0.78
14 0.7
15 0.63
16 0.61
17 0.56
18 0.52
19 0.5
20 0.48
21 0.49
22 0.54
23 0.56
24 0.59
25 0.58
26 0.58
27 0.57
28 0.51
29 0.45
30 0.41
31 0.41
32 0.33
33 0.28
34 0.25
35 0.2
36 0.22
37 0.21
38 0.17
39 0.14
40 0.13
41 0.15
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.21
51 0.24
52 0.3
53 0.36
54 0.46
55 0.53
56 0.61
57 0.68
58 0.76
59 0.83
60 0.82
61 0.83
62 0.84
63 0.85
64 0.85
65 0.77
66 0.67
67 0.6
68 0.55
69 0.47
70 0.4
71 0.37
72 0.32
73 0.3
74 0.32
75 0.31
76 0.26
77 0.25
78 0.24
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.2
86 0.24
87 0.25
88 0.23
89 0.27
90 0.28
91 0.28
92 0.35
93 0.32
94 0.3
95 0.3
96 0.28
97 0.26
98 0.29
99 0.31
100 0.26
101 0.26
102 0.22
103 0.23
104 0.24
105 0.23
106 0.22
107 0.18
108 0.16
109 0.21
110 0.25
111 0.3
112 0.38
113 0.46
114 0.45
115 0.52
116 0.61
117 0.65
118 0.72
119 0.73
120 0.7
121 0.71
122 0.75
123 0.68
124 0.61
125 0.52
126 0.43
127 0.36
128 0.29
129 0.19
130 0.16
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.18
143 0.19
144 0.22
145 0.22
146 0.2
147 0.19
148 0.17
149 0.15
150 0.12
151 0.11
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.14
162 0.17
163 0.21
164 0.2
165 0.22
166 0.26
167 0.26
168 0.24
169 0.23
170 0.21
171 0.18
172 0.18
173 0.16
174 0.14
175 0.17
176 0.25
177 0.26
178 0.27
179 0.28
180 0.29
181 0.36
182 0.41
183 0.37
184 0.37
185 0.4
186 0.39
187 0.44
188 0.44
189 0.38
190 0.31
191 0.33
192 0.29
193 0.24
194 0.22
195 0.16
196 0.15
197 0.16
198 0.19
199 0.18
200 0.15
201 0.16
202 0.21
203 0.27
204 0.33
205 0.38
206 0.41
207 0.42
208 0.44
209 0.47
210 0.42
211 0.37
212 0.31
213 0.27
214 0.24
215 0.21
216 0.18
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.17
221 0.16
222 0.13
223 0.15
224 0.17
225 0.19
226 0.21
227 0.22
228 0.27
229 0.36
230 0.4
231 0.42
232 0.46
233 0.47
234 0.47
235 0.48
236 0.45
237 0.39
238 0.34
239 0.3
240 0.23
241 0.19
242 0.16
243 0.13
244 0.09
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.08
250 0.1
251 0.12
252 0.15
253 0.16
254 0.17
255 0.17
256 0.21
257 0.23
258 0.23
259 0.22
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.21
264 0.18
265 0.15
266 0.15
267 0.16
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.15
273 0.14
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.2
278 0.21
279 0.25
280 0.25
281 0.31
282 0.37
283 0.39
284 0.39
285 0.4
286 0.47
287 0.48
288 0.53
289 0.54
290 0.58
291 0.65
292 0.68
293 0.71
294 0.73
295 0.75
296 0.67
297 0.67
298 0.62
299 0.57
300 0.52
301 0.43
302 0.32
303 0.29
304 0.28
305 0.23
306 0.17
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.13
311 0.09
312 0.11
313 0.12
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.13
319 0.14
320 0.12
321 0.1
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.08
329 0.1
330 0.16
331 0.24
332 0.3
333 0.31
334 0.35
335 0.36
336 0.36
337 0.34
338 0.35
339 0.33
340 0.33
341 0.37
342 0.34
343 0.35
344 0.33
345 0.32
346 0.25
347 0.19
348 0.13
349 0.09
350 0.07
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.06
360 0.1
361 0.15
362 0.19
363 0.24
364 0.28
365 0.36
366 0.42
367 0.48
368 0.55
369 0.58
370 0.63
371 0.61
372 0.58
373 0.53
374 0.47
375 0.38
376 0.29
377 0.2
378 0.11
379 0.09
380 0.08
381 0.06
382 0.07
383 0.11
384 0.11
385 0.16
386 0.17
387 0.19
388 0.27
389 0.35
390 0.45
391 0.5
392 0.59
393 0.63
394 0.72
395 0.81
396 0.81
397 0.83
398 0.81
399 0.81
400 0.76
401 0.71
402 0.66
403 0.59
404 0.57
405 0.48
406 0.42
407 0.41
408 0.43
409 0.41
410 0.37
411 0.36
412 0.3
413 0.3
414 0.28
415 0.21
416 0.16
417 0.15
418 0.15
419 0.12
420 0.1
421 0.09
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.12
426 0.14
427 0.16
428 0.18
429 0.18
430 0.18
431 0.2
432 0.21
433 0.18
434 0.16
435 0.17
436 0.17
437 0.17
438 0.16
439 0.13
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.09
444 0.07
445 0.08
446 0.11
447 0.14
448 0.2
449 0.28
450 0.33
451 0.41
452 0.49
453 0.56
454 0.62
455 0.69
456 0.71