FuNGI

A0A1W2TDJ4

Protein Details

Accession

A0A1W2TDJ4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
213-232	AAAGRKRKKRWDVSSTPADE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
216-222	GRKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 19, nucl 3.5, cyto_nucl 3.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDVDFETVRKHQAERNAATAAKKGARPSGQRSENPTKAKLTESFDTDLYDRNGGDKYAGYLTSIPAADGEDEEMEDADSSRRLVGQYTATRAQIDEFAHGSGVEEDDPFSGRGENSTRIIDRETDYQKRRFDRVLTPTRADAFAANRLATTADEGRTYRDVMELRELEREEERVKRAVQARQKEGQVADGEHRATLQDGDKENADAGSTEAAAAGRKRKKRWDVSSTPADEPAPAAAETEGRTKRSRWDQAPALQVPGAVEAPKKRSRWDQAPSATPIGASGLVTPMHTSQISASSVPSFGTDISAPGGVLSDEDLNTLLPGEAQGFAIAQPPPNYPTGHAPLHRVSATPLPANYGGFMMQDPESNRLSGSQMPKEIPGVGELQFFKQEDMTYFGKLADGSDENSLSVDELKERKIMRLLLKIKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGPLFNQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRILWKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLATMISVMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIGSNLNDEQTKVRTVTSLAIAALAEASNPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQVMDILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCAGTEGVTAGYLKEHVLDEFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDIGQKVGVSEILERIVGNLKDESEAYRKMTVETVEKVVASLGAADIGERLEERLIDGILHSFQEQSVEDVIMLNGFGTVVNALGTRCKPYIPQIVSTILWRLNNKSATIRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILSALRAIVTVVGISQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMVHLLNVIFPNIFETSPHVIDRIVEAIEAIRVAVGPGLVMNYVWAGLFHPARKVRQPYWRLYNDAYVYQADALVPYYPNLNEEGIDRPELAIVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.48
3	0.49
4	0.48
5	0.48
6	0.47
7	0.46
8	0.43
9	0.39
10	0.38
11	0.37
12	0.41
13	0.46
14	0.52
15	0.56
16	0.6
17	0.63
18	0.66
19	0.72
20	0.74
21	0.74
22	0.73
23	0.68
24	0.62
25	0.56
26	0.56
27	0.52
28	0.48
29	0.45
30	0.44
31	0.42
32	0.38
33	0.39
34	0.35
35	0.34
36	0.29
37	0.27
38	0.22
39	0.21
40	0.22
41	0.19
42	0.2
43	0.16
44	0.16
45	0.17
46	0.17
47	0.17
48	0.17
49	0.17
50	0.2
51	0.19
52	0.16
53	0.13
54	0.14
55	0.13
56	0.12
57	0.13
58	0.09
59	0.09
60	0.1
61	0.09
62	0.09
63	0.08
64	0.08
65	0.08
66	0.09
67	0.09
68	0.1
69	0.11
70	0.11
71	0.13
72	0.16
73	0.23
74	0.27
75	0.33
76	0.36
77	0.35
78	0.36
79	0.34
80	0.32
81	0.28
82	0.25
83	0.21
84	0.19
85	0.18
86	0.18
87	0.17
88	0.17
89	0.13
90	0.13
91	0.1
92	0.09
93	0.1
94	0.1
95	0.12
96	0.11
97	0.11
98	0.12
99	0.11
100	0.15
101	0.19
102	0.22
103	0.23
104	0.27
105	0.28
106	0.28
107	0.3
108	0.29
109	0.28
110	0.33
111	0.38
112	0.43
113	0.49
114	0.54
115	0.6
116	0.62
117	0.64
118	0.61
119	0.58
120	0.58
121	0.62
122	0.65
123	0.64
124	0.62
125	0.59
126	0.57
127	0.51
128	0.43
129	0.35
130	0.28
131	0.28
132	0.27
133	0.24
134	0.21
135	0.21
136	0.21
137	0.18
138	0.19
139	0.16
140	0.15
141	0.18
142	0.18
143	0.22
144	0.23
145	0.24
146	0.19
147	0.21
148	0.21
149	0.21
150	0.29
151	0.27
152	0.27
153	0.31
154	0.31
155	0.29
156	0.29
157	0.3
158	0.25
159	0.29
160	0.31
161	0.3
162	0.3
163	0.35
164	0.4
165	0.45
166	0.5
167	0.54
168	0.58
169	0.6
170	0.61
171	0.58
172	0.51
173	0.47
174	0.41
175	0.34
176	0.3
177	0.28
178	0.26
179	0.22
180	0.21
181	0.17
182	0.15
183	0.16
184	0.16
185	0.18
186	0.2
