FuNGI

C6H9S0

Protein Details

Accession

C6H9S0

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
73-116	HGVRQVRRVLRNNPGREKKSITGPSKEHKQRTRSLKTTTRREIE	Hydrophilic
126-146	GHDKRERKGATTKRMKKRDGV	Basic
296-316	GTTSKQQRVKAKKPQKGKLTT	Hydrophilic
643-665	ATLANRRSPKKRQAKALSKFQEP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
87-103	GREKKSITGPSKEHKQR
129-147	KRERKGATTKRMKKRDGVA
649-655	RSPKKRQ

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MDNSAITSQSNPTPLVCSVTPIIVGSPPSPAHVIELSSPSTPPTPLTLLASFSKTPSRKTTNPDTNGENTTCHGVRQVRRVLRNNPGREKKSITGPSKEHKQRTRSLKTTTRREIEIVEGDRLIVGHDKRERKGATTKRMKKRDGVADKKLYARVSKVKSSENLDLDAKIPSSKVCNNTLPLVVDDMDNESSELQLEKAIKRRHDWTPAREVTTPVVDVAELHSSPCGKAVTRMHGVGTLLSDYGFSGVVETSLGTQSESFHNAPTTKRPMELQKFSTVPAIPTPTESSATEDVQGTTSKQQRVKAKKPQKGKLTTITSHATAKYCVADQTVDLDYIQNVAPKSPRRKNISNRLSGMKHSNSGRGKSSTLKNDNGPPVFRVVPPLEAFKSFEGQELLFGTSSQLERGYPEYQCDETQDTQNSPSNSAAVSELAVPYRISSEGKNLGSSLFGLSGSKNLWSASARDLTGAVFEVDEIDFQEPSMGLSVLATKSRCHPGNRGPPRRNLVDVDNVPDKKLDIDTTEGENGSHSSVADNIVDRENLNPKISANTSANTSETNLECAPQNKPAFSRFTTSELAKKVAAYGFKPIKSRDNMISLLERCWETQSKTLMPESKPNQGTDDARKNGFRKENHSDVRVRPDSATLANRRSPKKRQAKALSKFQEPNNFLPIENSTTTPSMLPIEHVISSHTILINDDQLSDSVGETVSFLPTLDHNGNGTTLQENMLEIKSPATPNARHSRQGSSSASFSIEPPSLASQITKAIKSQPRIRAFNGLKQPTWYEKILMYDPIQLEDLAAWLNTDGFGRIGEDREVGPGVVREWCESKGVCCVWKKQVSGRSHCLPMVS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.23
4	0.23
5	0.22
6	0.22
7	0.22
8	0.18
9	0.19
10	0.15
11	0.17
12	0.14
13	0.17
14	0.16
15	0.18
16	0.19
17	0.18
18	0.2
19	0.19
20	0.2
21	0.19
22	0.22
23	0.22
24	0.21
25	0.21
26	0.2
27	0.2
28	0.19
29	0.18
30	0.19
31	0.19
32	0.2
33	0.24
34	0.23
35	0.25
36	0.27
37	0.3
38	0.26
39	0.26
40	0.33
41	0.31
42	0.35
43	0.41
44	0.47
45	0.49
46	0.56
47	0.64
48	0.66
49	0.69
50	0.69
51	0.65
52	0.61
53	0.6
54	0.54
55	0.44
56	0.35
57	0.35
58	0.31
59	0.26
60	0.27
61	0.3
62	0.35
63	0.43
64	0.51
65	0.53
66	0.62
67	0.7
68	0.71
69	0.73
70	0.77
71	0.78
72	0.79
73	0.81
74	0.76
75	0.74
76	0.73
77	0.67
78	0.68
79	0.68
80	0.63
81	0.62
82	0.63
83	0.66
84	0.7
85	0.75
86	0.75
87	0.73
88	0.74
89	0.75
90	0.79
91	0.81
92	0.77
93	0.77
94	0.77
95	0.78
96	0.82
97	0.82
98	0.75
99	0.67
100	0.62
101	0.55
102	0.51
103	0.49
104	0.41
105	0.33
106	0.28
107	0.26
108	0.24
109	0.22
110	0.17
111	0.16
112	0.14
113	0.2
114	0.27
115	0.33
116	0.35
117	0.44
118	0.44
119	0.43
120	0.53
121	0.55
122	0.59
123	0.64
124	0.73
125	0.75
126	0.83
127	0.82
128	0.79
129	0.78
130	0.78
131	0.78
132	0.76
133	0.75
134	0.74
135	0.73
136	0.7
137	0.65
138	0.56
139	0.48
140	0.46
141	0.45
142	0.43
143	0.46
144	0.46
145	0.47
146	0.49
147	0.52
148	0.53
149	0.46
150	0.43
151	0.38
152	0.35
153	0.31
154	0.28
155	0.22
156	0.15
157	0.14
158	0.11
159	0.16
160	0.2
161	0.24
162	0.28
163	0.31
164	0.33
165	0.35
166	0.36
167	0.32
168	0.27
169	0.25
170	0.2
171	0.16
172	0.14
173	0.14
174	0.13
175	0.11
176	0.11
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.06
182	0.09
183	0.12
184	0.15
185	0.24
186	0.29
187	0.32
188	0.36
189	0.42
190	0.46
191	0.53
192	0.57
193	0.56
194	0.61
195	0.61
196	0.61
197	0.57
198	0.52
199	0.44
200	0.38
201	0.31
202	0.21
203	0.17
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.12
208	0.09
209	0.09
210	0.1
211	0.11
212	0.11
213	0.13
214	0.13
215	0.1
216	0.17
217	0.21
218	0.26
219	0.29
220	0.3
221	0.28
222	0.28
223	0.28
224	0.22
225	0.18
226	0.12
227	0.09
228	0.08
229	0.08
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.08
245	0.1
246	0.14
247	0.14
248	0.14
249	0.17
250	0.18
251	0.2
252	0.25
253	0.31
254	0.27
255	0.28
256	0.31
257	0.38
258	0.45
259	0.49
260	0.45
261	0.43
262	0.43
263	0.43
264	0.43
265	0.33
266	0.26
267	0.22
268	0.22
269	0.17
270	0.18
271	0.2
272	0.18
273	0.19
274	0.18
275	0.2
276	0.19
277	0.2
278	0.19
279	0.17
280	0.16
281	0.15
282	0.15
283	0.12
284	0.16
285	0.21
286	0.25
287	0.28
288	0.34
289	0.42
290	0.52
291	0.6
292	0.65
293	0.69
294	0.71
295	0.78
296	0.8
297	0.81
298	0.78
299	0.74
300	0.72
301	0.68
302	0.62
303	0.57
304	0.51
305	0.42
306	0.37
307	0.33
308	0.25
309	0.19
310	0.18
311	0.15
312	0.13
313	0.12
314	0.11
315	0.1
316	0.09
317	0.12
318	0.11
319	0.1
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.1
324	0.1
325	0.09
326	0.08
327	0.09
328	0.14
329	0.21
330	0.3
331	0.36
332	0.44
333	0.49
334	0.58
335	0.67
336	0.74
337	0.75
338	0.73
339	0.69
340	0.67
341	0.6
342	0.53
343	0.5
344	0.4
345	0.35
346	0.3
347	0.34
348	0.32
349	0.33
350	0.34
351	0.3
352	0.3
353	0.32
354	0.36
355	0.38
356	0.4
357	0.4
358	0.39
359	0.42
360	0.46
361	0.41
362	0.36
363	0.28
364	0.26
365	0.25
366	0.22
367	0.21
368	0.16
369	0.17
370	0.17
371	0.19
372	0.17
373	0.17
374	0.18
375	0.15
376	0.16
377	0.13
378	0.13
379	0.12
380	0.11
381	0.11
382	0.1
383	0.1
384	0.08
385	0.08
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.07
393	0.1
394	0.12
395	0.11
396	0.12
397	0.14
398	0.15
399	0.15
400	0.16
401	0.16
402	0.16
403	0.19
404	0.19
405	0.17
406	0.18
407	0.21
408	0.2
409	0.18
410	0.17
411	0.14
412	0.13
413	0.12
414	0.1
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.07
427	0.11
428	0.16
429	0.16
430	0.16
431	0.16
432	0.15
433	0.14
434	0.14
435	0.1
436	0.06
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.06
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.11
449	0.13
450	0.12
451	0.12
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.1
456	0.07
457	0.04
458	0.04
459	0.05
460	0.04
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.05
471	0.04
472	0.04
473	0.06
474	0.07
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.13
479	0.19
480	0.23
481	0.24
482	0.3
483	0.37
484	0.48
485	0.58
486	0.66
487	0.63
488	0.67
489	0.69
490	0.65
491	0.58
492	0.49
493	0.42
494	0.39
495	0.35
496	0.33
497	0.34
498	0.32
499	0.3
500	0.27
501	0.24
502	0.17
503	0.17
504	0.14
505	0.09
506	0.12
507	0.13
508	0.15
509	0.16
510	0.15
511	0.14
