FuNGI

C6HCI1

Protein Details

Accession

C6HCI1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
413-436	EAQYKRQLKQKRQGKKDGHRDANG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
419-444	QLKQKRQGKKDGHRDANGHGKQRRER
498-527	RHSRGGRGRGRGRGSDRGERGRGRGGSYKK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 10.499, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MADVPSADCILSGDNKHPPSKRPCLDQASNRMEPGGEPVEDEGSDFYTPIKGGTPVPTAQNSLAEDNNHIIPPALPKTAPAIPGLTFLYETTAAAESQTVEGSGHSDAVEQTSSLDRACELGMSQELDKQVPAPNDVEMRTTSPEDQHRQGEHQSRSHTAPEESENDIPSVPEVSKESIPSTHNGVLGDPHAGGSEIGSDNSENPEWEIDSSPYESSSSDSSSDSSDDDGDSSDDYDLLDPEEQARILMAAEGGSDDEGDEKHKGVHIRTANEKPEEIVPKPDITVTPEMKVEVLGNVETIVENVVLIKANISGEYQVLESGSVLCLADLSVIGMVSETLGRVEQPRYTVRFPNEESIKEAKLDKGTPVFYVVDHSTFVFTQPLKGLKGSDASNFHDEEVGEEEIEFSDDEAEAQYKRQLKQKRQGKKDGHRDANGHGKQRRERLGPSGLRSSEINYDDINTEDGYTPLSRPKNFHEMIGHTEAPTEESHLRNQFAERHSRGGRGRGRGRGSDRGERGRGRGGSYKKHGDDRQPQQSQNHLEQPQRQQQETSQHTYPRQSAEFTQAFYQAQNLSQQQSLPYNSSSYPHQTSQQNQPSQVFNTNQTFSTPGFLPTQQQYLFQPLHQSQSSPPFPPPGSHINPAFFRNLQQQQQNPPYQPPQQAQQRLQSQHSSQVPTTQTSADTFAAAQAQLDLLRRLSRSGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.33
3	0.4
4	0.44
5	0.5
6	0.55
7	0.64
8	0.65
9	0.65
10	0.7
11	0.72
12	0.77
13	0.77
14	0.78
15	0.76
16	0.72
17	0.64
18	0.55
19	0.46
20	0.37
21	0.34
22	0.28
23	0.19
24	0.17
25	0.18
26	0.19
27	0.19
28	0.19
29	0.14
30	0.12
31	0.12
32	0.11
33	0.11
34	0.11
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.12
39	0.14
40	0.19
41	0.23
42	0.23
43	0.28
44	0.29
45	0.3
46	0.29
47	0.3
48	0.28
49	0.27
50	0.27
51	0.24
52	0.24
53	0.24
54	0.25
55	0.21
56	0.19
57	0.16
58	0.15
59	0.2
60	0.22
61	0.21
62	0.19
63	0.2
64	0.25
65	0.28
66	0.28
67	0.23
68	0.21
69	0.2
70	0.23
71	0.22
72	0.18
73	0.15
74	0.14
75	0.15
76	0.13
77	0.13
78	0.12
79	0.12
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.09
84	0.1
85	0.1
86	0.08
87	0.07
88	0.07
89	0.09
90	0.09
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.1
96	0.1
97	0.08
98	0.1
99	0.12
100	0.12
101	0.11
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.11
106	0.1
107	0.07
108	0.09
109	0.1
110	0.12
111	0.12
112	0.14
113	0.15
114	0.15
115	0.15
116	0.15
117	0.18
118	0.17
119	0.19
120	0.18
121	0.19
122	0.21
123	0.22
124	0.22
125	0.19
126	0.2
127	0.21
128	0.22
129	0.21
130	0.24
131	0.31
132	0.34
133	0.38
134	0.41
135	0.4
136	0.42
137	0.48
138	0.51
139	0.49
140	0.48
141	0.48
142	0.46
143	0.46
144	0.46
145	0.41
146	0.33
147	0.3
148	0.29
149	0.29
150	0.29
151	0.28
152	0.25
153	0.23
154	0.22
155	0.19
156	0.15
157	0.14
158	0.1
159	0.1
160	0.11
161	0.14
162	0.15
163	0.16
164	0.17
165	0.19
166	0.2
167	0.21
168	0.24
169	0.23
170	0.23
171	0.22
172	0.21
173	0.19
174	0.18
175	0.17
176	0.12
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.06
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.12
189	0.12
190	0.09
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.11
195	0.12
196	0.11
197	0.12
198	0.13
199	0.13
200	0.13
201	0.13
202	0.11
203	0.11
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.12
208	0.12
209	0.12
210	0.13
211	0.12
212	0.11
213	0.1
214	0.09
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.07
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.04
237	0.03
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.03
243	0.03
244	0.04
245	0.04
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.11
251	0.13
252	0.13
253	0.21
254	0.23
255	0.26
256	0.33
257	0.38
258	0.4
259	0.39
260	0.38
261	0.31
262	0.32
263	0.33
264	0.27
265	0.25
266	0.23
267	0.22
268	0.22
269	0.21
270	0.17
271	0.17
272	0.22
273	0.19
274	0.19
275	0.19
276	0.18
277	0.18
278	0.17
279	0.14
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.02
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.06
330	0.07
331	0.08
332	0.11
333	0.14
334	0.18
335	0.21
336	0.25
337	0.25
338	0.29
339	0.3
340	0.33
341	0.32
342	0.29
343	0.31
344	0.29
345	0.27
346	0.24
347	0.23
348	0.18
349	0.18
350	0.18
351	0.15
352	0.15
353	0.15
354	0.14
355	0.16
356	0.14
357	0.12
358	0.14
359	0.13
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.09
365	0.1
366	0.1
367	0.09
368	0.1
369	0.11
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.14
374	0.12
375	0.15
376	0.15
377	0.16
378	0.17
379	0.19
380	0.21
381	0.21
382	0.2
383	0.18
384	0.17
385	0.14
386	0.14
387	0.12
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.06
400	0.05
401	0.06
402	0.1
403	0.15
404	0.18
405	0.25
406	0.34
407	0.42
408	0.52
409	0.6
410	0.66
411	0.7
412	0.77
413	0.8
414	0.82
415	0.84
416	0.84
417	0.82
418	0.75
419	0.69
420	0.62
421	0.63
422	0.56
423	0.53
424	0.46
425	0.46
426	0.47
427	0.52
428	0.54
429	0.47
430	0.46
431	0.45
432	0.51
433	0.48
434	0.47
435	0.46
436	0.4
437	0.37
438	0.35
439	0.31
440	0.27
441	0.25
442	0.22
443	0.16
444	0.17
445	0.16
446	0.16
447	0.15
448	0.1
449	0.09
450	0.09
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.15
456	0.2
457	0.21
458	0.23
459	0.29
460	0.36
461	0.36
462	0.38
463	0.36
464	0.34
465	0.37
466	0.4
467	0.35
468	0.26
469	0.26
470	0.23
471	0.2
472	0.18
473	0.16
474	0.14
475	0.15
476	0.2
477	0.22
478	0.23
479	0.23
480	0.25
481	0.27
482	0.28
483	0.36
484	0.33
485	0.37
486	0.37
487	0.43
488	0.43
489	0.46
490	0.48
491	0.49
492	0.53
493	0.53
494	0.56
495	0.56
496	0.59
497	0.59
498	0.59
499	0.58
500	0.58
501	0.57
502	0.59
503	0.54
504	0.51
505	0.49
506	0.45
507	0.4
508	0.43
509	0.42
510	0.44
511	0.49
512	0.55
513	0.51
514	0.57
515	0.58
516	0.6
517	0.64
518	0.65
519	0.69
520	0.67
521	0.67
522	0.62
523	0.65
524	0.61
525	0.57
526	0.56
527	0.5
528	0.49
529	0.52
530	0.58
531	0.59
532	0.58
533	0.53
534	0.47
535	0.47
536	0.52
537	0.51
538	0.49
539	0.44
540	0.45
541	0.47
542	0.49
543	0.48
544	0.43
545	0.38
546	0.35
547	0.32
548	0.36
549	0.34
550	0.31
551	0.3
552	0.27
553	0.26
554	0.23
555	0.24
556	0.16
557	0.16
558	0.19
559	0.2
560	0.2
561	0.2
562	0.21
563	0.21
564	0.24
565	0.25
566	0.23
567	0.22
568	0.22
569	0.22
570	0.23
571	0.24
572	0.26
573	0.29
574	0.28
575	0.34
576	0.37
577	0.42
578	0.51
579	0.57
580	0.55
581	0.53
582	0.54
583	0.51
584	0.49
585	0.5
586	0.41
587	0.38
588	0.39
589	0.38
590	0.35
591	0.33
592	0.31
593	0.25
594	0.27
595	0.21
596	0.18
597	0.2
598	0.2
599	0.24
600	0.24
601	0.3
602	0.26
603	0.28
604	0.27
605	0.31
606	0.31
607	0.27
608	0.33
609	0.28
610	0.34
611	0.33
612	0.32
613	0.3
614	0.39
615	0.42
616	0.36
617	0.36
618	0.36
619	0.37
620	0.37
621	0.38
622	0.37
623	0.39
624	0.43
625	0.44
626	0.43
627	0.45
628	0.46
629	0.45
630	0.37
631	0.35
632	0.38
633	0.42
634	0.44
635	0.49
636	0.52
637	0.58
638	0.66
639	0.69
640	0.63
641	0.62
642	0.62
643	0.62
644	0.63
645	0.56
646	0.57
647	0.6
648	0.66
649	0.64
650	0.67
651	0.68
652	0.66
653	0.68
654	0.65
655	0.57
656	0.57
657	0.58
658	0.54
659	0.45
660	0.47
661	0.45
662	0.41
663	0.41
664	0.34
665	0.29
666	0.26
667	0.29
668	0.22
669	0.2
670	0.17
671	0.16
672	0.17
673	0.15
674	0.14
675	0.1
676	0.11
677	0.12
678	0.14
679	0.14
680	0.15
681	0.19
682	0.19

C6HCI1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer