Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HQX3

Protein Details
Accession C6HQX3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-69RNPSGTWRRRQHARLQGSNRHydrophilic
808-834QVSRKRTYAEEKQKVEKRLRNNDNSNDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 9, nucl 5, cyto 3.5, plas 1, pero 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MRHMRYASKRQALLSPLYPFVLAAFWGAAERTIQGDKCSAANSSRVCGIRNPSGTWRRRQHARLQGSNRPTTAYEEGHGYSLNFQRHINTQSARIDALIPGEEENAPPSPRGLSNYLNDSATFRSEDWLLDPDRIQFESDVGHSRDIGTKLIDDPRFANDFKLWKHLLLYRKRHHGDDGVIAIWKGLRERGQPIDLPVDGEYASLLWRNFIIVGWKRDDFLTEIHSYASELYERSGKSWDREKFYKSIVVGLFKAGQFSRGVEWHEKLKNTHLSNPNAMLLMLFEPAVSSDGGLRALRKICKTLDNHQIYCHTVPFLVKAGRLADAFAMHEFLLQRNDLPQSIQDISPLIKYLRHFGSDAEVDLFLANLKFKGLFQKEKSVMSLASRSGGRTKIYVPTTAKEGEKEANAVNDKLGARLFATKTFTFELILAGVKAFGATALKPQTLRQMALKAGDAKTLSEQIDILKKEGISVGNSAFSRVVQKLASEGDDSILNELLESDLHPEVLENLETAEGLFNSYSAVDDPRRARMLFKILSILSTEDPYHYNILLRNAVHLKDWQKIPRILDQMRDHDIHPTKHTLDVMVKKILFPRRRGMQEPPHPENFRATMFLIGILQNMVGAGIDVPARYWTEVLKRLGMSADWQEFRKLCLWLAHFYFPVNPKRTVSTFKTDATSPDRPISDLDHKKFLPAAHPESPLRQLFSVHLQYAIIAWGFSLPPSSNQIYHNPFSDEREKIVPWIRGHVLIRELKQKGVVVQMNTVRKVTRHRLAVLFEDIYDLVNPKTRYWSATGYASEEGMWPRRRDHLQVSRKRTYAEEKQKVEKRLRNNDNSND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.45
3 0.38
4 0.36
5 0.33
6 0.27
7 0.23
8 0.18
9 0.12
10 0.09
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.11
19 0.15
20 0.16
21 0.17
22 0.2
23 0.2
24 0.21
25 0.22
26 0.21
27 0.19
28 0.25
29 0.25
30 0.25
31 0.3
32 0.3
33 0.3
34 0.33
35 0.38
36 0.4
37 0.42
38 0.43
39 0.47
40 0.56
41 0.6
42 0.65
43 0.68
44 0.67
45 0.74
46 0.76
47 0.76
48 0.77
49 0.8
50 0.8
51 0.79
52 0.8
53 0.78
54 0.77
55 0.67
56 0.59
57 0.5
58 0.46
59 0.43
60 0.36
61 0.29
62 0.28
63 0.28
64 0.26
65 0.26
66 0.2
67 0.21
68 0.25
69 0.27
70 0.24
71 0.24
72 0.26
73 0.31
74 0.34
75 0.35
76 0.31
77 0.34
78 0.36
79 0.38
80 0.35
81 0.3
82 0.28
83 0.22
84 0.22
85 0.16
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.17
98 0.22
99 0.24
100 0.25
101 0.29
102 0.34
103 0.35
104 0.33
105 0.31
106 0.29
107 0.26
108 0.23
109 0.21
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.19
116 0.18
117 0.18
118 0.19
119 0.2
120 0.22
121 0.22
122 0.21
123 0.17
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.2
128 0.19
129 0.19
130 0.18
131 0.19
132 0.24
133 0.23
134 0.23
135 0.18
136 0.17
137 0.2
138 0.28
139 0.27
140 0.24
141 0.24
142 0.27
143 0.29
144 0.28
145 0.27
146 0.24
147 0.28
148 0.29
149 0.35
150 0.31
151 0.28
152 0.32
153 0.34
154 0.39
155 0.44
156 0.52
157 0.52
158 0.62
159 0.64
160 0.63
161 0.61
162 0.57
163 0.5
164 0.45
165 0.4
166 0.3
167 0.28
168 0.25
169 0.21
170 0.17
171 0.14
172 0.1
173 0.11
174 0.14
175 0.17
176 0.22
177 0.27
178 0.29
179 0.3
180 0.31
181 0.32
182 0.28
183 0.26
184 0.21
185 0.18
186 0.14
187 0.13
188 0.1
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.16
199 0.2
200 0.24
201 0.27
202 0.27
203 0.28
204 0.28
205 0.29
206 0.22
207 0.18
208 0.19
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.09
217 0.07
218 0.08
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.19
223 0.2
224 0.23
225 0.32
226 0.37
227 0.4
228 0.44
229 0.46
230 0.44
231 0.45
232 0.45
233 0.37
234 0.37
235 0.32
236 0.3
237 0.27
238 0.25
239 0.25
240 0.2
241 0.22
242 0.16
243 0.15
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.17
249 0.19
250 0.21
251 0.27
252 0.3
253 0.31
254 0.3
255 0.35
256 0.4
257 0.38
258 0.45
259 0.46
260 0.46
261 0.46
262 0.46
263 0.4
264 0.32
265 0.29
266 0.2
267 0.14
268 0.1
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.11
283 0.15
284 0.19
285 0.2
286 0.22
287 0.23
288 0.3
289 0.34
290 0.38
291 0.44
292 0.47
293 0.46
294 0.45
295 0.45
296 0.41
297 0.37
298 0.31
299 0.2
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.15
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.13
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.12
329 0.14
330 0.14
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.13
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.15
340 0.16
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.19
345 0.17
346 0.17
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.14
360 0.18
361 0.24
362 0.26
363 0.35
364 0.36
365 0.37
366 0.38
367 0.31
368 0.27
369 0.22
370 0.21
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.14
376 0.15
377 0.14
378 0.13
379 0.15
380 0.19
381 0.2
382 0.24
383 0.23
384 0.22
385 0.25
386 0.26
387 0.25
388 0.19
389 0.2
390 0.16
391 0.15
392 0.16
393 0.13
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.12
401 0.12
402 0.09
403 0.08
404 0.11
405 0.12
406 0.11
407 0.15
408 0.15
409 0.17
410 0.18
411 0.17
412 0.14
413 0.14
414 0.12
415 0.08
416 0.08
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.07
427 0.09
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.18
432 0.19
433 0.2
434 0.18
435 0.19
436 0.19
437 0.2
438 0.21
439 0.18
440 0.16
441 0.17
442 0.16
443 0.13
444 0.14
445 0.15
446 0.14
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.16
451 0.16
452 0.15
453 0.14
454 0.13
455 0.13
456 0.15
457 0.14
458 0.1
459 0.11
460 0.1
461 0.12
462 0.12
463 0.13
464 0.11
465 0.11
466 0.13
467 0.12
468 0.13
469 0.1
470 0.1
471 0.11
472 0.11
473 0.12
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.08
510 0.08
511 0.13
512 0.15
513 0.19
514 0.22
515 0.22
516 0.23
517 0.24
518 0.31
519 0.27
520 0.26
521 0.25
522 0.23
523 0.23
524 0.22
525 0.2
526 0.13
527 0.13
528 0.12
529 0.1
530 0.11
531 0.13
532 0.13
533 0.12
534 0.13
535 0.13
536 0.16
537 0.18
538 0.17
539 0.19
540 0.2
541 0.21
542 0.2
543 0.23
544 0.23
545 0.25
546 0.3
547 0.31
548 0.35
549 0.38
550 0.39
551 0.42
552 0.47
553 0.43
554 0.46
555 0.46
556 0.45
557 0.45
558 0.44
559 0.37
560 0.38
561 0.41
562 0.35
563 0.33
564 0.33
565 0.3
566 0.31
567 0.31
568 0.25
569 0.27
570 0.3
571 0.31
572 0.31
573 0.3
574 0.29
575 0.35
576 0.41
577 0.4
578 0.38
579 0.43
580 0.46
581 0.52
582 0.55
583 0.57
584 0.59
585 0.63
586 0.68
587 0.66
588 0.66
589 0.62
590 0.59
591 0.54
592 0.46
593 0.37
594 0.3
595 0.25
596 0.19
597 0.17
598 0.16
599 0.14
600 0.11
601 0.1
602 0.08
603 0.07
604 0.05
605 0.05
606 0.04
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.05
614 0.06
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.1
619 0.16
620 0.23
621 0.24
622 0.27
623 0.26
624 0.26
625 0.26
626 0.24
627 0.21
628 0.2
629 0.23
630 0.22
631 0.23
632 0.26
633 0.25
634 0.27
635 0.28
636 0.24
637 0.2
638 0.24
639 0.26
640 0.28
641 0.31
642 0.31
643 0.28
644 0.28
645 0.31
646 0.31
647 0.37
648 0.36
649 0.36
650 0.35
651 0.39
652 0.42
653 0.45
654 0.44
655 0.43
656 0.43
657 0.42
658 0.43
659 0.39
660 0.4
661 0.41
662 0.4
663 0.35
664 0.36
665 0.34
666 0.32
667 0.33
668 0.35
669 0.38
670 0.42
671 0.43
672 0.45
673 0.44
674 0.45
675 0.46
676 0.41
677 0.38
678 0.35
679 0.39
680 0.37
681 0.42
682 0.42
683 0.42
684 0.47
685 0.42
686 0.37
687 0.3
688 0.27
689 0.25
690 0.31
691 0.32
692 0.26
693 0.25
694 0.22
695 0.21
696 0.21
697 0.19
698 0.11
699 0.07
700 0.06
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.09
705 0.09
706 0.11
707 0.17
708 0.19
709 0.21
710 0.24
711 0.32
712 0.36
713 0.38
714 0.38
715 0.37
716 0.36
717 0.4
718 0.44
719 0.37
720 0.34
721 0.36
722 0.34
723 0.35
724 0.41
725 0.41
726 0.36
727 0.4
728 0.38
729 0.4
730 0.41
731 0.39
732 0.39
733 0.38
734 0.41
735 0.44
736 0.43
737 0.38
738 0.4
739 0.38
740 0.33
741 0.36
742 0.37
743 0.3
744 0.35
745 0.41
746 0.44
747 0.44
748 0.43
749 0.36
750 0.34
751 0.42
752 0.44
753 0.45
754 0.45
755 0.49
756 0.52
757 0.54
758 0.55
759 0.51
760 0.43
761 0.35
762 0.31
763 0.25
764 0.21
765 0.19
766 0.16
767 0.12
768 0.18
769 0.19
770 0.18
771 0.26
772 0.26
773 0.29
774 0.32
775 0.36
776 0.34
777 0.38
778 0.39
779 0.35
780 0.34
781 0.31
782 0.27
783 0.24
784 0.25
785 0.27
786 0.32
787 0.31
788 0.33
789 0.41
790 0.45
791 0.49
792 0.55
793 0.58
794 0.62
795 0.7
796 0.77
797 0.77
798 0.74
799 0.7
800 0.65
801 0.63
802 0.64
803 0.65
804 0.66
805 0.64
806 0.72
807 0.78
808 0.8
809 0.81
810 0.77
811 0.76
812 0.78
813 0.82
814 0.82