Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HT21

Protein Details
Accession C6HT21    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-34VELRKRKAPAEPPKPSTKKTKKVTKPDAPAAVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-26RKRKAPAEPPKPSTKKTKKVTK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 12.333, mito 9.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000866  AhpC/TSA  
IPR036249  Thioredoxin-like_sf  
IPR013766  Thioredoxin_domain  
Gene Ontology GO:0016209  F:antioxidant activity  
GO:0016491  F:oxidoreductase activity  
GO:0034599  P:cellular response to oxidative stress  
Pfam View protein in Pfam  
PF00578  AhpC-TSA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51352  THIOREDOXIN_2  
CDD cd03017  PRX_BCP  
Amino Acid Sequences MVELRKRKAPAEPPKPSTKKTKKVTKPDAPAAVAAIPTPKKEEALNADATPVAPSSQKKPPKIGDTIDLDQIGTNITTHNGAPTTLKSLVEQSASGVVLFTYPRASTPGCTTQVCLFRDRYDKLTSTGLSIFGLSADSPKANANFKSKQNLPYPLLCDPTASLIGALGLKKTPKGTVRGVFAVSKEGKVLLLESGGPAATADAVQKLVESG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.8
3 0.76
4 0.77
5 0.76
6 0.76
7 0.76
8 0.81
9 0.8
10 0.85
11 0.91
12 0.9
13 0.88
14 0.86
15 0.81
16 0.72
17 0.62
18 0.52
19 0.42
20 0.32
21 0.23
22 0.2
23 0.16
24 0.15
25 0.19
26 0.18
27 0.18
28 0.18
29 0.23
30 0.24
31 0.28
32 0.3
33 0.26
34 0.26
35 0.25
36 0.24
37 0.2
38 0.13
39 0.1
40 0.1
41 0.12
42 0.16
43 0.25
44 0.33
45 0.35
46 0.42
47 0.48
48 0.5
49 0.53
50 0.5
51 0.47
52 0.46
53 0.45
54 0.4
55 0.33
56 0.27
57 0.23
58 0.2
59 0.15
60 0.08
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.14
78 0.13
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.12
95 0.17
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.23
100 0.29
101 0.29
102 0.28
103 0.24
104 0.24
105 0.29
106 0.3
107 0.29
108 0.26
109 0.26
110 0.25
111 0.27
112 0.24
113 0.21
114 0.2
115 0.16
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.07
120 0.07
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.08
127 0.11
128 0.14
129 0.17
130 0.24
131 0.29
132 0.33
133 0.39
134 0.41
135 0.46
136 0.48
137 0.52
138 0.48
139 0.47
140 0.47
141 0.42
142 0.42
143 0.35
144 0.29
145 0.23
146 0.23
147 0.19
148 0.15
149 0.12
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.13
159 0.18
160 0.21
161 0.26
162 0.33
163 0.37
164 0.41
165 0.42
166 0.43
167 0.39
168 0.35
169 0.37
170 0.31
171 0.26
172 0.21
173 0.19
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.08