Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0D0DV88

Protein Details
Accession A0A0D0DV88    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-30DEVIAARPKSHRRTGRRPSAKAQVLHydrophilic
178-199ASRGIRRGRGRGRKGTERPPKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-23PKSHRRTGRRP
174-198VARPASRGIRRGRGRGRKGTERPPK
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 11.333, nucl 4.5, cyto_nucl 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDQSLDEVIAARPKSHRRTGRRPSAKAQVLGHPTNVAARTAVQNSAAAKVVAAAAPASHPADKIIVSNLPADVNEVQIKELFHSTVGPLRDVTLHHDSVGRSKGVAAIHFQRKGDGTKAYQQYNNRLIDGKRPMKIEIVVDPARPAPFQSLASRVAPPPAAAAASASAVPNARVARPASRGIRRGRGRGRKGTERPPKSAADLDAEMEDYTASNIAVPAAATVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.49
3 0.57
4 0.61
5 0.72
6 0.8
7 0.85
8 0.86
9 0.85
10 0.82
11 0.83
12 0.8
13 0.74
14 0.66
15 0.63
16 0.59
17 0.55
18 0.48
19 0.38
20 0.32
21 0.3
22 0.28
23 0.2
24 0.13
25 0.13
26 0.16
27 0.17
28 0.18
29 0.15
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.17
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.08
39 0.08
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.07
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.12
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.11
67 0.12
68 0.1
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.19
84 0.18
85 0.21
86 0.23
87 0.17
88 0.12
89 0.12
90 0.15
91 0.13
92 0.14
93 0.12
94 0.17
95 0.22
96 0.24
97 0.24
98 0.22
99 0.22
100 0.23
101 0.23
102 0.19
103 0.16
104 0.22
105 0.26
106 0.28
107 0.3
108 0.31
109 0.36
110 0.4
111 0.38
112 0.31
113 0.31
114 0.29
115 0.32
116 0.39
117 0.36
118 0.33
119 0.33
120 0.34
121 0.32
122 0.33
123 0.28
124 0.21
125 0.23
126 0.21
127 0.2
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.15
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.16
137 0.17
138 0.19
139 0.21
140 0.22
141 0.2
142 0.2
143 0.18
144 0.16
145 0.13
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.14
161 0.16
162 0.2
163 0.23
164 0.3
165 0.34
166 0.4
167 0.46
168 0.5
169 0.58
170 0.59
171 0.65
172 0.69
173 0.72
174 0.73
175 0.76
176 0.79
177 0.79
178 0.81
179 0.82
180 0.83
181 0.78
182 0.76
183 0.7
184 0.65
185 0.59
186 0.55
187 0.46
188 0.41
189 0.36
190 0.31
191 0.27
192 0.25
193 0.21
194 0.16
195 0.14
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06