FuNGI

C6HCV4

Protein Details

Accession

C6HCV4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
679-699	SSPPPPPPRKIIQPKLTRLFD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, pero 3, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003150 DNA-bd_RFX
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
PROSITE	View protein in PROSITE PS51526 RFX_DBD

Amino Acid Sequences

MEPTSTLDQIRTDPAAFYLALREVHKDQRPLEVAMNGPVAADGSPADARSARGLRRAPPQRQPYTATSPATRQTRSTANTPGTPASLNNSIPSLSYSPSSAPTTIAVNNSNNNNNNTAVNVTATMMPTPTPPAATIDNRAPMFTIVVDTPSNRRGKYSQVDQPPLTRNMDPMMMSMIPEKTPRIYNHCVRGLQSHIPSEVDFALHHLVVISDERGDKFKFDDFPFLAEELVEKILEITYLVSGIRWEIDYTTLEEPRDNLLYGTGNNDIIEKMAKFRVTLSDDNVETEEFARNLRNIKEAALTLRNMSMLEANAVFLSTLEIFKDGMLVVLNTPRQPRFNEILNYALDTIEQVCPYWETDPEDPLFSVLFGLLGSSDRYHILTSLKILILFSMELETIKRLQGIPDDKINMLMSYTLLEQDKELLSGTLDFFYQYTAIPENVEELLRNFSLPTTLIPRLTNLLLFEGERDVNEIVDQEECKAPAATSIPIVPPDLHSMLLQLPEPERCSRWLKCCFIEDPECDITQLALWHAYQNCFADERVPGVSTLPAAEFINTVSRTFSSAQAQVVTGPVAKFIIRGIRPLETSYDLNGYPYRQCKWNVPNGQCRVSFVDPAKLKEHVFREHMLLNPADLGNLQDARRPTNICAWDTCKDYEIPTINTARVAGHVSTHLPPLQDMSSPPPPPPRKIIQPKLTRLFDYYPTPIDEKGEPVGIAYKAILILRNVIRNLPKESAGPEHGNRSWNYVIFFASRNKLIEIADYNPTLRRDIFELVDEIKSN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.21
3	0.19
4	0.17
5	0.16
6	0.17
7	0.19
8	0.2
9	0.24
10	0.27
11	0.36
12	0.41
13	0.44
14	0.42
15	0.48
16	0.51
17	0.49
18	0.47
19	0.42
20	0.37
21	0.34
22	0.34
23	0.24
24	0.21
25	0.17
26	0.15
27	0.11
28	0.1
29	0.06
30	0.08
31	0.1
32	0.1
33	0.12
34	0.12
35	0.14
36	0.2
37	0.26
38	0.26
39	0.33
40	0.37
41	0.41
42	0.51
43	0.6
44	0.61
45	0.65
46	0.72
47	0.72
48	0.72
49	0.72
50	0.69
51	0.67
52	0.66
53	0.59
54	0.52
55	0.5
56	0.53
57	0.53
58	0.48
59	0.41
60	0.39
61	0.43
62	0.44
63	0.45
64	0.45
65	0.43
66	0.44
67	0.45
68	0.42
69	0.36
70	0.32
71	0.28
72	0.25
73	0.26
74	0.23
75	0.22
76	0.21
77	0.19
78	0.19
79	0.22
80	0.18
81	0.15
82	0.15
83	0.15
84	0.16
85	0.2
86	0.22
87	0.19
88	0.18
89	0.18
90	0.2
91	0.21
92	0.23
93	0.23
94	0.23
95	0.27
96	0.31
97	0.37
98	0.38
99	0.38
100	0.37
101	0.35
102	0.32
103	0.29
104	0.25
105	0.19
106	0.15
107	0.13
108	0.12
109	0.12
110	0.12
111	0.11
112	0.11
113	0.1
114	0.1
115	0.13
116	0.13
117	0.12
118	0.12
119	0.15
120	0.2
121	0.22
122	0.25
123	0.26
124	0.32
125	0.31
126	0.3
127	0.28
128	0.23
129	0.21
130	0.17
131	0.15
132	0.09
133	0.11
134	0.12
135	0.13
136	0.16
137	0.23
138	0.27
139	0.25
140	0.29
141	0.28
142	0.36
143	0.42
144	0.46
145	0.48
146	0.53
147	0.59
148	0.56
149	0.6
150	0.58
151	0.54
152	0.49
153	0.41
154	0.34
155	0.29
156	0.3
157	0.24
158	0.19
159	0.18
160	0.14
161	0.14
162	0.15
163	0.15
164	0.14
165	0.15
166	0.16
167	0.15
168	0.21
169	0.24
170	0.29
171	0.36
172	0.42
173	0.48
174	0.53
175	0.51
176	0.47
177	0.48
178	0.44
179	0.43
180	0.39
181	0.33
182	0.28
183	0.28
184	0.26
185	0.24
186	0.19
187	0.14
188	0.11
189	0.11
190	0.12
191	0.1
192	0.1
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.08
198	0.07
199	0.09
200	0.1
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.14
205	0.18
206	0.22
207	0.22
208	0.28
209	0.26
210	0.28
211	0.28
212	0.27
213	0.23
214	0.17
215	0.16
216	0.1
217	0.1
218	0.08
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.04
226	0.05
227	0.05
228	0.04
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.05
233	0.06
234	0.06
235	0.08
236	0.09
237	0.12
238	0.15
239	0.16
240	0.16
241	0.16
242	0.16
243	0.17
244	0.17
245	0.14
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.13
251	0.11
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.1
258	0.08
259	0.09
260	0.12
261	0.12
262	0.12
263	0.13
264	0.18
265	0.22
266	0.23
267	0.24
268	0.26
269	0.25
270	0.26
271	0.26
272	0.2
273	0.15
274	0.14
275	0.12
276	0.08
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.14
281	0.15
282	0.16
283	0.15
284	0.16
285	0.17
286	0.16
287	0.19
288	0.18
289	0.17
290	0.15
291	0.15
292	0.14
293	0.13
294	0.12
295	0.1
296	0.07
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.07
318	0.09
319	0.1
320	0.13
321	0.14
322	0.16
323	0.18
324	0.23
325	0.24
326	0.28
327	0.29
328	0.28
329	0.29
330	0.27
331	0.26
332	0.21
333	0.17
334	0.11
335	0.09
336	0.09
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.11
346	0.12
347	0.14
348	0.15
349	0.15
350	0.14
351	0.13
352	0.12
353	0.08
354	0.07
355	0.05
356	0.04
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.06
388	0.07
389	0.13
390	0.16
391	0.17
392	0.19
393	0.2
394	0.19
395	0.2
396	0.2
397	0.14
398	0.11
399	0.09
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.07
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.05
422	0.06
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.11
441	0.12
442	0.14
443	0.14
444	0.15
445	0.16
446	0.16
447	0.16
448	0.11
449	0.11
450	0.1
451	0.1
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.08
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.07
461	0.06
462	0.08
463	0.08
464	0.07
465	0.08
466	0.08
467	0.09
468	0.09
469	0.08
470	0.09
471	0.11
472	0.1
473	0.1
474	0.11
475	0.1
476	0.11
477	0.12
478	0.1
479	0.1
480	0.13
481	0.13
482	0.12
483	0.12
484	0.12
485	0.13
486	0.13
487	0.12
488	0.1
489	0.1
490	0.11
491	0.14
492	0.15
493	0.15
494	0.18
495	0.24
496	0.28
497	0.35
498	0.42
499	0.43
500	0.44
501	0.46
502	0.44
503	0.44
504	0.44
505	0.38
506	0.36
507	0.34
508	0.31
509	0.28
510	0.26
511	0.2
512	0.15
513	0.13
514	0.08
515	0.07
516	0.07
517	0.11
518	0.12
519	0.13
520	0.14
521	0.15
522	0.15
523	0.15
524	0.15
525	0.14
526	0.12
527	0.13
528	0.13
529	0.12
530	0.11
531	0.11
532	0.11
533	0.09
534	0.1
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.07
540	0.08
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.13
545	0.13
546	0.15
547	0.17
548	0.19
549	0.17
550	0.19
551	0.19
552	0.19
553	0.19
554	0.16
555	0.16
556	0.13
557	0.11
558	0.09
559	0.09
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.09
564	0.16
565	0.15
566	0.18
567	0.2
568	0.22
569	0.23
570	0.24
571	0.26
572	0.21
573	0.22
574	0.2
575	0.21
576	0.18
577	0.19
578	0.19
579	0.18
580	0.2
581	0.23
582	0.24
583	0.27
584	0.29
585	0.36
586	0.42
587	0.51
588	0.55
589	0.58
590	0.65
591	0.66
592	0.69
593	0.61
594	0.56
595	0.52
596	0.45
597	0.43
598	0.35
599	0.38
600	0.36
601	0.39
602	0.38
603	0.35
604	0.34
605	0.35
606	0.38
607	0.35
608	0.36
609	0.34
610	0.35
611	0.35
612	0.36
613	0.33
614	0.28
615	0.23
616	0.21
617	0.19
618	0.16
619	0.12
620	0.11
621	0.11
622	0.14
623	0.14
624	0.16
625	0.17
626	0.21
627	0.24
628	0.26
629	0.25
630	0.3
631	0.35
632	0.33
633	0.37
634	0.39
635	0.39
636	0.4
637	0.39
638	0.32
639	0.29
640	0.28
641	0.3
642	0.29
643	0.28
644	0.29
645	0.3
646	0.29
647	0.28
648	0.27
649	0.21
650	0.18
651	0.18
652	0.14
653	0.13
654	0.14
655	0.17
656	0.18
657	0.2
658	0.2
659	0.18
660	0.18
661	0.19
662	0.19
663	0.17
664	0.18
665	0.22
666	0.28
667	0.29
668	0.32
669	0.39
670	0.43
671	0.46
672	0.52
673	0.52
674	0.55
675	0.65
676	0.72
677	0.72
678	0.76
679	0.81
680	0.84
681	0.8
682	0.71
683	0.65
684	0.58
685	0.53
686	0.49
687	0.43
688	0.36
689	0.36
690	0.36
691	0.31
692	0.31
693	0.27
694	0.24
695	0.23
696	0.22
697	0.18
698	0.17
699	0.21
700	0.18
701	0.17
702	0.14
703	0.13
704	0.12
705	0.14
706	0.15
707	0.11
708	0.18
709	0.22
710	0.27
711	0.27
712	0.31
713	0.36
714	0.38
715	0.43
716	0.39
717	0.36
718	0.33
719	0.36
720	0.37
721	0.38
722	0.4
723	0.37
724	0.42
725	0.43
726	0.46
727	0.44
728	0.44
729	0.41
730	0.37
731	0.36
732	0.29
733	0.28
734	0.26
735	0.28
736	0.28
737	0.3
738	0.31
739	0.31
740	0.31
741	0.31
742	0.29
743	0.3
744	0.28
745	0.26
746	0.28
747	0.27
748	0.28
749	0.3
750	0.31
751	0.29
752	0.26
753	0.25
754	0.25
755	0.28
756	0.28
757	0.26
758	0.28
759	0.27

C6HCV4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer