Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HIN1

Protein Details
Accession C6HIN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-80VEAITQKKKKTPPSSSKKAGKSKSSKKETKKGSGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-100KKKKTPPSSSKKAGKSKSSKKETKKGSGTTVGSSGKKDKKSGSKSSKPE
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.999, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027353  NET_dom  
IPR038336  NET_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF17035  BET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51525  NET  
Amino Acid Sequences MSRPLVSCCWLEDNPSDSEGEESEDEDDHEKLHLLHKSIAAMSSAVEAITQKKKKTPPSSSKKAGKSKSSKKETKKGSGTTVGSSGKKDKKSGSKSSKPEKQHWVTYREKQIISHGISSLPEKRMTEALKIIQSNVPGLKDTKEAEIELDIDELPNDVLLVLLKFVKKHAPSAMDIDEPEPEPVAVVAPPKPKKNKPMSKYEQEARINSIEGTISRFQGGGGGGRGRDSSQPIQSVEGAESSEDDDSEESEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.26
4 0.2
5 0.21
6 0.18
7 0.17
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.17
20 0.19
21 0.2
22 0.23
23 0.24
24 0.25
25 0.25
26 0.25
27 0.19
28 0.16
29 0.13
30 0.11
31 0.1
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.12
36 0.22
37 0.26
38 0.26
39 0.34
40 0.41
41 0.51
42 0.6
43 0.66
44 0.67
45 0.73
46 0.81
47 0.84
48 0.86
49 0.85
50 0.84
51 0.8
52 0.79
53 0.79
54 0.8
55 0.81
56 0.82
57 0.82
58 0.81
59 0.84
60 0.82
61 0.81
62 0.78
63 0.71
64 0.66
65 0.64
66 0.57
67 0.49
68 0.45
69 0.39
70 0.32
71 0.31
72 0.33
73 0.33
74 0.34
75 0.35
76 0.37
77 0.43
78 0.5
79 0.59
80 0.61
81 0.64
82 0.7
83 0.77
84 0.78
85 0.74
86 0.73
87 0.72
88 0.67
89 0.67
90 0.64
91 0.61
92 0.59
93 0.6
94 0.61
95 0.56
96 0.51
97 0.43
98 0.41
99 0.4
100 0.35
101 0.3
102 0.22
103 0.18
104 0.18
105 0.2
106 0.2
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.18
112 0.19
113 0.19
114 0.17
115 0.18
116 0.19
117 0.19
118 0.19
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.15
154 0.15
155 0.19
156 0.22
157 0.23
158 0.25
159 0.29
160 0.3
161 0.25
162 0.24
163 0.22
164 0.19
165 0.17
166 0.15
167 0.11
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.08
174 0.12
175 0.2
176 0.25
177 0.33
178 0.41
179 0.47
180 0.57
181 0.66
182 0.72
183 0.69
184 0.76
185 0.77
186 0.78
187 0.79
188 0.75
189 0.73
190 0.68
191 0.64
192 0.57
193 0.49
194 0.41
195 0.33
196 0.28
197 0.2
198 0.15
199 0.18
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.13
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.16
212 0.17
213 0.16
214 0.19
215 0.23
216 0.25
217 0.28
218 0.31
219 0.31
220 0.33
221 0.33
222 0.31
223 0.25
224 0.21
225 0.16
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.11
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.09