FuNGI

C6HL53

Protein Details

Accession

C6HL53

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
124-147	GDEALSPEKRRKRKRGGAEDIEES	Basic
365-389	EQVAGQQKEKKKRKQKHAPPADVEE	Hydrophilic
466-492	FPPLLPRKLRVTRAKRVVKKTRNGSVG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
131-141	EKRRKRKRGGA
151-172	RMAKEEAKEDEKRRSEKAKRQK
372-381	KEKKKRKQKH
472-486	RKLRVTRAKRVVKKT
578-602	RPDKGPGFKVRTKSRGAKARAGQPK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MGKKQKSQPTAAASALEENAGSTPAANGSIPSFPFFAGGGESAVAVDPMLASLFEKSAGPVKAPQFTNAKLIATSANGGKSGGRTNGVGQGTSQDDMELTSSNEEEAGEGASSETSDQMMEDVGDEALSPEKRRKRKRGGAEDIEESYMRRMAKEEAKEDEKRRSEKAKRQKIVESVGRESDSSDSERDNEEGEDGTSDDEDGIDNPPIVHESNSNKPDAALLDKSARTIFLSNVSTEAIKSKSAKKTLLKHLCSFFPSIPESATPHKIESIRFRSTAFSTQSMPKRAAYAKRELMDSTTRSTNAYVVYSTTAAARGAPRALNGSIILDRHLRVDSVAHPAPIDYKRCIFVGNLGFVDEETPTDEQVAGQQKEKKKRKQKHAPPADVEEGLWRTFNEHTAAGKSADPSSNKISKDTGPYPNLGGGPVESVRVIRDPATRIGKGVAYVQFRDENAVEMALLLDGQKFPPLLPRKLRVTRAKRVVKKTRNGSVGDQGRSNGSKTDSRNANKTRLGQRRSGVGGDRQASFEGRATALLGKAGGWRVQHRRSTDDSGGRRSRDNEATSGGSSPFVFEGFRARPDKGPGFKVRTKSRGAKARAGQPKSRNTLELFSGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.32
3	0.24
4	0.17
5	0.13
6	0.12
7	0.11
8	0.09
9	0.07
10	0.07
11	0.08
12	0.09
13	0.09
14	0.09
15	0.11
16	0.15
17	0.15
18	0.17
19	0.17
20	0.15
21	0.16
22	0.16
23	0.14
24	0.12
25	0.12
26	0.1
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.08
31	0.07
32	0.05
33	0.05
34	0.04
35	0.04
36	0.04
37	0.04
38	0.05
39	0.06
40	0.07
41	0.07
42	0.08
43	0.09
44	0.15
45	0.16
46	0.18
47	0.23
48	0.27
49	0.34
50	0.35
51	0.38
52	0.37
53	0.38
54	0.42
55	0.37
56	0.34
57	0.27
58	0.27
59	0.23
60	0.19
61	0.2
62	0.16
63	0.15
64	0.15
65	0.15
66	0.15
67	0.16
68	0.19
69	0.19
70	0.18
71	0.18
72	0.2
73	0.27
74	0.26
75	0.24
76	0.2
77	0.21
78	0.21
79	0.21
80	0.19
81	0.12
82	0.11
83	0.11
84	0.12
85	0.09
86	0.08
87	0.09
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.08
92	0.08
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.06
97	0.06
98	0.06
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.05
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.05
108	0.05
109	0.06
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.06
114	0.1
115	0.11
116	0.13
117	0.21
118	0.3
119	0.4
120	0.51
121	0.61
122	0.68
123	0.76
124	0.85
125	0.88
126	0.9
127	0.89
128	0.83
129	0.76
130	0.66
131	0.58
132	0.47
133	0.36
134	0.27
135	0.21
136	0.16
137	0.13
138	0.13
139	0.18
140	0.25
141	0.3
142	0.32
143	0.35
144	0.42
145	0.48
146	0.5
147	0.54
148	0.54
149	0.52
150	0.54
151	0.58
152	0.61
153	0.65
154	0.72
155	0.74
156	0.72
157	0.74
158	0.74
159	0.7
160	0.68
161	0.65
162	0.59
163	0.51
164	0.48
165	0.43
166	0.37
167	0.32
168	0.25
169	0.21
170	0.17
171	0.15
172	0.14
173	0.14
174	0.16
175	0.15
176	0.15
177	0.13
178	0.12
179	0.11
180	0.1
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.06
185	0.06
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.06
191	0.06
192	0.07
193	0.06
194	0.07
195	0.08
196	0.09
197	0.09
198	0.12
199	0.16
200	0.24
201	0.26
202	0.27
203	0.25
204	0.25
205	0.25
206	0.22
207	0.21
208	0.14
209	0.14
210	0.17
211	0.17
212	0.18
213	0.17
214	0.16
215	0.14
216	0.14
217	0.12
218	0.14
219	0.15
220	0.14
221	0.15
222	0.15
223	0.14
224	0.13
225	0.14
226	0.1
227	0.11
228	0.14
229	0.21
230	0.26
231	0.3
232	0.36
233	0.4
234	0.48
235	0.57
236	0.64
237	0.6
238	0.59
239	0.57
240	0.53
241	0.48
242	0.42
243	0.32
244	0.25
245	0.22
246	0.18
247	0.16
248	0.15
249	0.16
250	0.17
251	0.21
252	0.19
253	0.18
254	0.21
255	0.22
256	0.23
257	0.29
258	0.32
259	0.31
260	0.31
261	0.31
262	0.3
263	0.31
264	0.34
265	0.27
266	0.22
267	0.22
268	0.28
269	0.32
270	0.32
271	0.31
272	0.26
273	0.27
274	0.3
275	0.35
276	0.32
277	0.34
278	0.36
279	0.36
280	0.37
281	0.33
282	0.31
283	0.28
284	0.26
285	0.21
286	0.18
287	0.17
288	0.17
289	0.17
290	0.16
291	0.13
292	0.12
293	0.09
294	0.08
295	0.09
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.1
308	0.1
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.1
315	0.09
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.08
321	0.1
322	0.1
323	0.15
324	0.16
325	0.14
326	0.14
327	0.14
328	0.18
329	0.2
330	0.21
331	0.16
332	0.17
333	0.18
334	0.19
335	0.2
336	0.15
337	0.18
338	0.18
339	0.18
340	0.17
341	0.16
342	0.16
343	0.15
344	0.15
345	0.09
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.11
354	0.18
355	0.18
356	0.22
357	0.28
358	0.34
359	0.45
360	0.55
361	0.6
362	0.63
363	0.72
364	0.79
365	0.85
366	0.89
367	0.9
368	0.91
369	0.89
370	0.82
371	0.78
372	0.69
373	0.58
374	0.47
375	0.39
376	0.29
377	0.22
378	0.18
379	0.12
380	0.11
381	0.12
382	0.13
383	0.12
384	0.12
385	0.13
386	0.14
387	0.16
388	0.15
389	0.16
390	0.15
391	0.15
392	0.18
393	0.18
394	0.2
395	0.25
396	0.29
397	0.28
398	0.29
399	0.29
400	0.28
401	0.34
402	0.37
403	0.38
404	0.34
405	0.35
406	0.34
407	0.34
408	0.31
409	0.24
410	0.18
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.09
419	0.1
420	0.11
421	0.14
422	0.16
423	0.23
424	0.29
425	0.28
426	0.28
427	0.28
428	0.26
429	0.24
430	0.25
431	0.24
432	0.21
433	0.21
434	0.23
435	0.23
436	0.23
437	0.25
438	0.21
439	0.17
440	0.15
441	0.14
442	0.11
443	0.09
444	0.1
445	0.06
446	0.06
447	0.04
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.17
455	0.23
456	0.3
457	0.37
458	0.43
459	0.51
460	0.58
461	0.67
462	0.69
463	0.71
464	0.73
465	0.77
466	0.81
467	0.81
468	0.84
469	0.86
470	0.85
471	0.86
472	0.84
473	0.82
474	0.77
475	0.72
476	0.65
477	0.64
478	0.62
479	0.54
480	0.47
481	0.39
482	0.38
483	0.35
484	0.32
485	0.25
486	0.22
487	0.26
488	0.28
489	0.37
490	0.42
491	0.45
492	0.54
493	0.56
494	0.6
495	0.59
496	0.64
497	0.65
498	0.66
499	0.66
500	0.62
501	0.6
502	0.59
503	0.56
504	0.51
505	0.45
506	0.41
507	0.43
508	0.39
509	0.38
510	0.33
511	0.31
512	0.29
513	0.26
514	0.22
515	0.18
516	0.15
517	0.14
518	0.15
519	0.15
520	0.14
521	0.13
522	0.11
523	0.1
524	0.12
525	0.14
526	0.15
527	0.16
528	0.24
529	0.33
530	0.4
531	0.46
532	0.47
533	0.51
534	0.55
535	0.6
536	0.6
537	0.6
538	0.58
539	0.62
540	0.65
541	0.61
542	0.59
543	0.54
544	0.54
545	0.52
546	0.5
547	0.43
548	0.41
549	0.41
550	0.38
551	0.37
552	0.29
553	0.23
554	0.2
555	0.18
556	0.14
557	0.12
558	0.11
559	0.09
560	0.17
561	0.18
562	0.26
563	0.28
564	0.3
565	0.34
566	0.42
567	0.5
568	0.49
569	0.55
570	0.57
571	0.62
572	0.65
573	0.7
574	0.72
575	0.7
576	0.72
577	0.73
578	0.74
579	0.75
580	0.75
581	0.76
582	0.74
583	0.77
584	0.79
585	0.76
586	0.75
587	0.74
588	0.77
589	0.75
590	0.71
591	0.65
592	0.58
593	0.56

C6HL53

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer