Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HJ29

Protein Details
Accession C6HJ29    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSEYWKSTPKYWCKHCKTYVRDTAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-160RKRKLKDR
286-294KKRKPKHAR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
Amino Acid Sequences MSEYWKSTPKYWCKHCKTYVRDTAFERTQHEATGKHQGNLRRFLRDIHRNNERDERKNQQARNEIERLKGVVSGSSKTGEQQRPPWKHGLGGGSGAGPATGANAESSASLSANAEQRKRRIWRSREIGKLLRDTAEEKGHEQDPMAGLNIGVRKRKLKDRREEAAGETVMRKGWGSTTRAFPDDGKDIDALLERATELKRKGPKMETPDVKAEREGVVDGSIDIATRKENPAANDGDVPPIKREERGNGSTIAGTKEKGDAKDVSRSASEALGETSEGIVPAVVFKKRKPKHAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.86
3 0.86
4 0.84
5 0.84
6 0.84
7 0.8
8 0.75
9 0.7
10 0.69
11 0.64
12 0.59
13 0.52
14 0.47
15 0.42
16 0.39
17 0.37
18 0.3
19 0.28
20 0.36
21 0.35
22 0.32
23 0.35
24 0.4
25 0.44
26 0.52
27 0.52
28 0.47
29 0.45
30 0.48
31 0.53
32 0.57
33 0.58
34 0.57
35 0.64
36 0.61
37 0.65
38 0.69
39 0.67
40 0.63
41 0.62
42 0.62
43 0.62
44 0.68
45 0.67
46 0.65
47 0.67
48 0.66
49 0.67
50 0.66
51 0.58
52 0.51
53 0.5
54 0.42
55 0.33
56 0.3
57 0.22
58 0.18
59 0.18
60 0.17
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.26
66 0.27
67 0.29
68 0.37
69 0.46
70 0.51
71 0.55
72 0.58
73 0.49
74 0.46
75 0.45
76 0.39
77 0.29
78 0.25
79 0.21
80 0.16
81 0.15
82 0.13
83 0.09
84 0.06
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.08
99 0.13
100 0.16
101 0.2
102 0.23
103 0.26
104 0.33
105 0.38
106 0.46
107 0.51
108 0.54
109 0.59
110 0.65
111 0.71
112 0.7
113 0.7
114 0.66
115 0.58
116 0.55
117 0.46
118 0.38
119 0.3
120 0.25
121 0.23
122 0.21
123 0.18
124 0.16
125 0.18
126 0.18
127 0.17
128 0.15
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.07
134 0.06
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.18
141 0.22
142 0.32
143 0.4
144 0.46
145 0.55
146 0.61
147 0.65
148 0.65
149 0.64
150 0.56
151 0.5
152 0.41
153 0.32
154 0.24
155 0.19
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.06
160 0.09
161 0.13
162 0.16
163 0.18
164 0.23
165 0.25
166 0.26
167 0.27
168 0.24
169 0.23
170 0.23
171 0.21
172 0.18
173 0.16
174 0.15
175 0.14
176 0.14
177 0.11
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.08
182 0.09
183 0.13
184 0.13
185 0.2
186 0.27
187 0.3
188 0.36
189 0.39
190 0.45
191 0.49
192 0.57
193 0.55
194 0.53
195 0.59
196 0.56
197 0.52
198 0.45
199 0.39
200 0.3
201 0.25
202 0.21
203 0.13
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.11
215 0.14
216 0.17
217 0.19
218 0.24
219 0.26
220 0.27
221 0.28
222 0.27
223 0.29
224 0.28
225 0.27
226 0.24
227 0.26
228 0.26
229 0.25
230 0.28
231 0.3
232 0.37
233 0.39
234 0.39
235 0.36
236 0.36
237 0.35
238 0.33
239 0.29
240 0.22
241 0.19
242 0.17
243 0.21
244 0.25
245 0.24
246 0.27
247 0.28
248 0.3
249 0.39
250 0.38
251 0.36
252 0.32
253 0.32
254 0.29
255 0.26
256 0.23
257 0.15
258 0.15
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.1
269 0.14
270 0.19
271 0.22
272 0.27
273 0.39
274 0.45