Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D0DLW4

Protein Details
Accession A0A0D0DLW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-67PPSPVPKPPKTKSGKNGKLSKREAKEQRKKVYIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-63RKKIARKAAQAAHLPSSTAPPPSPVPKPPKTKSGKNGKLSKREAKEQRKK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 7.5, cyto_nucl 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039795  LTN1/Rkr1  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:1990112  C:RQC complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Amino Acid Sequences MVKAQKSSATSGTRKKIARKAAQAAHLPSSTAPPPSPVPKPPKTKSGKNGKLSKREAKEQRKKVYIPPTKPAPPVLDPLDTTGLAHLLPPELVVVLRALGKKDVVTRAKAIEELAKWVDEAIKEGTMHDHDRGFYAENMHGEKTDAVVKMLPVWLHRSPILFTHPARRLRHLSASLQLSLLRLTPVREALITWANEIASQADLETVLGTWAMLPHDTDRGVSSIGVKSWVDFVSTTPKSGADTQQQLRDRSISQFQCTQSQLVLVLTPPLLTSLFTFARRTVLDPQGLHMYLNPGPVATPAVQEYPIHGKSGAPQGKDEIQGKNVSQGKNIPQGKTAPQGKGGIQGKKGVSTPPQPQQKKSGRYVPPPDSQSPSLSSQSDRDSAAEENDSDRAGRLRIGALGVVKWIWGTC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.68
3 0.69
4 0.72
5 0.73
6 0.74
7 0.76
8 0.75
9 0.77
10 0.74
11 0.7
12 0.64
13 0.55
14 0.46
15 0.37
16 0.35
17 0.3
18 0.26
19 0.23
20 0.21
21 0.26
22 0.31
23 0.36
24 0.4
25 0.48
26 0.54
27 0.63
28 0.65
29 0.7
30 0.72
31 0.76
32 0.77
33 0.8
34 0.8
35 0.8
36 0.85
37 0.84
38 0.86
39 0.85
40 0.85
41 0.8
42 0.8
43 0.81
44 0.82
45 0.84
46 0.84
47 0.85
48 0.83
49 0.8
50 0.78
51 0.78
52 0.77
53 0.72
54 0.7
55 0.69
56 0.67
57 0.66
58 0.61
59 0.56
60 0.49
61 0.48
62 0.44
63 0.38
64 0.32
65 0.33
66 0.31
67 0.25
68 0.23
69 0.17
70 0.14
71 0.11
72 0.11
73 0.09
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.06
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.14
89 0.18
90 0.26
91 0.27
92 0.28
93 0.3
94 0.31
95 0.31
96 0.3
97 0.27
98 0.23
99 0.2
100 0.21
101 0.19
102 0.17
103 0.16
104 0.16
105 0.17
106 0.12
107 0.14
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.15
114 0.17
115 0.16
116 0.16
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.16
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.18
126 0.17
127 0.16
128 0.15
129 0.14
130 0.12
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.1
140 0.15
141 0.15
142 0.17
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.18
147 0.22
148 0.2
149 0.2
150 0.27
151 0.33
152 0.4
153 0.42
154 0.45
155 0.45
156 0.45
157 0.5
158 0.44
159 0.39
160 0.37
161 0.37
162 0.32
163 0.27
164 0.24
165 0.18
166 0.15
167 0.13
168 0.09
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.1
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.09
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.11
216 0.11
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.17
221 0.17
222 0.18
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.19
227 0.22
228 0.19
229 0.25
230 0.27
231 0.34
232 0.38
233 0.38
234 0.36
235 0.35
236 0.3
237 0.27
238 0.33
239 0.28
240 0.27
241 0.31
242 0.31
243 0.33
244 0.33
245 0.3
246 0.22
247 0.2
248 0.18
249 0.13
250 0.12
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.1
261 0.12
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.18
266 0.18
267 0.2
268 0.23
269 0.25
270 0.28
271 0.27
272 0.29
273 0.3
274 0.29
275 0.26
276 0.2
277 0.19
278 0.16
279 0.17
280 0.15
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.13
285 0.1
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.15
292 0.2
293 0.2
294 0.2
295 0.19
296 0.18
297 0.21
298 0.32
299 0.33
300 0.26
301 0.26
302 0.29
303 0.32
304 0.37
305 0.37
306 0.29
307 0.28
308 0.3
309 0.29
310 0.34
311 0.36
312 0.32
313 0.31
314 0.33
315 0.36
316 0.42
317 0.47
318 0.4
319 0.37
320 0.4
321 0.42
322 0.46
323 0.47
324 0.39
325 0.39
326 0.4
327 0.38
328 0.43
329 0.45
330 0.41
331 0.38
332 0.41
333 0.38
334 0.38
335 0.39
336 0.34
337 0.34
338 0.35
339 0.41
340 0.44
341 0.54
342 0.56
343 0.59
344 0.65
345 0.69
346 0.7
347 0.7
348 0.71
349 0.69
350 0.74
351 0.79
352 0.76
353 0.74
354 0.72
355 0.69
356 0.66
357 0.6
358 0.53
359 0.48
360 0.45
361 0.41
362 0.36
363 0.34
364 0.32
365 0.33
366 0.33
367 0.3
368 0.26
369 0.25
370 0.24
371 0.25
372 0.23
373 0.2
374 0.19
375 0.19
376 0.19
377 0.17
378 0.17
379 0.16
380 0.15
381 0.16
382 0.15
383 0.16
384 0.17
385 0.18
386 0.18
387 0.18
388 0.17
389 0.17
390 0.15
391 0.14