Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HM06

Protein Details
Accession C6HM06    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-193VTTQSSEKSRKHRRHRHRDDEDDERBasic
215-238DENDRRSHHHRIHRSRRRSSSPSPBasic
261-288SYSPHLRDRSRDRSRRLPRENSSHSRKEBasic
333-352VSNYATKRQRARPSSCCTLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-187KSRKHRRHRHRD
193-289RTSRHRSRRHDDTSERYRSRRHDENDRRSHHHRIHRSRRRSSSPSPSRNPPPDHHLSRRSPSPDQRRRSYSPHLRDRSRDRSRRLPRENSSHSRKES
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGDLNLKKSWHPVLQKNQERVWLEQKKALEERKRIEQMMKERQEERQIQELQEMQEAAGGKKRLNRVDWMYSGPAAGQTGTTEEMEGYLLGKRRIDDLIKGSENSKLQKSSTEGSFMALQNANTARDVAAKVREDPMLAIKKQEQAAYEAMMNDPVRRKQLLKAAGVVTTQSSEKSRKHRRHRHRDDEDDERTSRHRSRRHDDTSERYRSRRHDENDRRSHHHRIHRSRRRSSSPSPSRNPPPDHHLSRRSPSPDQRRRSYSPHLRDRSRDRSRRLPRENSSHSRKESWHHSRGVSPPPSRHRSDTAAPSREARPTTAAPTMISDEERKGQVSNYATKRQRARPSSCCTLSRC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.67
3 0.75
4 0.76
5 0.72
6 0.72
7 0.67
8 0.63
9 0.63
10 0.6
11 0.54
12 0.52
13 0.51
14 0.51
15 0.55
16 0.59
17 0.57
18 0.57
19 0.6
20 0.65
21 0.69
22 0.64
23 0.62
24 0.61
25 0.62
26 0.65
27 0.66
28 0.61
29 0.58
30 0.6
31 0.63
32 0.61
33 0.56
34 0.54
35 0.5
36 0.46
37 0.47
38 0.46
39 0.38
40 0.34
41 0.3
42 0.2
43 0.19
44 0.2
45 0.16
46 0.19
47 0.18
48 0.18
49 0.23
50 0.3
51 0.33
52 0.35
53 0.41
54 0.42
55 0.48
56 0.48
57 0.46
58 0.42
59 0.36
60 0.33
61 0.26
62 0.2
63 0.14
64 0.12
65 0.08
66 0.06
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.11
78 0.12
79 0.14
80 0.14
81 0.16
82 0.19
83 0.2
84 0.21
85 0.23
86 0.28
87 0.29
88 0.29
89 0.28
90 0.29
91 0.3
92 0.3
93 0.29
94 0.24
95 0.23
96 0.25
97 0.28
98 0.27
99 0.26
100 0.26
101 0.22
102 0.22
103 0.25
104 0.22
105 0.22
106 0.19
107 0.18
108 0.17
109 0.18
110 0.17
111 0.14
112 0.14
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.19
121 0.19
122 0.17
123 0.17
124 0.21
125 0.22
126 0.21
127 0.22
128 0.22
129 0.26
130 0.27
131 0.28
132 0.21
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.17
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.17
146 0.19
147 0.2
148 0.27
149 0.31
150 0.29
151 0.31
152 0.29
153 0.28
154 0.27
155 0.23
156 0.16
157 0.11
158 0.1
159 0.08
160 0.09
161 0.13
162 0.17
163 0.27
164 0.38
165 0.47
166 0.58
167 0.68
168 0.77
169 0.84
170 0.91
171 0.92
172 0.9
173 0.89
174 0.83
175 0.8
176 0.72
177 0.65
178 0.54
179 0.44
180 0.37
181 0.34
182 0.35
183 0.34
184 0.37
185 0.41
186 0.48
187 0.57
188 0.62
189 0.65
190 0.65
191 0.67
192 0.69
193 0.7
194 0.66
195 0.58
196 0.56
197 0.53
198 0.55
199 0.55
200 0.51
201 0.53
202 0.61
203 0.7
204 0.74
205 0.74
206 0.74
207 0.7
208 0.73
209 0.7
210 0.68
211 0.68
212 0.7
213 0.76
214 0.79
215 0.84
216 0.85
217 0.85
218 0.84
219 0.81
220 0.78
221 0.78
222 0.78
223 0.78
224 0.74
225 0.74
226 0.74
227 0.74
228 0.71
229 0.63
230 0.6
231 0.6
232 0.62
233 0.62
234 0.62
235 0.59
236 0.59
237 0.63
238 0.61
239 0.59
240 0.62
241 0.65
242 0.67
243 0.69
244 0.72
245 0.73
246 0.72
247 0.71
248 0.72
249 0.72
250 0.72
251 0.75
252 0.75
253 0.73
254 0.75
255 0.78
256 0.78
257 0.78
258 0.76
259 0.73
260 0.76
261 0.82
262 0.85
263 0.84
264 0.83
265 0.8
266 0.82
267 0.84
268 0.83
269 0.81
270 0.78
271 0.73
272 0.68
273 0.62
274 0.59
275 0.6
276 0.6
277 0.59
278 0.55
279 0.53
280 0.55
281 0.58
282 0.61
283 0.59
284 0.55
285 0.56
286 0.61
287 0.65
288 0.64
289 0.63
290 0.59
291 0.56
292 0.58
293 0.6
294 0.61
295 0.59
296 0.56
297 0.55
298 0.52
299 0.52
300 0.46
301 0.38
302 0.33
303 0.31
304 0.34
305 0.34
306 0.32
307 0.27
308 0.29
309 0.29
310 0.25
311 0.25
312 0.23
313 0.22
314 0.25
315 0.26
316 0.24
317 0.22
318 0.22
319 0.26
320 0.29
321 0.36
322 0.38
323 0.47
324 0.51
325 0.58
326 0.66
327 0.69
328 0.74
329 0.74
330 0.76
331 0.75
332 0.79
333 0.81
334 0.78