Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HLH5

Protein Details
Accession C6HLH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-259SVVSRKKTGTVKKKNERCKRFTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-244KKT
248-249KK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.333, cyto 9.5, cyto_mito 6.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MTEDQDLLAKIGLLAGQINQHKNQATPPAQPSRGGRYTSYPSTHPRRHAGWAPYRGRASHPSSRRHAAPHRNRTLVLSNLSTPAESASGTPSCNASTDEMNEAKPVCQNGWVAKRDRHMQLINSAIYDKEAQARTKAIEESRKLKAQRIAQREEAKVLRYVQGVGGYRPVATPVVGQRAASYRITIQDVPFQVVRGGSKLIRLPNEPSAANVTPKKVNIGGVNFVRSKKGNLHRLGSVVSRKKTGTVKKKNERCKRFTSTGSCFKGPNCPYIHDPNKVAICKEFLQTGKCAAGSACDLSHESSAERSPSCLHFLRGRCSNPSCRYAHVRVNPGAPVCHDFAILGYCSKGEICDQRHVHECPDYANTGNCGNRKCQLPHVDRAGQIRKIAANKAETTDDRDSADDDDILSDEEAYDEIDSDDVDSDDSDDDPIIITEGVDTGEISQQQDFVRFSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.15
4 0.21
5 0.25
6 0.26
7 0.3
8 0.32
9 0.32
10 0.36
11 0.39
12 0.38
13 0.41
14 0.48
15 0.52
16 0.52
17 0.56
18 0.55
19 0.55
20 0.56
21 0.51
22 0.45
23 0.43
24 0.48
25 0.51
26 0.49
27 0.45
28 0.48
29 0.56
30 0.61
31 0.6
32 0.6
33 0.57
34 0.61
35 0.65
36 0.65
37 0.65
38 0.68
39 0.66
40 0.66
41 0.65
42 0.58
43 0.54
44 0.53
45 0.5
46 0.5
47 0.53
48 0.55
49 0.59
50 0.64
51 0.62
52 0.63
53 0.66
54 0.67
55 0.7
56 0.73
57 0.75
58 0.72
59 0.69
60 0.65
61 0.61
62 0.55
63 0.48
64 0.39
65 0.33
66 0.32
67 0.31
68 0.26
69 0.2
70 0.16
71 0.13
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.14
81 0.15
82 0.13
83 0.14
84 0.16
85 0.2
86 0.2
87 0.2
88 0.21
89 0.2
90 0.19
91 0.19
92 0.19
93 0.14
94 0.16
95 0.18
96 0.24
97 0.31
98 0.35
99 0.37
100 0.4
101 0.45
102 0.48
103 0.49
104 0.48
105 0.44
106 0.41
107 0.41
108 0.42
109 0.37
110 0.31
111 0.28
112 0.22
113 0.2
114 0.18
115 0.14
116 0.15
117 0.18
118 0.19
119 0.2
120 0.22
121 0.22
122 0.23
123 0.26
124 0.24
125 0.29
126 0.32
127 0.35
128 0.39
129 0.44
130 0.42
131 0.45
132 0.46
133 0.48
134 0.52
135 0.55
136 0.55
137 0.56
138 0.61
139 0.56
140 0.55
141 0.48
142 0.4
143 0.35
144 0.32
145 0.27
146 0.21
147 0.2
148 0.16
149 0.19
150 0.18
151 0.16
152 0.17
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.09
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.18
166 0.21
167 0.19
168 0.17
169 0.13
170 0.15
171 0.18
172 0.18
173 0.16
174 0.18
175 0.18
176 0.2
177 0.19
178 0.17
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.1
183 0.11
184 0.09
185 0.11
186 0.14
187 0.16
188 0.18
189 0.19
190 0.21
191 0.24
192 0.26
193 0.23
194 0.21
195 0.23
196 0.22
197 0.24
198 0.22
199 0.2
200 0.2
201 0.2
202 0.21
203 0.17
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.19
208 0.18
209 0.21
210 0.21
211 0.21
212 0.21
213 0.18
214 0.18
215 0.22
216 0.3
217 0.35
218 0.37
219 0.39
220 0.38
221 0.38
222 0.38
223 0.33
224 0.33
225 0.3
226 0.28
227 0.27
228 0.26
229 0.29
230 0.35
231 0.41
232 0.45
233 0.5
234 0.6
235 0.68
236 0.76
237 0.83
238 0.86
239 0.86
240 0.81
241 0.79
242 0.76
243 0.71
244 0.69
245 0.66
246 0.63
247 0.64
248 0.61
249 0.54
250 0.47
251 0.42
252 0.45
253 0.39
254 0.37
255 0.3
256 0.29
257 0.31
258 0.4
259 0.45
260 0.39
261 0.39
262 0.37
263 0.4
264 0.38
265 0.35
266 0.26
267 0.24
268 0.22
269 0.22
270 0.21
271 0.18
272 0.19
273 0.19
274 0.2
275 0.18
276 0.16
277 0.15
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.14
295 0.15
296 0.2
297 0.2
298 0.21
299 0.26
300 0.29
301 0.35
302 0.39
303 0.4
304 0.41
305 0.45
306 0.51
307 0.49
308 0.52
309 0.48
310 0.46
311 0.51
312 0.5
313 0.54
314 0.51
315 0.52
316 0.49
317 0.49
318 0.47
319 0.4
320 0.35
321 0.29
322 0.26
323 0.21
324 0.18
325 0.16
326 0.13
327 0.13
328 0.14
329 0.13
330 0.1
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.1
337 0.17
338 0.21
339 0.3
340 0.32
341 0.35
342 0.42
343 0.43
344 0.41
345 0.38
346 0.35
347 0.28
348 0.3
349 0.28
350 0.23
351 0.23
352 0.22
353 0.22
354 0.26
355 0.28
356 0.27
357 0.28
358 0.31
359 0.36
360 0.38
361 0.42
362 0.48
363 0.5
364 0.55
365 0.61
366 0.6
367 0.57
368 0.63
369 0.61
370 0.53
371 0.49
372 0.44
373 0.4
374 0.39
375 0.41
376 0.37
377 0.35
378 0.34
379 0.36
380 0.38
381 0.34
382 0.38
383 0.37
384 0.34
385 0.3
386 0.29
387 0.27
388 0.24
389 0.25
390 0.17
391 0.14
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.09
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.11
429 0.12
430 0.13
431 0.14
432 0.16
433 0.17
434 0.22