512	0.14
513	0.13
514	0.1
515	0.08
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.11
527	0.16
528	0.17
529	0.18
530	0.17
531	0.16
532	0.19
533	0.2
534	0.22
535	0.18
536	0.17
537	0.19
538	0.19
539	0.19
540	0.16
541	0.16
542	0.15
543	0.14
544	0.16
545	0.13
546	0.13
547	0.15
548	0.16
549	0.17
550	0.21
551	0.22
552	0.21
553	0.23
554	0.25
555	0.29
556	0.28
557	0.31
558	0.26
559	0.29
560	0.31
561	0.31
562	0.32
563	0.29
564	0.3
565	0.25
566	0.23
567	0.21
568	0.2
569	0.2
570	0.16
571	0.23
572	0.27
573	0.29
574	0.32
575	0.32
576	0.37
577	0.39
578	0.42
579	0.37
580	0.36
581	0.35
582	0.34
583	0.37
584	0.31
585	0.28
586	0.26
587	0.23
588	0.19
589	0.22
590	0.23
591	0.19
592	0.24
593	0.27
594	0.27
595	0.29
596	0.33
597	0.35
598	0.34
599	0.4
600	0.39
601	0.43
602	0.43
603	0.41
604	0.4
605	0.38
606	0.41
607	0.41
608	0.46
609	0.4
610	0.41
611	0.45
612	0.44
613	0.48
614	0.51
615	0.46
616	0.45
617	0.49
618	0.57
619	0.56
620	0.59
621	0.57
622	0.54
623	0.6
624	0.54
625	0.48
626	0.39
627	0.36
628	0.33
629	0.32
630	0.35
631	0.3
632	0.33
633	0.37
634	0.43
635	0.49
636	0.55
637	0.59
638	0.63
639	0.69
640	0.71
641	0.76
642	0.8
643	0.84
644	0.84
645	0.86
646	0.8
647	0.77
648	0.75
649	0.69
650	0.68
651	0.61
652	0.56
653	0.5
654	0.45
655	0.38
656	0.34
657	0.32
658	0.27
659	0.24
660	0.22
661	0.2
662	0.2
663	0.2
664	0.18
665	0.17
666	0.14
667	0.13
668	0.13
669	0.13
670	0.14
671	0.14
672	0.14
673	0.14
674	0.14
675	0.14
676	0.15
677	0.13
678	0.12
679	0.12
680	0.14
681	0.15
682	0.14
683	0.13
684	0.12
685	0.11
686	0.12
687	0.11
688	0.1
689	0.08
690	0.07
691	0.07
692	0.07
693	0.08
694	0.08
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.08
699	0.14
700	0.14
701	0.14
702	0.14
703	0.15
704	0.16
705	0.15
706	0.16
707	0.11
708	0.1
709	0.1
710	0.1
711	0.1
712	0.11
713	0.12
714	0.11
715	0.11
716	0.12
717	0.14
718	0.15
719	0.19
720	0.23
721	0.25
722	0.32
723	0.42
724	0.45
725	0.48
726	0.5
727	0.53
728	0.51
729	0.56
730	0.52
731	0.45
732	0.43
733	0.38
734	0.37
735	0.3
736	0.26
737	0.23
738	0.2
739	0.16
740	0.17
741	0.18
742	0.17
743	0.17
744	0.17
745	0.14
746	0.21
747	0.25
748	0.23
749	0.23
750	0.31
751	0.37
752	0.45
753	0.53
754	0.55
755	0.6
756	0.64
757	0.65
758	0.67
759	0.64
760	0.65
761	0.67
762	0.62
763	0.54
764	0.53
765	0.54
766	0.5
767	0.51
768	0.43
769	0.35
770	0.32
771	0.35
772	0.34
773	0.34
774	0.28
775	0.3
776	0.29
777	0.29
778	0.27
779	0.22
780	0.2
781	0.16
782	0.15
783	0.09
784	0.09
785	0.07
786	0.06
787	0.07
788	0.07
789	0.07
790	0.07
791	0.07
792	0.07
793	0.1
794	0.11
795	0.13
796	0.14
797	0.15
798	0.15
799	0.17
800	0.18
801	0.15
802	0.15
803	0.14
804	0.14
805	0.17
806	0.18
807	0.18
808	0.2
809	0.21
810	0.24
811	0.24
812	0.24
813	0.28
814	0.3
815	0.34
816	0.37
817	0.43
818	0.49
819	0.55
820	0.58
821	0.58
822	0.63
823	0.66
824	0.69
825	0.71
826	0.67
827	0.65

C6H9S0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer