Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6H988

Protein Details
Accession C6H988    Localization Confidence High Confidence Score 25.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-116RNQEEEEQRKKKKSKEGRREKKSRRRQESDDAFSGBasic
119-139EIEGKRARKRREDGEKRSRKIBasic
162-182MDEQLKKPTKRRARKADGIDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-108RHKRARNQEEEEQRKKKKSKEGRREKKSRRRQ
122-138GKRARKRREDGEKRSRK
167-176KKPTKRRARK
408-423RRMKARQAAAMKASKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEPAAAESPLVDKEDDSMQHKEEDIAKLDLSDDESVLSDVDDAQFEDFDAANVSIDERPAIAIDEENLKLIGRHKRARNQEEEEQRKKKKSKEGRREKKSRRRQESDDAFSGGEEIEGKRARKRREDGEKRSRKIVEEINEEDLDPATRRRRALDRMMDEQLKKPTKRRARKADGIDLADLADAEIEDVRRRMTDAAKLDSIARKENRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLLAALGRLPINKETLIASGIGRVIVFYTKSKRPEIGIKRQAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYEEAYFDPSQLAARNQGVSAQATAAEARARELLPPRLANRARVEAGHTSYTIVPRSTTVQESRFARPLGASGEDRFRRMKARQAAAMKASKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.13
4 0.14
5 0.19
6 0.21
7 0.24
8 0.26
9 0.26
10 0.28
11 0.28
12 0.3
13 0.3
14 0.3
15 0.3
16 0.28
17 0.26
18 0.25
19 0.25
20 0.22
21 0.2
22 0.16
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.13
61 0.19
62 0.27
63 0.31
64 0.4
65 0.47
66 0.56
67 0.67
68 0.73
69 0.76
70 0.74
71 0.74
72 0.77
73 0.79
74 0.8
75 0.79
76 0.79
77 0.79
78 0.79
79 0.77
80 0.77
81 0.79
82 0.8
83 0.82
84 0.86
85 0.88
86 0.92
87 0.95
88 0.95
89 0.95
90 0.95
91 0.95
92 0.94
93 0.91
94 0.87
95 0.87
96 0.85
97 0.81
98 0.73
99 0.63
100 0.52
101 0.44
102 0.37
103 0.25
104 0.16
105 0.1
106 0.07
107 0.11
108 0.15
109 0.17
110 0.23
111 0.3
112 0.36
113 0.45
114 0.5
115 0.55
116 0.63
117 0.73
118 0.77
119 0.81
120 0.85
121 0.78
122 0.79
123 0.71
124 0.62
125 0.56
126 0.52
127 0.47
128 0.43
129 0.43
130 0.4
131 0.38
132 0.36
133 0.31
134 0.24
135 0.19
136 0.13
137 0.16
138 0.17
139 0.2
140 0.21
141 0.25
142 0.31
143 0.37
144 0.45
145 0.49
146 0.48
147 0.5
148 0.53
149 0.53
150 0.48
151 0.46
152 0.45
153 0.43
154 0.41
155 0.42
156 0.48
157 0.55
158 0.64
159 0.7
160 0.73
161 0.75
162 0.81
163 0.81
164 0.8
165 0.73
166 0.64
167 0.54
168 0.43
169 0.34
170 0.25
171 0.19
172 0.1
173 0.05
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.07
183 0.09
184 0.1
185 0.15
186 0.18
187 0.21
188 0.21
189 0.21
190 0.22
191 0.23
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.2
196 0.22
197 0.27
198 0.29
199 0.31
200 0.37
201 0.37
202 0.41
203 0.42
204 0.42
205 0.41
206 0.41
207 0.37
208 0.31
209 0.25
210 0.21
211 0.19
212 0.18
213 0.14
214 0.11
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.06
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.11
282 0.16
283 0.22
284 0.26
285 0.28
286 0.3
287 0.32
288 0.41
289 0.47
290 0.52
291 0.56
292 0.58
293 0.59
294 0.61
295 0.59
296 0.51
297 0.43
298 0.34
299 0.33
300 0.27
301 0.25
302 0.22
303 0.22
304 0.25
305 0.25
306 0.24
307 0.19
308 0.21
309 0.24
310 0.3
311 0.37
312 0.37
313 0.39
314 0.4
315 0.39
316 0.39
317 0.35
318 0.3
319 0.23
320 0.25
321 0.24
322 0.28
323 0.26
324 0.24
325 0.24
326 0.23
327 0.22
328 0.19
329 0.17
330 0.15
331 0.17
332 0.18
333 0.17
334 0.19
335 0.19
336 0.18
337 0.17
338 0.13
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.1
346 0.12
347 0.12
348 0.16
349 0.21
350 0.27
351 0.31
352 0.36
353 0.36
354 0.44
355 0.46
356 0.48
357 0.48
358 0.48
359 0.44
360 0.4
361 0.43
362 0.38
363 0.4
364 0.36
365 0.3
366 0.26
367 0.27
368 0.3
369 0.28
370 0.23
371 0.2
372 0.19
373 0.24
374 0.25
375 0.28
376 0.31
377 0.31
378 0.37
379 0.4
380 0.45
381 0.46
382 0.43
383 0.38
384 0.33
385 0.33
386 0.3
387 0.3
388 0.27
389 0.25
390 0.34
391 0.35
392 0.38
393 0.38
394 0.37
395 0.4
396 0.42
397 0.48
398 0.48
399 0.53
400 0.59
401 0.62
402 0.66
403 0.66