Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HDP6

Protein Details
Accession C6HDP6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-138IATHCRKRYRLTPTKNPNANVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013859  Ssr4_N  
IPR046464  SWI-SNF_Ssr4_C  
Gene Ontology GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF20497  SWI-SNF_Ssr4_C  
PF08549  SWI-SNF_Ssr4_N  
Amino Acid Sequences MADPAGGVPQQLLPHMHLVSSYRYPLMNNLSHETAVEYLISAPKVVRELQTMHWMFLDGPPDGTVILVWQPLNHLGTNFASDGYVWADAEQIYSTEIRGYNLELYLQRCGYHPPNEQIATHCRKRYRLTPTKNPNANVVPCDPSLWIIHYSKTPAGDQIPANRILVTPQMQNILAQRRFLQSQGQLVRKEFMLHDRNSWPTINLPPQVGQQNFMPHGAPYANPMLGRQQSGPFYQQQQGQNLPGPQNKPSRSSRASATAAALASAAAGDYSLEEEEVSTGDMLDTITPRDISKMRYRHHHEWMDEIFGSPYSVKQIIPVDLGLGRKGELESLTAGFFDAPTGPRCERRVLEKSRGHLDTSTREEVASELSIPTSAPRRRVDDIINNLQKALGRLIVRVTEISCVEEGGLQKRVVPPETTSEFSRGDIDMGEAGMSLRQAADSKQQPSPSHAASAGPVPTPVAAPTTQQTEVGKVSALPAGATLQTPSTSGLPLPTEPSKPDGSGDVEMGGVELANAAAATTITGNQTGEWVIVSKEDSAAPQDASIAVVSAIEGGYNHPTSTELTGAAAPAPVTAATGADIPVSELQGLKSAANTDLSEASALETSNFDDAAEFSNLDSAADALAAYGEQNDDLGMGDLDNSAFGEAFHASEAEREQLQDNENENEEIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.21
4 0.19
5 0.21
6 0.24
7 0.26
8 0.26
9 0.23
10 0.23
11 0.24
12 0.29
13 0.34
14 0.33
15 0.34
16 0.37
17 0.37
18 0.36
19 0.35
20 0.31
21 0.24
22 0.2
23 0.15
24 0.11
25 0.1
26 0.13
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.16
32 0.18
33 0.18
34 0.19
35 0.23
36 0.26
37 0.36
38 0.35
39 0.33
40 0.31
41 0.29
42 0.26
43 0.25
44 0.25
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.13
51 0.09
52 0.07
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.12
58 0.15
59 0.18
60 0.17
61 0.15
62 0.16
63 0.17
64 0.19
65 0.18
66 0.15
67 0.13
68 0.12
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.18
90 0.18
91 0.19
92 0.22
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.25
97 0.28
98 0.33
99 0.37
100 0.38
101 0.44
102 0.45
103 0.45
104 0.44
105 0.47
106 0.48
107 0.49
108 0.5
109 0.47
110 0.51
111 0.57
112 0.61
113 0.62
114 0.65
115 0.68
116 0.73
117 0.79
118 0.83
119 0.84
120 0.77
121 0.72
122 0.68
123 0.61
124 0.54
125 0.46
126 0.39
127 0.33
128 0.33
129 0.26
130 0.21
131 0.2
132 0.18
133 0.19
134 0.17
135 0.18
136 0.19
137 0.22
138 0.22
139 0.23
140 0.21
141 0.2
142 0.21
143 0.23
144 0.24
145 0.28
146 0.3
147 0.29
148 0.29
149 0.26
150 0.24
151 0.21
152 0.23
153 0.18
154 0.16
155 0.16
156 0.18
157 0.18
158 0.19
159 0.23
160 0.28
161 0.26
162 0.26
163 0.27
164 0.28
165 0.29
166 0.29
167 0.3
168 0.23
169 0.3
170 0.36
171 0.39
172 0.38
173 0.38
174 0.39
175 0.33
176 0.32
177 0.25
178 0.27
179 0.29
180 0.27
181 0.31
182 0.33
183 0.35
184 0.36
185 0.35
186 0.27
187 0.23
188 0.28
189 0.28
190 0.27
191 0.25
192 0.24
193 0.27
194 0.33
195 0.31
196 0.27
197 0.23
198 0.26
199 0.26
200 0.25
201 0.22
202 0.15
203 0.16
204 0.15
205 0.13
206 0.11
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.17
212 0.18
213 0.19
214 0.18
215 0.19
216 0.2
217 0.22
218 0.24
219 0.22
220 0.24
221 0.26
222 0.3
223 0.31
224 0.32
225 0.33
226 0.32
227 0.32
228 0.31
229 0.32
230 0.31
231 0.29
232 0.31
233 0.37
234 0.37
235 0.39
236 0.41
237 0.45
238 0.43
239 0.44
240 0.41
241 0.4
242 0.4
243 0.35
244 0.32
245 0.25
246 0.22
247 0.19
248 0.16
249 0.09
250 0.07
251 0.05
252 0.04
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.09
277 0.11
278 0.14
279 0.22
280 0.3
281 0.32
282 0.41
283 0.5
284 0.53
285 0.61
286 0.62
287 0.54
288 0.51
289 0.5
290 0.43
291 0.34
292 0.28
293 0.19
294 0.14
295 0.14
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.1
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.07
328 0.11
329 0.12
330 0.16
331 0.18
332 0.21
333 0.21
334 0.28
335 0.35
336 0.38
337 0.46
338 0.46
339 0.47
340 0.5
341 0.5
342 0.43
343 0.36
344 0.33
345 0.28
346 0.3
347 0.29
348 0.23
349 0.22
350 0.21
351 0.19
352 0.18
353 0.13
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.13
361 0.15
362 0.2
363 0.23
364 0.28
365 0.3
366 0.33
367 0.37
368 0.37
369 0.41
370 0.46
371 0.46
372 0.41
373 0.39
374 0.36
375 0.32
376 0.26
377 0.19
378 0.14
379 0.11
380 0.12
381 0.13
382 0.13
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.14
396 0.13
397 0.15
398 0.17
399 0.2
400 0.19
401 0.19
402 0.18
403 0.21
404 0.25
405 0.25
406 0.24
407 0.25
408 0.24
409 0.23
410 0.23
411 0.17
412 0.14
413 0.12
414 0.11
415 0.08
416 0.07
417 0.06
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.04
425 0.05
426 0.06
427 0.13
428 0.18
429 0.22
430 0.25
431 0.3
432 0.3
433 0.35
434 0.38
435 0.32
436 0.29
437 0.26
438 0.23
439 0.19
440 0.21
441 0.17
442 0.13
443 0.12
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.11
452 0.14
453 0.15
454 0.16
455 0.16
456 0.17
457 0.17
458 0.16
459 0.15
460 0.1
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.08
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.11
480 0.15
481 0.17
482 0.18
483 0.19
484 0.22
485 0.22
486 0.21
487 0.22
488 0.2
489 0.2
490 0.2
491 0.19
492 0.15
493 0.14
494 0.13
495 0.12
496 0.09
497 0.05
498 0.04
499 0.03
500 0.03
501 0.02
502 0.02
503 0.02
504 0.02
505 0.03
506 0.03
507 0.04
508 0.05
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.09
521 0.08
522 0.09
523 0.09
524 0.1
525 0.12
526 0.14
527 0.13
528 0.12
529 0.12
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.07
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.04
540 0.04
541 0.06
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.12
547 0.14
548 0.15
549 0.15
550 0.11
551 0.12
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.1
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.07
566 0.06
567 0.06
568 0.08
569 0.08
570 0.09
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.13
575 0.14
576 0.12
577 0.13
578 0.14
579 0.15
580 0.16
581 0.16
582 0.14
583 0.14
584 0.15
585 0.14
586 0.12
587 0.12
588 0.11
589 0.11
590 0.09
591 0.09
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.09
596 0.08
597 0.09
598 0.12
599 0.13
600 0.12
601 0.11
602 0.14
603 0.14
604 0.13
605 0.12
606 0.09
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.05
620 0.06
621 0.07
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.07
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.08
638 0.11
639 0.12
640 0.13
641 0.14
642 0.15
643 0.17
644 0.2
645 0.23
646 0.26
647 0.29
648 0.29
649 0.31