187	0.22
188	0.23
189	0.23
190	0.22
191	0.19
192	0.16
193	0.1
194	0.09
195	0.08
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.09
201	0.12
202	0.2
203	0.27
204	0.35
205	0.41
206	0.51
207	0.61
208	0.7
209	0.77
210	0.78
211	0.78
212	0.79
213	0.82
214	0.77
215	0.68
216	0.59
217	0.49
218	0.39
219	0.32
220	0.24
221	0.16
222	0.11
223	0.11
224	0.09
225	0.1
226	0.12
227	0.19
228	0.21
229	0.22
230	0.25
231	0.25
232	0.34
233	0.42
234	0.5
235	0.47
236	0.53
237	0.57
238	0.61
239	0.68
240	0.6
241	0.52
242	0.42
243	0.38
244	0.3
245	0.24
246	0.19
247	0.11
248	0.13
249	0.15
250	0.22
251	0.28
252	0.29
253	0.32
254	0.41
255	0.48
256	0.55
257	0.58
258	0.6
259	0.59
260	0.64
261	0.63
262	0.56
263	0.47
264	0.38
265	0.31
266	0.23
267	0.17
268	0.12
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.09
274	0.08
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.09
279	0.13
280	0.14
281	0.13
282	0.14
283	0.13
284	0.13
285	0.13
286	0.12
287	0.09
288	0.08
289	0.09
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.08
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.05
308	0.04
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.09
317	0.09
318	0.11
319	0.12
320	0.14
321	0.16
322	0.18
323	0.18
324	0.17
325	0.23
326	0.26
327	0.29
328	0.29
329	0.31
330	0.31
331	0.34
332	0.32
333	0.26
334	0.23
335	0.24
336	0.25
337	0.22
338	0.2
339	0.2
340	0.2
341	0.2
342	0.18
343	0.14
344	0.11
345	0.1
346	0.1
347	0.09
348	0.08
349	0.11
350	0.12
351	0.15
352	0.15
353	0.15
354	0.15
355	0.14
356	0.16
357	0.18
358	0.23
359	0.23
360	0.24
361	0.25
362	0.26
363	0.26
364	0.24
365	0.19
366	0.15
367	0.13
368	0.12
369	0.14
370	0.14
371	0.14
372	0.16
373	0.16
374	0.15
375	0.14
376	0.13
377	0.11
378	0.16
379	0.16
380	0.15
381	0.15
382	0.14
383	0.14
384	0.13
385	0.12
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.11
393	0.1
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.09
398	0.11
399	0.12
400	0.16
401	0.17
402	0.18
403	0.21
404	0.26
405	0.27
406	0.35
407	0.41
408	0.43
409	0.49
410	0.49
411	0.47
412	0.48
413	0.48
414	0.45
415	0.44
416	0.42
417	0.42
418	0.45
419	0.44
420	0.42
421	0.48
422	0.5
423	0.45
424	0.43
425	0.41
426	0.45
427	0.52
428	0.51
429	0.42
430	0.33
431	0.31
432	0.3
433	0.29
434	0.23
435	0.15
436	0.12
437	0.13
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.1
442	0.08
443	0.08
444	0.09
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.1
450	0.12
451	0.13
452	0.13
453	0.13
454	0.16
455	0.17
456	0.18
457	0.16
458	0.15
459	0.14
460	0.18
461	0.2
462	0.17
463	0.17
464	0.17
465	0.18
466	0.17
467	0.17
468	0.13
469	0.12
470	0.15
471	0.17
472	0.19
473	0.21
474	0.2
475	0.21
476	0.23
477	0.23
478	0.19
479	0.16
480	0.14
481	0.13
482	0.14
483	0.13
484	0.12
485	0.09
486	0.09
487	0.09
488	0.08
489	0.06
490	0.04
491	0.03
492	0.04
493	0.05
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.07
499	0.09
500	0.1
501	0.12
502	0.12
503	0.14
504	0.14
505	0.14
506	0.14
507	0.12
508	0.1
509	0.07
510	0.07
511	0.05
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.05
523	0.06
524	0.07
525	0.08
526	0.08
527	0.11
528	0.12
529	0.13
530	0.13
531	0.12
532	0.11
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.09
539	0.08
540	0.09
541	0.08
542	0.07
543	0.06
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.03
551	0.02
552	0.03
553	0.03
554	0.04
555	0.06
556	0.07
557	0.11
558	0.16
559	0.2
560	0.23
561	0.27
562	0.37
563	0.45
564	0.52
565	0.55
566	0.57
567	0.6
568	0.65
569	0.62
570	0.57
571	0.49
572	0.45
573	0.44
574	0.37
575	0.33
576	0.26
577	0.24
578	0.19
579	0.17
580	0.13
581	0.08
582	0.06
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.08
597	0.08
598	0.08
599	0.09
600	0.08
601	0.08
602	0.08
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.11
607	0.11
608	0.1
609	0.09
610	0.1
611	0.11
612	0.1
613	0.1
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.07
618	0.06
619	0.05
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.04
628	0.05
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.06
637	0.05
638	0.05
639	0.06
640	0.08
641	0.13
642	0.22
643	0.24
644	0.25
645	0.31
646	0.34
647	0.36
648	0.36
649	0.37
650	0.32
651	0.3
652	0.3
653	0.24
654	0.2
655	0.18
656	0.15
657	0.08
658	0.05
659	0.04
660	0.03
661	0.04
662	0.03
663	0.04
664	0.05
665	0.05
666	0.04
667	0.07
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.08
674	0.08
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.09
686	0.09
687	0.1
688	0.13
689	0.13
690	0.13
691	0.14
692	0.16
693	0.13
694	0.15
695	0.14
696	0.13
697	0.16
698	0.19
699	0.19
700	0.17
701	0.17
702	0.16
703	0.16
704	0.14
705	0.11
706	0.07
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.05
711	0.04
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.06
716	0.05
717	0.07
718	0.08
719	0.1
720	0.1
721	0.1
722	0.1
723	0.11
724	0.12
725	0.16
726	0.2
727	0.18
728	0.2
729	0.28
730	0.34
731	0.41
732	0.48
733	0.51
734	0.5
735	0.58
736	0.57
737	0.5
738	0.46
739	0.4
740	0.36
741	0.31
742	0.27
743	0.2
744	0.21
745	0.2
746	0.17
747	0.15
748	0.1
749	0.09
750	0.08
751	0.07
752	0.05
753	0.05
754	0.06
755	0.07
756	0.07
757	0.07
758	0.07
759	0.07
760	0.12
761	0.11
762	0.12
763	0.12
764	0.12
765	0.12
766	0.13
767	0.15
768	0.14
769	0.16
770	0.16
771	0.18
772	0.18
773	0.19
774	0.2
775	0.19
776	0.19
777	0.19
778	0.19
779	0.17
780	0.17
781	0.16
782	0.14
783	0.12
784	0.08
785	0.06
786	0.04
787	0.04
788	0.03
789	0.03
790	0.04
791	0.04
792	0.04
793	0.04
794	0.04
795	0.04
796	0.04
797	0.05
798	0.06
799	0.06
800	0.06
801	0.06
802	0.06
803	0.07
804	0.07
805	0.07
806	0.06
807	0.06
808	0.08
809	0.08
810	0.09
811	0.09
812	0.08
813	0.08
814	0.08
815	0.08
816	0.07
817	0.06
818	0.04
819	0.03
820	0.03
821	0.03
822	0.03
823	0.03
824	0.03
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.08
829	0.09
830	0.12
831	0.12
832	0.13
833	0.14
834	0.2
835	0.3
836	0.29
837	0.31
838	0.3
839	0.33
840	0.33
841	0.32
842	0.29
843	0.22
844	0.22
845	0.21
846	0.22
847	0.25
848	0.26
849	0.27
850	0.3
851	0.32
852	0.37
853	0.41
854	0.39
855	0.33
856	0.33
857	0.33
858	0.29
859	0.26
860	0.19
861	0.15
862	0.12
863	0.12
864	0.1
865	0.1
866	0.09
867	0.08
868	0.1
869	0.1
870	0.11
871	0.11
872	0.11
873	0.11
874	0.1
875	0.11
876	0.09
877	0.09
878	0.08
879	0.08
880	0.09
881	0.08
882	0.07
883	0.06
884	0.05
885	0.04
886	0.05
887	0.06
888	0.06
889	0.06
890	0.06
891	0.06
892	0.06
893	0.06
894	0.05
895	0.05
896	0.04
897	0.04
898	0.04
899	0.05
900	0.05
901	0.04
902	0.04
903	0.04
904	0.04
905	0.04
906	0.04
907	0.04
908	0.04
909	0.04
910	0.04
911	0.05
912	0.05
913	0.05
914	0.08
915	0.11
916	0.12
917	0.12
918	0.14
919	0.16
920	0.18
921	0.2
922	0.2
923	0.23
924	0.25
925	0.26
926	0.28
927	0.29
928	0.33
929	0.37
930	0.46
931	0.45
932	0.51
933	0.53
934	0.59
935	0.62
936	0.64
937	0.61
938	0.61
939	0.57
940	0.53
941	0.5
942	0.42
943	0.35
944	0.28
945	0.23
946	0.14
947	0.11
948	0.08
949	0.08
950	0.08
951	0.09
952	0.1
953	0.11
954	0.14
955	0.17
956	0.2
957	0.22
958	0.23
959	0.23
960	0.26
961	0.25
962	0.24
963	0.24
964	0.22
965	0.21
966	0.19
967	0.18
968	0.19
969	0.19
970	0.19
971	0.15
972	0.18
973	0.22
974	0.22
975	0.24
976	0.22
977	0.27
978	0.33
979	0.43
980	0.49
981	0.51
982	0.59
983	0.65
984	0.72
985	0.67
986	0.6
987	0.51
988	0.41
989	0.36
990	0.28
991	0.2
992	0.11
993	0.13
994	0.13
995	0.12
996	0.11
997	0.11
998	0.11
999	0.1
1000	0.1
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.08
1004	0.1
1005	0.12
1006	0.12
1007	0.13
1008	0.14
1009	0.16
1010	0.19
1011	0.26
1012	0.31
1013	0.35
1014	0.38
1015	0.42
1016	0.42
1017	0.41
1018	0.38
1019	0.29
1020	0.25
1021	0.19
1022	0.15
1023	0.11
1024	0.09
1025	0.08
1026	0.07
1027	0.06
1028	0.04
1029	0.04
1030	0.04
1031	0.05
1032	0.05
1033	0.06
1034	0.09
1035	0.1
1036	0.1
1037	0.11
1038	0.16
1039	0.16
1040	0.18
1041	0.18
1042	0.17
1043	0.18
1044	0.18
1045	0.19
1046	0.2
1047	0.23
1048	0.25
1049	0.26
1050	0.25
1051	0.28
1052	0.27
1053	0.26
1054	0.2
1055	0.17
1056	0.14
1057	0.14
1058	0.15
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.13
1064	0.12
1065	0.13
1066	0.11
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.09
1072	0.08
1073	0.07
1074	0.08
1075	0.08
1076	0.08
1077	0.08
1078	0.08
1079	0.08
1080	0.07
1081	0.06
1082	0.07
1083	0.1
1084	0.1
1085	0.1
1086	0.11
1087	0.14
1088	0.19
1089	0.21
1090	0.23
1091	0.2
1092	0.2
1093	0.22
1094	0.27
1095	0.3
1096	0.27
1097	0.27
1098	0.26
1099	0.26
1100	0.25
1101	0.23
1102	0.18
1103	0.11
1104	0.1
1105	0.08
1106	0.06
1107	0.05
1108	0.05
1109	0.05
1110	0.04
1111	0.04
1112	0.04
1113	0.03
1114	0.05
1115	0.05
1116	0.05
1117	0.07
1118	0.07
1119	0.08
1120	0.09
1121	0.1
1122	0.08
1123	0.08
1124	0.11
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.11
1128	0.16
1129	0.21
1130	0.23
1131	0.24
1132	0.21
1133	0.2
1134	0.21
1135	0.23
1136	0.19
1137	0.14
1138	0.11
1139	0.11
1140	0.11
1141	0.11
1142	0.1
1143	0.08
1144	0.06
1145	0.05
1146	0.06
1147	0.06
1148	0.05
1149	0.05
1150	0.05
1151	0.06
1152	0.06
1153	0.06
1154	0.06
1155	0.06
1156	0.06
1157	0.06
1158	0.06
1159	0.06
1160	0.12
1161	0.16
1162	0.17
1163	0.25
1164	0.31
1165	0.37
1166	0.45
1167	0.53
1168	0.55
1169	0.62
1170	0.67
1171	0.69
1172	0.74
1173	0.74
1174	0.71
1175	0.66
1176	0.66
1177	0.59
1178	0.53
1179	0.46
1180	0.36
1181	0.32
1182	0.26
1183	0.23
1184	0.15
1185	0.12
1186	0.12
1187	0.11
1188	0.11
1189	0.1
1190	0.13
1191	0.13
1192	0.14
1193	0.16
1194	0.15
1195	0.14
1196	0.15
1197	0.2
1198	0.2
1199	0.21
1200	0.2
1201	0.18

A0A1W2TDJ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer