FuNGI

C6HAF2

Protein Details

Accession

C6HAF2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-30	MSQYDRSRMDPKRRPPIDHKKKQFAAPTYK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-16	RRPP

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016558 DNA_primase_lsu_euk IPR007238 DNA_primase_lsu_euk/arc
Gene Ontology	GO:0005658 C:alpha DNA polymerase:primase complex GO:0051539 F:4 iron, 4 sulfur cluster binding GO:0003677 F:DNA binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006269 P:DNA replication, synthesis of RNA primer
Pfam	View protein in Pfam PF04104 DNA_primase_lrg
CDD	cd07322 PriL_PriS_Eukaryotic

Amino Acid Sequences

MSQYDRSRMDPKRRPPIDHKKKQFAAPTYKEHDYSHRLNFYEIPPTQEITLEQFEQWAIDRLRILAELEACSYRNKTPAETASHITPLLNKFLPLSANTSSSTGVDQRLRNERQKDHYSHFILRLAFSSTEDLRRRFTRLETMLFKFRFQLDDSKERRAFIESLNFNWDMVSDEEKHELGESLLASTYGVRRLEDESWFKVDWEKVPELVERRGVFVRKGKAYVPVREQLSMVLAEFTARLEKALEFTSRALPRLDEDDRLTPILEHLSKNFGTSDSSYAEGEGSVPGAPITAASIDSLSQHFPLCMRNLHMQLRKNSHLKHFGRLQYTLFLKGIGLSLEDALVFWRQSFKIFTDDEFNSKYKYNVRHAYGDVGGDANRRGRGYPPYSCQKILTDNSPGAGQTHGCPYRHFSVENLINLLQATGVNDQEVLRGVREDVGKTRYHIACNRVFEWAHKAELKKVRDEGSWSQTDLDTIVHPNTYFKRSYLLKNLGKIVKEDVDMTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.83
3	0.85
4	0.86
5	0.87
6	0.87
7	0.86
8	0.86
9	0.85
10	0.83
11	0.81
12	0.8
13	0.76
14	0.74
15	0.7
16	0.68
17	0.63
18	0.57
19	0.55
20	0.52
21	0.51
22	0.51
23	0.5
24	0.47
25	0.47
26	0.49
27	0.43
28	0.45
29	0.4
30	0.37
31	0.33
32	0.34
33	0.32
34	0.29
35	0.27
36	0.23
37	0.26
38	0.21
39	0.19
40	0.18
41	0.18
42	0.17
43	0.18
44	0.2
45	0.17
46	0.17
47	0.18
48	0.18
49	0.19
50	0.19
51	0.19
52	0.14
53	0.15
54	0.14
55	0.16
56	0.16
57	0.16
58	0.18
59	0.2
60	0.19
61	0.23
62	0.24
63	0.24
64	0.3
65	0.35
66	0.4
67	0.41
68	0.42
69	0.38
70	0.39
71	0.36
72	0.3
73	0.29
74	0.23
75	0.25
76	0.22
77	0.2
78	0.19
79	0.21
80	0.22
81	0.18
82	0.21
83	0.18
84	0.19
85	0.2
86	0.2
87	0.19
88	0.18
89	0.19
90	0.16
91	0.19
92	0.22
93	0.24
94	0.29
95	0.38
96	0.44
97	0.5
98	0.55
99	0.57
100	0.6
101	0.66
102	0.66
103	0.62
104	0.64
105	0.61
106	0.58
107	0.54
108	0.5
109	0.42
110	0.37
111	0.32
112	0.26
113	0.22
114	0.19
115	0.2
116	0.17
117	0.24
118	0.28
119	0.29
120	0.31
121	0.32
122	0.35
123	0.34
124	0.35
125	0.36
126	0.36
127	0.41
128	0.42
129	0.44
130	0.49
131	0.47
132	0.44
133	0.37
134	0.34
135	0.3
136	0.26
137	0.3
138	0.28
139	0.37
140	0.4
141	0.47
142	0.48
143	0.46
144	0.45
145	0.4
146	0.35
147	0.28
148	0.34
149	0.26
150	0.27
151	0.3
152	0.29
153	0.25
154	0.23
155	0.2
156	0.13
157	0.13
158	0.15
159	0.12
160	0.13
161	0.15
162	0.15
163	0.15
164	0.13
165	0.12
166	0.09
167	0.09
168	0.07
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.07
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.11
179	0.14
180	0.16
181	0.2
182	0.23
183	0.21
184	0.24
185	0.24
186	0.23
187	0.23
188	0.23
189	0.21
190	0.23
191	0.21
192	0.19
193	0.2
194	0.23
195	0.23
196	0.23
197	0.25
198	0.2
199	0.21
200	0.23
201	0.23
202	0.23
203	0.26
204	0.3
205	0.27
206	0.28
207	0.27
208	0.33
209	0.36
210	0.38
211	0.36
212	0.36
213	0.35
214	0.34
215	0.33
216	0.25
217	0.21
218	0.16
219	0.12
220	0.07
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.07
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.11
235	0.17
236	0.17
237	0.18
238	0.17
239	0.15
240	0.16
241	0.2
242	0.2
243	0.15
244	0.17
245	0.17
246	0.18
247	0.18
248	0.17
249	0.12
250	0.11
251	0.13
252	0.12
253	0.11
254	0.1
255	0.14
256	0.14
257	0.14
258	0.14
259	0.11
260	0.11
261	0.12
262	0.14
263	0.11
264	0.12
265	0.12
266	0.11
267	0.11
268	0.09
269	0.08
270	0.06
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.03
278	0.04
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.06
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.1
292	0.12
293	0.12
294	0.15
295	0.19
296	0.24
297	0.31
298	0.36
299	0.39
300	0.44
301	0.48
302	0.51
303	0.52
304	0.51
305	0.5
306	0.55
307	0.51
308	0.51
309	0.52
310	0.52
311	0.49
312	0.47
313	0.42
314	0.37
315	0.36
316	0.32
317	0.25
318	0.19
319	0.16
320	0.14
321	0.14
322	0.09
323	0.08
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.09
334	0.09
335	0.11
336	0.13
337	0.14
338	0.18
339	0.19
340	0.2
341	0.23
342	0.24
343	0.25
344	0.27
345	0.26
346	0.23
347	0.23
348	0.25
349	0.25
350	0.31
351	0.36
352	0.4
353	0.43
354	0.46
355	0.46
356	0.47
357	0.42
358	0.35
359	0.27
360	0.2
361	0.17
362	0.14
363	0.14
364	0.13
365	0.14
366	0.15
367	0.15
368	0.18
369	0.26
370	0.31
371	0.35
372	0.39
373	0.47
374	0.5
375	0.51
376	0.49
377	0.43
378	0.45
379	0.41
380	0.39
381	0.35
382	0.31
383	0.3
384	0.29
385	0.26
386	0.2
387	0.18
388	0.14
389	0.11
390	0.2
391	0.23
392	0.24
393	0.25
394	0.3
395	0.34
396	0.36
397	0.35
398	0.27
399	0.32
400	0.37
401	0.37
402	0.34
403	0.29
404	0.26
405	0.26
406	0.24
407	0.15
408	0.1
409	0.1
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.13
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.12
421	0.15
422	0.17
423	0.19
424	0.22
425	0.25
426	0.26
427	0.28
428	0.36
429	0.35
430	0.39
431	0.42
432	0.44
433	0.47
434	0.51
435	0.5
436	0.47
437	0.44
438	0.4
439	0.42
440	0.38
441	0.36
442	0.35
443	0.36
444	0.4
445	0.48
446	0.49
447	0.47
448	0.49
449	0.48
450	0.45
451	0.51
452	0.49
453	0.48
454	0.47
455	0.42
456	0.39
457	0.36
458	0.33
459	0.27
460	0.21
461	0.15
462	0.15
463	0.16
464	0.15
465	0.16
466	0.21
467	0.25
468	0.29
469	0.28
470	0.26
471	0.32
472	0.36
473	0.44
474	0.49
475	0.54
476	0.55
477	0.59
478	0.67
479	0.64
480	0.6
481	0.54
482	0.49
483	0.43
484	0.39

C6HAF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer