Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HNB6

Protein Details
Accession C6HNB6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
456-484APAASSGGKKQKKKWSKGKVKDKANHAVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
462-478GGKKQKKKWSKGKVKDK
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 8, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004977  Ribosomal_S25  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03297  Ribosomal_S25  
PF00400  WD40  
Amino Acid Sequences MSTKSLMKNLNTCVIPSEYCRYICILAGNKLSIIFAPDGQNIIRNITLKESITGCVKALRWSKPPGPSIAEPDAFSPDSQRILYASGNYISVWDLHDENWCAEIEAGDTFNFTYVDFAATHDEVVAFSEFNVHLTIFSLSTGGQRVIKSPKFSNATGYGFRPATGHLALLLKLDANDTLTIHEPETYEAITTVTLNTVDAQGLKWSPNGAWLGVWDSASTMPRVEIYTADGQYYRTYSEAANDSNLGVKTIEWSPDSQLLAIGRHDGTVALTNCKTFSLLSVLPDPLSFGSIGRDIYVEQQSSVTNGTSEYVLAPKSPVFPYTFSSAGGGARAVSSIAFSRNRHMLATIDQSLPHIVWMWSTKSKTPRLIGCLIQKSSVRQLLWCPTFPELLMTANEDDIPTVHQWICNRRPRIARIPLADGGKYSASWPNQGLRAKSALSHTPLAISHLGSSSEAPAASSGGKKQKKKWSKGKVKDKANHAVVLDKATSEKLYKDVQSYRLITVATLVDRLKINGSLARQALADLEEKGQIKKVVGHSKMNIYTRAVTAAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.31
4 0.34
5 0.31
6 0.31
7 0.31
8 0.3
9 0.28
10 0.28
11 0.3
12 0.3
13 0.31
14 0.34
15 0.33
16 0.31
17 0.3
18 0.28
19 0.22
20 0.19
21 0.15
22 0.14
23 0.17
24 0.18
25 0.19
26 0.19
27 0.23
28 0.21
29 0.22
30 0.22
31 0.2
32 0.2
33 0.23
34 0.26
35 0.22
36 0.25
37 0.23
38 0.23
39 0.25
40 0.25
41 0.22
42 0.23
43 0.23
44 0.28
45 0.34
46 0.37
47 0.4
48 0.46
49 0.52
50 0.56
51 0.58
52 0.55
53 0.54
54 0.51
55 0.52
56 0.51
57 0.46
58 0.39
59 0.37
60 0.36
61 0.3
62 0.27
63 0.23
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.18
68 0.14
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.15
74 0.16
75 0.15
76 0.15
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.09
103 0.08
104 0.1
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.12
112 0.11
113 0.07
114 0.06
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.11
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.12
131 0.13
132 0.17
133 0.25
134 0.28
135 0.32
136 0.33
137 0.39
138 0.41
139 0.41
140 0.42
141 0.38
142 0.39
143 0.37
144 0.36
145 0.33
146 0.28
147 0.28
148 0.23
149 0.19
150 0.18
151 0.16
152 0.14
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.1
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.11
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.09
235 0.08
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.14
243 0.15
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.06
254 0.06
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.1
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.08
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.16
309 0.18
310 0.18
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.13
315 0.12
316 0.09
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.09
325 0.13
326 0.13
327 0.17
328 0.2
329 0.21
330 0.2
331 0.2
332 0.18
333 0.17
334 0.22
335 0.21
336 0.19
337 0.18
338 0.18
339 0.18
340 0.16
341 0.13
342 0.1
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.13
347 0.18
348 0.19
349 0.24
350 0.3
351 0.35
352 0.39
353 0.42
354 0.42
355 0.43
356 0.45
357 0.45
358 0.46
359 0.47
360 0.43
361 0.41
362 0.37
363 0.34
364 0.36
365 0.36
366 0.29
367 0.24
368 0.27
369 0.33
370 0.35
371 0.33
372 0.3
373 0.26
374 0.27
375 0.25
376 0.23
377 0.15
378 0.14
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.09
388 0.08
389 0.1
390 0.11
391 0.13
392 0.17
393 0.26
394 0.35
395 0.42
396 0.44
397 0.48
398 0.54
399 0.6
400 0.66
401 0.66
402 0.64
403 0.58
404 0.61
405 0.58
406 0.54
407 0.46
408 0.37
409 0.3
410 0.23
411 0.2
412 0.16
413 0.17
414 0.17
415 0.19
416 0.21
417 0.23
418 0.29
419 0.33
420 0.32
421 0.3
422 0.31
423 0.29
424 0.29
425 0.29
426 0.27
427 0.28
428 0.28
429 0.25
430 0.24
431 0.24
432 0.25
433 0.22
434 0.17
435 0.14
436 0.13
437 0.14
438 0.13
439 0.13
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.1
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.12
448 0.17
449 0.26
450 0.34
451 0.4
452 0.49
453 0.59
454 0.68
455 0.77
456 0.81
457 0.83
458 0.86
459 0.91
460 0.94
461 0.92
462 0.92
463 0.89
464 0.87
465 0.85
466 0.78
467 0.7
468 0.59
469 0.54
470 0.45
471 0.41
472 0.32
473 0.23
474 0.2
475 0.18
476 0.19
477 0.16
478 0.16
479 0.17
480 0.22
481 0.24
482 0.3
483 0.34
484 0.37
485 0.42
486 0.44
487 0.41
488 0.38
489 0.36
490 0.29
491 0.26
492 0.24
493 0.17
494 0.18
495 0.17
496 0.17
497 0.18
498 0.2
499 0.19
500 0.18
501 0.19
502 0.2
503 0.23
504 0.26
505 0.26
506 0.26
507 0.23
508 0.22
509 0.21
510 0.19
511 0.18
512 0.13
513 0.14
514 0.18
515 0.19
516 0.2
517 0.24
518 0.24
519 0.24
520 0.29
521 0.37
522 0.42
523 0.46
524 0.52
525 0.52
526 0.59
527 0.64
528 0.61
529 0.55
530 0.49
531 0.47
532 0.41