FuNGI

A0A0D0DVN3

Protein Details

Accession

A0A0D0DVN3

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
276-382	DGERSNPRRRKRGSKNKSKESNKRKRRRTKDSEEDSDSEDERIKIKKKRPRKDDDSDEQSSDVPKSKKRKRRSKKSEEEEEEEEEVPNNKKRKGKSKKRDDSSSEGS	Basic
390-417	SEDERPRSKSKSKSSSKKTSSSKRVSFK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
280-305	SNPRRRKRGSKNKSKESNKRKRRRTK
317-327	RIKIKKKRPRK
339-351	PKSKKRKRRSKKS
363-374	NNKKRKGKSKKR
395-413	PRSKSKSKSSSKKTSSSKR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, mito_nucl 12, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNVDELRLHQAALGANDKALTLKEAEKLIPDGVARTAAINFLLGTGMFKVMTSSGGVSAFRAVMKKEMDVKKDMTGEEAMVLSHIQSSGNEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLVKSIKAVRHPTRKIYMLAHLEPSVELTGGPWYTDNELDTEFIKLLSTACLHYIRDRSFPKQLGKRSLQSQQRLYAIGAAPSYPSAPQIQHFLSKSKITETELGVEHVEMLLRVLELDGEIEKIPAFAASAWDATVPSEVSDTASESDKSDGERSNPRRRKRGSKNKSKESNKRKRRRTKDSEEDSDSEDERIKIKKKRPRKDDDSDEQSSDVPKSKKRKRRSKKSEEEEEEEEEVPNNKKRKGKSKKRDDSSSEGSDSEPQSESEDERPRSKSKSKSSSKKTSSSKRVSFKGQKSPSPDLNDTFTGGAFVYRAIRQERIVLGWSQAPCGRCPVSDFCRDKGPTNPQQCVYYEEWYTLGAGGGRNDAPPAAMKVEMQKPHTPPTARRN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.3
3	0.28
4	0.27
5	0.26
6	0.18
7	0.18
8	0.18
9	0.18
10	0.16
11	0.14
12	0.12
13	0.12
14	0.14
15	0.18
16	0.2
17	0.21
18	0.22
19	0.24
20	0.23
21	0.22
22	0.19
23	0.17
24	0.16
25	0.16
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.12
30	0.11
31	0.1
32	0.09
33	0.08
34	0.08
35	0.06
36	0.07
37	0.07
38	0.08
39	0.08
40	0.07
41	0.08
42	0.08
43	0.09
44	0.09
45	0.09
46	0.1
47	0.11
48	0.11
49	0.11
50	0.12
51	0.12
52	0.13
53	0.14
54	0.13
55	0.17
56	0.19
57	0.22
58	0.3
59	0.36
60	0.38
61	0.41
62	0.42
63	0.42
64	0.44
65	0.4
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.21
70	0.18
71	0.13
72	0.1
73	0.1
74	0.07
75	0.07
76	0.07
77	0.06
78	0.06
79	0.11
80	0.12
81	0.13
82	0.14
83	0.13
84	0.15
85	0.19
86	0.22
87	0.2
88	0.23
89	0.25
90	0.28
91	0.34
92	0.4
93	0.45
94	0.52
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.48
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.32
104	0.31
105	0.27
106	0.32
107	0.35
108	0.38
109	0.41
110	0.44
111	0.45
112	0.52
113	0.55
114	0.5
115	0.47
116	0.47
117	0.43
118	0.47
119	0.55
120	0.55
121	0.61
122	0.64
123	0.66
124	0.63
125	0.61
126	0.57
127	0.5
128	0.48
129	0.44
130	0.42
131	0.38
132	0.32
133	0.29
134	0.26
135	0.24
136	0.17
137	0.1
138	0.08
139	0.06
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.08
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.08
160	0.07
161	0.1
162	0.12
163	0.12
164	0.16
165	0.22
166	0.22
167	0.29
168	0.32
169	0.34
170	0.39
171	0.43
172	0.48
173	0.5
174	0.54
175	0.55
176	0.57
177	0.57
178	0.55
179	0.58
180	0.57
181	0.56
182	0.53
183	0.48
184	0.45
185	0.41
186	0.36
187	0.32
188	0.25
189	0.2
190	0.16
191	0.12
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.06
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.09
200	0.13
201	0.14
202	0.18
203	0.19
204	0.2
205	0.2
206	0.22
207	0.21
208	0.2
209	0.2
210	0.18
211	0.2
212	0.19
213	0.2
214	0.18
215	0.19
216	0.16
217	0.15
218	0.12
219	0.09
220	0.08
221	0.04
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.04
238	0.04
239	0.03
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.1
260	0.09
261	0.1
262	0.12
263	0.12
264	0.15
265	0.24
266	0.31
267	0.41
268	0.49
269	0.53
270	0.6
271	0.66
272	0.73
273	0.75
274	0.79
275	0.79
276	0.83
277	0.87
278	0.88
279	0.92
280	0.91
281	0.9
282	0.9
283	0.9
284	0.89
285	0.89
286	0.9
287	0.91
288	0.91
289	0.92
290	0.91
291	0.9
292	0.9
293	0.88
294	0.84
295	0.78
296	0.69
297	0.61
298	0.52
299	0.42
300	0.32
301	0.25
302	0.19
303	0.17
304	0.2
305	0.24
306	0.3
307	0.38
308	0.46
309	0.56
310	0.65
311	0.73
312	0.78
313	0.8
314	0.83
315	0.84
316	0.84
317	0.81
318	0.73
319	0.64
320	0.54
321	0.46
322	0.37
323	0.29
324	0.26
325	0.22
326	0.26
327	0.35
328	0.45
329	0.54
330	0.63
331	0.73
332	0.78
333	0.87
334	0.92
335	0.92
336	0.94
337	0.94
338	0.94
339	0.89
340	0.83
341	0.75
342	0.67
343	0.58
344	0.47
345	0.37
346	0.28
347	0.24
348	0.22
349	0.25
350	0.26
351	0.29
352	0.35
353	0.41
354	0.51
355	0.6
356	0.68
357	0.73
358	0.8
359	0.85
360	0.88
361	0.9
362	0.85
363	0.82
364	0.78
365	0.71
366	0.61
367	0.51
368	0.43
369	0.39
370	0.33
371	0.27
372	0.2
373	0.16
374	0.17
375	0.18
376	0.19
377	0.22
378	0.3
379	0.31
380	0.35
381	0.39
382	0.4
383	0.46
384	0.51
385	0.54
386	0.56
387	0.64
388	0.7
389	0.76
390	0.82
391	0.86
392	0.85
393	0.85
394	0.84
395	0.84
396	0.84
397	0.83
398	0.82
399	0.79
400	0.77
401	0.78
402	0.79
403	0.76
404	0.76
405	0.73
406	0.7
407	0.7
408	0.72
409	0.69
410	0.66
411	0.62
412	0.53
413	0.51
414	0.46
415	0.4
416	0.33
417	0.26
418	0.19
419	0.15
420	0.13
421	0.08
422	0.08
423	0.1
424	0.11
425	0.15
426	0.17
427	0.2
428	0.2
429	0.25
430	0.25
431	0.25
432	0.26
433	0.23
434	0.22
435	0.25
436	0.24
437	0.23
438	0.24
439	0.24
440	0.22
441	0.27
442	0.26
443	0.22
444	0.27
445	0.32
446	0.35
447	0.44
448	0.47
449	0.43
450	0.51
451	0.52
452	0.51
453	0.52
454	0.56
455	0.55
456	0.59
457	0.63
458	0.56
459	0.58
460	0.56
461	0.53
462	0.46
463	0.41
464	0.34
465	0.29
466	0.27
467	0.24
468	0.23
469	0.17
470	0.14
471	0.11
472	0.12
473	0.12
474	0.15
475	0.15
476	0.15
477	0.15
478	0.14
479	0.13
480	0.14
481	0.16
482	0.15
483	0.15
484	0.16
485	0.23
486	0.32
487	0.36
488	0.39
489	0.44
490	0.46
491	0.53
492	0.6
493	0.58

A0A0D0DVN3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer