Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D0E407

Protein Details
Accession A0A0D0E407    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-41GETPINEPPQPKKKRKLPTLSSSLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-31KKKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MKRGSVGLVAYSSSEDGETPINEPPQPKKKRKLPTLSSSLTIPTPIDNPALHQGRVRTIPHVEGQYATYIYVPLVLHPKDVLYTLLQDVLKFAEEPVPSLYPIGRQSDGQIAGSRAAQWELHISLSHPLFLRAHQREEFKRAIQQVASSLAPFDASFAAFSELTNDERTRTFLAVEVGAGHVELRRCLDLLSPTLRLLRQKEFYADPKFHASIAWALLEKTPSPSNPALFPTTGVLDEIALDEFPPPGDEAVHRSISPPTSTESKENFARIPHFPRSLVPSINQAYAGKLSEARTGGFVVDRISVKIGKDIFTWPLKLVRNGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.12
5 0.12
6 0.13
7 0.16
8 0.19
9 0.21
10 0.25
11 0.33
12 0.41
13 0.51
14 0.59
15 0.66
16 0.72
17 0.81
18 0.87
19 0.89
20 0.87
21 0.87
22 0.86
23 0.79
24 0.71
25 0.61
26 0.53
27 0.42
28 0.34
29 0.24
30 0.17
31 0.15
32 0.15
33 0.16
34 0.14
35 0.17
36 0.25
37 0.28
38 0.27
39 0.28
40 0.28
41 0.31
42 0.36
43 0.34
44 0.29
45 0.28
46 0.3
47 0.32
48 0.32
49 0.28
50 0.23
51 0.23
52 0.21
53 0.19
54 0.16
55 0.12
56 0.1
57 0.09
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.16
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.09
70 0.11
71 0.11
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.16
84 0.16
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.14
89 0.16
90 0.18
91 0.16
92 0.15
93 0.17
94 0.22
95 0.22
96 0.2
97 0.19
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.12
112 0.12
113 0.14
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.14
118 0.23
119 0.22
120 0.26
121 0.28
122 0.33
123 0.35
124 0.4
125 0.4
126 0.32
127 0.34
128 0.32
129 0.3
130 0.25
131 0.23
132 0.18
133 0.18
134 0.17
135 0.12
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.13
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.17
182 0.18
183 0.2
184 0.22
185 0.24
186 0.25
187 0.25
188 0.27
189 0.29
190 0.35
191 0.37
192 0.35
193 0.32
194 0.33
195 0.33
196 0.29
197 0.26
198 0.2
199 0.16
200 0.16
201 0.14
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.18
211 0.19
212 0.2
213 0.21
214 0.24
215 0.23
216 0.21
217 0.22
218 0.18
219 0.16
220 0.15
221 0.13
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.13
238 0.17
239 0.19
240 0.18
241 0.19
242 0.21
243 0.23
244 0.23
245 0.19
246 0.19
247 0.22
248 0.25
249 0.3
250 0.31
251 0.34
252 0.36
253 0.37
254 0.35
255 0.34
256 0.35
257 0.35
258 0.38
259 0.4
260 0.4
261 0.38
262 0.4
263 0.43
264 0.44
265 0.4
266 0.35
267 0.36
268 0.35
269 0.35
270 0.34
271 0.27
272 0.24
273 0.24
274 0.24
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.21
279 0.22
280 0.2
281 0.2
282 0.19
283 0.19
284 0.17
285 0.16
286 0.12
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.19
291 0.2
292 0.2
293 0.25
294 0.25
295 0.22
296 0.23
297 0.25
298 0.28
299 0.3
300 0.32
301 0.28
302 0.34
303 0.37