FuNGI

C6H9U1

Protein Details

Accession

C6H9U1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
117-139	WMTMRRQKSGERHSKRMHFPPFD	Hydrophilic
347-368	LNELHRKKPKAQSKQNLLRTLK	Hydrophilic
1016-1037	VIGYRNKKCWPRDSRMRLMRHD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 8.5, cyto_mito 5.5, plas 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012591 PRO8NT IPR012592 PROCN IPR027652 PRP8 IPR019581 Prp8_U5-snRNA-bd IPR042516 Prp8_U5-snRNA-bd_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR019582 RRM_spliceosomal_PrP8
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0030623 F:U5 snRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF08082 PRO8NT PF08083 PROCN PF10598 RRM_4 PF10597 U5_2-snRNA_bdg

Amino Acid Sequences

MEKNEWLRTQRNRFGEQRKAGFVESQKADLPPEHLRKIVKDIGEVSQKKFSTDKWSFSGASKFMPHVVLKLLENMPMPWESAREVKVLYHVNGCLALVNEIPRVIEPVFHAQWATMWMTMRRQKSGERHSKRMHFPPFDNEEPEGFLTAKALNVAIPGGPRFEPLYKDVDPNDEDFGEFNAIDRIIFRAPIRTEYRVAFPYLYNSLPRSVKLSWYSYPQIVYVQSDPNLPAFYFDPVINPISSRSVAPKNITVSHEDHIFGAENDEDEFTLPGNAEPFLADEELYTSETASAIALWWAPYPFDRRSGRMVRAQDVPLVKQWYLEHCPQGQPVKVRVSYQKLLKTYVLNELHRKKPKAQSKQNLLRTLKGTKFFQQTTIDWVEAGLQVCRQGFNMLNLLIHRKNLTYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLMREILRLTKLIVDAQVQYRLGNIDAFQLADGILYAFNHVGQLTGMYRYKYKLMHQIRSCKDLKHLIYYRFNSGPVGKGPGCGFWAPAWRVWLFFLRGIIPLLERWLGNLLSRQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRASVMADLMDMMPEGIKQNKVNTVLQHLSEAWRCWKSNIPWKVPGLPAPIENIILRYVKSKADWWISVAHYNRERIRRGATVDKTVAKKNLGRLTRLWLKAEQERQHNYLKDGPYVSSEEAVAIYTTTVHWLESRKFSPIPFPSVSYKHDTKILILALERLREAYSVKGRLNQSQREELALIEQAYDSPGTTLARIKRFLLTQRAFKEVGIDMNDNYSNINPVYDIEPIEKITDAYLDQYLWYQADQRHLFPAWIKPSDSEVPPLLTYKWAQGINNLSNVWETADGECNVMIETELSKVYEKIDLTLLNRLLRLIMDHNLADYITSKNNVQLNYKDMNHTNSYGMIRGLQFSGFVFQYYGLVIDLLLLGLQRASEIAGPPQSPNDFLQFKDRSTETRHPIRLYTRYIDKIWVFLRFSADESRDLIQRFLTEQPDPNFENVIGYRNKKCWPRDSRMRLMRHDVNLGRAVFWDLKNRLPRSITTIEWDDTFASVYSKDNPNMLFSMCGFEVRILPKIRNQNDEFQVKDSVWSLANNTTKERTAYAFLQVTEEDIQKFNNRIRQILMSSGSTTFTKLPISGIRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.79
3	0.77
4	0.73
5	0.7
6	0.66
7	0.6
8	0.57
9	0.52
10	0.5
11	0.44
12	0.4
13	0.37
14	0.35
15	0.36
16	0.31
17	0.32
18	0.33
19	0.38
20	0.39
21	0.41
22	0.43
23	0.44
24	0.5
25	0.5
26	0.42
27	0.38
28	0.38
29	0.41
30	0.48
31	0.48
32	0.44
33	0.46
34	0.45
35	0.43
36	0.43
37	0.39
38	0.39
39	0.42
40	0.44
41	0.4
42	0.45
43	0.44
44	0.46
45	0.49
46	0.4
47	0.38
48	0.35
49	0.33
50	0.3
51	0.32
52	0.29
53	0.24
54	0.26
55	0.24
56	0.22
57	0.27
58	0.26
59	0.25
60	0.25
61	0.23
62	0.23
63	0.2
64	0.21
65	0.15
66	0.16
67	0.16
68	0.2
69	0.21
70	0.2
71	0.2
72	0.2
73	0.26
74	0.29
75	0.29
76	0.27
77	0.26
78	0.26
79	0.25
80	0.24
81	0.19
82	0.15
83	0.14
84	0.12
85	0.13
86	0.13
87	0.13
88	0.13
89	0.12
90	0.14
91	0.13
92	0.13
93	0.15
94	0.22
95	0.23
96	0.23
97	0.23
98	0.2
99	0.2
100	0.21
101	0.2
102	0.14
103	0.15
104	0.17
105	0.26
106	0.33
107	0.36
108	0.37
109	0.38
110	0.44
111	0.52
112	0.6
113	0.63
114	0.65
115	0.71
116	0.76
117	0.82
118	0.83
119	0.82
120	0.81
121	0.76
122	0.72
123	0.71
124	0.7
125	0.65
126	0.6
127	0.52
128	0.43
129	0.39
130	0.36
131	0.28
132	0.21
133	0.17
134	0.14
135	0.13
136	0.12
137	0.1
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.1
144	0.1
145	0.12
146	0.12
147	0.13
148	0.16
149	0.18
150	0.2
151	0.21
152	0.27
153	0.26
154	0.3
155	0.29
156	0.31
157	0.31
158	0.3
159	0.3
160	0.24
161	0.22
162	0.19
163	0.19
164	0.15
165	0.13
166	0.12
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.12
172	0.11
173	0.13
174	0.13
175	0.18
176	0.2
177	0.27
178	0.32
179	0.33
180	0.35
181	0.35
182	0.4
183	0.35
184	0.35
185	0.29
186	0.25
187	0.25
188	0.25
189	0.25
190	0.22
191	0.22
192	0.26
193	0.25
194	0.26
195	0.26
196	0.24
197	0.29
198	0.31
199	0.34
200	0.31
201	0.36
202	0.39
203	0.36
204	0.36
205	0.3
206	0.28
207	0.24
208	0.25
209	0.21
210	0.21
211	0.2
212	0.21
213	0.21
214	0.2
215	0.2
216	0.16
217	0.16
218	0.13
219	0.14
220	0.14
221	0.14
222	0.14
223	0.15
224	0.17
225	0.15
226	0.14
227	0.14
228	0.15
229	0.16
230	0.16
231	0.19
232	0.23
233	0.27
234	0.29
235	0.32
236	0.33
237	0.36
238	0.37
239	0.36
240	0.33
241	0.31
242	0.3
243	0.27
244	0.23
245	0.2
246	0.19
247	0.14
248	0.13
249	0.11
250	0.09
251	0.09
252	0.1
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.08
270	0.09
271	0.1
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.06
278	0.05
279	0.04
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.09
287	0.14
288	0.15
289	0.23
290	0.26
291	0.28
292	0.36
293	0.42
294	0.44
295	0.46
296	0.48
297	0.44
298	0.46
299	0.44
300	0.4
301	0.35
302	0.32
303	0.29
304	0.29
305	0.26
306	0.23
307	0.24
308	0.25
309	0.29
310	0.31
311	0.3
312	0.29
313	0.31
314	0.33
315	0.36
316	0.34
317	0.33
318	0.35
319	0.37
320	0.36
321	0.38
322	0.4
323	0.43
324	0.44
325	0.46
326	0.47
327	0.42
328	0.44
329	0.43
330	0.39
331	0.33
332	0.37
333	0.36
334	0.34
335	0.41
336	0.45
337	0.52
338	0.57
339	0.59
340	0.57
341	0.61
342	0.68
343	0.7
344	0.74
345	0.76
346	0.79
347	0.85
348	0.86
349	0.85
350	0.77
351	0.7
352	0.63
353	0.6
354	0.53
355	0.48
356	0.43
357	0.4
358	0.44
359	0.41
360	0.41
361	0.38
362	0.35
363	0.36
364	0.36
365	0.29
366	0.22
367	0.22
368	0.18
369	0.16
370	0.16
371	0.1
372	0.08
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.12
380	0.15
381	0.13
382	0.14
383	0.14
384	0.19
385	0.17
386	0.17
387	0.16
388	0.14
389	0.16
390	0.17
391	0.19
392	0.19
393	0.21
394	0.25
395	0.28
396	0.28
397	0.26
398	0.32
399	0.29
400	0.25
401	0.24
402	0.18
403	0.16
404	0.18
405	0.22
406	0.18
407	0.21
408	0.3
409	0.4
410	0.47
411	0.54
412	0.62
413	0.61
414	0.66
415	0.7
416	0.71
417	0.7
418	0.66
419	0.66
420	0.65
421	0.63
422	0.56
423	0.49
424	0.38
425	0.29
426	0.27
427	0.19
428	0.12
429	0.1
430	0.1
431	0.09
432	0.11
433	0.12
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.14
439	0.16
440	0.14
441	0.13
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.1
446	0.08
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.05
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.05
466	0.05
467	0.08
468	0.1
469	0.1
470	0.12
471	0.13
472	0.16
473	0.17
474	0.2
475	0.27
476	0.33
477	0.41
478	0.45
479	0.54
480	0.53
481	0.58
482	0.56
483	0.47
484	0.44
485	0.43
486	0.39
487	0.38
488	0.41
489	0.4
490	0.46
491	0.47
492	0.47
493	0.4
494	0.39
495	0.31
496	0.27
497	0.23
498	0.16
499	0.2
500	0.15
501	0.16
502	0.16
503	0.15
504	0.16
505	0.14
506	0.14
507	0.1
508	0.16
509	0.15
510	0.16
511	0.17
512	0.16
513	0.16
514	0.16
515	0.18
516	0.14
517	0.13
518	0.13
519	0.11
520	0.12
521	0.12
522	0.11
523	0.09
524	0.07
525	0.08
526	0.08
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.12
533	0.12
534	0.12
535	0.13
536	0.13
537	0.12
538	0.17
539	0.24
540	0.22
541	0.24
542	0.24
543	0.28
544	0.28
545	0.33
546	0.3
547	0.26
548	0.31
549	0.36
550	0.42
551	0.39
552	0.4
553	0.39
554	0.43
555	0.47
556	0.42
557	0.36
558	0.31
559	0.3
560	0.29
561	0.25
562	0.19
563	0.12
564	0.11
565	0.08
566	0.05
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.04
578	0.05
579	0.07
580	0.08
581	0.1
582	0.14
583	0.17
584	0.19
585	0.19
586	0.22
587	0.22
588	0.22
589	0.21
590	0.18
591	0.17
592	0.16
593	0.17
594	0.15
595	0.17
596	0.17
597	0.17
598	0.23
599	0.26
600	0.35
601	0.41
602	0.42
603	0.44
604	0.45
605	0.47
606	0.41
607	0.39
608	0.33
609	0.26
610	0.22
611	0.19
612	0.18
613	0.16
614	0.15
615	0.13
616	0.1
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.11
621	0.11
622	0.12
623	0.14
624	0.16
625	0.19
626	0.19
627	0.19
628	0.21
629	0.21
630	0.26
631	0.25
632	0.25
633	0.24
634	0.28
635	0.32
636	0.34
637	0.35
638	0.32
639	0.34
640	0.32
641	0.34
642	0.38
643	0.36
644	0.35
645	0.35
646	0.38
647	0.37
648	0.37
649	0.35
650	0.29
651	0.29
652	0.31
653	0.35
654	0.33
655	0.33
656	0.31
657	0.36
658	0.41
659	0.41
660	0.36
661	0.31
662	0.33
663	0.36
664	0.43
665	0.4
666	0.39
667	0.42
668	0.43
669	0.46
670	0.44
671	0.41
672	0.39
673	0.35
674	0.31
675	0.28
676	0.24
677	0.21
678	0.22
679	0.2
680	0.14
681	0.13
682	0.1
683	0.1
684	0.09
685	0.07
686	0.05
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.07
694	0.11
695	0.14
696	0.19
697	0.2
698	0.22
699	0.23
700	0.23
701	0.29
702	0.29
703	0.32
704	0.28
705	0.3
706	0.31
707	0.33
708	0.36
709	0.34
710	0.33
711	0.29
712	0.32
713	0.29
714	0.25
715	0.25
716	0.23
717	0.17
718	0.15
719	0.19
720	0.16
721	0.16
722	0.15
723	0.12
724	0.12
725	0.12
726	0.12
727	0.13
728	0.17
729	0.21
730	0.22
731	0.27
732	0.29
733	0.36
734	0.42
735	0.43
736	0.42
737	0.43
738	0.43
739	0.39
740	0.37
741	0.3
742	0.24
743	0.19
744	0.15
745	0.1
746	0.09
747	0.07
748	0.08
749	0.08
750	0.06
751	0.05
752	0.06
753	0.06
754	0.07
755	0.12
756	0.17
757	0.21
758	0.22
759	0.23
760	0.25
761	0.28
762	0.32
763	0.38
764	0.36
765	0.4
766	0.41
767	0.44
768	0.41
769	0.38
770	0.36
771	0.26
772	0.26
773	0.21
774	0.2
775	0.16
776	0.18
777	0.18
778	0.15
779	0.15
780	0.12
781	0.1
782	0.09
783	0.09
784	0.07
785	0.08
786	0.1
787	0.1
788	0.11
789	0.11
790	0.12
791	0.12
792	0.13
793	0.12
794	0.1
795	0.09
796	0.09
797	0.08
798	0.08
799	0.09
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.09
804	0.08
805	0.08
806	0.11
807	0.12
808	0.21
809	0.23
810	0.23
811	0.26
812	0.26
813	0.27
814	0.25
815	0.3
816	0.27
817	0.27
818	0.27
819	0.25
820	0.3
821	0.33
822	0.31
823	0.28
824	0.23
825	0.23
826	0.22
827	0.23
828	0.18
829	0.16
830	0.16
831	0.15
832	0.19
833	0.19
834	0.19
835	0.22
836	0.28
837	0.28
838	0.3
839	0.28
840	0.23
841	0.21
842	0.21
843	0.18
844	0.11
845	0.1
846	0.09
847	0.13
848	0.13
849	0.13
850	0.13
851	0.12
852	0.11
853	0.1
854	0.09
855	0.05
856	0.06
857	0.06
858	0.07
859	0.08
860	0.08
861	0.09
862	0.1
863	0.13
864	0.13
865	0.13
866	0.15
867	0.16
868	0.17
869	0.23
870	0.24
871	0.22
872	0.22
873	0.2
874	0.18
875	0.16
876	0.17
877	0.13
878	0.13
879	0.14
880	0.14
881	0.14
882	0.14
883	0.14
884	0.12
885	0.11
886	0.11
887	0.1
888	0.12
889	0.12
890	0.17
891	0.21
892	0.23
893	0.26
894	0.26
895	0.29
896	0.33
897	0.34
898	0.33
899	0.33
900	0.35
901	0.34
902	0.33
903	0.28
904	0.27
905	0.26
906	0.23
907	0.21
908	0.19
909	0.16
910	0.16
911	0.16
912	0.12
913	0.12
914	0.11
915	0.13
916	0.11
917	0.11
918	0.1
919	0.09
920	0.09
921	0.09
922	0.09
923	0.06
924	0.06
925	0.05
926	0.05
927	0.05
928	0.04
929	0.04
930	0.03
931	0.03
932	0.03
933	0.03
934	0.03
935	0.03
936	0.04
937	0.06
938	0.07
939	0.1
940	0.14
941	0.15
942	0.16
943	0.2
944	0.2
945	0.21
946	0.21
947	0.25
948	0.23
949	0.24
950	0.32
951	0.31
952	0.3
953	0.33
954	0.33
955	0.3
956	0.37
957	0.45
958	0.44
959	0.51
960	0.56
961	0.53
962	0.56
963	0.6
964	0.58
965	0.54
966	0.53
967	0.5
968	0.5
969	0.49
970	0.5
971	0.43
972	0.42
973	0.38
974	0.38
975	0.32
976	0.29
977	0.32
978	0.27
979	0.29
980	0.29
981	0.29
982	0.25
983	0.26
984	0.27
985	0.27
986	0.27
987	0.25
988	0.2
989	0.19
990	0.2
991	0.22
992	0.24
993	0.23
994	0.29
995	0.31
996	0.35
997	0.36
998	0.34
999	0.32
1000	0.27
1001	0.28
1002	0.22
1003	0.26
1004	0.27
1005	0.3
1006	0.34
1007	0.37
1008	0.44
1009	0.48
1010	0.54
1011	0.58
1012	0.62
1013	0.67
1014	0.73
1015	0.78
1016	0.82
1017	0.83
1018	0.83
1019	0.79
1020	0.78
1021	0.75
1022	0.67
1023	0.67
1024	0.57
1025	0.53
1026	0.51
1027	0.46
1028	0.37
1029	0.31
1030	0.31
1031	0.27
1032	0.27
1033	0.32
1034	0.28
1035	0.35
1036	0.44
1037	0.45
1038	0.47
1039	0.45
1040	0.45
1041	0.44
1042	0.46
1043	0.41
1044	0.38
1045	0.4
1046	0.36
1047	0.33
1048	0.33
1049	0.25
1050	0.21
1051	0.21
1052	0.15
1053	0.12
1054	0.11
1055	0.12
1056	0.17
1057	0.23
1058	0.24
1059	0.26
1060	0.27
1061	0.29
1062	0.3
1063	0.28
1064	0.24
1065	0.19
1066	0.22
1067	0.19
1068	0.19
1069	0.16
1070	0.15
1071	0.2
1072	0.2
1073	0.27
1074	0.25
1075	0.28
1076	0.34
1077	0.44
1078	0.49
1079	0.53
1080	0.54
1081	0.57
1082	0.61
1083	0.65
1084	0.6
1085	0.52
1086	0.5
1087	0.41
1088	0.39
1089	0.31
1090	0.25
1091	0.21
1092	0.19
1093	0.19
1094	0.24
1095	0.29
1096	0.29
1097	0.32
1098	0.34
1099	0.35
1100	0.36
1101	0.35
1102	0.31
1103	0.31
1104	0.31
1105	0.34
1106	0.33
1107	0.31
1108	0.32
1109	0.29
1110	0.29
1111	0.27
1112	0.27
1113	0.22
1114	0.19
1115	0.22
1116	0.24
1117	0.29
1118	0.32
1119	0.36
1120	0.36
1121	0.37
1122	0.4
1123	0.44
1124	0.41
1125	0.42
1126	0.4
1127	0.34
1128	0.34
1129	0.32
1130	0.31
1131	0.25
1132	0.25
1133	0.2
1134	0.19
1135	0.18
1136	0.17
1137	0.2

C6H9U1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer