Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HCD9

Protein Details
Accession C6HCD9    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-100SPANKRRDQERERGPPHRKRRRIAGENDTDRBasic
262-299EEKKRELKVFKEEKRRERRDSSRHRREMRRRQGSNASHBasic
311-343TQPVENSRDRNRERSKKHRREGRERNQERSSKHBasic
349-369DSQSHKTSRNHETNRSKCPSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-92PPPPDPEESPANKRRDQERERGPPHRKRRRI
254-292ERERNKWAEEKKRELKVFKEEKRRERRDSSRHRREMRRR
320-338RNRERSKKHRREGRERNQE
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MVLHLLGKKSWNVYNRDNIARVRRDEAEAKAREEEERRHLQQVDAEKRLEILRGLRSPSKSPPPPDPEESPANKRRDQERERGPPHRKRRRIAGENDTDRDIRFAREDAQRAEARREKDVVVVGKLPKDDAPLMDDSGHISLFPEPAAADSVINDLRKNPEAEAEATRKKREYEDQYTMRFSNAAGFKTSLDKGPWYSSSTTDIAAQTVEDMLPNKDVWGNEDPRRQERERARISMGDPLMAMKRGVRQLRDVERERNKWAEEKKRELKVFKEEKRRERRDSSRHRREMRRRQGSNASHNSLAGFSLDAGTQPVENSRDRNRERSKKHRREGRERNQERSSKHMRSYVDSQSHKTSRNHETNRSKCPSADK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.56
3 0.59
4 0.59
5 0.59
6 0.62
7 0.62
8 0.59
9 0.54
10 0.5
11 0.5
12 0.5
13 0.51
14 0.51
15 0.47
16 0.47
17 0.45
18 0.43
19 0.43
20 0.43
21 0.43
22 0.41
23 0.47
24 0.47
25 0.49
26 0.5
27 0.46
28 0.47
29 0.51
30 0.51
31 0.46
32 0.43
33 0.37
34 0.38
35 0.37
36 0.33
37 0.24
38 0.21
39 0.24
40 0.27
41 0.32
42 0.35
43 0.38
44 0.41
45 0.46
46 0.52
47 0.52
48 0.52
49 0.57
50 0.59
51 0.63
52 0.64
53 0.61
54 0.57
55 0.58
56 0.59
57 0.59
58 0.59
59 0.58
60 0.57
61 0.58
62 0.61
63 0.63
64 0.64
65 0.65
66 0.67
67 0.72
68 0.75
69 0.8
70 0.81
71 0.81
72 0.86
73 0.87
74 0.85
75 0.8
76 0.83
77 0.84
78 0.83
79 0.82
80 0.81
81 0.8
82 0.77
83 0.74
84 0.65
85 0.55
86 0.45
87 0.39
88 0.3
89 0.21
90 0.17
91 0.16
92 0.19
93 0.24
94 0.28
95 0.27
96 0.32
97 0.34
98 0.34
99 0.4
100 0.39
101 0.36
102 0.35
103 0.35
104 0.3
105 0.29
106 0.32
107 0.27
108 0.23
109 0.25
110 0.24
111 0.24
112 0.23
113 0.22
114 0.18
115 0.18
116 0.17
117 0.13
118 0.15
119 0.14
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.08
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.13
144 0.15
145 0.15
146 0.14
147 0.14
148 0.16
149 0.18
150 0.21
151 0.23
152 0.28
153 0.3
154 0.31
155 0.3
156 0.29
157 0.3
158 0.34
159 0.38
160 0.39
161 0.45
162 0.48
163 0.49
164 0.5
165 0.47
166 0.39
167 0.3
168 0.22
169 0.2
170 0.17
171 0.16
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.18
176 0.19
177 0.14
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.16
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.04
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.09
205 0.13
206 0.18
207 0.22
208 0.26
209 0.31
210 0.34
211 0.37
212 0.44
213 0.42
214 0.45
215 0.48
216 0.53
217 0.53
218 0.54
219 0.51
220 0.47
221 0.46
222 0.44
223 0.36
224 0.26
225 0.21
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.14
230 0.09
231 0.13
232 0.19
233 0.23
234 0.23
235 0.26
236 0.33
237 0.41
238 0.48
239 0.48
240 0.52
241 0.57
242 0.59
243 0.59
244 0.55
245 0.49
246 0.48
247 0.53
248 0.54
249 0.53
250 0.6
251 0.64
252 0.69
253 0.72
254 0.69
255 0.65
256 0.65
257 0.67
258 0.66
259 0.69
260 0.69
261 0.74
262 0.82
263 0.85
264 0.82
265 0.81
266 0.83
267 0.83
268 0.86
269 0.87
270 0.87
271 0.88
272 0.9
273 0.91
274 0.92
275 0.92
276 0.92
277 0.91
278 0.83
279 0.81
280 0.82
281 0.79
282 0.78
283 0.74
284 0.67
285 0.57
286 0.54
287 0.47
288 0.37
289 0.29
290 0.19
291 0.11
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.07
299 0.08
300 0.11
301 0.14
302 0.16
303 0.21
304 0.29
305 0.39
306 0.43
307 0.53
308 0.6
309 0.68
310 0.75
311 0.81
312 0.85
313 0.85
314 0.91
315 0.91
316 0.91
317 0.91
318 0.93
319 0.93
320 0.93
321 0.88
322 0.86
323 0.85
324 0.81
325 0.73
326 0.71
327 0.69
328 0.65
329 0.64
330 0.62
331 0.56
332 0.56
333 0.59
334 0.6
335 0.6
336 0.56
337 0.56
338 0.59
339 0.62
340 0.62
341 0.6
342 0.58
343 0.59
344 0.66
345 0.69
346 0.71
347 0.76
348 0.77
349 0.83
350 0.82
351 0.74