Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BWD8

Protein Details
Accession Q6BWD8    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-55GEKKPAKKFPNGPKRGNSRINKPHQRPKGPHGRNDRPRPSSBasic
166-191GPGGKPQNPLKRKQKPQKKSVDTLDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-53KKPAKKFPNGPKRGNSRINKPHQRPKGPHGRNDRPRP
153-184RGNPRGPRNAAPGGPGGKPQNPLKRKQKPQKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
KEGG dha:DEHA2B12122g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSNPILEKSLDEIIGEKKPAKKFPNGPKRGNSRINKPHQRPKGPHGRNDRPRPSSSVPREVTAISKSKPILRVKNIHPDLNGEDLSNLFDGVAPVEFVKFDPRKDDVAYVCFQYDHNKNNSIAISKFDGRKAMGENLVVESATSLADRIVAPRGNPRGPRNAAPGGPGGKPQNPLKRKQKPQKKSVDTLDEELSAYMSGKSEGELKRESKVNKLDDEMDSYWSNKNENDSNAAKENSNANVNQPDDTADEMKLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.25
4 0.29
5 0.36
6 0.44
7 0.47
8 0.53
9 0.59
10 0.68
11 0.75
12 0.77
13 0.78
14 0.78
15 0.82
16 0.81
17 0.82
18 0.77
19 0.77
20 0.79
21 0.82
22 0.84
23 0.84
24 0.85
25 0.86
26 0.89
27 0.84
28 0.84
29 0.84
30 0.8
31 0.79
32 0.79
33 0.8
34 0.8
35 0.85
36 0.84
37 0.79
38 0.75
39 0.74
40 0.7
41 0.7
42 0.66
43 0.65
44 0.58
45 0.53
46 0.51
47 0.44
48 0.4
49 0.34
50 0.31
51 0.22
52 0.25
53 0.25
54 0.28
55 0.34
56 0.39
57 0.43
58 0.46
59 0.53
60 0.54
61 0.64
62 0.63
63 0.57
64 0.5
65 0.45
66 0.4
67 0.36
68 0.31
69 0.2
70 0.16
71 0.14
72 0.15
73 0.12
74 0.09
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.18
89 0.21
90 0.23
91 0.24
92 0.27
93 0.2
94 0.22
95 0.22
96 0.19
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.17
101 0.2
102 0.21
103 0.23
104 0.25
105 0.25
106 0.27
107 0.27
108 0.24
109 0.2
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.18
114 0.17
115 0.18
116 0.16
117 0.17
118 0.17
119 0.16
120 0.15
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.1
126 0.08
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.05
135 0.06
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.16
140 0.21
141 0.25
142 0.3
143 0.32
144 0.37
145 0.4
146 0.42
147 0.42
148 0.41
149 0.37
150 0.34
151 0.34
152 0.28
153 0.25
154 0.25
155 0.22
156 0.22
157 0.26
158 0.31
159 0.38
160 0.4
161 0.49
162 0.57
163 0.64
164 0.72
165 0.79
166 0.83
167 0.82
168 0.88
169 0.9
170 0.86
171 0.83
172 0.8
173 0.78
174 0.7
175 0.64
176 0.55
177 0.44
178 0.37
179 0.29
180 0.22
181 0.13
182 0.11
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.14
189 0.16
190 0.19
191 0.24
192 0.25
193 0.29
194 0.35
195 0.36
196 0.38
197 0.44
198 0.44
199 0.42
200 0.44
201 0.44
202 0.39
203 0.44
204 0.36
205 0.32
206 0.29
207 0.27
208 0.28
209 0.26
210 0.26
211 0.21
212 0.26
213 0.27
214 0.29
215 0.34
216 0.32
217 0.36
218 0.39
219 0.4
220 0.34
221 0.32
222 0.33
223 0.3
224 0.32
225 0.28
226 0.27
227 0.31
228 0.32
229 0.3
230 0.27
231 0.25
232 0.22
233 0.26
234 0.23