Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D0E538

Protein Details
Accession A0A0D0E538    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1278-1300DASLPQKPCKTCKNRFHASCLYKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 9, cyto 6.5, cyto_nucl 4, E.R. 4, plas 3, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039795  LTN1/Rkr1  
IPR039804  RING-CH-C4HC3_LTN1  
IPR001841  Znf_RING  
IPR011016  Znf_RING-CH  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:1990112  C:RQC complex  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16491  RING-CH-C4HC3_LTN1  
Amino Acid Sequences MVLVVAAGIPESTLPASLPPTSLGSGTEKHDMGSETHPIAHLLTSFWAPLDARLLDRRPSASAWLKSLLECLIFIVQRGIQTHEVTAQLREDATALLTSQFSRIWTELVTQRLQIDETEAANIVVGALEKVAKLGDDLFNASFDALSPSLLNPVQTSNITHDPAPTFLRVFSTKFSPDTHAGQKTRGAVEAYIQRIADALESDLSSSGRTSTENIVTKPLTTLAKIMDTFGPSLFDNASFAARTDALFLAHSVELLTASVQGVLAYLRYRSESSFQGEGESQTQTFWTELLGAIASSTRSTALSLLSPLLGAPLPRHLRGMSGAMDELVERLVDDAIAPGADETTVAKVLSAPAPFLSPTGLATIASVLSNSITSFAETRIRIAGVPSTQLGDLEGLIEIGPAVEFVRKLVGSGYNFTGDIGVELYVGVFLLAFVIPCVGEENGGYEDEVVGDAKALWSSWISENRERDREMKEFVSGLLKERLKAVVVDDKAETRPEHVILSISPSPAGIHIDPLAELLPSRGEYDAMLDSDALPSSSLSPSLALLDPTLPTSSSSSTPPNSTRTAYRRATSALLAHLSTSRTVARSNLWALRHILVLGFYANECLRVGDVRSGFFTADDGTEDIDNVVERVKSLTTYLLGRSEEDVHTKAVSTLMGKKVSVAWDGGSLASFVVEVAQRAKEKDRVRDAAVLGIVLQHLFSDATRDDADLWLGLARRLEKTAPQTAITILASIAAYAPEPPKLDRYRNELAASLLGVRPSAVPTTGLTTLRLLAAAAPDPDSDVVFLPQQRAVNVMKACQTWVAAEDDEEAGDEEGVNEHVESAMTLVFFHLAPILQNVSGSHWEFIWDVVENNLENCFLEDSETLATLGRTIKLVMVIEDLASTNKPLRANWEEKKSPIFALIRDMVAVDTRAMPYSEPRALCRELALSVIQDIPSTMMTEKTLPAMCHLLVDQSQEVQRMGYHLLHNAARKRTEHYVIESAVDTEDVVNPELPTELLAILQQSLGSGEALDLDEQSTVRNMEVSGYLLSWMTAFDLFIGASLKVRSGYFNHMRSLDIISQYFIPNVFDVLGLFSGGKRVFKLDVWAVDEFYLDTFNPGSSLSFQILAAHLYHRALLTVPALIRSWISDCTDKQLLMRVVEYTSSYFSPGIIKAELAQVRQPDVASELSTTENLSVKVSPASGEVTVSYTVDEQPLELSIRMPSDWPLHRLEVRDAKMVGVSEDRWRAWVLGVQQVVWQQNGRIVDGLTLFTKNVTLHFAGQVECAICYSIISVMDASLPQKPCKTCKNRFHASCLYKWFKTSHSSSCPLCRSDIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.12
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.17
8 0.18
9 0.18
10 0.18
11 0.19
12 0.22
13 0.24
14 0.28
15 0.25
16 0.24
17 0.26
18 0.26
19 0.25
20 0.26
21 0.27
22 0.23
23 0.24
24 0.25
25 0.23
26 0.22
27 0.2
28 0.16
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.12
36 0.13
37 0.17
38 0.16
39 0.19
40 0.25
41 0.29
42 0.31
43 0.34
44 0.35
45 0.33
46 0.34
47 0.38
48 0.41
49 0.41
50 0.4
51 0.41
52 0.4
53 0.37
54 0.38
55 0.31
56 0.22
57 0.19
58 0.17
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.17
63 0.16
64 0.19
65 0.21
66 0.23
67 0.23
68 0.24
69 0.24
70 0.24
71 0.26
72 0.25
73 0.25
74 0.21
75 0.19
76 0.18
77 0.17
78 0.15
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.21
94 0.24
95 0.28
96 0.28
97 0.26
98 0.26
99 0.26
100 0.26
101 0.21
102 0.2
103 0.17
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.09
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.1
122 0.12
123 0.12
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.12
130 0.1
131 0.13
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.12
140 0.14
141 0.16
142 0.17
143 0.19
144 0.21
145 0.25
146 0.26
147 0.25
148 0.27
149 0.26
150 0.28
151 0.28
152 0.24
153 0.2
154 0.19
155 0.24
156 0.23
157 0.23
158 0.23
159 0.26
160 0.27
161 0.28
162 0.3
163 0.31
164 0.33
165 0.37
166 0.42
167 0.45
168 0.43
169 0.44
170 0.45
171 0.44
172 0.41
173 0.38
174 0.31
175 0.23
176 0.27
177 0.31
178 0.29
179 0.27
180 0.25
181 0.23
182 0.21
183 0.21
184 0.17
185 0.11
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.12
198 0.16
199 0.23
200 0.27
201 0.27
202 0.31
203 0.31
204 0.3
205 0.29
206 0.28
207 0.22
208 0.19
209 0.2
210 0.17
211 0.2
212 0.2
213 0.21
214 0.19
215 0.19
216 0.2
217 0.18
218 0.18
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.1
256 0.11
257 0.13
258 0.16
259 0.19
260 0.23
261 0.25
262 0.24
263 0.24
264 0.24
265 0.24
266 0.22
267 0.2
268 0.15
269 0.13
270 0.14
271 0.12
272 0.11
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.15
301 0.18
302 0.19
303 0.21
304 0.2
305 0.21
306 0.23
307 0.25
308 0.18
309 0.16
310 0.16
311 0.14
312 0.14
313 0.12
314 0.1
315 0.07
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.09
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.1
364 0.15
365 0.15
366 0.16
367 0.15
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.17
372 0.12
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.1
398 0.14
399 0.14
400 0.17
401 0.18
402 0.17
403 0.17
404 0.16
405 0.15
406 0.1
407 0.09
408 0.07
409 0.06
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.02
417 0.02
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.07
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.07
447 0.11
448 0.18
449 0.23
450 0.28
451 0.35
452 0.39
453 0.43
454 0.42
455 0.42
456 0.41
457 0.38
458 0.37
459 0.31
460 0.27
461 0.24
462 0.23
463 0.23
464 0.19
465 0.19
466 0.22
467 0.22
468 0.21
469 0.22
470 0.22
471 0.18
472 0.18
473 0.17
474 0.17
475 0.17
476 0.18
477 0.18
478 0.19
479 0.19
480 0.2
481 0.18
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.12
487 0.12
488 0.1
489 0.16
490 0.15
491 0.13
492 0.12
493 0.12
494 0.12
495 0.11
496 0.14
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.08
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.05
522 0.05
523 0.04
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.08
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.08
537 0.08
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.1
542 0.11
543 0.13
544 0.15
545 0.16
546 0.19
547 0.21
548 0.23
549 0.23
550 0.24
551 0.28
552 0.29
553 0.36
554 0.35
555 0.34
556 0.32
557 0.32
558 0.31
559 0.26
560 0.23
561 0.16
562 0.15
563 0.14
564 0.13
565 0.12
566 0.11
567 0.1
568 0.1
569 0.09
570 0.09
571 0.1
572 0.1
573 0.11
574 0.13
575 0.15
576 0.18
577 0.18
578 0.19
579 0.2
580 0.2
581 0.19
582 0.16
583 0.13
584 0.09
585 0.09
586 0.07
587 0.05
588 0.04
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.07
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.11
602 0.11
603 0.11
604 0.1
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.05
613 0.05
614 0.04
615 0.04
616 0.05
617 0.04
618 0.04
619 0.05
620 0.05
621 0.05
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.08
626 0.09
627 0.11
628 0.11
629 0.11
630 0.12
631 0.13
632 0.13
633 0.14
634 0.14
635 0.12
636 0.12
637 0.11
638 0.1
639 0.09
640 0.08
641 0.08
642 0.11
643 0.14
644 0.14
645 0.14
646 0.14
647 0.15
648 0.16
649 0.15
650 0.11
651 0.08
652 0.08
653 0.09
654 0.08
655 0.07
656 0.06
657 0.05
658 0.04
659 0.04
660 0.03
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.05
665 0.07
666 0.08
667 0.1
668 0.12
669 0.19
670 0.22
671 0.29
672 0.34
673 0.35
674 0.37
675 0.39
676 0.37
677 0.32
678 0.28
679 0.2
680 0.14
681 0.11
682 0.09
683 0.05
684 0.05
685 0.03
686 0.03
687 0.03
688 0.03
689 0.05
690 0.05
691 0.08
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.08
696 0.09
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.07
703 0.08
704 0.09
705 0.1
706 0.1
707 0.12
708 0.17
709 0.21
710 0.22
711 0.21
712 0.21
713 0.2
714 0.21
715 0.18
716 0.14
717 0.08
718 0.07
719 0.06
720 0.06
721 0.05
722 0.04
723 0.04
724 0.05
725 0.06
726 0.07
727 0.08
728 0.09
729 0.15
730 0.2
731 0.25
732 0.27
733 0.34
734 0.37
735 0.39
736 0.39
737 0.33
738 0.29
739 0.24
740 0.21
741 0.15
742 0.11
743 0.08
744 0.07
745 0.06
746 0.06
747 0.07
748 0.07
749 0.06
750 0.06
751 0.06
752 0.1
753 0.12
754 0.12
755 0.12
756 0.12
757 0.12
758 0.11
759 0.11
760 0.08
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.07
766 0.06
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.07
771 0.06
772 0.07
773 0.08
774 0.08
775 0.09
776 0.12
777 0.12
778 0.12
779 0.14
780 0.14
781 0.18
782 0.18
783 0.18
784 0.18
785 0.18
786 0.18
787 0.16
788 0.15
789 0.1
790 0.11
791 0.11
792 0.09
793 0.09
794 0.1
795 0.09
796 0.08
797 0.08
798 0.07
799 0.05
800 0.05
801 0.05
802 0.04
803 0.04
804 0.05
805 0.04
806 0.04
807 0.04
808 0.04
809 0.04
810 0.04
811 0.04
812 0.04
813 0.04
814 0.04
815 0.04
816 0.05
817 0.05
818 0.05
819 0.05
820 0.04
821 0.05
822 0.06
823 0.07
824 0.06
825 0.07
826 0.07
827 0.09
828 0.12
829 0.12
830 0.11
831 0.1
832 0.11
833 0.11
834 0.11
835 0.1
836 0.08
837 0.07
838 0.07
839 0.09
840 0.07
841 0.08
842 0.08
843 0.07
844 0.06
845 0.07
846 0.07
847 0.06
848 0.07
849 0.07
850 0.08
851 0.08
852 0.09
853 0.08
854 0.08
855 0.08
856 0.08
857 0.09
858 0.08
859 0.08
860 0.08
861 0.08
862 0.09
863 0.09
864 0.08
865 0.09
866 0.08
867 0.08
868 0.08
869 0.08
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.08
874 0.12
875 0.13
876 0.12
877 0.2
878 0.26
879 0.34
880 0.4
881 0.47
882 0.46
883 0.47
884 0.5
885 0.44
886 0.37
887 0.35
888 0.3
889 0.21
890 0.24
891 0.24
892 0.21
893 0.19
894 0.19
895 0.13
896 0.12
897 0.12
898 0.07
899 0.07
900 0.07
901 0.08
902 0.08
903 0.09
904 0.11
905 0.15
906 0.19
907 0.19
908 0.21
909 0.25
910 0.26
911 0.26
912 0.24
913 0.21
914 0.16
915 0.17
916 0.15
917 0.11
918 0.1
919 0.11
920 0.1
921 0.08
922 0.08
923 0.07
924 0.07
925 0.08
926 0.08
927 0.07
928 0.08
929 0.1
930 0.1
931 0.13
932 0.15
933 0.13
934 0.15
935 0.17
936 0.16
937 0.15
938 0.15
939 0.14
940 0.12
941 0.14
942 0.12
943 0.12
944 0.14
945 0.14
946 0.14
947 0.12
948 0.12
949 0.11
950 0.13
951 0.14
952 0.14
953 0.15
954 0.18
955 0.21
956 0.26
957 0.3
958 0.32
959 0.33
960 0.33
961 0.36
962 0.39
963 0.41
964 0.39
965 0.39
966 0.38
967 0.36
968 0.36
969 0.31
970 0.25
971 0.2
972 0.17
973 0.11
974 0.07
975 0.09
976 0.09
977 0.09
978 0.1
979 0.09
980 0.1
981 0.1
982 0.09
983 0.08
984 0.07
985 0.06
986 0.06
987 0.06
988 0.06
989 0.06
990 0.06
991 0.05
992 0.05
993 0.05
994 0.05
995 0.05
996 0.05
997 0.04
998 0.05
999 0.06
1000 0.06
1001 0.06
1002 0.05
1003 0.06
1004 0.06
1005 0.07
1006 0.07
1007 0.07
1008 0.07
1009 0.08
1010 0.07
1011 0.08
1012 0.09
1013 0.1
1014 0.09
1015 0.09
1016 0.09
1017 0.09
1018 0.09
1019 0.07
1020 0.07
1021 0.06
1022 0.06
1023 0.05
1024 0.05
1025 0.06
1026 0.05
1027 0.06
1028 0.07
1029 0.06
1030 0.08
1031 0.08
1032 0.09
1033 0.1
1034 0.1
1035 0.12
1036 0.14
1037 0.23
1038 0.3
1039 0.32
1040 0.35
1041 0.34
1042 0.35
1043 0.34
1044 0.36
1045 0.3
1046 0.25
1047 0.22
1048 0.2
1049 0.21
1050 0.21
1051 0.2
1052 0.15
1053 0.13
1054 0.1
1055 0.11
1056 0.1
1057 0.08
1058 0.08
1059 0.08
1060 0.08
1061 0.07
1062 0.07
1063 0.06
1064 0.11
1065 0.12
1066 0.13
1067 0.12
1068 0.14
1069 0.16
1070 0.17
1071 0.22
1072 0.22
1073 0.24
1074 0.27
1075 0.27
1076 0.26
1077 0.24
1078 0.23
1079 0.18
1080 0.14
1081 0.12
1082 0.08
1083 0.08
1084 0.08
1085 0.08
1086 0.08
1087 0.08
1088 0.09
1089 0.1
1090 0.12
1091 0.12
1092 0.13
1093 0.13
1094 0.14
1095 0.14
1096 0.14
1097 0.12
1098 0.11
1099 0.12
1100 0.11
1101 0.12
1102 0.11
1103 0.11
1104 0.1
1105 0.11
1106 0.1
1107 0.12
1108 0.12
1109 0.13
1110 0.13
1111 0.13
1112 0.13
1113 0.13
1114 0.14
1115 0.14
1116 0.17
1117 0.2
1118 0.2
1119 0.27
1120 0.29
1121 0.28
1122 0.26
1123 0.32
1124 0.32
1125 0.28
1126 0.29
1127 0.23
1128 0.21
1129 0.22
1130 0.23
1131 0.16
1132 0.16
1133 0.14
1134 0.15
1135 0.14
1136 0.14
1137 0.16
1138 0.16
1139 0.17
1140 0.15
1141 0.15
1142 0.14
1143 0.22
1144 0.23
1145 0.22
1146 0.24
1147 0.23
1148 0.25
1149 0.26
1150 0.24
1151 0.18
1152 0.18
1153 0.18
1154 0.15
1155 0.14
1156 0.13
1157 0.13
1158 0.14
1159 0.14
1160 0.13
1161 0.14
1162 0.14
1163 0.15
1164 0.14
1165 0.14
1166 0.15
1167 0.15
1168 0.13
1169 0.12
1170 0.14
1171 0.13
1172 0.13
1173 0.12
1174 0.13
1175 0.13
1176 0.13
1177 0.12
1178 0.11
1179 0.12
1180 0.12
1181 0.12
1182 0.1
1183 0.1
1184 0.11
1185 0.13
1186 0.11
1187 0.12
1188 0.12
1189 0.14
1190 0.14
1191 0.14
1192 0.16
1193 0.22
1194 0.25
1195 0.28
1196 0.3
1197 0.34
1198 0.36
1199 0.39
1200 0.44
1201 0.45
1202 0.45
1203 0.47
1204 0.43
1205 0.38
1206 0.37
1207 0.34
1208 0.28
1209 0.22
1210 0.21
1211 0.22
1212 0.26
1213 0.26
1214 0.25
1215 0.26
1216 0.25
1217 0.23
1218 0.25
1219 0.22
1220 0.24
1221 0.24
1222 0.23
1223 0.24
1224 0.28
1225 0.28
1226 0.26
1227 0.24
1228 0.18
1229 0.22
1230 0.23
1231 0.21
1232 0.18
1233 0.17
1234 0.17
1235 0.17
1236 0.18
1237 0.16
1238 0.15
1239 0.14
1240 0.13
1241 0.15
1242 0.13
1243 0.14
1244 0.17
1245 0.17
1246 0.18
1247 0.21
1248 0.23
1249 0.21
1250 0.21
1251 0.22
1252 0.18
1253 0.16
1254 0.14
1255 0.12
1256 0.1
1257 0.09
1258 0.1
1259 0.09
1260 0.09
1261 0.1
1262 0.1
1263 0.09
1264 0.1
1265 0.11
1266 0.12
1267 0.17
1268 0.2
1269 0.23
1270 0.3
1271 0.34
1272 0.41
1273 0.51
1274 0.6
1275 0.64
1276 0.71
1277 0.77
1278 0.81
1279 0.81
1280 0.82
1281 0.82
1282 0.77
1283 0.74
1284 0.73
1285 0.72
1286 0.62
1287 0.61
1288 0.55
1289 0.48
1290 0.5
1291 0.49
1292 0.48
1293 0.49
1294 0.53
1295 0.55
1296 0.61
1297 0.63
1298 0.56