FuNGI

C6HNM9

Protein Details

Accession

C6HNM9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
436-466	VFQPGEVRPSRPKKKVVKKSEPTAQKRNIHA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
444-455	PSRPKKKVVKKS

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 8.5, cyto_mito 7, mito 4.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011068 NuclTrfase_I-like_C IPR007012 PolA_pol_cen_dom IPR007010 PolA_pol_RNA-bd_dom IPR014492 PolyA_polymerase
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:1990817 F:poly(A) RNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0031123 P:RNA 3'-end processing GO:0043631 P:RNA polyadenylation
Pfam	View protein in Pfam PF04928 PAP_central PF04926 PAP_RNA-bind

Amino Acid Sequences

MAAAPTRQWGVTPPVSNALPTPAEIAANDDLTTELKRQNNFEAPAETERSIDLIYARLLVHSVPLNLDLRNKDLLRGLDEKEIRCVNGTRVTDEILELVPQQKTFRLALRAIKLWAQRRAIYSNIVGFPGGVAWAMLVARVCQLYPQATGSAIVGKFFRIMNQWKWPQPVLLKPIEEGPLQMKVWNPQIYHGDKYHLMPIITPAYPSMCATHNVSLSTKTVLLRELKRGGDIADKIFVGQLSWNDLFTRHTFFSQDYKYYLNITSASRSKDAQSVWSGLVESKLRHLVGALDRKSSIEIAHPFPKGFERIHICKDEKEIVEVMGGSMKYQAKGTKTETTDESNDPQHTAASQNGGEAIKMPETDHPNGDNGCTLYTTTYYIGLELKPLVPGASRSLDISADTHIFKSTCTSWAQYQPGINDLNITHVRNYDLPEDVFQPGEVRPSRPKKKVVKKSEPTAQKRNIHALDNEAPSENPAKRHASPNGMPSAAATA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.36
3	0.36
4	0.32
5	0.29
6	0.23
7	0.21
8	0.21
9	0.16
10	0.17
11	0.16
12	0.2
13	0.17
14	0.17
15	0.16
16	0.13
17	0.13
18	0.14
19	0.16
20	0.15
21	0.2
22	0.24
23	0.27
24	0.31
25	0.37
26	0.43
27	0.45
28	0.45
29	0.42
30	0.41
31	0.43
32	0.43
33	0.36
34	0.29
35	0.26
36	0.24
37	0.2
38	0.17
39	0.13
40	0.1
41	0.1
42	0.12
43	0.12
44	0.11
45	0.11
46	0.1
47	0.12
48	0.13
49	0.13
50	0.12
51	0.15
52	0.16
53	0.17
54	0.23
55	0.22
56	0.23
57	0.28
58	0.28
59	0.26
60	0.3
61	0.3
62	0.3
63	0.32
64	0.31
65	0.33
66	0.37
67	0.36
68	0.37
69	0.37
70	0.32
71	0.31
72	0.31
73	0.27
74	0.31
75	0.31
76	0.28
77	0.27
78	0.28
79	0.25
80	0.24
81	0.2
82	0.12
83	0.12
84	0.11
85	0.13
86	0.13
87	0.13
88	0.14
89	0.15
90	0.18
91	0.19
92	0.23
93	0.24
94	0.27
95	0.33
96	0.37
97	0.38
98	0.36
99	0.39
100	0.41
101	0.43
102	0.45
103	0.42
104	0.41
105	0.42
106	0.44
107	0.4
108	0.37
109	0.32
110	0.3
111	0.27
112	0.24
113	0.2
114	0.17
115	0.15
116	0.12
117	0.1
118	0.05
119	0.04
120	0.03
121	0.04
122	0.04
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.09
131	0.09
132	0.11
133	0.12
134	0.11
135	0.11
136	0.12
137	0.11
138	0.15
139	0.13
140	0.13
141	0.12
142	0.11
143	0.13
144	0.12
145	0.13
146	0.14
147	0.2
148	0.24
149	0.33
150	0.38
151	0.4
152	0.44
153	0.43
154	0.41
155	0.4
156	0.4
157	0.37
158	0.35
159	0.31
160	0.28
161	0.3
162	0.29
163	0.25
164	0.2
165	0.16
166	0.16
167	0.16
168	0.17
169	0.15
170	0.16
171	0.22
172	0.25
173	0.23
174	0.23
175	0.29
176	0.31
177	0.33
178	0.31
179	0.27
180	0.25
181	0.26
182	0.26
183	0.22
184	0.19
185	0.16
186	0.18
187	0.18
188	0.17
189	0.15
190	0.12
191	0.11
192	0.12
193	0.12
194	0.11
195	0.09
196	0.11
197	0.13
198	0.16
199	0.16
200	0.16
201	0.16
202	0.16
203	0.16
204	0.15
205	0.14
206	0.12
207	0.12
208	0.14
209	0.18
210	0.19
211	0.23
212	0.26
213	0.24
214	0.24
215	0.24
216	0.22
217	0.21
218	0.2
219	0.16
220	0.13
221	0.13
222	0.12
223	0.12
224	0.11
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.1
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.11
233	0.13
234	0.13
235	0.16
236	0.12
237	0.13
238	0.13
239	0.15
240	0.2
241	0.2
242	0.2
243	0.18
244	0.18
245	0.18
246	0.19
247	0.18
248	0.14
249	0.14
250	0.13
251	0.16
252	0.17
253	0.19
254	0.18
255	0.19
256	0.19
257	0.2
258	0.2
259	0.19
260	0.18
261	0.18
262	0.17
263	0.17
264	0.15
265	0.12
266	0.14
267	0.12
268	0.11
269	0.11
270	0.13
271	0.12
272	0.12
273	0.12
274	0.13
275	0.18
276	0.26
277	0.25
278	0.24
279	0.24
280	0.25
281	0.25
282	0.22
283	0.16
284	0.13
285	0.16
286	0.19
287	0.24
288	0.24
289	0.23
290	0.24
291	0.26
292	0.23
293	0.2
294	0.22
295	0.24
296	0.28
297	0.32
298	0.38
299	0.37
300	0.35
301	0.39
302	0.38
303	0.31
304	0.29
305	0.25
306	0.2
307	0.19
308	0.17
309	0.13
310	0.1
311	0.1
312	0.08
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.14
317	0.17
318	0.17
319	0.21
320	0.26
321	0.29
322	0.3
323	0.32
324	0.33
325	0.34
326	0.36
327	0.34
328	0.32
329	0.29
330	0.28
331	0.26
332	0.23
333	0.19
334	0.16
335	0.15
336	0.14
337	0.13
338	0.12
339	0.11
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.12
345	0.1
346	0.11
347	0.12
348	0.15
349	0.21
350	0.23
351	0.24
352	0.23
353	0.25
354	0.25
355	0.25
356	0.21
357	0.16
358	0.14
359	0.13
360	0.12
361	0.1
362	0.11
363	0.12
364	0.1
365	0.11
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.11
370	0.12
371	0.12
372	0.11
373	0.1
374	0.11
375	0.1
376	0.09
377	0.11
378	0.13
379	0.14
380	0.14
381	0.15
382	0.16
383	0.16
384	0.16
385	0.15
386	0.14
387	0.14
388	0.14
389	0.14
390	0.15
391	0.15
392	0.14
393	0.18
394	0.17
395	0.18
396	0.19
397	0.22
398	0.25
399	0.33
400	0.36
401	0.35
402	0.36
403	0.34
404	0.35
405	0.34
406	0.28
407	0.23
408	0.19
409	0.23
410	0.24
411	0.24
412	0.22
413	0.21
414	0.24
415	0.24
416	0.27
417	0.23
418	0.23
419	0.22
420	0.23
421	0.24
422	0.23
423	0.21
424	0.18
425	0.17
426	0.14
427	0.21
428	0.21
429	0.24
430	0.33
431	0.43
432	0.53
433	0.59
434	0.68
435	0.72
436	0.81
437	0.87
438	0.88
439	0.88
440	0.88
441	0.9
442	0.9
443	0.89
444	0.87
445	0.86
446	0.84
447	0.81
448	0.77
449	0.77
450	0.71
451	0.65
452	0.58
453	0.56
454	0.53
455	0.49
456	0.45
457	0.36
458	0.33
459	0.31
460	0.35
461	0.31
462	0.27
463	0.29
464	0.34
465	0.37
466	0.45
467	0.49
468	0.52
469	0.54
470	0.58
471	0.59
472	0.53
473	0.48

C6HNM9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer